MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 11377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010529	GCT	2	6	146362	146367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_010529	CGA	2	6	146509	146514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3003	NC_010529	CG	3	6	146539	146544	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3004	NC_010529	GC	3	6	146554	146559	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3005	NC_010529	GAATGC	2	12	146582	146593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188591458
3006	NC_010529	CG	3	6	146653	146658	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3007	NC_010529	CAC	2	6	146675	146680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591458
3008	NC_010529	TGC	2	6	146683	146688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3009	NC_010529	GCGA	2	8	146729	146736	25 %	0 %	50 %	25 %	188591458
3010	NC_010529	CCA	2	6	146767	146772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591458
3011	NC_010529	GC	3	6	146805	146810	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3012	NC_010529	CGG	2	6	146874	146879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591458
3013	NC_010529	GCT	2	6	146881	146886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3014	NC_010529	AGCA	2	8	146910	146917	50 %	0 %	25 %	25 %	188591458
3015	NC_010529	CG	3	6	146946	146951	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3016	NC_010529	CTG	2	6	146962	146967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3017	NC_010529	GCCG	2	8	147013	147020	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3018	NC_010529	GCT	2	6	147025	147030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3019	NC_010529	GGCAG	2	10	147093	147102	20 %	0 %	60 %	20 %	188591458
3020	NC_010529	CCGG	2	8	147116	147123	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3021	NC_010529	CG	3	6	147129	147134	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3022	NC_010529	TGC	2	6	147192	147197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3023	NC_010529	CTT	2	6	147214	147219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591458
3024	NC_010529	GCC	2	6	147224	147229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591458
3025	NC_010529	CG	3	6	147238	147243	0 %	0 %	50 %	50 %	188591458
3026	NC_010529	CTG	2	6	147311	147316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3027	NC_010529	GGT	2	6	147346	147351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591458
3028	NC_010529	GCC	2	6	147479	147484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591458
3029	NC_010529	ACG	2	6	147564	147569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3030	NC_010529	CAG	2	6	147641	147646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3031	NC_010529	GT	3	6	147652	147657	0 %	50 %	50 %	0 %	188591458
3032	NC_010529	AGC	2	6	147685	147690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591458
3033	NC_010529	CAC	2	6	147695	147700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591459
3034	NC_010529	CGC	2	6	147753	147758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591459
3035	NC_010529	GCT	2	6	147813	147818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591459
3036	NC_010529	GC	3	6	147820	147825	0 %	0 %	50 %	50 %	188591459
3037	NC_010529	TCG	2	6	147890	147895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591459
3038	NC_010529	CACTG	2	10	147906	147915	20 %	20 %	20 %	40 %	188591459
3039	NC_010529	GCC	2	6	147982	147987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591459
3040	NC_010529	CCT	2	6	148112	148117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591460
3041	NC_010529	CAG	2	6	148134	148139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591460
3042	NC_010529	CCA	2	6	148152	148157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591460
3043	NC_010529	GCCGAA	2	12	148212	148223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591460
3044	NC_010529	GGC	2	6	148253	148258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591460
3045	NC_010529	GCA	2	6	148310	148315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591460
3046	NC_010529	CAG	2	6	148389	148394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591460
3047	NC_010529	GACC	2	8	148489	148496	25 %	0 %	25 %	50 %	188591461
3048	NC_010529	ACGC	2	8	148569	148576	25 %	0 %	25 %	50 %	188591461
3049	NC_010529	CGG	2	6	148579	148584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591461
3050	NC_010529	CCG	2	6	148618	148623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591461
3051	NC_010529	CCG	2	6	148632	148637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591461
3052	NC_010529	ACG	2	6	148674	148679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3053	NC_010529	CGC	2	6	148684	148689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591461
3054	NC_010529	TCT	2	6	148713	148718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591461
3055	NC_010529	CGA	2	6	148885	148890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3056	NC_010529	TGGC	2	8	148916	148923	0 %	25 %	50 %	25 %	188591461
3057	NC_010529	CCG	2	6	148947	148952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591461
3058	NC_010529	CTGG	2	8	148957	148964	0 %	25 %	50 %	25 %	188591461
3059	NC_010529	GTG	2	6	148973	148978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591461
3060	NC_010529	GC	4	8	149017	149024	0 %	0 %	50 %	50 %	188591461
3061	NC_010529	TC	3	6	149041	149046	0 %	50 %	0 %	50 %	188591461
3062	NC_010529	GCT	2	6	149056	149061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3063	NC_010529	CTG	2	6	149099	149104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3064	NC_010529	CTGGA	2	10	149138	149147	20 %	20 %	40 %	20 %	188591461
3065	NC_010529	TCC	2	6	149291	149296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591461
3066	NC_010529	CAA	2	6	149341	149346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591461
3067	NC_010529	CGG	2	6	149365	149370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591461
3068	NC_010529	GC	3	6	149391	149396	0 %	0 %	50 %	50 %	188591461
3069	NC_010529	GC	3	6	149422	149427	0 %	0 %	50 %	50 %	188591461
3070	NC_010529	CGA	2	6	149431	149436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3071	NC_010529	GCT	2	6	149491	149496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3072	NC_010529	ACG	2	6	149511	149516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3073	NC_010529	CGT	2	6	149529	149534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3074	NC_010529	GCA	2	6	149546	149551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591461
3075	NC_010529	ATG	2	6	149581	149586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591461
3076	NC_010529	GCA	2	6	149614	149619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591462
3077	NC_010529	GATC	2	8	149691	149698	25 %	25 %	25 %	25 %	188591462
3078	NC_010529	GC	3	6	149760	149765	0 %	0 %	50 %	50 %	188591462
3079	NC_010529	CAG	2	6	149779	149784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591462
3080	NC_010529	CGT	2	6	149802	149807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591462
3081	NC_010529	GGC	2	6	149837	149842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591462
3082	NC_010529	CGC	2	6	149874	149879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
3083	NC_010529	CAC	2	6	149907	149912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591462
3084	NC_010529	GC	3	6	149932	149937	0 %	0 %	50 %	50 %	188591462
3085	NC_010529	CGC	2	6	149990	149995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
3086	NC_010529	TCG	2	6	150080	150085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591462
3087	NC_010529	GGC	2	6	150100	150105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591462
3088	NC_010529	CAGCC	2	10	150147	150156	20 %	0 %	20 %	60 %	188591462
3089	NC_010529	CGCT	2	8	150157	150164	0 %	25 %	25 %	50 %	188591462
3090	NC_010529	TA	3	6	150166	150171	50 %	50 %	0 %	0 %	188591462
3091	NC_010529	GCC	2	6	150249	150254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
3092	NC_010529	CGT	2	6	150335	150340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591462
3093	NC_010529	GC	3	6	150345	150350	0 %	0 %	50 %	50 %	188591462
3094	NC_010529	CTC	2	6	150364	150369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591462
3095	NC_010529	GCC	2	6	150403	150408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
3096	NC_010529	GA	3	6	150413	150418	50 %	0 %	50 %	0 %	188591462
3097	NC_010529	GCC	2	6	150488	150493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
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3099	NC_010529	CGC	2	6	150552	150557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
3100	NC_010529	TC	3	6	150562	150567	0 %	50 %	0 %	50 %	188591462
3101	NC_010529	CCGA	2	8	150595	150602	25 %	0 %	25 %	50 %	188591462
3102	NC_010529	CCGG	2	8	150633	150640	0 %	0 %	50 %	50 %	188591462
3103	NC_010529	TGG	2	6	150647	150652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591462
3104	NC_010529	CGG	2	6	150663	150668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591462
3105	NC_010529	GCC	2	6	150688	150693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
3106	NC_010529	GCC	2	6	150751	150756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591462
3107	NC_010529	ACAACG	2	12	150838	150849	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	188591463
3108	NC_010529	CCGGAA	2	12	150861	150872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591463
3109	NC_010529	CAC	2	6	150899	150904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591463
3110	NC_010529	G	6	6	150914	150919	0 %	0 %	100 %	0 %	188591463
3111	NC_010529	CG	3	6	151015	151020	0 %	0 %	50 %	50 %	188591463
3112	NC_010529	TCA	2	6	151094	151099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_010529	GCC	2	6	151116	151121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_010529	GGCA	2	8	151127	151134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_010529	CCT	2	6	151178	151183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591464
3116	NC_010529	GCCG	2	8	151221	151228	0 %	0 %	50 %	50 %	188591464
3117	NC_010529	GAA	2	6	151251	151256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591464
3118	NC_010529	GAT	2	6	151376	151381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591464
3119	NC_010529	CGCGC	2	10	151384	151393	0 %	0 %	40 %	60 %	188591464
3120	NC_010529	ACC	2	6	151440	151445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591464
3121	NC_010529	CGC	2	6	151475	151480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591464
3122	NC_010529	CCCG	2	8	151529	151536	0 %	0 %	25 %	75 %	188591464
3123	NC_010529	GTG	2	6	151542	151547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591464
3124	NC_010529	GCT	2	6	151571	151576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591464
3125	NC_010529	GC	3	6	151580	151585	0 %	0 %	50 %	50 %	188591464
3126	NC_010529	ATC	2	6	151590	151595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591464
3127	NC_010529	GC	3	6	151606	151611	0 %	0 %	50 %	50 %	188591464
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3130	NC_010529	GCA	2	6	151857	151862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591465
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3138	NC_010529	AG	3	6	152193	152198	50 %	0 %	50 %	0 %	188591465
3139	NC_010529	GCA	2	6	152223	152228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591465
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3142	NC_010529	GTC	2	6	152308	152313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591466
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3153	NC_010529	GAA	2	6	152832	152837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_010529	ACG	2	6	152838	152843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_010529	CAA	2	6	152859	152864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3156	NC_010529	GC	3	6	152900	152905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3157	NC_010529	CGC	2	6	152919	152924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3158	NC_010529	GCA	3	9	152929	152937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_010529	GCACC	2	10	153140	153149	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3162	NC_010529	CA	3	6	153168	153173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3163	NC_010529	AGGT	2	8	153219	153226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_010529	CGT	2	6	153229	153234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3250	NC_010529	TTC	2	6	156930	156935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591469
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3364	NC_010529	TTCC	2	8	161789	161796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3370	NC_010529	CAA	2	6	162094	162099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591478
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3373	NC_010529	GCC	2	6	162149	162154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591478
3374	NC_010529	GT	3	6	162323	162328	0 %	50 %	50 %	0 %	188591478
3375	NC_010529	C	6	6	162349	162354	0 %	0 %	0 %	100 %	188591478
3376	NC_010529	GC	3	6	162398	162403	0 %	0 %	50 %	50 %	188591478
3377	NC_010529	TCA	2	6	162449	162454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591478
3378	NC_010529	GAC	2	6	162567	162572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591478
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3388	NC_010529	TCC	2	6	162941	162946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591478
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3412	NC_010529	T	7	7	164590	164596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3444	NC_010529	T	7	7	165901	165907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3446	NC_010529	CTG	2	6	166162	166167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3474	NC_010529	CCT	2	6	167487	167492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3480	NC_010529	CCGG	2	8	167912	167919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3481	NC_010529	GAA	2	6	167932	167937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3482	NC_010529	CT	3	6	167961	167966	0 %	50 %	0 %	50 %	188591482
3483	NC_010529	GCTC	2	8	167989	167996	0 %	25 %	25 %	50 %	188591482
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3492	NC_010529	ATG	2	6	168159	168164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591482
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3494	NC_010529	TCGGCG	2	12	168189	168200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	188591482
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3496	NC_010529	CGC	2	6	168229	168234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591482
3497	NC_010529	GCGG	2	8	168341	168348	0 %	0 %	75 %	25 %	188591482
3498	NC_010529	GGA	2	6	168352	168357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591482
3499	NC_010529	GTCT	2	8	168427	168434	0 %	50 %	25 %	25 %	188591482
3500	NC_010529	CGGT	2	8	168468	168475	0 %	25 %	50 %	25 %	188591482

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