MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C chromosome

Total Repeats: 50961

< Previous12345678910111213...101102Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010424	GCCGG	2	10	90980	90989	0 %	0 %	60 %	40 %	169830305
2003	NC_010424	AAG	2	6	90992	90997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830305
2004	NC_010424	AAG	2	6	91022	91027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169830305
2005	NC_010424	CTT	2	6	91069	91074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830305
2006	NC_010424	ATC	2	6	91106	91111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830305
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2009	NC_010424	AGG	2	6	91152	91157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830305
2010	NC_010424	TAC	2	6	91163	91168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830305
2011	NC_010424	TGC	2	6	91203	91208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830305
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2013	NC_010424	GAG	2	6	91226	91231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830305
2014	NC_010424	GGA	2	6	91240	91245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830305
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2016	NC_010424	CG	3	6	91291	91296	0 %	0 %	50 %	50 %	169830305
2017	NC_010424	GAT	2	6	91300	91305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830305
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2106	NC_010424	GT	3	6	95614	95619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2108	NC_010424	ATCGG	2	10	95694	95703	20 %	20 %	40 %	20 %	169830310
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2127	NC_010424	TGC	2	6	96510	96515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830310
2128	NC_010424	CCA	2	6	96568	96573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830310
2129	NC_010424	TCT	2	6	96574	96579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830310
2130	NC_010424	CTA	2	6	96617	96622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830310
2131	NC_010424	GCG	2	6	96730	96735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830310
2132	NC_010424	TCG	2	6	96760	96765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830310
2133	NC_010424	TGT	2	6	96766	96771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169830310
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2135	NC_010424	GT	3	6	96892	96897	0 %	50 %	50 %	0 %	169830310
2136	NC_010424	GCG	2	6	96957	96962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830310
2137	NC_010424	GAG	2	6	97017	97022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830310
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2140	NC_010424	GTG	2	6	97242	97247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830310
2141	NC_010424	CGG	2	6	97303	97308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830310
2142	NC_010424	CTG	2	6	97437	97442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830310
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2147	NC_010424	TGG	2	6	97558	97563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830310
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2152	NC_010424	GGC	2	6	97752	97757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830310
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2172	NC_010424	GCG	4	12	98439	98450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830310
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2178	NC_010424	GCG	2	6	98637	98642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830310
2179	NC_010424	CGC	2	6	98657	98662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830310
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2182	NC_010424	AGTGA	2	10	98821	98830	40 %	20 %	40 %	0 %	169830311
2183	NC_010424	GA	3	6	98829	98834	50 %	0 %	50 %	0 %	169830311
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2191	NC_010424	TAC	2	6	99337	99342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830311
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2212	NC_010424	GAG	2	6	100066	100071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830311
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2214	NC_010424	GCC	2	6	100127	100132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2215	NC_010424	TTTC	2	8	100210	100217	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2216	NC_010424	CGG	2	6	100242	100247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2217	NC_010424	GTG	2	6	100286	100291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2218	NC_010424	CCCA	2	8	100302	100309	25 %	0 %	0 %	75 %	169830312
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2225	NC_010424	TTTC	2	8	100477	100484	0 %	75 %	0 %	25 %	169830312
2226	NC_010424	AC	3	6	100546	100551	50 %	0 %	0 %	50 %	169830312
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2233	NC_010424	CCCGG	2	10	101099	101108	0 %	0 %	40 %	60 %	169830313
2234	NC_010424	GGA	3	9	101127	101135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169830313
2235	NC_010424	CG	3	6	101224	101229	0 %	0 %	50 %	50 %	169830313
2236	NC_010424	GC	3	6	101243	101248	0 %	0 %	50 %	50 %	169830313
2237	NC_010424	GGT	2	6	101319	101324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169830313
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2239	NC_010424	ATC	2	6	101437	101442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830313
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2241	NC_010424	CCA	2	6	101558	101563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830313
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2243	NC_010424	G	6	6	101639	101644	0 %	0 %	100 %	0 %	169830313
2244	NC_010424	ACG	2	6	101663	101668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830313
2245	NC_010424	CAT	2	6	101741	101746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830314
2246	NC_010424	CCGG	3	12	101850	101861	0 %	0 %	50 %	50 %	169830314
2247	NC_010424	CGA	2	6	101864	101869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830314
2248	NC_010424	CGG	2	6	101931	101936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830314
2249	NC_010424	GGC	3	9	101969	101977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830314
2250	NC_010424	GGGA	2	8	102086	102093	25 %	0 %	75 %	0 %	169830314
2251	NC_010424	CCA	2	6	102105	102110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169830315
2252	NC_010424	GCA	2	6	102129	102134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830315
2253	NC_010424	CCGG	2	8	102145	102152	0 %	0 %	50 %	50 %	169830315
2254	NC_010424	CGT	2	6	102274	102279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169830315
2255	NC_010424	GGC	2	6	102339	102344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830315
2256	NC_010424	ATC	2	6	102380	102385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830315
2257	NC_010424	GACCTG	2	12	102386	102397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	169830315
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2262	NC_010424	GTG	3	9	102608	102616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_010424	GT	3	6	102758	102763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2264	NC_010424	GCC	3	9	102785	102793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830316
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2282	NC_010424	CCG	2	6	103586	103591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2283	NC_010424	ACG	2	6	103677	103682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2285	NC_010424	ACAATA	2	12	103718	103729	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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2290	NC_010424	GA	4	8	103897	103904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2291	NC_010424	TGA	2	6	103919	103924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830317
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2371	NC_010424	ACGT	2	8	106962	106969	25 %	25 %	25 %	25 %	169830320
2372	NC_010424	ATC	2	6	107049	107054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830320
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2375	NC_010424	AT	3	6	107238	107243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2376	NC_010424	ATC	2	6	107276	107281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2377	NC_010424	TTCC	2	8	107301	107308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2378	NC_010424	GGCCC	2	10	107309	107318	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2379	NC_010424	GGC	2	6	107387	107392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2487	NC_010424	TGA	2	6	112808	112813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169830323
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2489	NC_010424	CTTA	2	8	112876	112883	25 %	50 %	0 %	25 %	169830323
2490	NC_010424	AGCCGA	2	12	112900	112911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169830323
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2492	NC_010424	ACGAA	2	10	112942	112951	60 %	0 %	20 %	20 %	169830323
2493	NC_010424	AAGAA	2	10	112986	112995	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_010424	GAGGG	2	10	113004	113013	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_010424	TAC	2	6	113053	113058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169830324
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2498	NC_010424	GGC	2	6	113115	113120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169830324
2499	NC_010424	CCG	2	6	113177	113182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169830324
2500	NC_010424	CTT	2	6	113197	113202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169830324

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