MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 4674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010379	TCA	2	6	94213	94218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834597
3002	NC_010379	TATT	2	8	94222	94229	25 %	75 %	0 %	0 %	169834597
3003	NC_010379	ACC	2	6	94241	94246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_010379	T	6	6	94256	94261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010379	TTA	2	6	94263	94268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010379	TA	3	6	94357	94362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010379	T	6	6	94363	94368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010379	TTAT	2	8	94377	94384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010379	AT	3	6	94383	94388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010379	ACT	2	6	94404	94409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010379	TA	3	6	94418	94423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010379	TTA	2	6	94424	94429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010379	TATT	2	8	94472	94479	25 %	75 %	0 %	0 %	169834542
3014	NC_010379	TCT	2	6	94480	94485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834542
3015	NC_010379	ATTA	2	8	94518	94525	50 %	50 %	0 %	0 %	169834542
3016	NC_010379	ATG	2	6	94537	94542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834542
3017	NC_010379	ATA	2	6	94555	94560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834542
3018	NC_010379	ATA	4	12	94610	94621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834542
3019	NC_010379	TAA	2	6	94641	94646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834542
3020	NC_010379	AT	3	6	94710	94715	50 %	50 %	0 %	0 %	169834542
3021	NC_010379	TTTCT	2	10	94725	94734	0 %	80 %	0 %	20 %	169834542
3022	NC_010379	AATT	2	8	94767	94774	50 %	50 %	0 %	0 %	169834542
3023	NC_010379	TCT	2	6	94786	94791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834542
3024	NC_010379	TTAT	2	8	94792	94799	25 %	75 %	0 %	0 %	169834542
3025	NC_010379	TAAT	2	8	94815	94822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010379	AT	3	6	94834	94839	50 %	50 %	0 %	0 %	169834624
3027	NC_010379	ATA	2	6	94844	94849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834624
3028	NC_010379	TAT	2	6	94858	94863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834624
3029	NC_010379	ATT	2	6	94943	94948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834624
3030	NC_010379	TAGAA	2	10	94981	94990	60 %	20 %	20 %	0 %	169834624
3031	NC_010379	AAT	2	6	94999	95004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834624
3032	NC_010379	AT	4	8	95039	95046	50 %	50 %	0 %	0 %	169834624
3033	NC_010379	CTA	2	6	95052	95057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834624
3034	NC_010379	CAA	2	6	95061	95066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834624
3035	NC_010379	TAT	3	9	95103	95111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_010379	CT	3	6	95127	95132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_010379	CTA	2	6	95236	95241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834642
3038	NC_010379	TTC	2	6	95255	95260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834642
3039	NC_010379	TC	3	6	95259	95264	0 %	50 %	0 %	50 %	169834642
3040	NC_010379	GTT	2	6	95281	95286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834642
3041	NC_010379	CTT	2	6	95302	95307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834642
3042	NC_010379	TTA	2	6	95433	95438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010379	AT	3	6	95443	95448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010379	TAA	2	6	95464	95469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010379	TTAA	2	8	95487	95494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010379	TA	3	6	95532	95537	50 %	50 %	0 %	0 %	169834580
3047	NC_010379	A	7	7	95547	95553	100 %	0 %	0 %	0 %	169834580
3048	NC_010379	TTC	2	6	95592	95597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834580
3049	NC_010379	AATTT	2	10	95602	95611	40 %	60 %	0 %	0 %	169834580
3050	NC_010379	CAT	2	6	95621	95626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834580
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3052	NC_010379	TCA	2	6	95680	95685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834580
3053	NC_010379	TAT	2	6	95700	95705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834580
3054	NC_010379	T	6	6	95714	95719	0 %	100 %	0 %	0 %	169834580
3055	NC_010379	TCT	2	6	95761	95766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834580
3056	NC_010379	CTT	2	6	95858	95863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834580
3057	NC_010379	ATGTAT	2	12	95867	95878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169834580
3058	NC_010379	CAT	2	6	95936	95941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834580
3059	NC_010379	AAT	2	6	95956	95961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834580
3060	NC_010379	AGA	2	6	96071	96076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010379	TTA	2	6	96113	96118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010379	CTTT	2	8	96143	96150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_010379	TAAA	2	8	96177	96184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010379	CATT	2	8	96191	96198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_010379	CTATAA	2	12	96234	96245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3066	NC_010379	TATT	2	8	96256	96263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010379	AATC	2	8	96264	96271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_010379	AT	3	6	96287	96292	50 %	50 %	0 %	0 %	169834634
3069	NC_010379	TAA	2	6	96312	96317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834634
3070	NC_010379	TTA	2	6	96370	96375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834634
3071	NC_010379	ATT	2	6	96456	96461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834634
3072	NC_010379	AAT	2	6	96488	96493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834634
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3076	NC_010379	TA	3	6	96645	96650	50 %	50 %	0 %	0 %	169834634
3077	NC_010379	GTCT	2	8	96663	96670	0 %	50 %	25 %	25 %	169834634
3078	NC_010379	ATA	2	6	96783	96788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834634
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3080	NC_010379	TAT	2	6	96824	96829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834634
3081	NC_010379	ATT	3	9	96856	96864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834634
3082	NC_010379	T	7	7	96896	96902	0 %	100 %	0 %	0 %	169834634
3083	NC_010379	AC	3	6	96927	96932	50 %	0 %	0 %	50 %	169834634
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3087	NC_010379	AT	4	8	97034	97041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3090	NC_010379	TAAT	2	8	97132	97139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010379	T	7	7	97164	97170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010379	AATG	2	8	97189	97196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010379	CATT	2	8	97219	97226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_010379	T	6	6	97255	97260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_010379	CTATAA	2	12	97261	97272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3098	NC_010379	TTTAAG	2	12	97431	97442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169834725
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3100	NC_010379	ATG	2	6	97507	97512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834725
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3102	NC_010379	T	6	6	97554	97559	0 %	100 %	0 %	0 %	169834725
3103	NC_010379	AT	3	6	97575	97580	50 %	50 %	0 %	0 %	169834725
3104	NC_010379	AT	3	6	97586	97591	50 %	50 %	0 %	0 %	169834725
3105	NC_010379	CTA	2	6	97600	97605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834725
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3107	NC_010379	AAT	2	6	97639	97644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834725
3108	NC_010379	ATT	2	6	97656	97661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834725
3109	NC_010379	GTT	2	6	97674	97679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834725
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3111	NC_010379	ATT	2	6	97689	97694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834725
3112	NC_010379	T	6	6	97709	97714	0 %	100 %	0 %	0 %	169834725
3113	NC_010379	TTA	2	6	97755	97760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834725
3114	NC_010379	TAT	2	6	97774	97779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834725
3115	NC_010379	CTTT	2	8	97797	97804	0 %	75 %	0 %	25 %	169834725
3116	NC_010379	TTTAT	2	10	97827	97836	20 %	80 %	0 %	0 %	169834725
3117	NC_010379	TTC	2	6	97841	97846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834725
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3119	NC_010379	AAATG	2	10	97859	97868	60 %	20 %	20 %	0 %	169834725
3120	NC_010379	TAT	2	6	97915	97920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834725
3121	NC_010379	ATT	2	6	97940	97945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834725
3122	NC_010379	T	6	6	97964	97969	0 %	100 %	0 %	0 %	169834725
3123	NC_010379	ATA	2	6	97974	97979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834725
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3125	NC_010379	AATTA	2	10	98025	98034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_010379	T	6	6	98074	98079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010379	TCT	2	6	98091	98096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834627
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3130	NC_010379	A	6	6	98177	98182	100 %	0 %	0 %	0 %	169834627
3131	NC_010379	TAA	3	9	98206	98214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834627
3132	NC_010379	TTC	2	6	98276	98281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834627
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