MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 102259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010407	GCGG	2	8	145307	145314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_010407	CGT	3	9	145321	145329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_010407	GA	3	6	145351	145356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_010407	CGC	2	6	145403	145408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_010407	GCG	2	6	145411	145416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_010407	GGC	2	6	145428	145433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_010407	CG	3	6	145472	145477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_010407	TCCG	2	8	145511	145518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_010407	CCG	2	6	145521	145526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_010407	CG	3	6	145525	145530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_010407	GCC	2	6	145581	145586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780580
4512	NC_010407	GCT	2	6	145587	145592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780580
4513	NC_010407	GCA	2	6	145596	145601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780580
4514	NC_010407	CGG	2	6	145632	145637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780580
4515	NC_010407	TCG	2	6	145664	145669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780580
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4517	NC_010407	ACG	2	6	145853	145858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780580
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4519	NC_010407	GGC	2	6	145869	145874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780580
4520	NC_010407	TCG	2	6	145934	145939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780580
4521	NC_010407	TCG	3	9	145997	146005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780580
4522	NC_010407	GC	3	6	146032	146037	0 %	0 %	50 %	50 %	170780580
4523	NC_010407	CAG	2	6	146200	146205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780580
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4531	NC_010407	GC	3	6	146408	146413	0 %	0 %	50 %	50 %	170780580
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4534	NC_010407	CGCGT	2	10	146506	146515	0 %	20 %	40 %	40 %	170780580
4535	NC_010407	CGA	2	6	146517	146522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780580
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4541	NC_010407	GGC	2	6	146847	146852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780580
4542	NC_010407	CCGCG	2	10	146853	146862	0 %	0 %	40 %	60 %	170780580
4543	NC_010407	CCA	2	6	146868	146873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780580
4544	NC_010407	CGG	2	6	146937	146942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780580
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4548	NC_010407	TGC	2	6	146972	146977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780580
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4554	NC_010407	ATCGCG	2	12	147088	147099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170780580
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4558	NC_010407	GCAC	2	8	147170	147177	25 %	0 %	25 %	50 %	170780580
4559	NC_010407	GCT	2	6	147183	147188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780580
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4561	NC_010407	GGC	2	6	147196	147201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780580
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4563	NC_010407	CGG	2	6	147236	147241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780580
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4565	NC_010407	GAC	2	6	147271	147276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_010407	CCGC	4	16	147280	147295	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4567	NC_010407	GCGG	2	8	147312	147319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_010407	GCT	2	6	147337	147342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780581
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4586	NC_010407	CG	5	10	147976	147985	0 %	0 %	50 %	50 %	170780581
4587	NC_010407	CGA	2	6	148001	148006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780581
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4593	NC_010407	GCCCTC	2	12	148124	148135	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	170780582
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4620	NC_010407	GC	4	8	148903	148910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4624	NC_010407	CAT	2	6	149121	149126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780583
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4653	NC_010407	CGT	2	6	150084	150089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780583
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4985	NC_010407	CCA	2	6	161211	161216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780592
4986	NC_010407	TGC	2	6	161277	161282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780592
4987	NC_010407	GTCCTC	2	12	161294	161305	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	170780592
4988	NC_010407	CGG	2	6	161313	161318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780592
4989	NC_010407	TGA	2	6	161319	161324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780592
4990	NC_010407	GCA	2	6	161328	161333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780592
4991	NC_010407	GCC	2	6	161340	161345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780592
4992	NC_010407	GGC	2	6	161360	161365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780592
4993	NC_010407	CG	3	6	161470	161475	0 %	0 %	50 %	50 %	170780592
4994	NC_010407	CGC	2	6	161527	161532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780592
4995	NC_010407	CGG	2	6	161542	161547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780592
4996	NC_010407	CGG	2	6	161560	161565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780592
4997	NC_010407	GGT	2	6	161594	161599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780592
4998	NC_010407	CAA	2	6	161617	161622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780592
4999	NC_010407	GCT	2	6	161632	161637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780592
5000	NC_010407	CAG	2	6	161657	161662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780592

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