MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 11377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010529	CTT	2	6	540543	540548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591831
11002	NC_010529	T	6	6	540555	540560	0 %	100 %	0 %	0 %	188591831
11003	NC_010529	TCG	2	6	540576	540581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591831
11004	NC_010529	GCT	2	6	540594	540599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591831
11005	NC_010529	G	6	6	540605	540610	0 %	0 %	100 %	0 %	188591831
11006	NC_010529	GCT	2	6	540711	540716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591831
11007	NC_010529	ACG	2	6	540757	540762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591831
11008	NC_010529	CAT	2	6	540855	540860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591831
11009	NC_010529	GCG	2	6	540912	540917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591831
11010	NC_010529	AAG	2	6	540929	540934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_010529	AGC	2	6	541048	541053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11012	NC_010529	GCG	2	6	541116	541121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591832
11013	NC_010529	GCG	2	6	541173	541178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591832
11014	NC_010529	GCG	3	9	541286	541294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591832
11015	NC_010529	TGG	2	6	541311	541316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591832
11016	NC_010529	GCT	2	6	541327	541332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11017	NC_010529	TGC	2	6	541342	541347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11018	NC_010529	GCCGC	2	10	541461	541470	0 %	0 %	40 %	60 %	188591832
11019	NC_010529	GCT	2	6	541479	541484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11020	NC_010529	GCA	2	6	541499	541504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11021	NC_010529	GCA	2	6	541529	541534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11022	NC_010529	ACG	2	6	541540	541545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11023	NC_010529	CTG	2	6	541546	541551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11024	NC_010529	CGAT	2	8	541585	541592	25 %	25 %	25 %	25 %	188591832
11025	NC_010529	CCG	2	6	541593	541598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591832
11026	NC_010529	CCAA	2	8	541631	541638	50 %	0 %	0 %	50 %	188591832
11027	NC_010529	AGGC	2	8	541673	541680	25 %	0 %	50 %	25 %	188591832
11028	NC_010529	CGT	2	6	541689	541694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11029	NC_010529	CCGG	2	8	541746	541753	0 %	0 %	50 %	50 %	188591832
11030	NC_010529	TTG	2	6	541837	541842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591832
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11032	NC_010529	GCA	2	6	541888	541893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11033	NC_010529	CAC	2	6	541911	541916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591832
11034	NC_010529	GAGC	2	8	541931	541938	25 %	0 %	50 %	25 %	188591832
11035	NC_010529	GC	3	6	541951	541956	0 %	0 %	50 %	50 %	188591832
11036	NC_010529	GATA	2	8	542088	542095	50 %	25 %	25 %	0 %	188591832
11037	NC_010529	CG	3	6	542122	542127	0 %	0 %	50 %	50 %	188591832
11038	NC_010529	ACC	2	6	542153	542158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591832
11039	NC_010529	CGC	2	6	542199	542204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591832
11040	NC_010529	GGC	2	6	542219	542224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591832
11041	NC_010529	CGT	2	6	542242	542247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591832
11042	NC_010529	GAG	2	6	542378	542383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_010529	GCC	2	6	542400	542405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_010529	CAA	2	6	542518	542523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_010529	CGA	2	6	542653	542658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_010529	GCTT	2	8	542665	542672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_010529	GTAT	2	8	542687	542694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_010529	GCA	2	6	542800	542805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
11049	NC_010529	TCGA	2	8	542810	542817	25 %	25 %	25 %	25 %	188591833
11050	NC_010529	ACG	2	6	542855	542860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
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11052	NC_010529	AGGC	2	8	542950	542957	25 %	0 %	50 %	25 %	188591833
11053	NC_010529	GGC	2	6	542959	542964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591833
11054	NC_010529	GAA	2	6	542975	542980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591833
11055	NC_010529	GCAG	2	8	542983	542990	25 %	0 %	50 %	25 %	188591833
11056	NC_010529	CAG	2	6	542999	543004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
11057	NC_010529	GCC	2	6	543011	543016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591833
11058	NC_010529	GCA	2	6	543028	543033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
11059	NC_010529	TCG	2	6	543069	543074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591833
11060	NC_010529	GGCGCA	2	12	543091	543102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	188591833
11061	NC_010529	GCA	2	6	543154	543159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
11062	NC_010529	GCA	2	6	543187	543192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
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11064	NC_010529	GCA	2	6	543259	543264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
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11071	NC_010529	CAG	2	6	543578	543583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
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11073	NC_010529	CG	4	8	543613	543620	0 %	0 %	50 %	50 %	188591833
11074	NC_010529	CAG	3	9	543668	543676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591833
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11076	NC_010529	GGA	2	6	543807	543812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_010529	GAC	2	6	543837	543842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591834
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11080	NC_010529	AGCG	2	8	544029	544036	25 %	0 %	50 %	25 %	188591834
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11084	NC_010529	GGC	3	9	544118	544126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591834
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11086	NC_010529	CCGA	2	8	544204	544211	25 %	0 %	25 %	50 %	188591834
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11091	NC_010529	CGCGC	2	10	544355	544364	0 %	0 %	40 %	60 %	188591834
11092	NC_010529	CGG	2	6	544373	544378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591834
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11099	NC_010529	C	6	6	544521	544526	0 %	0 %	0 %	100 %	188591834
11100	NC_010529	CAG	2	6	544550	544555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591834
11101	NC_010529	GCGG	2	8	544584	544591	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_010529	AAG	2	6	544736	544741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591835
11103	NC_010529	GACG	2	8	544767	544774	25 %	0 %	50 %	25 %	188591835
11104	NC_010529	GTG	2	6	544844	544849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591835
11105	NC_010529	GTCG	2	8	544855	544862	0 %	25 %	50 %	25 %	188591835
11106	NC_010529	CGG	2	6	544951	544956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591835
11107	NC_010529	C	7	7	544964	544970	0 %	0 %	0 %	100 %	188591835
11108	NC_010529	GCC	2	6	545017	545022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591835
11109	NC_010529	GCC	2	6	545149	545154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591835
11110	NC_010529	GCC	2	6	545176	545181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591835
11111	NC_010529	GC	3	6	545319	545324	0 %	0 %	50 %	50 %	188591835
11112	NC_010529	GC	3	6	545394	545399	0 %	0 %	50 %	50 %	188591835
11113	NC_010529	AGC	2	6	545439	545444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591835
11114	NC_010529	AG	3	6	545451	545456	50 %	0 %	50 %	0 %	188591835
11115	NC_010529	GC	3	6	545469	545474	0 %	0 %	50 %	50 %	188591835
11116	NC_010529	A	6	6	545618	545623	100 %	0 %	0 %	0 %	188591835
11117	NC_010529	GCTC	2	8	545661	545668	0 %	25 %	25 %	50 %	188591835
11118	NC_010529	GCT	2	6	545815	545820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591835
11119	NC_010529	GCCGC	2	10	545836	545845	0 %	0 %	40 %	60 %	188591835
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11240	NC_010529	TCA	2	6	551502	551507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591842
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11242	NC_010529	CTAT	2	8	551627	551634	25 %	50 %	0 %	25 %	188591842
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11244	NC_010529	GCT	3	9	551706	551714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591842
11245	NC_010529	CGCC	2	8	551757	551764	0 %	0 %	25 %	75 %	188591842
11246	NC_010529	GATC	2	8	551793	551800	25 %	25 %	25 %	25 %	188591842
11247	NC_010529	GGC	2	6	551835	551840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591842
11248	NC_010529	AAG	2	6	551866	551871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591842
11249	NC_010529	GAG	2	6	551950	551955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591842
11250	NC_010529	AGA	2	6	551997	552002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591842
11251	NC_010529	CAT	2	6	552059	552064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591842
11252	NC_010529	GC	3	6	552113	552118	0 %	0 %	50 %	50 %	188591842
11253	NC_010529	TGA	2	6	552260	552265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591842
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11256	NC_010529	CGC	2	6	552445	552450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11257	NC_010529	TGA	2	6	552507	552512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11258	NC_010529	ACG	2	6	552535	552540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11260	NC_010529	GCT	2	6	552629	552634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591843
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11307	NC_010529	GGC	2	6	553928	553933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11333	NC_010529	CCCT	2	8	555201	555208	0 %	25 %	0 %	75 %	188591846
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11361	NC_010529	CTC	2	6	556242	556247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591846
11362	NC_010529	CGC	2	6	556347	556352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591846
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11364	NC_010529	CGA	2	6	556633	556638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591846
11365	NC_010529	ATC	2	6	556674	556679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591846
11366	NC_010529	TGAC	2	8	556690	556697	25 %	25 %	25 %	25 %	188591846
11367	NC_010529	GAA	2	6	556814	556819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591846
11368	NC_010529	CAG	2	6	556845	556850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591846
11369	NC_010529	GAC	2	6	556938	556943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591846
11370	NC_010529	AAG	2	6	556959	556964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591846
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