MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 11377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010529	CGGCG	2	10	317437	317446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6502	NC_010529	GTG	2	6	317508	317513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_010529	CG	3	6	317668	317673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6504	NC_010529	GCA	2	6	317683	317688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_010529	TTG	2	6	317712	317717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_010529	CAC	2	6	317720	317725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6507	NC_010529	GAA	2	6	317759	317764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_010529	CAC	2	6	317765	317770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_010529	TGA	2	6	317842	317847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_010529	CG	3	6	317914	317919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_010529	GAT	2	6	317930	317935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_010529	GTC	2	6	317939	317944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_010529	GGATC	2	10	317979	317988	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6514	NC_010529	TCGCGA	2	12	317999	318010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_010529	CGT	2	6	318033	318038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_010529	TTA	2	6	318053	318058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_010529	CGA	2	6	318245	318250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_010529	GAA	2	6	318351	318356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591617
6519	NC_010529	GCT	2	6	318389	318394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591617
6520	NC_010529	GGC	2	6	318534	318539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591617
6521	NC_010529	TCA	2	6	318541	318546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591617
6522	NC_010529	ACG	2	6	318615	318620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591617
6523	NC_010529	GT	3	6	318687	318692	0 %	50 %	50 %	0 %	188591617
6524	NC_010529	GGC	2	6	318817	318822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591617
6525	NC_010529	GC	3	6	319007	319012	0 %	0 %	50 %	50 %	188591617
6526	NC_010529	TGG	2	6	319031	319036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591617
6527	NC_010529	AGG	2	6	319223	319228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591617
6528	NC_010529	GCT	2	6	319284	319289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591617
6529	NC_010529	AGG	2	6	319334	319339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591617
6530	NC_010529	GAA	2	6	319368	319373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591617
6531	NC_010529	AAAG	2	8	319390	319397	75 %	0 %	25 %	0 %	188591617
6532	NC_010529	GC	3	6	319447	319452	0 %	0 %	50 %	50 %	188591617
6533	NC_010529	CAT	2	6	319488	319493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591617
6534	NC_010529	TGG	2	6	319500	319505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591617
6535	NC_010529	TCA	2	6	319566	319571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591617
6536	NC_010529	GA	3	6	319610	319615	50 %	0 %	50 %	0 %	188591617
6537	NC_010529	GCC	2	6	319737	319742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_010529	GGC	2	6	319773	319778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_010529	GAG	2	6	319792	319797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_010529	AGCC	2	8	319858	319865	25 %	0 %	25 %	50 %	188591618
6541	NC_010529	CGT	2	6	319937	319942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591618
6542	NC_010529	TGG	2	6	320252	320257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591618
6543	NC_010529	CTGC	2	8	320284	320291	0 %	25 %	25 %	50 %	188591618
6544	NC_010529	CGC	2	6	320333	320338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591618
6545	NC_010529	GAA	2	6	320347	320352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591618
6546	NC_010529	AAT	2	6	320388	320393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591618
6547	NC_010529	TGGCG	2	10	320440	320449	0 %	20 %	60 %	20 %	188591618
6548	NC_010529	GCT	2	6	320485	320490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591618
6549	NC_010529	TCT	2	6	320497	320502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591618
6550	NC_010529	CGAT	2	8	320610	320617	25 %	25 %	25 %	25 %	188591618
6551	NC_010529	TCG	2	6	320667	320672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591618
6552	NC_010529	AAC	2	6	320681	320686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591618
6553	NC_010529	G	6	6	320721	320726	0 %	0 %	100 %	0 %	188591618
6554	NC_010529	CTG	2	6	320779	320784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591618
6555	NC_010529	AGT	2	6	320862	320867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591618
6556	NC_010529	TCAC	2	8	320921	320928	25 %	25 %	0 %	50 %	188591618
6557	NC_010529	GCC	2	6	320936	320941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591618
6558	NC_010529	TGATC	2	10	321155	321164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6559	NC_010529	TCC	2	6	321173	321178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_010529	TGGG	2	8	321261	321268	0 %	25 %	75 %	0 %	188591619
6561	NC_010529	GCC	2	6	321298	321303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591619
6562	NC_010529	CGC	2	6	321417	321422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591619
6563	NC_010529	CG	3	6	321441	321446	0 %	0 %	50 %	50 %	188591619
6564	NC_010529	GTT	2	6	321448	321453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591619
6565	NC_010529	AGG	2	6	321521	321526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591619
6566	NC_010529	CGC	2	6	321539	321544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591619
6567	NC_010529	AAGG	2	8	321555	321562	50 %	0 %	50 %	0 %	188591619
6568	NC_010529	AAG	2	6	321568	321573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591619
6569	NC_010529	GAC	2	6	321604	321609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591619
6570	NC_010529	AAT	2	6	321619	321624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591619
6571	NC_010529	TCC	2	6	321651	321656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591619
6572	NC_010529	CAA	2	6	321716	321721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591619
6573	NC_010529	CGC	2	6	321849	321854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591619
6574	NC_010529	CCG	2	6	321875	321880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591619
6575	NC_010529	ATC	2	6	321987	321992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591620
6576	NC_010529	GT	4	8	322023	322030	0 %	50 %	50 %	0 %	188591620
6577	NC_010529	CG	3	6	322032	322037	0 %	0 %	50 %	50 %	188591620
6578	NC_010529	TTGG	2	8	322049	322056	0 %	50 %	50 %	0 %	188591620
6579	NC_010529	GAG	3	9	322106	322114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591620
6580	NC_010529	GAA	2	6	322120	322125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591620
6581	NC_010529	A	7	7	322189	322195	100 %	0 %	0 %	0 %	188591620
6582	NC_010529	ACGC	2	8	322202	322209	25 %	0 %	25 %	50 %	188591620
6583	NC_010529	GAC	3	9	322277	322285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591621
6584	NC_010529	TCG	2	6	322316	322321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591621
6585	NC_010529	AGGA	2	8	322329	322336	50 %	0 %	50 %	0 %	188591621
6586	NC_010529	ATA	2	6	322355	322360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591621
6587	NC_010529	GCT	2	6	322387	322392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591621
6588	NC_010529	GAA	2	6	322484	322489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591621
6589	NC_010529	CTTG	2	8	322498	322505	0 %	50 %	25 %	25 %	188591621
6590	NC_010529	A	6	6	322807	322812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_010529	CGAG	2	8	322905	322912	25 %	0 %	50 %	25 %	188591622
6592	NC_010529	TGT	2	6	322942	322947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591622
6593	NC_010529	TCA	2	6	322972	322977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591622
6594	NC_010529	CAAT	2	8	323103	323110	50 %	25 %	0 %	25 %	188591622
6595	NC_010529	GC	3	6	323126	323131	0 %	0 %	50 %	50 %	188591622
6596	NC_010529	AGC	2	6	323132	323137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591622
6597	NC_010529	GCTT	2	8	323186	323193	0 %	50 %	25 %	25 %	188591622
6598	NC_010529	GGT	2	6	323217	323222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591622
6599	NC_010529	GGAA	2	8	323233	323240	50 %	0 %	50 %	0 %	188591622
6600	NC_010529	GTC	2	6	323247	323252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591622
6601	NC_010529	TGC	2	6	323329	323334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591622
6602	NC_010529	A	6	6	323336	323341	100 %	0 %	0 %	0 %	188591622
6603	NC_010529	TTC	2	6	323374	323379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591622
6604	NC_010529	TC	3	6	323378	323383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_010529	CCG	2	6	323435	323440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6606	NC_010529	CAT	2	6	323464	323469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_010529	AAG	2	6	323471	323476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_010529	GAA	2	6	323538	323543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_010529	ATT	2	6	323552	323557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_010529	GCA	2	6	323570	323575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_010529	TCATT	2	10	323592	323601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6612	NC_010529	CCTA	2	8	323844	323851	25 %	25 %	0 %	50 %	188591623
6613	NC_010529	TTC	2	6	323883	323888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591623
6614	NC_010529	AAG	2	6	323945	323950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591624
6615	NC_010529	GAT	2	6	323984	323989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591624
6616	NC_010529	T	6	6	323996	324001	0 %	100 %	0 %	0 %	188591624
6617	NC_010529	CGT	2	6	324002	324007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591624
6618	NC_010529	ATC	2	6	324030	324035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591624
6619	NC_010529	TGC	2	6	324041	324046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591624
6620	NC_010529	CGT	2	6	324068	324073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591624
6621	NC_010529	GGA	2	6	324094	324099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591624
6622	NC_010529	GC	3	6	324154	324159	0 %	0 %	50 %	50 %	188591624
6623	NC_010529	CAG	2	6	324226	324231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591624
6624	NC_010529	GGC	2	6	324235	324240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591624
6625	NC_010529	GTC	2	6	324243	324248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591624
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6995	NC_010529	CCT	2	6	344661	344666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6996	NC_010529	ATC	2	6	344703	344708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591642
6997	NC_010529	CGG	2	6	344742	344747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591642
6998	NC_010529	TGCC	2	8	344761	344768	0 %	25 %	25 %	50 %	188591642
6999	NC_010529	GCG	2	6	344843	344848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591642
7000	NC_010529	TTCCAT	2	12	344882	344893	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188591642

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