MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 4674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010379	CTTT	2	8	29989	29996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_010379	AT	3	6	30008	30013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010379	TAA	2	6	30017	30022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010379	ATT	2	6	30023	30028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834707
1005	NC_010379	T	6	6	30043	30048	0 %	100 %	0 %	0 %	169834707
1006	NC_010379	T	8	8	30078	30085	0 %	100 %	0 %	0 %	169834707
1007	NC_010379	T	6	6	30095	30100	0 %	100 %	0 %	0 %	169834707
1008	NC_010379	TA	3	6	30171	30176	50 %	50 %	0 %	0 %	169834707
1009	NC_010379	T	6	6	30183	30188	0 %	100 %	0 %	0 %	169834707
1010	NC_010379	T	6	6	30255	30260	0 %	100 %	0 %	0 %	169834707
1011	NC_010379	TAAT	2	8	30268	30275	50 %	50 %	0 %	0 %	169834707
1012	NC_010379	ATA	2	6	30281	30286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834707
1013	NC_010379	TA	3	6	30324	30329	50 %	50 %	0 %	0 %	169834707
1014	NC_010379	ATT	2	6	30372	30377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010379	TCC	2	6	30378	30383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_010379	TAA	2	6	30418	30423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010379	CTTC	2	8	30449	30456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_010379	ATA	2	6	30460	30465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010379	TCT	2	6	30478	30483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010379	ATTT	2	8	30492	30499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010379	TAT	2	6	30524	30529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010379	ATA	2	6	30556	30561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010379	AT	3	6	30569	30574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010379	TAT	3	9	30572	30580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834572
1025	NC_010379	TCT	2	6	30584	30589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834572
1026	NC_010379	TTC	2	6	30590	30595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834572
1027	NC_010379	TA	3	6	30597	30602	50 %	50 %	0 %	0 %	169834572
1028	NC_010379	TA	3	6	30633	30638	50 %	50 %	0 %	0 %	169834572
1029	NC_010379	TAA	2	6	30655	30660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834572
1030	NC_010379	AT	4	8	30679	30686	50 %	50 %	0 %	0 %	169834572
1031	NC_010379	TAA	2	6	30709	30714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834572
1032	NC_010379	T	6	6	30740	30745	0 %	100 %	0 %	0 %	169834572
1033	NC_010379	TTC	2	6	30775	30780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834572
1034	NC_010379	AAT	2	6	30785	30790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834572
1035	NC_010379	ATA	3	9	30803	30811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834572
1036	NC_010379	AAAC	2	8	30812	30819	75 %	0 %	0 %	25 %	169834572
1037	NC_010379	ATA	2	6	30827	30832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834572
1038	NC_010379	CTTT	2	8	30891	30898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_010379	TA	3	6	30949	30954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010379	AAT	2	6	30977	30982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010379	TAAT	2	8	30995	31002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010379	TAT	2	6	31007	31012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010379	CTT	2	6	31097	31102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010379	ATT	2	6	31170	31175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010379	ATTT	2	8	31184	31191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010379	TTC	2	6	31202	31207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010379	TTTA	2	8	31264	31271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010379	AGA	2	6	31294	31299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010379	TA	3	6	31309	31314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010379	TAGTC	2	10	31386	31395	20 %	40 %	20 %	20 %	169834667
1051	NC_010379	ATA	2	6	31463	31468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834667
1052	NC_010379	AAC	2	6	31555	31560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834667
1053	NC_010379	CTTT	2	8	31599	31606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_010379	ACA	2	6	31658	31663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010379	CCT	2	6	31689	31694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_010379	ATT	3	9	31704	31712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834593
1057	NC_010379	T	7	7	31796	31802	0 %	100 %	0 %	0 %	169834593
1058	NC_010379	TAT	2	6	31839	31844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834593
1059	NC_010379	CTC	2	6	31858	31863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834593
1060	NC_010379	CAT	2	6	31888	31893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834593
1061	NC_010379	CTT	2	6	31899	31904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834593
1062	NC_010379	AT	3	6	31926	31931	50 %	50 %	0 %	0 %	169834593
1063	NC_010379	CAC	2	6	31972	31977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834593
1064	NC_010379	T	6	6	31978	31983	0 %	100 %	0 %	0 %	169834593
1065	NC_010379	ATC	2	6	32026	32031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834593
1066	NC_010379	AAT	2	6	32038	32043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834593
1067	NC_010379	T	6	6	32051	32056	0 %	100 %	0 %	0 %	169834593
1068	NC_010379	TTC	2	6	32068	32073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834593
1069	NC_010379	AT	3	6	32099	32104	50 %	50 %	0 %	0 %	169834593
1070	NC_010379	AAT	2	6	32131	32136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834593
1071	NC_010379	T	7	7	32138	32144	0 %	100 %	0 %	0 %	169834593
1072	NC_010379	TCT	2	6	32151	32156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834593
1073	NC_010379	TAAT	2	8	32318	32325	50 %	50 %	0 %	0 %	169834658
1074	NC_010379	GCT	2	6	32335	32340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834658
1075	NC_010379	AAT	2	6	32342	32347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834658
1076	NC_010379	TC	4	8	32358	32365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_010379	TTA	2	6	32416	32421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834699
1078	NC_010379	ACT	2	6	32556	32561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834699
1079	NC_010379	ATC	2	6	32573	32578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834699
1080	NC_010379	TCA	2	6	32580	32585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834699
1081	NC_010379	TCA	2	6	32604	32609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834699
1082	NC_010379	TA	3	6	32612	32617	50 %	50 %	0 %	0 %	169834699
1083	NC_010379	T	6	6	32642	32647	0 %	100 %	0 %	0 %	169834699
1084	NC_010379	TAG	2	6	32669	32674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834699
1085	NC_010379	TCT	2	6	32680	32685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834699
1086	NC_010379	TTG	3	9	32741	32749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834699
1087	NC_010379	T	6	6	32872	32877	0 %	100 %	0 %	0 %	169834699
1088	NC_010379	T	7	7	32958	32964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010379	TTAA	2	8	32974	32981	50 %	50 %	0 %	0 %	169834680
1090	NC_010379	TTA	2	6	32988	32993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834680
1091	NC_010379	AACAGC	2	12	33022	33033	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	169834680
1092	NC_010379	TAC	2	6	33063	33068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834680
1093	NC_010379	CAT	2	6	33144	33149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834680
1094	NC_010379	TAA	2	6	33150	33155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834680
1095	NC_010379	ATC	2	6	33289	33294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834680
1096	NC_010379	TAA	2	6	33298	33303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834680
1097	NC_010379	T	6	6	33305	33310	0 %	100 %	0 %	0 %	169834680
1098	NC_010379	AATTAA	2	12	33367	33378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834680
1099	NC_010379	TCTTTT	2	12	33379	33390	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169834680
1100	NC_010379	T	6	6	33387	33392	0 %	100 %	0 %	0 %	169834680
1101	NC_010379	ATA	2	6	33436	33441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834680
1102	NC_010379	TAC	2	6	33469	33474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834680
1103	NC_010379	T	6	6	33481	33486	0 %	100 %	0 %	0 %	169834680
1104	NC_010379	A	6	6	33544	33549	100 %	0 %	0 %	0 %	169834680
1105	NC_010379	ATC	2	6	33562	33567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834680
1106	NC_010379	AT	4	8	33631	33638	50 %	50 %	0 %	0 %	169834680
1107	NC_010379	TCT	2	6	33677	33682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834680
1108	NC_010379	ACA	2	6	33721	33726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834680
1109	NC_010379	ATCT	2	8	33733	33740	25 %	50 %	0 %	25 %	169834680
1110	NC_010379	TCA	2	6	33830	33835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834654
1111	NC_010379	T	6	6	33840	33845	0 %	100 %	0 %	0 %	169834654
1112	NC_010379	TTA	2	6	33898	33903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834654
1113	NC_010379	TA	3	6	33914	33919	50 %	50 %	0 %	0 %	169834654
1114	NC_010379	TAA	2	6	33922	33927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834654
1115	NC_010379	CTAT	2	8	33954	33961	25 %	50 %	0 %	25 %	169834654
1116	NC_010379	TAA	2	6	33974	33979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834654
1117	NC_010379	TA	3	6	34053	34058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010379	CATT	2	8	34097	34104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_010379	ATT	2	6	34118	34123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010379	ATC	2	6	34129	34134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_010379	TCA	2	6	34136	34141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_010379	TAA	3	9	34147	34155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010379	A	6	6	34158	34163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010379	ATT	2	6	34165	34170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010379	ATA	2	6	34189	34194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010379	TTTA	2	8	34214	34221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010379	ATT	2	6	34229	34234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010379	TTGTA	2	10	34255	34264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010379	TTCT	2	8	34275	34282	0 %	75 %	0 %	25 %	169834552
1130	NC_010379	TA	3	6	34293	34298	50 %	50 %	0 %	0 %	169834552
1131	NC_010379	T	6	6	34350	34355	0 %	100 %	0 %	0 %	169834552
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1133	NC_010379	CAT	2	6	34503	34508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834552
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