MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus plasmid pCSL1

Total Repeats: 2459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010408	TCA	2	6	58724	58729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016770
1502	NC_010408	CG	3	6	58730	58735	0 %	0 %	50 %	50 %	189016770
1503	NC_010408	AGA	2	6	58762	58767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016770
1504	NC_010408	AGC	4	12	58789	58800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016770
1505	NC_010408	CGG	2	6	58806	58811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016770
1506	NC_010408	GTC	2	6	58834	58839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016770
1507	NC_010408	CGA	2	6	58842	58847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016770
1508	NC_010408	GGA	2	6	58930	58935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016770
1509	NC_010408	CGG	2	6	58953	58958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016770
1510	NC_010408	TGA	2	6	59067	59072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016770
1511	NC_010408	GCT	2	6	59095	59100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016770
1512	NC_010408	CTG	2	6	59110	59115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016770
1513	NC_010408	GGA	2	6	59128	59133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016770
1514	NC_010408	CGA	2	6	59163	59168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016770
1515	NC_010408	CCGC	2	8	59232	59239	0 %	0 %	25 %	75 %	189016770
1516	NC_010408	GTGGCG	2	12	59261	59272	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189016770
1517	NC_010408	CCTA	2	8	59325	59332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_010408	CGA	2	6	59347	59352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010408	GCT	2	6	59435	59440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010408	T	6	6	59446	59451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010408	CAC	3	9	59574	59582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189016771
1522	NC_010408	CGGC	2	8	59585	59592	0 %	0 %	50 %	50 %	189016771
1523	NC_010408	CGA	2	6	59631	59636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016771
1524	NC_010408	CCCG	2	8	59660	59667	0 %	0 %	25 %	75 %	189016771
1525	NC_010408	TCA	2	6	59685	59690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016771
1526	NC_010408	GTC	2	6	59693	59698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016771
1527	NC_010408	GGA	2	6	59730	59735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016771
1528	NC_010408	CAT	2	6	59826	59831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016772
1529	NC_010408	TGC	2	6	60012	60017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1530	NC_010408	GC	3	6	60055	60060	0 %	0 %	50 %	50 %	189016772
1531	NC_010408	T	6	6	60092	60097	0 %	100 %	0 %	0 %	189016772
1532	NC_010408	TGA	2	6	60109	60114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016772
1533	NC_010408	TTG	2	6	60126	60131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189016772
1534	NC_010408	ACG	2	6	60291	60296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1535	NC_010408	GCA	2	6	60491	60496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1536	NC_010408	CTT	2	6	60499	60504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016772
1537	NC_010408	CG	3	6	60544	60549	0 %	0 %	50 %	50 %	189016772
1538	NC_010408	TGC	2	6	60555	60560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1539	NC_010408	AAG	2	6	60594	60599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016772
1540	NC_010408	TCG	3	9	60608	60616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1541	NC_010408	CGG	2	6	60718	60723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016772
1542	NC_010408	CCT	2	6	60781	60786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016772
1543	NC_010408	CTG	2	6	60804	60809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1544	NC_010408	CGG	2	6	60858	60863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016772
1545	NC_010408	TGG	2	6	60872	60877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189016772
1546	NC_010408	AGC	2	6	60882	60887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1547	NC_010408	TC	3	6	60900	60905	0 %	50 %	0 %	50 %	189016772
1548	NC_010408	AGC	2	6	60984	60989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1549	NC_010408	CGT	2	6	61037	61042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016772
1550	NC_010408	CA	3	6	61055	61060	50 %	0 %	0 %	50 %	189016772
1551	NC_010408	CGC	2	6	61198	61203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016772
1552	NC_010408	GGC	2	6	61207	61212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016772
1553	NC_010408	CTT	2	6	61234	61239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016772
1554	NC_010408	GGC	2	6	61289	61294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016772
1555	NC_010408	CCG	2	6	61317	61322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016772
1556	NC_010408	CAGC	2	8	61351	61358	25 %	0 %	25 %	50 %	189016772
1557	NC_010408	ATGGA	2	10	61359	61368	40 %	20 %	40 %	0 %	189016772
1558	NC_010408	GCTT	2	8	61455	61462	0 %	50 %	25 %	25 %	189016772
1559	NC_010408	CGG	2	6	61530	61535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_010408	CG	3	6	61662	61667	0 %	0 %	50 %	50 %	189016773
1561	NC_010408	CAG	2	6	61671	61676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016773
1562	NC_010408	TGA	2	6	61694	61699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016773
1563	NC_010408	TCC	2	6	61762	61767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016773
1564	NC_010408	TCG	2	6	61795	61800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016773
1565	NC_010408	TGGC	2	8	61816	61823	0 %	25 %	50 %	25 %	189016773
1566	NC_010408	CGC	2	6	61845	61850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016773
1567	NC_010408	GCC	2	6	62017	62022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016773
1568	NC_010408	CG	3	6	62069	62074	0 %	0 %	50 %	50 %	189016773
1569	NC_010408	GCAGA	2	10	62079	62088	40 %	0 %	40 %	20 %	189016773
1570	NC_010408	GCA	2	6	62093	62098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016773
1571	NC_010408	CGC	2	6	62150	62155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016773
1572	NC_010408	GC	3	6	62159	62164	0 %	0 %	50 %	50 %	189016773
1573	NC_010408	GCG	2	6	62234	62239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016773
1574	NC_010408	GCG	2	6	62265	62270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_010408	GA	3	6	62277	62282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010408	GC	3	6	62379	62384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_010408	T	6	6	62447	62452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010408	GA	3	6	62520	62525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010408	ACCG	2	8	62536	62543	25 %	0 %	25 %	50 %	189016774
1580	NC_010408	CGA	2	6	62571	62576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016774
1581	NC_010408	CTC	2	6	62578	62583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016774
1582	NC_010408	CGC	2	6	62613	62618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016774
1583	NC_010408	GAG	2	6	62632	62637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189016774
1584	NC_010408	CGA	2	6	62672	62677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016774
1585	NC_010408	GCA	2	6	62681	62686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016774
1586	NC_010408	CGC	2	6	62721	62726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016774
1587	NC_010408	GC	3	6	62733	62738	0 %	0 %	50 %	50 %	189016774
1588	NC_010408	GAA	3	9	62787	62795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016775
1589	NC_010408	CCGC	2	8	62824	62831	0 %	0 %	25 %	75 %	189016775
1590	NC_010408	CGT	2	6	62867	62872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016775
1591	NC_010408	G	6	6	62909	62914	0 %	0 %	100 %	0 %	189016775
1592	NC_010408	GT	3	6	62941	62946	0 %	50 %	50 %	0 %	189016775
1593	NC_010408	GCG	2	6	63019	63024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016775
1594	NC_010408	GCA	2	6	63036	63041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016775
1595	NC_010408	CGG	2	6	63048	63053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016775
1596	NC_010408	GAC	2	6	63097	63102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016775
1597	NC_010408	ACT	2	6	63119	63124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016775
1598	NC_010408	CGA	2	6	63149	63154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016775
1599	NC_010408	TC	3	6	63187	63192	0 %	50 %	0 %	50 %	189016775
1600	NC_010408	CCG	2	6	63203	63208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016775
1601	NC_010408	CGC	2	6	63231	63236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016775
1602	NC_010408	AAG	2	6	63268	63273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189016775
1603	NC_010408	CGG	2	6	63289	63294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016775
1604	NC_010408	CGC	2	6	63333	63338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016775
1605	NC_010408	CGA	2	6	63374	63379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016775
1606	NC_010408	GCC	2	6	63387	63392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016775
1607	NC_010408	CGG	2	6	63419	63424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016775
1608	NC_010408	CCT	2	6	63458	63463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016775
1609	NC_010408	CCG	2	6	63608	63613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016775
1610	NC_010408	CG	5	10	63687	63696	0 %	0 %	50 %	50 %	189016775
1611	NC_010408	GGC	2	6	63723	63728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016775
1612	NC_010408	CCACCC	2	12	63755	63766	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	189016775
1613	NC_010408	AGC	2	6	63784	63789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016775
1614	NC_010408	GGAA	2	8	63792	63799	50 %	0 %	50 %	0 %	189016775
1615	NC_010408	AGT	2	6	63800	63805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189016775
1616	NC_010408	CTT	2	6	63816	63821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189016776
1617	NC_010408	TCACCG	2	12	63823	63834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189016776
1618	NC_010408	CCGT	2	8	63837	63844	0 %	25 %	25 %	50 %	189016776
1619	NC_010408	CGC	2	6	63854	63859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189016776
1620	NC_010408	CAG	2	6	63921	63926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189016776
1621	NC_010408	CTC	3	9	63927	63935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189016776
1622	NC_010408	CAT	2	6	63956	63961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189016776
1623	NC_010408	GCG	2	6	64015	64020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189016776
1624	NC_010408	TCG	2	6	64024	64029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016776
1625	NC_010408	CGT	2	6	64141	64146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189016776
1626	NC_010408	GC	3	6	64207	64212	0 %	0 %	50 %	50 %	189016777
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