MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	ATTG	2	8	189	196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010379	TTTA	2	8	212	219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010379	TAAT	2	8	401	408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TTTA	2	8	702	709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	TGAT	2	8	1079	1086	25 %	50 %	25 %	0 %	169834641
6	NC_010379	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010379	ATGT	2	8	1564	1571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	AATT	2	8	1857	1864	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
9	NC_010379	AAAT	2	8	2019	2026	75 %	25 %	0 %	0 %	169834598
10	NC_010379	CTTT	2	8	2349	2356	0 %	75 %	0 %	25 %	169834657
11	NC_010379	TCTT	2	8	2996	3003	0 %	75 %	0 %	25 %	169834681
12	NC_010379	TTTA	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	169834681
13	NC_010379	TTTA	2	8	3155	3162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010379	TAAA	2	8	3171	3178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	TGCT	2	8	3481	3488	0 %	50 %	25 %	25 %	169834676
16	NC_010379	GTTA	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	169834692
17	NC_010379	ATAG	2	8	4400	4407	50 %	25 %	25 %	0 %	169834692
18	NC_010379	TGAA	2	8	5121	5128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010379	TTGC	2	8	5576	5583	0 %	50 %	25 %	25 %	169834615
20	NC_010379	TTTA	2	8	5599	5606	25 %	75 %	0 %	0 %	169834615
21	NC_010379	TTTA	2	8	5806	5813	25 %	75 %	0 %	0 %	169834615
22	NC_010379	ATTA	2	8	5977	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
23	NC_010379	CTAT	2	8	6189	6196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010379	AAAT	2	8	6371	6378	75 %	25 %	0 %	0 %	169834697
25	NC_010379	TTCT	2	8	7475	7482	0 %	75 %	0 %	25 %	169834616
26	NC_010379	AAAT	2	8	7519	7526	75 %	25 %	0 %	0 %	169834616
27	NC_010379	ATAA	2	8	7537	7544	75 %	25 %	0 %	0 %	169834616
28	NC_010379	TAAA	2	8	7929	7936	75 %	25 %	0 %	0 %	169834703
29	NC_010379	AACA	2	8	7948	7955	75 %	0 %	0 %	25 %	169834703
30	NC_010379	TCTA	2	8	8318	8325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010379	TTAA	2	8	8877	8884	50 %	50 %	0 %	0 %	169834551
32	NC_010379	TTTA	2	8	9050	9057	25 %	75 %	0 %	0 %	169834551
33	NC_010379	TCTT	2	8	9081	9088	0 %	75 %	0 %	25 %	169834551
34	NC_010379	ATAA	2	8	9721	9728	75 %	25 %	0 %	0 %	169834551
35	NC_010379	TTTA	2	8	10087	10094	25 %	75 %	0 %	0 %	169834709
36	NC_010379	CTTT	2	8	10311	10318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010379	TCTT	2	8	10670	10677	0 %	75 %	0 %	25 %	169834635
38	NC_010379	ATTT	2	8	11059	11066	25 %	75 %	0 %	0 %	169834635
39	NC_010379	TAAA	2	8	11085	11092	75 %	25 %	0 %	0 %	169834635
40	NC_010379	TATT	2	8	11139	11146	25 %	75 %	0 %	0 %	169834635
41	NC_010379	CTTT	2	8	11429	11436	0 %	75 %	0 %	25 %	169834584
42	NC_010379	AGCT	2	8	11467	11474	25 %	25 %	25 %	25 %	169834584
43	NC_010379	TAGG	2	8	11730	11737	25 %	25 %	50 %	0 %	169834584
44	NC_010379	TTTA	2	8	12066	12073	25 %	75 %	0 %	0 %	169834726
45	NC_010379	CATT	2	8	12166	12173	25 %	50 %	0 %	25 %	169834726
46	NC_010379	TAAT	2	8	12263	12270	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
47	NC_010379	TCTT	2	8	12282	12289	0 %	75 %	0 %	25 %	169834726
48	NC_010379	TAAT	2	8	12455	12462	50 %	50 %	0 %	0 %	169834726
49	NC_010379	ACTA	2	8	12682	12689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010379	TATC	2	8	13037	13044	25 %	50 %	0 %	25 %	169834649
51	NC_010379	TCTA	2	8	13102	13109	25 %	50 %	0 %	25 %	169834649
52	NC_010379	GGTT	2	8	13127	13134	0 %	50 %	50 %	0 %	169834649
53	NC_010379	TATG	2	8	13162	13169	25 %	50 %	25 %	0 %	169834649
54	NC_010379	CTTT	2	8	13393	13400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010379	TTAA	2	8	13418	13425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010379	TTAT	2	8	13479	13486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010379	ATTT	2	8	13504	13511	25 %	75 %	0 %	0 %	169834562
58	NC_010379	GTCA	2	8	13545	13552	25 %	25 %	25 %	25 %	169834562
59	NC_010379	TTAA	2	8	13808	13815	50 %	50 %	0 %	0 %	169834714
60	NC_010379	CATT	3	12	14335	14346	25 %	50 %	0 %	25 %	169834535
61	NC_010379	TTAA	2	8	14828	14835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010379	TACT	2	8	15650	15657	25 %	50 %	0 %	25 %	169834728
63	NC_010379	TTTA	2	8	15732	15739	25 %	75 %	0 %	0 %	169834728
64	NC_010379	TATT	2	8	15944	15951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010379	TAAT	2	8	15982	15989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010379	CTAT	2	8	16155	16162	25 %	50 %	0 %	25 %	169834724
67	NC_010379	ATTA	2	8	16364	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010379	AAGA	2	8	16499	16506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010379	ATTA	2	8	16509	16516	50 %	50 %	0 %	0 %	169834620
70	NC_010379	CTTT	2	8	16522	16529	0 %	75 %	0 %	25 %	169834620
71	NC_010379	ATTT	2	8	17403	17410	25 %	75 %	0 %	0 %	169834704
72	NC_010379	TAAT	2	8	17863	17870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010379	TCCA	2	8	17987	17994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010379	TAAA	2	8	18299	18306	75 %	25 %	0 %	0 %	169834577
75	NC_010379	TTTA	2	8	18635	18642	25 %	75 %	0 %	0 %	169834577
76	NC_010379	CTTT	2	8	18840	18847	0 %	75 %	0 %	25 %	169834577
77	NC_010379	TTTG	2	8	18957	18964	0 %	75 %	25 %	0 %	169834577
78	NC_010379	TTCT	2	8	19276	19283	0 %	75 %	0 %	25 %	169834577
79	NC_010379	CTAT	2	8	19293	19300	25 %	50 %	0 %	25 %	169834577
80	NC_010379	TAAA	2	8	19381	19388	75 %	25 %	0 %	0 %	169834577
81	NC_010379	ATTT	2	8	19415	19422	25 %	75 %	0 %	0 %	169834577
82	NC_010379	GCCA	2	8	19592	19599	25 %	0 %	25 %	50 %	169834577
83	NC_010379	TTTC	2	8	19937	19944	0 %	75 %	0 %	25 %	169834636
84	NC_010379	TACA	2	8	20077	20084	50 %	25 %	0 %	25 %	169834636
85	NC_010379	TCTT	2	8	20242	20249	0 %	75 %	0 %	25 %	169834636
86	NC_010379	TGTT	2	8	20414	20421	0 %	75 %	25 %	0 %	169834636
87	NC_010379	TAAT	2	8	20631	20638	50 %	50 %	0 %	0 %	169834636
88	NC_010379	ACCA	2	8	20869	20876	50 %	0 %	0 %	50 %	169834636
89	NC_010379	ATAA	2	8	21223	21230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010379	ATTT	2	8	21380	21387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010379	TCTT	2	8	21586	21593	0 %	75 %	0 %	25 %	169834710
92	NC_010379	AGCA	2	8	21828	21835	50 %	0 %	25 %	25 %	169834710
93	NC_010379	TCCT	2	8	21979	21986	0 %	50 %	0 %	50 %	169834710
94	NC_010379	TTTC	2	8	22156	22163	0 %	75 %	0 %	25 %	169834591
95	NC_010379	TAAA	2	8	22408	22415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010379	ATTA	2	8	22594	22601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010379	ATTT	2	8	22648	22655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010379	ACCT	2	8	23247	23254	25 %	25 %	0 %	50 %	169834539
99	NC_010379	TTTA	2	8	23629	23636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010379	ATTA	2	8	23933	23940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010379	CATT	2	8	24228	24235	25 %	50 %	0 %	25 %	169834700
102	NC_010379	CTTT	2	8	24303	24310	0 %	75 %	0 %	25 %	169834700
103	NC_010379	TTCT	2	8	24756	24763	0 %	75 %	0 %	25 %	169834700
104	NC_010379	TAAT	2	8	24906	24913	50 %	50 %	0 %	0 %	169834700
105	NC_010379	TAAT	2	8	24958	24965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010379	TTTG	2	8	25093	25100	0 %	75 %	25 %	0 %	169834708
107	NC_010379	TTTG	2	8	25193	25200	0 %	75 %	25 %	0 %	169834708
108	NC_010379	GTAA	2	8	25251	25258	50 %	25 %	25 %	0 %	169834708
109	NC_010379	TTAT	2	8	25415	25422	25 %	75 %	0 %	0 %	169834708
110	NC_010379	ATTT	2	8	25866	25873	25 %	75 %	0 %	0 %	169834708
111	NC_010379	TCTT	2	8	25899	25906	0 %	75 %	0 %	25 %	169834708
112	NC_010379	TTTA	2	8	26023	26030	25 %	75 %	0 %	0 %	169834708
113	NC_010379	CTTT	2	8	26119	26126	0 %	75 %	0 %	25 %	169834708
114	NC_010379	ATTC	2	8	26526	26533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010379	CAAT	2	8	26755	26762	50 %	25 %	0 %	25 %	169834651
116	NC_010379	TAAA	2	8	26765	26772	75 %	25 %	0 %	0 %	169834651
117	NC_010379	TATT	2	8	26789	26796	25 %	75 %	0 %	0 %	169834651
118	NC_010379	AATT	2	8	27027	27034	50 %	50 %	0 %	0 %	169834651
119	NC_010379	TCAT	2	8	27418	27425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010379	CTAC	2	8	27754	27761	25 %	25 %	0 %	50 %	169834599
121	NC_010379	CCTT	2	8	27856	27863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010379	CAAA	2	8	27907	27914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010379	ATTT	2	8	27982	27989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010379	CCTT	2	8	28017	28024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010379	ATTT	2	8	28273	28280	25 %	75 %	0 %	0 %	169834566
126	NC_010379	ATAA	2	8	29154	29161	75 %	25 %	0 %	0 %	169834655
127	NC_010379	TTAA	2	8	29193	29200	50 %	50 %	0 %	0 %	169834655
128	NC_010379	ATTT	2	8	29455	29462	25 %	75 %	0 %	0 %	169834655
129	NC_010379	ATTA	2	8	29659	29666	50 %	50 %	0 %	0 %	169834626
130	NC_010379	AATA	2	8	29775	29782	75 %	25 %	0 %	0 %	169834626
131	NC_010379	TCAA	2	8	29926	29933	50 %	25 %	0 %	25 %	169834626
132	NC_010379	CTTT	2	8	29989	29996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010379	TAAT	2	8	30268	30275	50 %	50 %	0 %	0 %	169834707
134	NC_010379	CTTC	2	8	30449	30456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010379	ATTT	2	8	30492	30499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010379	AAAC	2	8	30812	30819	75 %	0 %	0 %	25 %	169834572
137	NC_010379	CTTT	2	8	30891	30898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010379	TAAT	2	8	30995	31002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010379	ATTT	2	8	31184	31191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010379	TTTA	2	8	31264	31271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010379	CTTT	2	8	31599	31606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010379	TAAT	2	8	32318	32325	50 %	50 %	0 %	0 %	169834658
143	NC_010379	TTAA	2	8	32974	32981	50 %	50 %	0 %	0 %	169834680
144	NC_010379	ATCT	2	8	33733	33740	25 %	50 %	0 %	25 %	169834680
145	NC_010379	CTAT	2	8	33954	33961	25 %	50 %	0 %	25 %	169834654
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