MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 114465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_010520	TAA	2	6	19168	19173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758506
503	NC_010520	A	7	7	19188	19194	100 %	0 %	0 %	0 %	170758506
504	NC_010520	AT	3	6	19239	19244	50 %	50 %	0 %	0 %	170758506
505	NC_010520	ATA	2	6	19248	19253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758506
506	NC_010520	TAAAA	2	10	19254	19263	80 %	20 %	0 %	0 %	170758506
507	NC_010520	ATA	2	6	19267	19272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010520	TAAT	2	8	19277	19284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010520	T	6	6	19327	19332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010520	ATA	2	6	19357	19362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010520	TA	3	6	19367	19372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010520	AATT	2	8	19376	19383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010520	A	7	7	19407	19413	100 %	0 %	0 %	0 %	170761569
514	NC_010520	TA	3	6	19417	19422	50 %	50 %	0 %	0 %	170761569
515	NC_010520	TTG	2	6	19423	19428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170761569
516	NC_010520	ATT	3	9	19442	19450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761569
517	NC_010520	TACA	2	8	19465	19472	50 %	25 %	0 %	25 %	170761569
518	NC_010520	AAGA	2	8	19473	19480	75 %	0 %	25 %	0 %	170761569
519	NC_010520	TAA	2	6	19493	19498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761569
520	NC_010520	AAAT	2	8	19519	19526	75 %	25 %	0 %	0 %	170761569
521	NC_010520	GAAAT	2	10	19543	19552	60 %	20 %	20 %	0 %	170761569
522	NC_010520	A	7	7	19581	19587	100 %	0 %	0 %	0 %	170761569
523	NC_010520	TTA	2	6	19589	19594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761569
524	NC_010520	TA	3	6	19593	19598	50 %	50 %	0 %	0 %	170761569
525	NC_010520	AATAAA	2	12	19599	19610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170761569
526	NC_010520	TAT	2	6	19648	19653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761569
527	NC_010520	ATT	2	6	19654	19659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761569
528	NC_010520	GAT	2	6	19668	19673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761569
529	NC_010520	AT	4	8	19703	19710	50 %	50 %	0 %	0 %	170761569
530	NC_010520	GAA	2	6	19716	19721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761569
531	NC_010520	GAA	2	6	19732	19737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761569
532	NC_010520	GGAT	2	8	19740	19747	25 %	25 %	50 %	0 %	170761569
533	NC_010520	A	8	8	19749	19756	100 %	0 %	0 %	0 %	170761569
534	NC_010520	ATA	2	6	19854	19859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761569
535	NC_010520	T	6	6	19921	19926	0 %	100 %	0 %	0 %	170761569
536	NC_010520	GGT	2	6	19974	19979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170761569
537	NC_010520	ATATT	2	10	19982	19991	40 %	60 %	0 %	0 %	170761569
538	NC_010520	T	6	6	19995	20000	0 %	100 %	0 %	0 %	170761569
539	NC_010520	ATT	2	6	20005	20010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761569
540	NC_010520	ATTC	2	8	20013	20020	25 %	50 %	0 %	25 %	170761569
541	NC_010520	TAATA	2	10	20042	20051	60 %	40 %	0 %	0 %	170761569
542	NC_010520	GAA	3	9	20052	20060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170761569
543	NC_010520	GGA	2	6	20111	20116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170761569
544	NC_010520	TA	3	6	20128	20133	50 %	50 %	0 %	0 %	170761569
545	NC_010520	TAA	2	6	20144	20149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761569
546	NC_010520	TAA	2	6	20155	20160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761569
547	NC_010520	ATT	2	6	20167	20172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761569
548	NC_010520	GA	3	6	20179	20184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010520	A	6	6	20194	20199	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
550	NC_010520	ATG	2	6	20206	20211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
551	NC_010520	TGA	2	6	20212	20217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
552	NC_010520	AAT	2	6	20231	20236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760698
553	NC_010520	GAT	2	6	20313	20318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
554	NC_010520	ATG	2	6	20347	20352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
555	NC_010520	GAT	2	6	20367	20372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
556	NC_010520	AGC	2	6	20375	20380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170760698
557	NC_010520	TAA	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760698
558	NC_010520	A	7	7	20445	20451	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
559	NC_010520	TAA	2	6	20461	20466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760698
560	NC_010520	TA	3	6	20488	20493	50 %	50 %	0 %	0 %	170760698
561	NC_010520	A	6	6	20511	20516	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
562	NC_010520	A	6	6	20534	20539	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
563	NC_010520	A	6	6	20569	20574	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
564	NC_010520	AGA	2	6	20702	20707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760698
565	NC_010520	TAA	2	6	20756	20761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760698
566	NC_010520	TGA	2	6	20801	20806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
567	NC_010520	AT	3	6	20817	20822	50 %	50 %	0 %	0 %	170760698
568	NC_010520	A	7	7	20844	20850	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
569	NC_010520	ATT	2	6	20860	20865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170760698
570	NC_010520	A	7	7	20875	20881	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
571	NC_010520	TAA	2	6	20897	20902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760698
572	NC_010520	TAG	2	6	20905	20910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
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574	NC_010520	A	8	8	20936	20943	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
575	NC_010520	GTA	2	6	20968	20973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760698
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582	NC_010520	TA	3	6	21186	21191	50 %	50 %	0 %	0 %	170760698
583	NC_010520	TAGT	2	8	21214	21221	25 %	50 %	25 %	0 %	170760698
584	NC_010520	AAAG	2	8	21239	21246	75 %	0 %	25 %	0 %	170760698
585	NC_010520	ATT	2	6	21268	21273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170760698
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589	NC_010520	AAG	2	6	21431	21436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760698
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592	NC_010520	AAAT	2	8	21512	21519	75 %	25 %	0 %	0 %	170760698
593	NC_010520	A	6	6	21545	21550	100 %	0 %	0 %	0 %	170760698
594	NC_010520	AATTT	2	10	21590	21599	40 %	60 %	0 %	0 %	170760698
595	NC_010520	AGG	2	6	21600	21605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_010520	A	6	6	21646	21651	100 %	0 %	0 %	0 %	170759414
598	NC_010520	TAA	2	6	21738	21743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759414
599	NC_010520	TAC	2	6	21759	21764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170759414
600	NC_010520	GTTA	2	8	21765	21772	25 %	50 %	25 %	0 %	170759414
601	NC_010520	AGT	2	6	21811	21816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759414
602	NC_010520	ATA	2	6	21937	21942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759414
603	NC_010520	TTA	2	6	22024	22029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_010520	AAC	2	6	22118	22123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_010520	AG	3	6	22188	22193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010520	T	7	7	22260	22266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010520	AGG	2	6	22295	22300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010520	TATT	2	8	22304	22311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010520	AATA	2	8	22321	22328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010520	AAT	2	6	22360	22365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760371
612	NC_010520	AAG	2	6	22379	22384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760371
613	NC_010520	TGA	2	6	22425	22430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760371
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615	NC_010520	AGA	2	6	22453	22458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760371
616	NC_010520	TCT	2	6	22507	22512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170760371
617	NC_010520	CTAAA	2	10	22520	22529	60 %	20 %	0 %	20 %	170760371
618	NC_010520	A	7	7	22527	22533	100 %	0 %	0 %	0 %	170760371
619	NC_010520	TAG	2	6	22556	22561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760371
620	NC_010520	TGAAA	2	10	22563	22572	60 %	20 %	20 %	0 %	170760371
621	NC_010520	AGA	2	6	22581	22586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170760371
622	NC_010520	TAC	2	6	22602	22607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170760371
623	NC_010520	A	6	6	22625	22630	100 %	0 %	0 %	0 %	170760371
624	NC_010520	AT	3	6	22635	22640	50 %	50 %	0 %	0 %	170760371
625	NC_010520	ATA	2	6	22700	22705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760371
626	NC_010520	CAA	2	6	22730	22735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170760371
627	NC_010520	ACC	2	6	22926	22931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170760371
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631	NC_010520	TGA	2	6	23082	23087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760371
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