MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 11377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010529	TCA	2	6	168501	168506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591482
3502	NC_010529	CAG	2	6	168566	168571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591482
3503	NC_010529	TAC	2	6	168593	168598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591482
3504	NC_010529	CTG	2	6	168600	168605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591482
3505	NC_010529	GGC	2	6	168703	168708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591482
3506	NC_010529	CGT	2	6	168711	168716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591482
3507	NC_010529	AGC	2	6	168766	168771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591482
3508	NC_010529	GTG	2	6	168857	168862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591482
3509	NC_010529	CA	3	6	168899	168904	50 %	0 %	0 %	50 %	188591482
3510	NC_010529	ACG	2	6	169008	169013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_010529	GTA	2	6	169061	169066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591483
3512	NC_010529	CG	3	6	169129	169134	0 %	0 %	50 %	50 %	188591483
3513	NC_010529	GC	3	6	169214	169219	0 %	0 %	50 %	50 %	188591483
3514	NC_010529	GTT	2	6	169229	169234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591483
3515	NC_010529	CAT	2	6	169243	169248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591483
3516	NC_010529	CCA	2	6	169275	169280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591483
3517	NC_010529	AC	3	6	169340	169345	50 %	0 %	0 %	50 %	188591483
3518	NC_010529	GCG	4	12	169360	169371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591483
3519	NC_010529	GCG	2	6	169375	169380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591483
3520	NC_010529	ATC	2	6	169385	169390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591483
3521	NC_010529	GTG	2	6	169430	169435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591483
3522	NC_010529	CGG	2	6	169463	169468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591483
3523	NC_010529	ATGC	2	8	169521	169528	25 %	25 %	25 %	25 %	188591483
3524	NC_010529	TCA	2	6	169543	169548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591483
3525	NC_010529	C	6	6	169601	169606	0 %	0 %	0 %	100 %	188591484
3526	NC_010529	GA	3	6	169645	169650	50 %	0 %	50 %	0 %	188591484
3527	NC_010529	GCTT	2	8	169655	169662	0 %	50 %	25 %	25 %	188591484
3528	NC_010529	GTA	2	6	169674	169679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591484
3529	NC_010529	CGG	2	6	169715	169720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591484
3530	NC_010529	ACC	2	6	169781	169786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591484
3531	NC_010529	GTT	2	6	169865	169870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591484
3532	NC_010529	CAC	2	6	169947	169952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591484
3533	NC_010529	GCC	2	6	170000	170005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591484
3534	NC_010529	GTG	2	6	170031	170036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591484
3535	NC_010529	CGG	2	6	170040	170045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591484
3536	NC_010529	CGC	2	6	170059	170064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591484
3537	NC_010529	CCA	2	6	170106	170111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591484
3538	NC_010529	CGT	2	6	170155	170160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591484
3539	NC_010529	TGCC	2	8	170161	170168	0 %	25 %	25 %	50 %	188591484
3540	NC_010529	TCGA	2	8	170172	170179	25 %	25 %	25 %	25 %	188591484
3541	NC_010529	ATAG	2	8	170227	170234	50 %	25 %	25 %	0 %	188591484
3542	NC_010529	GTT	2	6	170237	170242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591484
3543	NC_010529	GC	3	6	170248	170253	0 %	0 %	50 %	50 %	188591484
3544	NC_010529	GCCG	2	8	170278	170285	0 %	0 %	50 %	50 %	188591484
3545	NC_010529	CCA	2	6	170353	170358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591484
3546	NC_010529	TCG	2	6	170359	170364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591484
3547	NC_010529	GCC	2	6	170455	170460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591484
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3551	NC_010529	TGA	2	6	170578	170583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591484
3552	NC_010529	GGC	2	6	170666	170671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591484
3553	NC_010529	CGC	2	6	170696	170701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591484
3554	NC_010529	GGC	2	6	170702	170707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591484
3555	NC_010529	CGA	2	6	170782	170787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591484
3556	NC_010529	TGC	2	6	170951	170956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591485
3557	NC_010529	AGC	2	6	170959	170964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591485
3558	NC_010529	GC	3	6	170963	170968	0 %	0 %	50 %	50 %	188591485
3559	NC_010529	TGA	2	6	170979	170984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591485
3560	NC_010529	CGCC	2	8	171010	171017	0 %	0 %	25 %	75 %	188591485
3561	NC_010529	CCA	2	6	171059	171064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591485
3562	NC_010529	GCA	2	6	171074	171079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591485
3563	NC_010529	CGG	2	6	171119	171124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591485
3564	NC_010529	AC	3	6	171128	171133	50 %	0 %	0 %	50 %	188591485
3565	NC_010529	CTG	2	6	171156	171161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591485
3566	NC_010529	GCCA	2	8	171192	171199	25 %	0 %	25 %	50 %	188591485
3567	NC_010529	TGC	2	6	171213	171218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591485
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3569	NC_010529	CAGA	2	8	171252	171259	50 %	0 %	25 %	25 %	188591485
3570	NC_010529	TGG	2	6	171315	171320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010529	GCG	2	6	171373	171378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591486
3572	NC_010529	CGG	2	6	171380	171385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591486
3573	NC_010529	GGAG	2	8	171452	171459	25 %	0 %	75 %	0 %	188591486
3574	NC_010529	CCG	2	6	171496	171501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591486
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3579	NC_010529	CCA	2	6	171776	171781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591486
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3581	NC_010529	CGA	2	6	171806	171811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591486
3582	NC_010529	CCAT	2	8	171826	171833	25 %	25 %	0 %	50 %	188591486
3583	NC_010529	TCG	2	6	171907	171912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_010529	CGG	2	6	171979	171984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591487
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3589	NC_010529	GTGCC	2	10	172177	172186	0 %	20 %	40 %	40 %	188591487
3590	NC_010529	ATC	2	6	172221	172226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591487
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3593	NC_010529	CGA	2	6	172405	172410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591487
3594	NC_010529	AAC	2	6	172526	172531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591488
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3597	NC_010529	GCCA	2	8	172782	172789	25 %	0 %	25 %	50 %	188591488
3598	NC_010529	TGCCG	2	10	172796	172805	0 %	20 %	40 %	40 %	188591488
3599	NC_010529	GCA	2	6	172846	172851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591488
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3601	NC_010529	CAGC	2	8	172868	172875	25 %	0 %	25 %	50 %	188591488
3602	NC_010529	TC	3	6	172888	172893	0 %	50 %	0 %	50 %	188591488
3603	NC_010529	GCCCA	2	10	172942	172951	20 %	0 %	20 %	60 %	188591488
3604	NC_010529	CCA	2	6	172964	172969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591488
3605	NC_010529	ATCG	2	8	173075	173082	25 %	25 %	25 %	25 %	188591488
3606	NC_010529	GCA	2	6	173083	173088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591488
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3609	NC_010529	GAC	2	6	173132	173137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591488
3610	NC_010529	CGGC	2	8	173158	173165	0 %	0 %	50 %	50 %	188591488
3611	NC_010529	A	6	6	173169	173174	100 %	0 %	0 %	0 %	188591488
3612	NC_010529	CGT	2	6	173201	173206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591488
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3615	NC_010529	GCC	2	6	173361	173366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591488
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3744	NC_010529	TGC	2	6	179292	179297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591493
3745	NC_010529	CGT	2	6	179302	179307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591493
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3747	NC_010529	TGC	2	6	179363	179368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591493
3748	NC_010529	CGGTT	2	10	179386	179395	0 %	40 %	40 %	20 %	188591493
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3762	NC_010529	CG	3	6	180118	180123	0 %	0 %	50 %	50 %	188591495
3763	NC_010529	CGCAGT	2	12	180176	180187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	188591495
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3766	NC_010529	GCG	2	6	180379	180384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591495
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3772	NC_010529	CGC	2	6	180625	180630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591495
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3783	NC_010529	CGG	2	6	181087	181092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591495
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3820	NC_010529	GC	3	6	182920	182925	0 %	0 %	50 %	50 %	188591497
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3823	NC_010529	CTTCG	2	10	183005	183014	0 %	40 %	20 %	40 %	188591497
3824	NC_010529	TCG	2	6	183021	183026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591497
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3828	NC_010529	CGA	2	6	183197	183202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591498
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3856	NC_010529	GGCTT	2	10	184775	184784	0 %	40 %	40 %	20 %	188591499
3857	NC_010529	GA	3	6	184800	184805	50 %	0 %	50 %	0 %	188591499
3858	NC_010529	GGC	2	6	184815	184820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3859	NC_010529	CGA	2	6	185064	185069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3860	NC_010529	GCC	2	6	185074	185079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3861	NC_010529	TCGA	2	8	185093	185100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3862	NC_010529	CAA	2	6	185153	185158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3863	NC_010529	ACC	2	6	185186	185191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591500
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3986	NC_010529	CAA	2	6	190603	190608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591505
3987	NC_010529	CTCTT	2	10	190743	190752	0 %	60 %	0 %	40 %	188591505
3988	NC_010529	CTT	2	6	190792	190797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591505
3989	NC_010529	AC	3	6	190875	190880	50 %	0 %	0 %	50 %	188591505
3990	NC_010529	CAT	2	6	190945	190950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591505
3991	NC_010529	TGGC	2	8	191019	191026	0 %	25 %	50 %	25 %	188591505
3992	NC_010529	GCC	2	6	191027	191032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591505
3993	NC_010529	TGC	2	6	191058	191063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591505
3994	NC_010529	G	6	6	191110	191115	0 %	0 %	100 %	0 %	188591505
3995	NC_010529	GGC	2	6	191162	191167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591505
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3997	NC_010529	CAG	2	6	191222	191227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591506
3998	NC_010529	GCC	2	6	191252	191257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591506
3999	NC_010529	AACGA	2	10	191281	191290	60 %	0 %	20 %	20 %	188591506
4000	NC_010529	CGGC	2	8	191365	191372	0 %	0 %	50 %	50 %	188591506

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