MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 1556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010529	AGCG	2	8	549	556	25 %	0 %	50 %	25 %	188591328
2	NC_010529	TCGA	2	8	649	656	25 %	25 %	25 %	25 %	188591328
3	NC_010529	GTTT	2	8	790	797	0 %	75 %	25 %	0 %	188591328
4	NC_010529	TCGC	2	8	955	962	0 %	25 %	25 %	50 %	188591328
5	NC_010529	CGGA	2	8	3880	3887	25 %	0 %	50 %	25 %	188591329
6	NC_010529	GGAA	2	8	3941	3948	50 %	0 %	50 %	0 %	188591329
7	NC_010529	AGTC	2	8	4174	4181	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
8	NC_010529	CGTA	2	8	4493	4500	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
9	NC_010529	GAAA	2	8	4703	4710	75 %	0 %	25 %	0 %	188591329
10	NC_010529	TTTC	2	8	4765	4772	0 %	75 %	0 %	25 %	188591329
11	NC_010529	ACTG	2	8	5063	5070	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
12	NC_010529	AGCG	2	8	5348	5355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010529	TATC	2	8	6540	6547	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
14	NC_010529	ATCC	2	8	6617	6624	25 %	25 %	0 %	50 %	188591330
15	NC_010529	ATTT	2	8	7122	7129	25 %	75 %	0 %	0 %	188591330
16	NC_010529	GAAG	2	8	7397	7404	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
17	NC_010529	GGAA	2	8	7892	7899	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
18	NC_010529	TTCA	2	8	8345	8352	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
19	NC_010529	CATT	2	8	8674	8681	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
20	NC_010529	GGCT	2	8	9138	9145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010529	CAAT	2	8	9367	9374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010529	TCGA	2	8	9514	9521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010529	CGGC	2	8	9633	9640	0 %	0 %	50 %	50 %	188591331
24	NC_010529	CAGC	2	8	9747	9754	25 %	0 %	25 %	50 %	188591331
25	NC_010529	GGCA	2	8	10143	10150	25 %	0 %	50 %	25 %	188591331
26	NC_010529	GTGC	2	8	10243	10250	0 %	25 %	50 %	25 %	188591331
27	NC_010529	TCCT	2	8	10620	10627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010529	GGTC	2	8	11185	11192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010529	TGGT	2	8	11820	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010529	GGAC	2	8	11833	11840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010529	GTAG	2	8	11954	11961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010529	TGCT	2	8	12475	12482	0 %	50 %	25 %	25 %	188591332
33	NC_010529	CGAC	2	8	13307	13314	25 %	0 %	25 %	50 %	188591332
34	NC_010529	GGCA	2	8	13872	13879	25 %	0 %	50 %	25 %	188591333
35	NC_010529	CCAA	2	8	13970	13977	50 %	0 %	0 %	50 %	188591333
36	NC_010529	GCTG	2	8	13981	13988	0 %	25 %	50 %	25 %	188591333
37	NC_010529	CTGG	2	8	14056	14063	0 %	25 %	50 %	25 %	188591333
38	NC_010529	GCAG	2	8	14200	14207	25 %	0 %	50 %	25 %	188591333
39	NC_010529	AGCG	2	8	15240	15247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010529	ATTG	2	8	15418	15425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010529	GCCC	2	8	15503	15510	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010529	GAGG	2	8	15569	15576	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010529	AGCC	2	8	15673	15680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010529	ATCG	2	8	16288	16295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010529	CCTT	2	8	16601	16608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010529	GGCC	2	8	17123	17130	0 %	0 %	50 %	50 %	188591334
47	NC_010529	ATCG	2	8	17507	17514	25 %	25 %	25 %	25 %	188591334
48	NC_010529	CAAG	2	8	18298	18305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010529	GACT	2	8	18429	18436	25 %	25 %	25 %	25 %	188591335
50	NC_010529	CTTG	2	8	20760	20767	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
51	NC_010529	GTTC	2	8	21449	21456	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
52	NC_010529	AGGC	2	8	21537	21544	25 %	0 %	50 %	25 %	188591336
53	NC_010529	CCGC	2	8	21586	21593	0 %	0 %	25 %	75 %	188591336
54	NC_010529	CGAC	2	8	21732	21739	25 %	0 %	25 %	50 %	188591336
55	NC_010529	GAGC	2	8	21929	21936	25 %	0 %	50 %	25 %	188591336
56	NC_010529	TCGC	2	8	21997	22004	0 %	25 %	25 %	50 %	188591336
57	NC_010529	CGTT	2	8	22025	22032	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
58	NC_010529	GCCA	2	8	22034	22041	25 %	0 %	25 %	50 %	188591336
59	NC_010529	CAGG	2	8	22114	22121	25 %	0 %	50 %	25 %	188591336
60	NC_010529	TCGC	2	8	22597	22604	0 %	25 %	25 %	50 %	188591336
61	NC_010529	TCGT	2	8	22639	22646	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
62	NC_010529	TCCA	2	8	23456	23463	25 %	25 %	0 %	50 %	188591336
63	NC_010529	GGGC	2	8	24998	25005	0 %	0 %	75 %	25 %	188591337
64	NC_010529	CAGG	2	8	25044	25051	25 %	0 %	50 %	25 %	188591338
65	NC_010529	CGGC	2	8	25074	25081	0 %	0 %	50 %	50 %	188591338
66	NC_010529	GTCT	2	8	25559	25566	0 %	50 %	25 %	25 %	188591338
67	NC_010529	GCCA	2	8	26060	26067	25 %	0 %	25 %	50 %	188591338
68	NC_010529	CCGG	2	8	26430	26437	0 %	0 %	50 %	50 %	188591338
69	NC_010529	CGCC	2	8	26793	26800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_010529	GGCT	2	8	26803	26810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010529	GCAG	2	8	27137	27144	25 %	0 %	50 %	25 %	188591339
72	NC_010529	GCCG	2	8	27163	27170	0 %	0 %	50 %	50 %	188591339
73	NC_010529	CAGG	2	8	27263	27270	25 %	0 %	50 %	25 %	188591339
74	NC_010529	TGCC	2	8	27352	27359	0 %	25 %	25 %	50 %	188591339
75	NC_010529	CCAT	2	8	27376	27383	25 %	25 %	0 %	50 %	188591339
76	NC_010529	CAAG	2	8	27687	27694	50 %	0 %	25 %	25 %	188591340
77	NC_010529	CACT	2	8	28240	28247	25 %	25 %	0 %	50 %	188591341
78	NC_010529	GATG	2	8	28921	28928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010529	CTCA	2	8	29607	29614	25 %	25 %	0 %	50 %	188591343
80	NC_010529	ATGA	2	8	29671	29678	50 %	25 %	25 %	0 %	188591343
81	NC_010529	GAAC	2	8	30509	30516	50 %	0 %	25 %	25 %	188591343
82	NC_010529	TGCT	2	8	30813	30820	0 %	50 %	25 %	25 %	188591343
83	NC_010529	GAAC	2	8	30910	30917	50 %	0 %	25 %	25 %	188591343
84	NC_010529	GATA	2	8	31813	31820	50 %	25 %	25 %	0 %	188591344
85	NC_010529	CCAC	2	8	32119	32126	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_010529	GGCT	2	8	32339	32346	0 %	25 %	50 %	25 %	188591345
87	NC_010529	AGCG	2	8	32412	32419	25 %	0 %	50 %	25 %	188591345
88	NC_010529	ACGA	2	8	32694	32701	50 %	0 %	25 %	25 %	188591345
89	NC_010529	GGTG	2	8	33037	33044	0 %	25 %	75 %	0 %	188591346
90	NC_010529	AGGG	2	8	33616	33623	25 %	0 %	75 %	0 %	188591346
91	NC_010529	CGTA	2	8	34087	34094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010529	CTTT	2	8	34591	34598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010529	TTTG	2	8	34710	34717	0 %	75 %	25 %	0 %	188591348
94	NC_010529	CCAA	2	8	35538	35545	50 %	0 %	0 %	50 %	188591349
95	NC_010529	TTGT	2	8	36209	36216	0 %	75 %	25 %	0 %	188591350
96	NC_010529	GATA	2	8	36702	36709	50 %	25 %	25 %	0 %	188591350
97	NC_010529	CATA	2	8	36898	36905	50 %	25 %	0 %	25 %	188591350
98	NC_010529	TTGC	2	8	37117	37124	0 %	50 %	25 %	25 %	188591350
99	NC_010529	ACCC	2	8	37387	37394	25 %	0 %	0 %	75 %	188591350
100	NC_010529	CTTG	2	8	37480	37487	0 %	50 %	25 %	25 %	188591350
101	NC_010529	CAAA	2	8	37592	37599	75 %	0 %	0 %	25 %	188591350
102	NC_010529	AATG	2	8	37600	37607	50 %	25 %	25 %	0 %	188591350
103	NC_010529	TCAT	2	8	37808	37815	25 %	50 %	0 %	25 %	188591351
104	NC_010529	CAAA	2	8	37833	37840	75 %	0 %	0 %	25 %	188591351
105	NC_010529	CCAG	2	8	38223	38230	25 %	0 %	25 %	50 %	188591352
106	NC_010529	TGCT	2	8	38243	38250	0 %	50 %	25 %	25 %	188591352
107	NC_010529	GCAA	2	8	38515	38522	50 %	0 %	25 %	25 %	188591352
108	NC_010529	TGCT	2	8	38541	38548	0 %	50 %	25 %	25 %	188591352
109	NC_010529	CGTC	2	8	38975	38982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010529	CGCT	2	8	39570	39577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010529	GTAT	2	8	39588	39595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010529	AATT	2	8	39689	39696	50 %	50 %	0 %	0 %	188591353
113	NC_010529	CGCC	2	8	40743	40750	0 %	0 %	25 %	75 %	188591354
114	NC_010529	GCTT	2	8	41087	41094	0 %	50 %	25 %	25 %	188591354
115	NC_010529	AGGC	2	8	41231	41238	25 %	0 %	50 %	25 %	188591355
116	NC_010529	GGAT	2	8	42266	42273	25 %	25 %	50 %	0 %	188591355
117	NC_010529	TCGG	2	8	42325	42332	0 %	25 %	50 %	25 %	188591355
118	NC_010529	TGCC	2	8	42477	42484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010529	CCAG	2	8	42612	42619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010529	GGGC	2	8	42893	42900	0 %	0 %	75 %	25 %	188591356
121	NC_010529	CCCG	2	8	43087	43094	0 %	0 %	25 %	75 %	188591356
122	NC_010529	GGGT	2	8	43512	43519	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010529	GGCC	2	8	43740	43747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010529	CAGT	2	8	43809	43816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010529	CCCG	2	8	43831	43838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_010529	TTGA	2	8	43883	43890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010529	CGTT	2	8	44442	44449	0 %	50 %	25 %	25 %	188591357
128	NC_010529	GGAA	2	8	44463	44470	50 %	0 %	50 %	0 %	188591357
129	NC_010529	CTTC	2	8	44880	44887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010529	TCGG	2	8	45278	45285	0 %	25 %	50 %	25 %	188591358
131	NC_010529	TCCT	2	8	45539	45546	0 %	50 %	0 %	50 %	188591358
132	NC_010529	GGGC	2	8	45603	45610	0 %	0 %	75 %	25 %	188591358
133	NC_010529	TGAG	2	8	45623	45630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010529	GACC	2	8	45674	45681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010529	GCGG	2	8	45778	45785	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010529	CGGC	2	8	45795	45802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010529	TCCA	2	8	46370	46377	25 %	25 %	0 %	50 %	188591360
138	NC_010529	ATGG	2	8	46504	46511	25 %	25 %	50 %	0 %	188591360
139	NC_010529	ATGG	2	8	47445	47452	25 %	25 %	50 %	0 %	188591362
140	NC_010529	CCGG	2	8	48035	48042	0 %	0 %	50 %	50 %	188591362
141	NC_010529	GATT	2	8	48712	48719	25 %	50 %	25 %	0 %	188591362
142	NC_010529	CGGT	2	8	48884	48891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010529	AGAT	2	8	48927	48934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010529	CTGC	2	8	49313	49320	0 %	25 %	25 %	50 %	188591363
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