MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 10011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	TGCG	2	8	1515	1522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010407	CACC	2	8	1542	1549	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_010407	GGAC	2	8	2094	2101	25 %	0 %	50 %	25 %	170780464
4	NC_010407	ACCG	2	8	2482	2489	25 %	0 %	25 %	50 %	170780464
5	NC_010407	GTTG	2	8	3244	3251	0 %	50 %	50 %	0 %	170780465
6	NC_010407	GCGG	2	8	3334	3341	0 %	0 %	75 %	25 %	170780465
7	NC_010407	GGAT	2	8	3513	3520	25 %	25 %	50 %	0 %	170780465
8	NC_010407	TCCG	2	8	3629	3636	0 %	25 %	25 %	50 %	170780465
9	NC_010407	CCCG	2	8	3840	3847	0 %	0 %	25 %	75 %	170780465
10	NC_010407	CGGC	2	8	4399	4406	0 %	0 %	50 %	50 %	170780466
11	NC_010407	CGTC	2	8	5124	5131	0 %	25 %	25 %	50 %	170780467
12	NC_010407	GCCA	2	8	6022	6029	25 %	0 %	25 %	50 %	170780467
13	NC_010407	CGGG	2	8	6497	6504	0 %	0 %	75 %	25 %	170780468
14	NC_010407	GCAC	2	8	8002	8009	25 %	0 %	25 %	50 %	170780469
15	NC_010407	ACGC	2	8	10416	10423	25 %	0 %	25 %	50 %	170780470
16	NC_010407	CAGC	2	8	10899	10906	25 %	0 %	25 %	50 %	170780470
17	NC_010407	TGCT	2	8	12976	12983	0 %	50 %	25 %	25 %	170780472
18	NC_010407	CGGC	2	8	13034	13041	0 %	0 %	50 %	50 %	170780472
19	NC_010407	GCGG	2	8	13179	13186	0 %	0 %	75 %	25 %	170780472
20	NC_010407	ACCC	2	8	13561	13568	25 %	0 %	0 %	75 %	170780473
21	NC_010407	CGAC	2	8	13586	13593	25 %	0 %	25 %	50 %	170780473
22	NC_010407	CGAC	2	8	13904	13911	25 %	0 %	25 %	50 %	170780473
23	NC_010407	GCGG	2	8	14050	14057	0 %	0 %	75 %	25 %	170780474
24	NC_010407	GCCG	2	8	14081	14088	0 %	0 %	50 %	50 %	170780474
25	NC_010407	CGCC	2	8	14744	14751	0 %	0 %	25 %	75 %	170780474
26	NC_010407	CGGC	2	8	15680	15687	0 %	0 %	50 %	50 %	170780476
27	NC_010407	CGCC	2	8	16331	16338	0 %	0 %	25 %	75 %	170780476
28	NC_010407	TGGC	2	8	16653	16660	0 %	25 %	50 %	25 %	170780478
29	NC_010407	CACG	2	8	16867	16874	25 %	0 %	25 %	50 %	170780478
30	NC_010407	CCGG	2	8	17190	17197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010407	CGCC	2	8	18199	18206	0 %	0 %	25 %	75 %	170780479
32	NC_010407	CCGT	2	8	18678	18685	0 %	25 %	25 %	50 %	170780479
33	NC_010407	CGGA	2	8	19040	19047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010407	GCCG	2	8	19124	19131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010407	CGAG	2	8	19173	19180	25 %	0 %	50 %	25 %	170780480
36	NC_010407	TCGT	2	8	19337	19344	0 %	50 %	25 %	25 %	170780480
37	NC_010407	CGTC	2	8	19566	19573	0 %	25 %	25 %	50 %	170780480
38	NC_010407	GGCC	2	8	19941	19948	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
39	NC_010407	GCGG	2	8	20277	20284	0 %	0 %	75 %	25 %	170780480
40	NC_010407	CGGC	2	8	20286	20293	0 %	0 %	50 %	50 %	170780480
41	NC_010407	GCTC	2	8	21374	21381	0 %	25 %	25 %	50 %	170780481
42	NC_010407	TCGA	2	8	21571	21578	25 %	25 %	25 %	25 %	170780481
43	NC_010407	CGGG	2	8	21848	21855	0 %	0 %	75 %	25 %	170780481
44	NC_010407	CGAC	2	8	22091	22098	25 %	0 %	25 %	50 %	170780481
45	NC_010407	GACG	2	8	22296	22303	25 %	0 %	50 %	25 %	170780481
46	NC_010407	CCGC	2	8	22584	22591	0 %	0 %	25 %	75 %	170780482
47	NC_010407	ACGA	2	8	22674	22681	50 %	0 %	25 %	25 %	170780482
48	NC_010407	CGAG	2	8	23930	23937	25 %	0 %	50 %	25 %	170780483
49	NC_010407	CCAG	2	8	24170	24177	25 %	0 %	25 %	50 %	170780483
50	NC_010407	CGGG	2	8	24390	24397	0 %	0 %	75 %	25 %	170780483
51	NC_010407	GCCC	2	8	25025	25032	0 %	0 %	25 %	75 %	170780483
52	NC_010407	CTCG	2	8	25345	25352	0 %	25 %	25 %	50 %	170780484
53	NC_010407	GGCG	2	8	25428	25435	0 %	0 %	75 %	25 %	170780484
54	NC_010407	CGCC	2	8	25774	25781	0 %	0 %	25 %	75 %	170780485
55	NC_010407	CGGG	2	8	25850	25857	0 %	0 %	75 %	25 %	170780485
56	NC_010407	GGCG	2	8	26042	26049	0 %	0 %	75 %	25 %	170780485
57	NC_010407	GGGC	2	8	26808	26815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010407	CCGC	2	8	26904	26911	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_010407	CGCC	2	8	27014	27021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_010407	GGCC	2	8	27074	27081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010407	CCGT	2	8	27300	27307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010407	CGCC	2	8	27349	27356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_010407	CCGC	2	8	27493	27500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_010407	CGGC	2	8	27701	27708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010407	CGCC	2	8	27896	27903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_010407	GCTG	2	8	28561	28568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010407	GCGG	2	8	28979	28986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010407	GTTG	2	8	29168	29175	0 %	50 %	50 %	0 %	170780486
69	NC_010407	GCGG	2	8	29258	29265	0 %	0 %	75 %	25 %	170780486
70	NC_010407	GGAT	2	8	29437	29444	25 %	25 %	50 %	0 %	170780486
71	NC_010407	TCCG	2	8	29553	29560	0 %	25 %	25 %	50 %	170780486
72	NC_010407	CCCG	2	8	29764	29771	0 %	0 %	25 %	75 %	170780486
73	NC_010407	CGCC	2	8	30461	30468	0 %	0 %	25 %	75 %	170780487
74	NC_010407	GTCG	2	8	32130	32137	0 %	25 %	50 %	25 %	170780489
75	NC_010407	GCCG	2	8	32207	32214	0 %	0 %	50 %	50 %	170780489
76	NC_010407	GCGG	2	8	32238	32245	0 %	0 %	75 %	25 %	170780489
77	NC_010407	GCAC	2	8	32549	32556	25 %	0 %	25 %	50 %	170780489
78	NC_010407	GCCG	2	8	32746	32753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010407	GGCC	2	8	35057	35064	0 %	0 %	50 %	50 %	170780492
80	NC_010407	GCCG	2	8	35279	35286	0 %	0 %	50 %	50 %	170780492
81	NC_010407	GGCG	2	8	35393	35400	0 %	0 %	75 %	25 %	170780492
82	NC_010407	CGGC	2	8	35415	35422	0 %	0 %	50 %	50 %	170780492
83	NC_010407	GACG	2	8	35762	35769	25 %	0 %	50 %	25 %	170780492
84	NC_010407	GTCG	2	8	36083	36090	0 %	25 %	50 %	25 %	170780493
85	NC_010407	CGCC	2	8	36205	36212	0 %	0 %	25 %	75 %	170780493
86	NC_010407	CTCG	2	8	36431	36438	0 %	25 %	25 %	50 %	170780493
87	NC_010407	GCCG	2	8	36584	36591	0 %	0 %	50 %	50 %	170780493
88	NC_010407	GACG	2	8	36758	36765	25 %	0 %	50 %	25 %	170780493
89	NC_010407	CGTC	2	8	36919	36926	0 %	25 %	25 %	50 %	170780493
90	NC_010407	GACC	2	8	38242	38249	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
91	NC_010407	ACCG	2	8	38412	38419	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
92	NC_010407	CGGC	2	8	39655	39662	0 %	0 %	50 %	50 %	170780494
93	NC_010407	CCAG	2	8	39730	39737	25 %	0 %	25 %	50 %	170780494
94	NC_010407	CGGC	2	8	40015	40022	0 %	0 %	50 %	50 %	170780494
95	NC_010407	TCGA	2	8	40182	40189	25 %	25 %	25 %	25 %	170780494
96	NC_010407	TGCA	2	8	40787	40794	25 %	25 %	25 %	25 %	170780494
97	NC_010407	TGTC	2	8	41800	41807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010407	GTTC	2	8	41866	41873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010407	GGCA	2	8	42525	42532	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010407	GTTG	2	8	42849	42856	0 %	50 %	50 %	0 %	170780498
101	NC_010407	GCGG	2	8	42939	42946	0 %	0 %	75 %	25 %	170780498
102	NC_010407	GGAT	2	8	43118	43125	25 %	25 %	50 %	0 %	170780498
103	NC_010407	TCCG	2	8	43234	43241	0 %	25 %	25 %	50 %	170780498
104	NC_010407	CCCG	2	8	43445	43452	0 %	0 %	25 %	75 %	170780498
105	NC_010407	CGGC	3	12	43877	43888	0 %	0 %	50 %	50 %	170780499
106	NC_010407	TTCC	2	8	45412	45419	0 %	50 %	0 %	50 %	170780502
107	NC_010407	TCCG	2	8	46357	46364	0 %	25 %	25 %	50 %	170780503
108	NC_010407	CGAC	2	8	46676	46683	25 %	0 %	25 %	50 %	170780503
109	NC_010407	CCCG	2	8	47052	47059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_010407	TCGC	2	8	47541	47548	0 %	25 %	25 %	50 %	170780504
111	NC_010407	CGCC	2	8	47929	47936	0 %	0 %	25 %	75 %	170780504
112	NC_010407	GTCC	2	8	48055	48062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010407	ACGG	2	8	48513	48520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010407	GGCC	2	8	49694	49701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010407	GGGC	2	8	49889	49896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010407	CCCG	2	8	49974	49981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_010407	CGGC	2	8	49983	49990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010407	CCGT	2	8	50032	50039	0 %	25 %	25 %	50 %	170780505
119	NC_010407	CGAC	2	8	50603	50610	25 %	0 %	25 %	50 %	170780505
120	NC_010407	CTCG	2	8	51246	51253	0 %	25 %	25 %	50 %	170780505
121	NC_010407	CGGG	2	8	52533	52540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010407	GCGG	2	8	52728	52735	0 %	0 %	75 %	25 %	170780508
123	NC_010407	CGGC	2	8	53183	53190	0 %	0 %	50 %	50 %	170780508
124	NC_010407	GGCG	2	8	53229	53236	0 %	0 %	75 %	25 %	170780508
125	NC_010407	CCGG	2	8	53650	53657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010407	CGGC	2	8	53868	53875	0 %	0 %	50 %	50 %	170780509
127	NC_010407	GGTG	2	8	54037	54044	0 %	25 %	75 %	0 %	170780509
128	NC_010407	GGCG	2	8	54271	54278	0 %	0 %	75 %	25 %	170780509
129	NC_010407	GCTC	2	8	55451	55458	0 %	25 %	25 %	50 %	170780510
130	NC_010407	ACGA	2	8	56853	56860	50 %	0 %	25 %	25 %	170780511
131	NC_010407	CCCG	2	8	57074	57081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_010407	ACGC	2	8	57084	57091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010407	TCGT	2	8	57190	57197	0 %	50 %	25 %	25 %	170780512
134	NC_010407	CGCT	2	8	57526	57533	0 %	25 %	25 %	50 %	170780512
135	NC_010407	GGGC	2	8	58587	58594	0 %	0 %	75 %	25 %	170780512
136	NC_010407	GCCC	2	8	58679	58686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_010407	CGGG	2	8	59207	59214	0 %	0 %	75 %	25 %	170780513
138	NC_010407	CGGC	2	8	59223	59230	0 %	0 %	50 %	50 %	170780513
139	NC_010407	GCTC	2	8	59339	59346	0 %	25 %	25 %	50 %	170780513
140	NC_010407	CGCA	2	8	59372	59379	25 %	0 %	25 %	50 %	170780513
141	NC_010407	CTGC	2	8	59811	59818	0 %	25 %	25 %	50 %	170780513
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