MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 102259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010407	CCG	2	6	129003	129008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780565
4002	NC_010407	GC	3	6	129046	129051	0 %	0 %	50 %	50 %	170780565
4003	NC_010407	GGC	2	6	129068	129073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780565
4004	NC_010407	CAC	3	9	129109	129117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780565
4005	NC_010407	GAG	2	6	129161	129166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780565
4006	NC_010407	CGT	2	6	129175	129180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4007	NC_010407	CGT	2	6	129196	129201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4008	NC_010407	CGA	2	6	129295	129300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4009	NC_010407	CGC	2	6	129307	129312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780565
4010	NC_010407	TCG	2	6	129324	129329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4011	NC_010407	TCG	2	6	129348	129353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4012	NC_010407	CTG	2	6	129428	129433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4013	NC_010407	CG	3	6	129471	129476	0 %	0 %	50 %	50 %	170780565
4014	NC_010407	CG	3	6	129536	129541	0 %	0 %	50 %	50 %	170780565
4015	NC_010407	GTCGAG	2	12	129587	129598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170780565
4016	NC_010407	TGC	2	6	129606	129611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4017	NC_010407	CGG	2	6	129622	129627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780565
4018	NC_010407	CCGC	2	8	129633	129640	0 %	0 %	25 %	75 %	170780565
4019	NC_010407	CGG	2	6	129724	129729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780565
4020	NC_010407	CCAC	2	8	129783	129790	25 %	0 %	0 %	75 %	170780565
4021	NC_010407	CGT	2	6	129904	129909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4022	NC_010407	CGG	2	6	129940	129945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780565
4023	NC_010407	GGC	2	6	129985	129990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780565
4024	NC_010407	CGA	2	6	130021	130026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4025	NC_010407	GCAC	2	8	130071	130078	25 %	0 %	25 %	50 %	170780565
4026	NC_010407	TCG	2	6	130086	130091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4027	NC_010407	GCTC	2	8	130119	130126	0 %	25 %	25 %	50 %	170780565
4028	NC_010407	CGC	2	6	130167	130172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780565
4029	NC_010407	CG	4	8	130176	130183	0 %	0 %	50 %	50 %	170780565
4030	NC_010407	CGT	2	6	130201	130206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4031	NC_010407	CGT	2	6	130273	130278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4032	NC_010407	TCG	2	6	130293	130298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4033	NC_010407	GC	3	6	130316	130321	0 %	0 %	50 %	50 %	170780565
4034	NC_010407	CGA	3	9	130324	130332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780565
4035	NC_010407	CGA	2	6	130345	130350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780565
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4037	NC_010407	GCC	2	6	130381	130386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780565
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4039	NC_010407	CTC	2	6	130418	130423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780565
4040	NC_010407	GAAGTA	2	12	130474	130485	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170780565
4041	NC_010407	GAA	2	6	130522	130527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780566
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4043	NC_010407	CG	3	6	130537	130542	0 %	0 %	50 %	50 %	170780566
4044	NC_010407	ATC	2	6	130556	130561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780566
4045	NC_010407	GGC	2	6	130565	130570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780566
4046	NC_010407	CGT	2	6	130576	130581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780566
4047	NC_010407	GCG	2	6	130622	130627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_010407	TCA	2	6	130633	130638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_010407	GAT	2	6	130643	130648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780567
4050	NC_010407	TCC	2	6	130674	130679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780567
4051	NC_010407	TCT	2	6	130701	130706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780567
4052	NC_010407	TCA	2	6	130710	130715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780567
4053	NC_010407	GC	3	6	130717	130722	0 %	0 %	50 %	50 %	170780567
4054	NC_010407	CGC	2	6	130759	130764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780567
4055	NC_010407	GC	3	6	130780	130785	0 %	0 %	50 %	50 %	170780567
4056	NC_010407	GCC	2	6	130828	130833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_010407	GGC	2	6	130841	130846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_010407	CCG	2	6	130866	130871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_010407	TCG	2	6	130915	130920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_010407	CGT	2	6	130925	130930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_010407	CT	3	6	130933	130938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_010407	GA	3	6	130990	130995	50 %	0 %	50 %	0 %	170780568
4063	NC_010407	ACCG	2	8	130999	131006	25 %	0 %	25 %	50 %	170780568
4064	NC_010407	TCG	2	6	131010	131015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780568
4065	NC_010407	CGT	3	9	131016	131024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4070	NC_010407	CAG	3	9	131194	131202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4073	NC_010407	GAA	2	6	131235	131240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780568
4074	NC_010407	CGAGGG	2	12	131325	131336	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	170780568
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4083	NC_010407	CGC	2	6	131590	131595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780568
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4087	NC_010407	AGC	2	6	131708	131713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
4088	NC_010407	GCTC	2	8	131732	131739	0 %	25 %	25 %	50 %	170780568
4089	NC_010407	GAG	2	6	131770	131775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780568
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4091	NC_010407	CG	3	6	131807	131812	0 %	0 %	50 %	50 %	170780568
4092	NC_010407	CAT	2	6	131817	131822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780568
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4097	NC_010407	GC	3	6	131911	131916	0 %	0 %	50 %	50 %	170780568
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4101	NC_010407	CGA	2	6	132246	132251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4104	NC_010407	CCT	2	6	132342	132347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780568
4105	NC_010407	CAC	2	6	132396	132401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780568
4106	NC_010407	CGA	2	6	132411	132416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4110	NC_010407	CGT	2	6	132601	132606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4117	NC_010407	CGA	2	6	132846	132851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4119	NC_010407	GGA	2	6	132900	132905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780568
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4121	NC_010407	ACC	2	6	132967	132972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780568
4122	NC_010407	AAC	2	6	133024	133029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780568
4123	NC_010407	GAG	2	6	133069	133074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780568
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4125	NC_010407	GAC	2	6	133114	133119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4132	NC_010407	CG	3	6	133297	133302	0 %	0 %	50 %	50 %	170780568
4133	NC_010407	GCA	2	6	133305	133310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780568
4134	NC_010407	CACGTG	2	12	133369	133380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170780568
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4139	NC_010407	CGT	2	6	133518	133523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_010407	GCG	2	6	133536	133541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_010407	CGT	2	6	133545	133550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_010407	TCC	2	6	133572	133577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4143	NC_010407	CCT	2	6	133590	133595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4144	NC_010407	GCG	2	6	133599	133604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4145	NC_010407	TGA	2	6	133653	133658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780569
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4154	NC_010407	CGGG	2	8	133958	133965	0 %	0 %	75 %	25 %	170780569
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4194	NC_010407	CGA	2	6	135150	135155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780570
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4213	NC_010407	GTC	3	9	135597	135605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4226	NC_010407	CCA	2	6	136373	136378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4227	NC_010407	ACACC	2	10	136380	136389	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4228	NC_010407	CT	3	6	136417	136422	0 %	50 %	0 %	50 %	170780572
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4239	NC_010407	TCA	2	6	136631	136636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780572
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4241	NC_010407	GC	3	6	136644	136649	0 %	0 %	50 %	50 %	170780572
4242	NC_010407	GGCGA	2	10	136669	136678	20 %	0 %	60 %	20 %	170780572
4243	NC_010407	TCG	2	6	136685	136690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780572
4244	NC_010407	CAA	2	6	136722	136727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780572
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4362	NC_010407	ACC	2	6	140177	140182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780575
4363	NC_010407	GCGTC	2	10	140189	140198	0 %	20 %	40 %	40 %	170780575
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4365	NC_010407	CGG	2	6	140226	140231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780575
4366	NC_010407	CGCCC	2	10	140238	140247	0 %	0 %	20 %	80 %	170780575
4367	NC_010407	GACGC	2	10	140278	140287	20 %	0 %	40 %	40 %	170780575
4368	NC_010407	CTA	2	6	140289	140294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780575
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4370	NC_010407	TCG	2	6	140315	140320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780575
4371	NC_010407	GCTG	2	8	140348	140355	0 %	25 %	50 %	25 %	170780575
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4374	NC_010407	CGCCC	2	10	140453	140462	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4375	NC_010407	CCCG	2	8	140468	140475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4376	NC_010407	CGG	2	6	140488	140493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780576
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4412	NC_010407	GAT	2	6	141589	141594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4487	NC_010407	GTC	2	6	144576	144581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780579
4488	NC_010407	CTCG	2	8	144609	144616	0 %	25 %	25 %	50 %	170780579
4489	NC_010407	GCT	2	6	144765	144770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780579
4490	NC_010407	AGG	2	6	144803	144808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780579
4491	NC_010407	CTG	2	6	144901	144906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780579
4492	NC_010407	GGC	2	6	144945	144950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780579
4493	NC_010407	TTC	2	6	144982	144987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780579
4494	NC_010407	TGC	2	6	144995	145000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780579
4495	NC_010407	CCT	2	6	145062	145067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780579
4496	NC_010407	TCT	2	6	145079	145084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780579
4497	NC_010407	GGC	2	6	145087	145092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780579
4498	NC_010407	CG	3	6	145142	145147	0 %	0 %	50 %	50 %	170780579
4499	NC_010407	TTC	2	6	145210	145215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780579
4500	NC_010407	GTC	2	6	145294	145299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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