MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 33777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_010482	TCCG	2	8	1556373	1556380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33002	NC_010482	GGT	2	6	1556424	1556429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33003	NC_010482	AGT	2	6	1556454	1556459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291190
33004	NC_010482	GCT	2	6	1556491	1556496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170291190
33005	NC_010482	TGA	2	6	1556629	1556634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291190
33006	NC_010482	TGG	2	6	1556690	1556695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170291190
33007	NC_010482	GAA	2	6	1556791	1556796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291190
33008	NC_010482	GAC	2	6	1556860	1556865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291190
33009	NC_010482	CGGT	2	8	1556883	1556890	0 %	25 %	50 %	25 %	170291190
33010	NC_010482	GAA	2	6	1556899	1556904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291190
33011	NC_010482	GGT	2	6	1556909	1556914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33012	NC_010482	GAA	2	6	1556941	1556946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291191
33013	NC_010482	GGA	2	6	1556986	1556991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291191
33014	NC_010482	TTA	2	6	1557010	1557015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170291191
33015	NC_010482	GGA	2	6	1557042	1557047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291191
33016	NC_010482	GAA	2	6	1557061	1557066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291191
33017	NC_010482	AGG	2	6	1557071	1557076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291191
33018	NC_010482	GCT	2	6	1557095	1557100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170291191
33019	NC_010482	AAT	2	6	1557130	1557135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291191
33020	NC_010482	AAG	2	6	1557137	1557142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291191
33021	NC_010482	GGAGA	2	10	1557217	1557226	40 %	0 %	60 %	0 %	170291191
33022	NC_010482	GGA	2	6	1557243	1557248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291191
33023	NC_010482	AGG	2	6	1557317	1557322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291191
33024	NC_010482	AGG	3	9	1557354	1557362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291191
33025	NC_010482	AGG	2	6	1557405	1557410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291191
33026	NC_010482	GAT	2	6	1557414	1557419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291191
33027	NC_010482	ACGAT	2	10	1557473	1557482	40 %	20 %	20 %	20 %	170291192
33028	NC_010482	CGG	2	6	1557531	1557536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170291192
33029	NC_010482	AAG	2	6	1557608	1557613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291192
33030	NC_010482	GGT	2	6	1557661	1557666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170291192
33031	NC_010482	CAG	2	6	1557698	1557703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291192
33032	NC_010482	AGG	2	6	1557781	1557786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291192
33033	NC_010482	AGG	2	6	1557796	1557801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291192
33034	NC_010482	AGG	2	6	1557805	1557810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291192
33035	NC_010482	TTA	2	6	1557852	1557857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33036	NC_010482	C	6	6	1557885	1557890	0 %	0 %	0 %	100 %	170291193
33037	NC_010482	G	6	6	1557951	1557956	0 %	0 %	100 %	0 %	170291193
33038	NC_010482	GA	3	6	1557963	1557968	50 %	0 %	50 %	0 %	170291193
33039	NC_010482	GAG	2	6	1557992	1557997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291193
33040	NC_010482	GATA	2	8	1558067	1558074	50 %	25 %	25 %	0 %	170291193
33041	NC_010482	TCGA	2	8	1558099	1558106	25 %	25 %	25 %	25 %	170291193
33042	NC_010482	GGA	2	6	1558157	1558162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291193
33043	NC_010482	TAG	2	6	1558309	1558314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291193
33044	NC_010482	CTA	2	6	1558446	1558451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291193
33045	NC_010482	AAGA	2	8	1558464	1558471	75 %	0 %	25 %	0 %	170291193
33046	NC_010482	AG	3	6	1558505	1558510	50 %	0 %	50 %	0 %	170291193
33047	NC_010482	C	7	7	1558565	1558571	0 %	0 %	0 %	100 %	170291193
33048	NC_010482	AG	3	6	1558613	1558618	50 %	0 %	50 %	0 %	170291193
33049	NC_010482	CAAA	2	8	1558625	1558632	75 %	0 %	0 %	25 %	170291193
33050	NC_010482	A	6	6	1558630	1558635	100 %	0 %	0 %	0 %	170291193
33051	NC_010482	AG	3	6	1558647	1558652	50 %	0 %	50 %	0 %	170291193
33052	NC_010482	ATG	2	6	1558690	1558695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291193
33053	NC_010482	ATG	2	6	1558705	1558710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291193
33054	NC_010482	GGA	2	6	1558733	1558738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291193
33055	NC_010482	TAA	2	6	1558757	1558762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291193
33056	NC_010482	GAG	2	6	1558781	1558786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291193
33057	NC_010482	CAT	2	6	1558865	1558870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291194
33058	NC_010482	AGG	2	6	1558885	1558890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291194
33059	NC_010482	AAT	2	6	1558893	1558898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291194
33060	NC_010482	TTC	2	6	1558936	1558941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170291194
33061	NC_010482	CTT	2	6	1558956	1558961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170291194
33062	NC_010482	CGA	2	6	1558962	1558967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291194
33063	NC_010482	AT	3	6	1558968	1558973	50 %	50 %	0 %	0 %	170291194
33064	NC_010482	GAT	2	6	1558989	1558994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291194
33065	NC_010482	GTA	2	6	1559044	1559049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291194
33066	NC_010482	GAA	2	6	1559061	1559066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291194
33067	NC_010482	AT	3	6	1559125	1559130	50 %	50 %	0 %	0 %	170291194
33068	NC_010482	ATA	2	6	1559152	1559157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291194
33069	NC_010482	GCA	3	9	1559239	1559247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291194
33070	NC_010482	GA	3	6	1559392	1559397	50 %	0 %	50 %	0 %	170291194
33071	NC_010482	GATAA	2	10	1559416	1559425	60 %	20 %	20 %	0 %	170291194
33072	NC_010482	ATC	2	6	1559449	1559454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291194
33073	NC_010482	CT	3	6	1559475	1559480	0 %	50 %	0 %	50 %	170291194
33074	NC_010482	GGA	2	6	1559487	1559492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291194
33075	NC_010482	GCT	2	6	1559538	1559543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170291194
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33077	NC_010482	C	6	6	1559671	1559676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33078	NC_010482	A	11	11	1559682	1559692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33079	NC_010482	AG	3	6	1559698	1559703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33080	NC_010482	ATT	2	6	1559704	1559709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170291195
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33082	NC_010482	TCC	2	6	1559851	1559856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170291195
33083	NC_010482	CTA	2	6	1559878	1559883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291195
33084	NC_010482	ACTG	2	8	1559911	1559918	25 %	25 %	25 %	25 %	170291195
33085	NC_010482	TAT	2	6	1560044	1560049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170291195
33086	NC_010482	TTG	2	6	1560123	1560128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170291195
33087	NC_010482	AGTAG	2	10	1560218	1560227	40 %	20 %	40 %	0 %	170291195
33088	NC_010482	CTC	2	6	1560239	1560244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170291195
33089	NC_010482	CTC	2	6	1560246	1560251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170291195
33090	NC_010482	TA	3	6	1560374	1560379	50 %	50 %	0 %	0 %	170291195
33091	NC_010482	GGA	2	6	1560482	1560487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291195
33092	NC_010482	GTA	3	9	1560521	1560529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291195
33093	NC_010482	AT	3	6	1560677	1560682	50 %	50 %	0 %	0 %	170291195
33094	NC_010482	AT	3	6	1560689	1560694	50 %	50 %	0 %	0 %	170291195
33095	NC_010482	TCCA	2	8	1560716	1560723	25 %	25 %	0 %	50 %	170291195
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33098	NC_010482	AG	4	8	1560776	1560783	50 %	0 %	50 %	0 %	170291195
33099	NC_010482	TATG	2	8	1560808	1560815	25 %	50 %	25 %	0 %	170291195
33100	NC_010482	TG	3	6	1560976	1560981	0 %	50 %	50 %	0 %	170291196
33101	NC_010482	TCC	2	6	1561023	1561028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170291196
33102	NC_010482	AGT	2	6	1561188	1561193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291196
33103	NC_010482	GCA	2	6	1561203	1561208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291196
33104	NC_010482	GAG	2	6	1561212	1561217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291196
33105	NC_010482	AAT	2	6	1561251	1561256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291196
33106	NC_010482	CTG	2	6	1561343	1561348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170291196
33107	NC_010482	ATG	2	6	1561424	1561429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291196
33108	NC_010482	ATA	2	6	1561501	1561506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291196
33109	NC_010482	TCT	2	6	1561512	1561517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170291196
33110	NC_010482	CGA	2	6	1561686	1561691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291196
33111	NC_010482	GAG	2	6	1561702	1561707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291196
33112	NC_010482	TTA	2	6	1561737	1561742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170291196
33113	NC_010482	ACTC	2	8	1561785	1561792	25 %	25 %	0 %	50 %	170291196
33114	NC_010482	TC	4	8	1561843	1561850	0 %	50 %	0 %	50 %	170291196
33115	NC_010482	GA	3	6	1561867	1561872	50 %	0 %	50 %	0 %	170291196
33116	NC_010482	ACT	2	6	1561916	1561921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291196
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33118	NC_010482	TCT	2	6	1562094	1562099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170291196
33119	NC_010482	AAG	2	6	1562114	1562119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291196
33120	NC_010482	GAA	2	6	1562170	1562175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170291196
33121	NC_010482	CAG	2	6	1562187	1562192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291196
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33125	NC_010482	TAACC	2	10	1562444	1562453	40 %	20 %	0 %	40 %	170291196
33126	NC_010482	T	7	7	1562512	1562518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33127	NC_010482	TAA	2	6	1562535	1562540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33129	NC_010482	TTA	2	6	1562625	1562630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33130	NC_010482	TAA	2	6	1562645	1562650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33131	NC_010482	TCA	2	6	1562667	1562672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33154	NC_010482	AGCT	2	8	1563854	1563861	25 %	25 %	25 %	25 %	170291197
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33161	NC_010482	GAT	2	6	1564062	1564067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33193	NC_010482	ATCGAA	2	12	1565509	1565520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170291201
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33223	NC_010482	ATA	2	6	1566936	1566941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291202
33224	NC_010482	GAG	2	6	1566957	1566962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291202
33225	NC_010482	GA	3	6	1566965	1566970	50 %	0 %	50 %	0 %	170291202
33226	NC_010482	AG	3	6	1566998	1567003	50 %	0 %	50 %	0 %	170291202
33227	NC_010482	ATC	2	6	1567060	1567065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291202
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33229	NC_010482	GGC	2	6	1567111	1567116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170291202
33230	NC_010482	AGG	2	6	1567122	1567127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291202
33231	NC_010482	GAT	2	6	1567141	1567146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291202
33232	NC_010482	AGCG	2	8	1567179	1567186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33233	NC_010482	GAT	2	6	1567204	1567209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291203
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33236	NC_010482	TGAG	2	8	1567322	1567329	25 %	25 %	50 %	0 %	170291203
33237	NC_010482	TCA	2	6	1567348	1567353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291203
33238	NC_010482	AG	3	6	1567389	1567394	50 %	0 %	50 %	0 %	170291203
33239	NC_010482	GGA	2	6	1567395	1567400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291203
33240	NC_010482	TCC	2	6	1567422	1567427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170291203
33241	NC_010482	AG	3	6	1567604	1567609	50 %	0 %	50 %	0 %	170291203
33242	NC_010482	AGG	2	6	1567624	1567629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291203
33243	NC_010482	TGA	2	6	1567721	1567726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291203
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33249	NC_010482	AGG	2	6	1567882	1567887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291203
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33253	NC_010482	A	6	6	1567972	1567977	100 %	0 %	0 %	0 %	170291203
33254	NC_010482	TA	3	6	1567979	1567984	50 %	50 %	0 %	0 %	170291203
33255	NC_010482	TAG	2	6	1567991	1567996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291203
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33257	NC_010482	GAGCTC	2	12	1568023	1568034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170291203
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33273	NC_010482	AGGT	2	8	1568506	1568513	25 %	25 %	50 %	0 %	170291204
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33301	NC_010482	TTC	2	6	1569964	1569969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170291207
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33306	NC_010482	CAT	2	6	1570028	1570033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291207
33307	NC_010482	AGTTC	2	10	1570051	1570060	20 %	40 %	20 %	20 %	170291207
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33312	NC_010482	TTTCT	2	10	1570243	1570252	0 %	80 %	0 %	20 %	170291207
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33314	NC_010482	TCA	2	6	1570318	1570323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33315	NC_010482	TGA	2	6	1570390	1570395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291208
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33319	NC_010482	ATA	2	6	1570530	1570535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291208
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33323	NC_010482	GGGAA	2	10	1570596	1570605	40 %	0 %	60 %	0 %	170291208
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33327	NC_010482	ACT	2	6	1570744	1570749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291208
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33330	NC_010482	GTTA	2	8	1570829	1570836	25 %	50 %	25 %	0 %	170291208
33331	NC_010482	CT	3	6	1570839	1570844	0 %	50 %	0 %	50 %	170291208
33332	NC_010482	GGA	2	6	1570856	1570861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291208
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33334	NC_010482	ATA	2	6	1570953	1570958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170291208
33335	NC_010482	C	6	6	1570991	1570996	0 %	0 %	0 %	100 %	170291208
33336	NC_010482	CTG	2	6	1571020	1571025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170291208
33337	NC_010482	GAC	2	6	1571052	1571057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291208
33338	NC_010482	GA	3	6	1571094	1571099	50 %	0 %	50 %	0 %	170291208
33339	NC_010482	GAC	2	6	1571141	1571146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291208
33340	NC_010482	GGA	2	6	1571185	1571190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291208
33341	NC_010482	TCC	2	6	1571287	1571292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170291208
33342	NC_010482	GATGA	2	10	1571322	1571331	40 %	20 %	40 %	0 %	170291208
33343	NC_010482	ATAG	2	8	1571436	1571443	50 %	25 %	25 %	0 %	170291208
33344	NC_010482	AGT	2	6	1571579	1571584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291208
33345	NC_010482	CGAGAC	2	12	1571600	1571611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291208
33346	NC_010482	GAG	2	6	1571640	1571645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291208
33347	NC_010482	CAG	2	6	1571677	1571682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291208
33348	NC_010482	AGG	2	6	1571712	1571717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291208
33349	NC_010482	GGA	2	6	1571821	1571826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291208
33350	NC_010482	AGC	2	6	1571841	1571846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291208
33351	NC_010482	GAG	2	6	1571855	1571860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291208
33352	NC_010482	GAG	2	6	1571909	1571914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291208
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33354	NC_010482	CCTC	2	8	1572076	1572083	0 %	25 %	0 %	75 %	170291209
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33473	NC_010482	ATG	2	6	1577055	1577060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291215
33474	NC_010482	GTA	2	6	1577078	1577083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170291215
33475	NC_010482	GGA	2	6	1577119	1577124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170291215
33476	NC_010482	ATC	2	6	1577223	1577228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170291215
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33480	NC_010482	GAC	2	6	1577410	1577415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170291215
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