MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 4460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	TAAAT	2	10	3631	3640	60 %	40 %	0 %	0 %	170755060
2	NC_010516	TAAAA	2	10	4111	4120	80 %	20 %	0 %	0 %	170755060
3	NC_010516	ACTTT	2	10	5955	5964	20 %	60 %	0 %	20 %	170756292
4	NC_010516	AAGAT	2	10	6343	6352	60 %	20 %	20 %	0 %	170756292
5	NC_010516	TAAAA	2	10	6996	7005	80 %	20 %	0 %	0 %	170756835
6	NC_010516	CATAA	2	10	9536	9545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010516	GGTAA	2	10	9614	9623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010516	TCGTG	2	10	10405	10414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010516	TAAGT	2	10	12081	12090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010516	AAAAT	2	10	13932	13941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010516	AAATT	2	10	14666	14675	60 %	40 %	0 %	0 %	170757636
12	NC_010516	AATAA	2	10	15404	15413	80 %	20 %	0 %	0 %	170754952
13	NC_010516	ATATA	2	10	15782	15791	60 %	40 %	0 %	0 %	170756030
14	NC_010516	TTTTA	2	10	16344	16353	20 %	80 %	0 %	0 %	170756030
15	NC_010516	AATAA	2	10	16693	16702	80 %	20 %	0 %	0 %	170756130
16	NC_010516	TTATT	2	10	17136	17145	20 %	80 %	0 %	0 %	170756130
17	NC_010516	TATAA	2	10	17782	17791	60 %	40 %	0 %	0 %	170756130
18	NC_010516	CAAAG	2	10	18571	18580	60 %	0 %	20 %	20 %	170756130
19	NC_010516	TAATG	2	10	18756	18765	40 %	40 %	20 %	0 %	170756130
20	NC_010516	TAAAA	2	10	19304	19313	80 %	20 %	0 %	0 %	170756130
21	NC_010516	GAAAT	2	10	19593	19602	60 %	20 %	20 %	0 %	170757148
22	NC_010516	ATATT	2	10	20032	20041	40 %	60 %	0 %	0 %	170757148
23	NC_010516	TAATA	2	10	20092	20101	60 %	40 %	0 %	0 %	170757148
24	NC_010516	AATTT	2	10	21640	21649	40 %	60 %	0 %	0 %	170754524
25	NC_010516	ATTAT	2	10	22317	22326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010516	TTTAA	2	10	23701	23710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010516	ATTAA	2	10	23721	23730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010516	TATTT	2	10	23793	23802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010516	TTTTA	2	10	26455	26464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010516	AATTA	2	10	26552	26561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010516	ATATT	2	10	26633	26642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010516	TTAAT	2	10	27046	27055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010516	AATAA	2	10	27936	27945	80 %	20 %	0 %	0 %	170756254
34	NC_010516	TATGT	2	10	28765	28774	20 %	60 %	20 %	0 %	170757006
35	NC_010516	TTATT	2	10	28883	28892	20 %	80 %	0 %	0 %	170756206
36	NC_010516	GGATT	2	10	29086	29095	20 %	40 %	40 %	0 %	170756206
37	NC_010516	ATTAT	2	10	29876	29885	40 %	60 %	0 %	0 %	170755918
38	NC_010516	ATTTT	2	10	30386	30395	20 %	80 %	0 %	0 %	170755918
39	NC_010516	ATAAG	2	10	31602	31611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010516	TAATT	2	10	32561	32570	40 %	60 %	0 %	0 %	170754592
41	NC_010516	ATTTT	2	10	33390	33399	20 %	80 %	0 %	0 %	170756726
42	NC_010516	TAAAT	2	10	33728	33737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010516	ATATA	2	10	34015	34024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010516	AATAA	2	10	35584	35593	80 %	20 %	0 %	0 %	170754513
45	NC_010516	AAAAT	2	10	37192	37201	80 %	20 %	0 %	0 %	170755371
46	NC_010516	AATAC	2	10	37284	37293	60 %	20 %	0 %	20 %	170755371
47	NC_010516	ATATT	2	10	37623	37632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010516	AATAA	2	10	37681	37690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010516	GATTT	2	10	38700	38709	20 %	60 %	20 %	0 %	170754521
50	NC_010516	TAATA	2	10	41233	41242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010516	GAATA	2	10	41320	41329	60 %	20 %	20 %	0 %	170756047
52	NC_010516	TTATT	2	10	41336	41345	20 %	80 %	0 %	0 %	170756047
53	NC_010516	ATAAA	2	10	41715	41724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010516	GATTT	2	10	42070	42079	20 %	60 %	20 %	0 %	170755512
55	NC_010516	AAAAG	2	10	42329	42338	80 %	0 %	20 %	0 %	170755512
56	NC_010516	TTGTA	2	10	42594	42603	20 %	60 %	20 %	0 %	170754535
57	NC_010516	ATAGA	2	10	43992	44001	60 %	20 %	20 %	0 %	170757635
58	NC_010516	GCAAT	2	10	44649	44658	40 %	20 %	20 %	20 %	170757635
59	NC_010516	AAAGA	2	10	44666	44675	80 %	0 %	20 %	0 %	170757635
60	NC_010516	AGTAT	2	10	45675	45684	40 %	40 %	20 %	0 %	170755970
61	NC_010516	TTAAT	2	10	46712	46721	40 %	60 %	0 %	0 %	170757165
62	NC_010516	ATTGT	2	10	47895	47904	20 %	60 %	20 %	0 %	170754943
63	NC_010516	ATAGA	2	10	48000	48009	60 %	20 %	20 %	0 %	170754943
64	NC_010516	GGTAA	2	10	48787	48796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010516	TCGTG	2	10	49578	49587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010516	TAAGT	2	10	51318	51327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010516	AAAAT	2	10	53169	53178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010516	AATAA	2	10	53827	53836	80 %	20 %	0 %	0 %	170757429
69	NC_010516	GAATA	2	10	54178	54187	60 %	20 %	20 %	0 %	170757429
70	NC_010516	GGTAA	2	10	55394	55403	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010516	TCGTG	2	10	56185	56194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010516	TAAGT	2	10	57925	57934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010516	AAAAT	2	10	59776	59785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010516	TTATA	2	10	60328	60337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010516	GGTAA	2	10	63315	63324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010516	TCGTG	2	10	64106	64115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010516	TAAGT	2	10	65782	65791	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010516	AAAAT	2	10	67633	67642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010516	TGATT	2	10	67968	67977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010516	TAAAT	2	10	68212	68221	60 %	40 %	0 %	0 %	170754737
81	NC_010516	AAGAA	2	10	68711	68720	80 %	0 %	20 %	0 %	170756457
82	NC_010516	GTATA	2	10	69290	69299	40 %	40 %	20 %	0 %	170754427
83	NC_010516	TTATA	2	10	69362	69371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010516	CATAA	2	10	70179	70188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010516	GGTAA	2	10	70257	70266	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010516	TCGTG	2	10	71048	71057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010516	TAAGT	2	10	72788	72797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010516	AAAAT	2	10	74639	74648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010516	GAAGA	2	10	75146	75155	60 %	0 %	40 %	0 %	170757604
90	NC_010516	AAATA	2	10	75764	75773	80 %	20 %	0 %	0 %	170757604
91	NC_010516	ATTAT	2	10	75887	75896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010516	GGTAA	2	10	76539	76548	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010516	TCGTG	2	10	77330	77339	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010516	TAAGT	2	10	79006	79015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010516	AAAAT	2	10	80857	80866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010516	TTGAA	2	10	82205	82214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010516	CAATC	2	10	82356	82365	40 %	20 %	0 %	40 %	170754739
98	NC_010516	TTATT	2	10	84633	84642	20 %	80 %	0 %	0 %	170756307
99	NC_010516	ATTTT	2	10	84650	84659	20 %	80 %	0 %	0 %	170756307
100	NC_010516	ATTTT	2	10	85003	85012	20 %	80 %	0 %	0 %	170756307
101	NC_010516	AAAAT	2	10	85037	85046	80 %	20 %	0 %	0 %	170756307
102	NC_010516	ATTTT	2	10	85733	85742	20 %	80 %	0 %	0 %	170757359
103	NC_010516	GAATA	2	10	86292	86301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010516	TATAA	2	10	87870	87879	60 %	40 %	0 %	0 %	170757865
105	NC_010516	AAAAG	2	10	88657	88666	80 %	0 %	20 %	0 %	170755522
106	NC_010516	TAAAT	2	10	89720	89729	60 %	40 %	0 %	0 %	170756340
107	NC_010516	TAAAT	2	10	90513	90522	60 %	40 %	0 %	0 %	170757341
108	NC_010516	TAGAA	2	10	90642	90651	60 %	20 %	20 %	0 %	170757341
109	NC_010516	ATGGA	2	10	92455	92464	40 %	20 %	40 %	0 %	170756863
110	NC_010516	AGGAT	2	10	92951	92960	40 %	20 %	40 %	0 %	170754439
111	NC_010516	AAAGA	2	10	93939	93948	80 %	0 %	20 %	0 %	170755254
112	NC_010516	AAGAA	2	10	94064	94073	80 %	0 %	20 %	0 %	170755254
113	NC_010516	ATTTA	2	10	95034	95043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010516	TACAA	2	10	95292	95301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010516	TTTAA	2	10	95700	95709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010516	AAGTT	2	10	96594	96603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010516	TATAA	2	10	99150	99159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010516	ATTTT	2	10	100220	100229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010516	ATTTA	2	10	100422	100431	40 %	60 %	0 %	0 %	170757565
120	NC_010516	TAATA	2	10	100692	100701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010516	TAATA	2	10	101877	101886	60 %	40 %	0 %	0 %	170754593
122	NC_010516	ATATT	2	10	104061	104070	40 %	60 %	0 %	0 %	170756172
123	NC_010516	AGAAA	2	10	106561	106570	80 %	0 %	20 %	0 %	170755122
124	NC_010516	AAAAC	2	10	106606	106615	80 %	0 %	0 %	20 %	170755122
125	NC_010516	AAATT	2	10	107706	107715	60 %	40 %	0 %	0 %	170757504
126	NC_010516	AAATG	2	10	107974	107983	60 %	20 %	20 %	0 %	170757504
127	NC_010516	GAAGT	2	10	108987	108996	40 %	20 %	40 %	0 %	170756516
128	NC_010516	GAAAA	2	10	110552	110561	80 %	0 %	20 %	0 %	170757578
129	NC_010516	AAAAT	2	10	116047	116056	80 %	20 %	0 %	0 %	170757557
130	NC_010516	ATAAA	2	10	116137	116146	80 %	20 %	0 %	0 %	170757557
131	NC_010516	ATTTA	2	10	117024	117033	40 %	60 %	0 %	0 %	170757668
132	NC_010516	GTTAT	2	10	119635	119644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010516	GAAAT	2	10	120335	120344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010516	ATTTT	2	10	121376	121385	20 %	80 %	0 %	0 %	170754242
135	NC_010516	ATACA	2	10	121893	121902	60 %	20 %	0 %	20 %	170755520
136	NC_010516	AATAT	2	10	122197	122206	60 %	40 %	0 %	0 %	170755520
137	NC_010516	TAAAA	2	10	122489	122498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010516	AAGAA	2	10	123462	123471	80 %	0 %	20 %	0 %	170756294
139	NC_010516	TAATA	2	10	123750	123759	60 %	40 %	0 %	0 %	170756294
140	NC_010516	AGAGA	2	10	123784	123793	60 %	0 %	40 %	0 %	170756294
141	NC_010516	TAAAT	2	10	124374	124383	60 %	40 %	0 %	0 %	170756294
142	NC_010516	TTCTA	2	10	125662	125671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010516	AATTC	2	10	126713	126722	40 %	40 %	0 %	20 %	170757315
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