MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid C

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010542	TAT	3	9	121	129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034886
2	NC_010542	AGA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034886
3	NC_010542	AAT	2	6	323	328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034886
4	NC_010542	AAG	2	6	367	372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034886
5	NC_010542	CAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034886
6	NC_010542	ATT	2	6	514	519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034886
7	NC_010542	TGT	2	6	565	570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034886
8	NC_010542	GAT	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034886
9	NC_010542	TTA	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034886
10	NC_010542	TTA	2	6	657	662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034886
11	NC_010542	TAA	2	6	670	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034886
12	NC_010542	ATA	2	6	697	702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034886
13	NC_010542	AAT	2	6	799	804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010542	CAC	2	6	843	848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010542	ATT	2	6	1061	1066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010542	GTG	2	6	1185	1190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034887
17	NC_010542	TCG	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034887
18	NC_010542	TGG	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034887
19	NC_010542	GGT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034887
20	NC_010542	CAG	2	6	1373	1378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034887
21	NC_010542	AGC	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034887
22	NC_010542	TTC	2	6	1519	1524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034887
23	NC_010542	GAT	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034887
24	NC_010542	ATT	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034887
25	NC_010542	GTT	2	6	1622	1627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034887
26	NC_010542	ATT	2	6	1650	1655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034887
27	NC_010542	TAG	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034887
28	NC_010542	GGT	2	6	1755	1760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034887
29	NC_010542	GTC	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034887
30	NC_010542	TGT	2	6	1803	1808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034887
31	NC_010542	TCT	2	6	1810	1815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034887
32	NC_010542	TCA	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034887
33	NC_010542	ATC	2	6	2016	2021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034887
34	NC_010542	ATT	2	6	2100	2105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034887
35	NC_010542	ATG	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034887
36	NC_010542	ATG	2	6	2395	2400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034887
37	NC_010542	TCT	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034887
38	NC_010542	CTA	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034887
39	NC_010542	ATA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034887
40	NC_010542	TAA	2	6	2593	2598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034887
41	NC_010542	TTC	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034887
42	NC_010542	TGG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034887
43	NC_010542	CTT	2	6	2672	2677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034887
44	NC_010542	CGA	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034887
45	NC_010542	TAG	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034887
46	NC_010542	TAG	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034887
47	NC_010542	CTT	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034887
48	NC_010542	CTA	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034887
49	NC_010542	CGG	2	6	2924	2929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034887
50	NC_010542	TCT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034887
51	NC_010542	TGA	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034887
52	NC_010542	AGG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034887
53	NC_010542	GCT	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034887
54	NC_010542	GGT	2	6	3342	3347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034887
55	NC_010542	TTG	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034887
56	NC_010542	TCG	2	6	3445	3450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034887
57	NC_010542	TGT	2	6	3538	3543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034887
58	NC_010542	GGA	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010542	GAC	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010542	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010542	GTA	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010542	TTA	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010542	TCC	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010542	AGG	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010542	TAG	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034888
66	NC_010542	AAC	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034888
67	NC_010542	TAA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034888
68	NC_010542	ACG	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034888
69	NC_010542	GAT	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034888
70	NC_010542	CAG	2	6	4501	4506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034888
71	NC_010542	ATG	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034888
72	NC_010542	TCA	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034888
73	NC_010542	TAC	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034888
74	NC_010542	CTT	2	6	4572	4577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034888
75	NC_010542	TAA	2	6	4700	4705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010542	GAG	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010542	AGG	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010542	GTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034889
79	NC_010542	AAC	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034889
80	NC_010542	GTT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034889
81	NC_010542	TGT	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034889
82	NC_010542	TGC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034889
83	NC_010542	TGA	3	9	5562	5570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034889
84	NC_010542	TTC	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034889
85	NC_010542	CTG	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034889
86	NC_010542	TCT	2	6	5743	5748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034889
87	NC_010542	CAT	2	6	5768	5773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034889
88	NC_010542	GTC	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034889
89	NC_010542	GTT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034889
90	NC_010542	GAG	2	6	5872	5877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034889
91	NC_010542	TCA	2	6	6011	6016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034889
92	NC_010542	GCT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034889
93	NC_010542	GAT	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034889
94	NC_010542	TGG	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034889
95	NC_010542	ATG	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034889
96	NC_010542	CAG	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034889
97	NC_010542	TAC	2	6	6602	6607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034889
98	NC_010542	ATT	2	6	6613	6618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034889
99	NC_010542	TGA	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010542	ATA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010542	GAT	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034891
102	NC_010542	GAT	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034891
103	NC_010542	TTA	2	6	7056	7061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034891
104	NC_010542	GTT	2	6	7105	7110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034891
105	NC_010542	TCT	2	6	7172	7177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034891
106	NC_010542	ACT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034891
107	NC_010542	AAG	2	6	7205	7210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034891
108	NC_010542	AGT	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034891
109	NC_010542	ATC	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034891
110	NC_010542	ATT	2	6	7289	7294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034891
111	NC_010542	AGA	2	6	7297	7302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034891
112	NC_010542	ATC	2	6	7423	7428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034891
113	NC_010542	TGA	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034893
114	NC_010542	AGA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034893
115	NC_010542	AAC	2	6	7958	7963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034893
116	NC_010542	TGA	2	6	7986	7991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034894
117	NC_010542	TGT	2	6	8097	8102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034894
118	NC_010542	ATG	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034894
119	NC_010542	ATT	2	6	8186	8191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034894
120	NC_010542	ATC	2	6	8219	8224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034894
121	NC_010542	TCT	2	6	8368	8373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034894
122	NC_010542	ATG	2	6	8417	8422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034894
123	NC_010542	AAG	2	6	8540	8545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034895
124	NC_010542	AAG	2	6	8600	8605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034895
125	NC_010542	AGA	2	6	8610	8615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034895
126	NC_010542	AAT	2	6	8617	8622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034895
127	NC_010542	ATC	2	6	8645	8650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010542	GTT	2	6	8882	8887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034896
129	NC_010542	GAG	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034896
130	NC_010542	AGA	2	6	9002	9007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034896
131	NC_010542	CCG	2	6	9022	9027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034896
132	NC_010542	CGG	2	6	9059	9064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034896
133	NC_010542	ATT	2	6	9139	9144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034896
134	NC_010542	TGA	2	6	9221	9226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034896
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136	NC_010542	TAG	2	6	9310	9315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034896
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163	NC_010542	ATC	2	6	11091	11096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_010542	AAG	2	6	11118	11123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_010542	TGA	2	6	11602	11607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010542	TGA	2	6	11659	11664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.