MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 113260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	GGA	2	6	25	30	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010516	AATA	2	8	73	80	75 %	25 %	0 %	0 %	170756151
3	NC_010516	AAGT	2	8	102	109	50 %	25 %	25 %	0 %	170756151
4	NC_010516	AAT	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
5	NC_010516	TTAC	2	8	242	249	25 %	50 %	0 %	25 %	170756151
6	NC_010516	A	7	7	253	259	100 %	0 %	0 %	0 %	170756151
7	NC_010516	ACT	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
8	NC_010516	GAA	2	6	287	292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
9	NC_010516	A	6	6	291	296	100 %	0 %	0 %	0 %	170756151
10	NC_010516	A	7	7	300	306	100 %	0 %	0 %	0 %	170756151
11	NC_010516	ATA	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
12	NC_010516	ATG	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
13	NC_010516	CTA	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
14	NC_010516	GCA	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170756151
15	NC_010516	TAGCAG	2	12	429	440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170756151
16	NC_010516	TTTA	2	8	466	473	25 %	75 %	0 %	0 %	170756151
17	NC_010516	TA	3	6	472	477	50 %	50 %	0 %	0 %	170756151
18	NC_010516	TGG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170756151
19	NC_010516	ATGC	2	8	509	516	25 %	25 %	25 %	25 %	170756151
20	NC_010516	TA	3	6	527	532	50 %	50 %	0 %	0 %	170756151
21	NC_010516	AGT	2	6	556	561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
22	NC_010516	TCT	2	6	569	574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170756151
23	NC_010516	AATT	3	12	591	602	50 %	50 %	0 %	0 %	170756151
24	NC_010516	GAT	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
25	NC_010516	AAAT	2	8	634	641	75 %	25 %	0 %	0 %	170756151
26	NC_010516	TGA	2	6	667	672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
27	NC_010516	AGAA	2	8	694	701	75 %	0 %	25 %	0 %	170756151
28	NC_010516	AACA	2	8	746	753	75 %	0 %	0 %	25 %	170756151
29	NC_010516	AAT	2	6	754	759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
30	NC_010516	TACC	2	8	789	796	25 %	25 %	0 %	50 %	170756151
31	NC_010516	AGA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
32	NC_010516	A	6	6	887	892	100 %	0 %	0 %	0 %	170756151
33	NC_010516	TA	4	8	933	940	50 %	50 %	0 %	0 %	170756151
34	NC_010516	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
35	NC_010516	TAG	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
36	NC_010516	TCA	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
37	NC_010516	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
38	NC_010516	AAG	2	6	1107	1112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
39	NC_010516	TAT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170756151
40	NC_010516	AGA	2	6	1141	1146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
41	NC_010516	AGA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
42	NC_010516	GAA	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
43	NC_010516	TAC	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
44	NC_010516	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
45	NC_010516	A	7	7	1312	1318	100 %	0 %	0 %	0 %	170756151
46	NC_010516	TAAA	2	8	1350	1357	75 %	25 %	0 %	0 %	170756151
47	NC_010516	AAAAAT	2	12	1368	1379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170756151
48	NC_010516	TAA	2	6	1396	1401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010516	TTAT	2	8	1406	1413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010516	TTG	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010516	ATT	2	6	1492	1497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010516	TTA	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010516	CAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010516	CTA	6	18	1558	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010516	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010516	TCTATT	2	12	1589	1600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010516	TAA	2	6	1618	1623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010516	AGG	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010516	A	7	7	1654	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	170757193
60	NC_010516	TAT	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
61	NC_010516	TTA	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
62	NC_010516	TAA	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
63	NC_010516	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
64	NC_010516	ATA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
65	NC_010516	AAAT	2	8	1897	1904	75 %	25 %	0 %	0 %	170757193
66	NC_010516	AGA	2	6	1910	1915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
67	NC_010516	ATA	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
68	NC_010516	AT	4	8	1959	1966	50 %	50 %	0 %	0 %	170757193
69	NC_010516	TAT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
70	NC_010516	A	6	6	2039	2044	100 %	0 %	0 %	0 %	170757193
71	NC_010516	TAG	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757193
72	NC_010516	AAG	2	6	2171	2176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
73	NC_010516	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170757193
74	NC_010516	GATAAT	2	12	2187	2198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757193
75	NC_010516	AGA	3	9	2252	2260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
76	NC_010516	TTTA	2	8	2300	2307	25 %	75 %	0 %	0 %	170757193
77	NC_010516	AAT	2	6	2324	2329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
78	NC_010516	ATT	2	6	2336	2341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
79	NC_010516	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
80	NC_010516	GAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
81	NC_010516	ATA	2	6	2397	2402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
82	NC_010516	CT	3	6	2441	2446	0 %	50 %	0 %	50 %	170757193
83	NC_010516	AAG	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
84	NC_010516	GAT	2	6	2493	2498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757193
85	NC_010516	TAA	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
86	NC_010516	GAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
87	NC_010516	AGT	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757193
88	NC_010516	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
89	NC_010516	A	6	6	2678	2683	100 %	0 %	0 %	0 %	170757193
90	NC_010516	AAT	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
91	NC_010516	AATT	2	8	2774	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	170757697
92	NC_010516	ATA	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757697
93	NC_010516	TTCT	2	8	2801	2808	0 %	75 %	0 %	25 %	170757697
94	NC_010516	CAA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170757697
95	NC_010516	T	6	6	2850	2855	0 %	100 %	0 %	0 %	170757697
96	NC_010516	AAGTTA	2	12	2869	2880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757697
97	NC_010516	A	6	6	2893	2898	100 %	0 %	0 %	0 %	170757697
98	NC_010516	GAC	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170757697
99	NC_010516	TAA	2	6	2939	2944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757697
100	NC_010516	ATT	2	6	2958	2963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757697
101	NC_010516	TA	3	6	2972	2977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010516	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010516	A	6	6	2998	3003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010516	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010516	TAAT	2	8	3014	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010516	TA	3	6	3038	3043	50 %	50 %	0 %	0 %	170755060
107	NC_010516	A	6	6	3043	3048	100 %	0 %	0 %	0 %	170755060
108	NC_010516	TAA	2	6	3057	3062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
109	NC_010516	ATG	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755060
110	NC_010516	CAAATA	2	12	3102	3113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170755060
111	NC_010516	TAA	2	6	3124	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
112	NC_010516	TA	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	170755060
113	NC_010516	ATAAAG	2	12	3198	3209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170755060
114	NC_010516	ATA	2	6	3231	3236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
115	NC_010516	AT	3	6	3291	3296	50 %	50 %	0 %	0 %	170755060
116	NC_010516	A	6	6	3308	3313	100 %	0 %	0 %	0 %	170755060
117	NC_010516	TAAA	2	8	3324	3331	75 %	25 %	0 %	0 %	170755060
118	NC_010516	ATAAAA	2	12	3332	3343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170755060
119	NC_010516	A	8	8	3340	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	170755060
120	NC_010516	TGT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170755060
121	NC_010516	AGA	2	6	3391	3396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755060
122	NC_010516	AAT	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
123	NC_010516	TAT	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170755060
124	NC_010516	ATA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
125	NC_010516	GAAA	2	8	3512	3519	75 %	0 %	25 %	0 %	170755060
126	NC_010516	A	6	6	3529	3534	100 %	0 %	0 %	0 %	170755060
127	NC_010516	ATG	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755060
128	NC_010516	AG	3	6	3610	3615	50 %	0 %	50 %	0 %	170755060
129	NC_010516	TAAAT	2	10	3631	3640	60 %	40 %	0 %	0 %	170755060
130	NC_010516	ATT	2	6	3641	3646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170755060
131	NC_010516	AAG	2	6	3662	3667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755060
132	NC_010516	AGA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755060
133	NC_010516	ATA	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
134	NC_010516	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170755060
135	NC_010516	A	7	7	3769	3775	100 %	0 %	0 %	0 %	170755060
136	NC_010516	GA	3	6	3782	3787	50 %	0 %	50 %	0 %	170755060
137	NC_010516	GAT	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755060
138	NC_010516	AAGT	2	8	3825	3832	50 %	25 %	25 %	0 %	170755060
139	NC_010516	ACA	2	6	3871	3876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170755060
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271	NC_010516	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756835
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