MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 102259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010407	GCG	2	6	318573	318578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780725
10002	NC_010407	GCC	2	6	318708	318713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780725
10003	NC_010407	GAA	2	6	318724	318729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780725
10004	NC_010407	GC	4	8	318737	318744	0 %	0 %	50 %	50 %	170780725
10005	NC_010407	AGC	2	6	318768	318773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780725
10006	NC_010407	ACC	2	6	318777	318782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780725
10007	NC_010407	GCC	2	6	318822	318827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_010407	TCG	2	6	318844	318849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780726
10009	NC_010407	CGC	2	6	318866	318871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780726
10010	NC_010407	CGG	2	6	318878	318883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780726
10011	NC_010407	GAC	2	6	318885	318890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780726
10012	NC_010407	CTC	2	6	318918	318923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780726
10013	NC_010407	CAC	2	6	318977	318982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780726
10014	NC_010407	GC	3	6	318983	318988	0 %	0 %	50 %	50 %	170780726
10015	NC_010407	GCG	2	6	319001	319006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780726
10016	NC_010407	TCC	2	6	319015	319020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780726
10017	NC_010407	CCT	2	6	319082	319087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780726
10018	NC_010407	CGG	2	6	319088	319093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780726
10019	NC_010407	TGG	2	6	319135	319140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780726
10020	NC_010407	CTG	2	6	319176	319181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780726
10021	NC_010407	GCC	2	6	319203	319208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780726
10022	NC_010407	TCGTG	2	10	319285	319294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10023	NC_010407	GCC	2	6	319315	319320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_010407	CGGC	2	8	319351	319358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_010407	CCG	2	6	319372	319377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_010407	CGG	2	6	319398	319403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_010407	CG	3	6	319405	319410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_010407	GCA	2	6	319476	319481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_010407	GAG	2	6	319484	319489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_010407	CAG	2	6	319509	319514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780727
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10033	NC_010407	CAG	2	6	319581	319586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780727
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10040	NC_010407	GTC	2	6	319904	319909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780728
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10042	NC_010407	CAA	2	6	319951	319956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780728
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10050	NC_010407	GTGG	2	8	320108	320115	0 %	25 %	75 %	0 %	170780728
10051	NC_010407	CG	3	6	320153	320158	0 %	0 %	50 %	50 %	170780728
10052	NC_010407	ACG	2	6	320183	320188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780728
10053	NC_010407	GTCGC	2	10	320197	320206	0 %	20 %	40 %	40 %	170780728
10054	NC_010407	GGA	2	6	320379	320384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_010407	CAT	2	6	320436	320441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780729
10056	NC_010407	ACC	4	12	320464	320475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780729
10057	NC_010407	TAC	2	6	320488	320493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780729
10058	NC_010407	TCAC	2	8	320501	320508	25 %	25 %	0 %	50 %	170780729
10059	NC_010407	ACG	2	6	320525	320530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780729
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10109	NC_010407	GAC	2	6	322692	322697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780730
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10119	NC_010407	CCAG	2	8	323102	323109	25 %	0 %	25 %	50 %	170780730
10120	NC_010407	CGT	2	6	323133	323138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780730
10121	NC_010407	CGA	2	6	323169	323174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780730
10122	NC_010407	CGA	2	6	323214	323219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780730
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10124	NC_010407	CGT	2	6	323304	323309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780730
10125	NC_010407	TCG	2	6	323360	323365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780730
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10136	NC_010407	CAC	2	6	323828	323833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10137	NC_010407	GGCCC	2	10	323857	323866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10138	NC_010407	GT	3	6	323889	323894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_010407	GAG	2	6	323908	323913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_010407	GTG	2	6	323939	323944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_010407	ACCT	2	8	324030	324037	25 %	25 %	0 %	50 %	170780731
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10144	NC_010407	ACC	2	6	324196	324201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780731
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10151	NC_010407	CTG	2	6	324570	324575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780731
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10161	NC_010407	GCC	2	6	325108	325113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10162	NC_010407	TCG	2	6	325122	325127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10168	NC_010407	AC	3	6	325311	325316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10169	NC_010407	AG	5	10	325353	325362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10175	NC_010407	GTC	2	6	325474	325479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780732
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10477	NC_010407	CGG	2	6	336329	336334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780752
10478	NC_010407	GTCGGC	2	12	336354	336365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170780752
10479	NC_010407	GCA	2	6	336398	336403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780752
10480	NC_010407	GCT	2	6	336419	336424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780752
10481	NC_010407	TCG	2	6	336444	336449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10482	NC_010407	CAG	2	6	336569	336574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10483	NC_010407	TCG	2	6	336585	336590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10484	NC_010407	AGG	3	9	336648	336656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780753
10485	NC_010407	GAG	2	6	336719	336724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780753
10486	NC_010407	CTG	2	6	336725	336730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10487	NC_010407	GGACGA	2	12	336775	336786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	170780753
10488	NC_010407	GTC	2	6	336788	336793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10489	NC_010407	CGC	2	6	336811	336816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780753
10490	NC_010407	GC	3	6	336826	336831	0 %	0 %	50 %	50 %	170780753
10491	NC_010407	CGA	2	6	336832	336837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10492	NC_010407	CCGCCA	2	12	336853	336864	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	170780753
10493	NC_010407	TCG	2	6	336924	336929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10494	NC_010407	CGA	2	6	336952	336957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780753
10495	NC_010407	CGC	2	6	336985	336990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780753
10496	NC_010407	CGTC	2	8	336997	337004	0 %	25 %	25 %	50 %	170780753
10497	NC_010407	CCT	2	6	337005	337010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780753
10498	NC_010407	CG	3	6	337022	337027	0 %	0 %	50 %	50 %	170780753
10499	NC_010407	GC	3	6	337039	337044	0 %	0 %	50 %	50 %	170780754
10500	NC_010407	CCG	2	6	337046	337051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780754

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