MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 4674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010379	TAA	2	6	15077	15082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834534
502	NC_010379	TCC	2	6	15095	15100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_010379	TTAAA	2	10	15101	15110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010379	TAA	2	6	15115	15120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010379	AAATA	2	10	15166	15175	80 %	20 %	0 %	0 %	169834603
506	NC_010379	ATCTTC	2	12	15184	15195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169834603
507	NC_010379	ACT	2	6	15254	15259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834603
508	NC_010379	TCC	2	6	15277	15282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834603
509	NC_010379	TGT	2	6	15333	15338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834603
510	NC_010379	T	8	8	15356	15363	0 %	100 %	0 %	0 %	169834603
511	NC_010379	A	6	6	15368	15373	100 %	0 %	0 %	0 %	169834603
512	NC_010379	T	6	6	15383	15388	0 %	100 %	0 %	0 %	169834603
513	NC_010379	AT	3	6	15398	15403	50 %	50 %	0 %	0 %	169834603
514	NC_010379	TTC	2	6	15409	15414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834603
515	NC_010379	T	8	8	15423	15430	0 %	100 %	0 %	0 %	169834603
516	NC_010379	TTC	2	6	15436	15441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834603
517	NC_010379	TAT	2	6	15451	15456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834603
518	NC_010379	ATT	2	6	15463	15468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834603
519	NC_010379	T	6	6	15498	15503	0 %	100 %	0 %	0 %	169834603
520	NC_010379	ATT	2	6	15526	15531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010379	T	7	7	15632	15638	0 %	100 %	0 %	0 %	169834728
522	NC_010379	TACT	2	8	15650	15657	25 %	50 %	0 %	25 %	169834728
523	NC_010379	T	6	6	15688	15693	0 %	100 %	0 %	0 %	169834728
524	NC_010379	TAT	2	6	15716	15721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834728
525	NC_010379	TTTA	2	8	15732	15739	25 %	75 %	0 %	0 %	169834728
526	NC_010379	AT	3	6	15740	15745	50 %	50 %	0 %	0 %	169834728
527	NC_010379	TCC	2	6	15759	15764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834728
528	NC_010379	AT	3	6	15808	15813	50 %	50 %	0 %	0 %	169834728
529	NC_010379	T	6	6	15849	15854	0 %	100 %	0 %	0 %	169834728
530	NC_010379	ACT	2	6	15856	15861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834728
531	NC_010379	TTC	2	6	15870	15875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834728
532	NC_010379	TA	3	6	15890	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	169834728
533	NC_010379	TTC	2	6	15932	15937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010379	TATT	2	8	15944	15951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010379	TAAT	2	8	15982	15989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010379	TAT	2	6	15990	15995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010379	A	7	7	16004	16010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010379	CCA	2	6	16074	16079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169834724
539	NC_010379	TA	3	6	16081	16086	50 %	50 %	0 %	0 %	169834724
540	NC_010379	TTC	2	6	16097	16102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834724
541	NC_010379	ATC	2	6	16127	16132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834724
542	NC_010379	CTAT	2	8	16155	16162	25 %	50 %	0 %	25 %	169834724
543	NC_010379	TGC	2	6	16221	16226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834724
544	NC_010379	TCC	2	6	16322	16327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_010379	TTA	2	6	16354	16359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010379	ATTA	2	8	16364	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010379	TTA	3	9	16369	16377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010379	A	6	6	16383	16388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010379	TAT	2	6	16391	16396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010379	TA	3	6	16422	16427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010379	AT	3	6	16436	16441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010379	AAGA	2	8	16499	16506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010379	ATTA	2	8	16509	16516	50 %	50 %	0 %	0 %	169834620
554	NC_010379	CTTT	2	8	16522	16529	0 %	75 %	0 %	25 %	169834620
555	NC_010379	T	6	6	16527	16532	0 %	100 %	0 %	0 %	169834620
556	NC_010379	TAA	2	6	16555	16560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834620
557	NC_010379	TAA	2	6	16597	16602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834620
558	NC_010379	T	6	6	16631	16636	0 %	100 %	0 %	0 %	169834620
559	NC_010379	TA	4	8	16666	16673	50 %	50 %	0 %	0 %	169834620
560	NC_010379	AT	3	6	16714	16719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010379	ATT	2	6	16721	16726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010379	TTATTT	2	12	16740	16751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	169834718
563	NC_010379	TCT	2	6	16798	16803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834718
564	NC_010379	TCTTT	2	10	16813	16822	0 %	80 %	0 %	20 %	169834718
565	NC_010379	CTT	2	6	16829	16834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834718
566	NC_010379	TAT	2	6	16866	16871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834718
567	NC_010379	TTTGT	2	10	16895	16904	0 %	80 %	20 %	0 %	169834718
568	NC_010379	TC	3	6	16905	16910	0 %	50 %	0 %	50 %	169834718
569	NC_010379	GCA	2	6	16981	16986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834718
570	NC_010379	TCT	2	6	16993	16998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834718
571	NC_010379	AAT	2	6	17016	17021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834718
572	NC_010379	CTGTAT	2	12	17169	17180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169834704
573	NC_010379	TCATTT	2	12	17195	17206	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169834704
574	NC_010379	ATG	2	6	17265	17270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834704
575	NC_010379	ATT	2	6	17293	17298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834704
576	NC_010379	AT	3	6	17331	17336	50 %	50 %	0 %	0 %	169834704
577	NC_010379	CAT	2	6	17337	17342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834704
578	NC_010379	A	6	6	17357	17362	100 %	0 %	0 %	0 %	169834704
579	NC_010379	ATTT	2	8	17403	17410	25 %	75 %	0 %	0 %	169834704
580	NC_010379	AAT	2	6	17430	17435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834704
581	NC_010379	T	7	7	17467	17473	0 %	100 %	0 %	0 %	169834704
582	NC_010379	TAA	2	6	17506	17511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834704
583	NC_010379	CAT	2	6	17515	17520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834704
584	NC_010379	ATTAA	2	10	17537	17546	60 %	40 %	0 %	0 %	169834704
585	NC_010379	TTTCTT	2	12	17556	17567	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169834704
586	NC_010379	A	6	6	17613	17618	100 %	0 %	0 %	0 %	169834704
587	NC_010379	T	7	7	17623	17629	0 %	100 %	0 %	0 %	169834704
588	NC_010379	AT	3	6	17716	17721	50 %	50 %	0 %	0 %	169834704
589	NC_010379	ATT	2	6	17734	17739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834704
590	NC_010379	T	6	6	17744	17749	0 %	100 %	0 %	0 %	169834704
591	NC_010379	ATC	2	6	17750	17755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834704
592	NC_010379	A	6	6	17801	17806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010379	AT	3	6	17816	17821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010379	ACA	2	6	17842	17847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010379	TAAT	2	8	17863	17870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010379	TAT	2	6	17886	17891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010379	TA	4	8	17929	17936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010379	AATTAA	2	12	17948	17959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010379	ATTTA	2	10	17977	17986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010379	TCCA	2	8	17987	17994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_010379	TA	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010379	T	6	6	18098	18103	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
603	NC_010379	T	6	6	18126	18131	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
604	NC_010379	TTC	2	6	18169	18174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834577
605	NC_010379	TA	3	6	18181	18186	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
606	NC_010379	T	6	6	18193	18198	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
607	NC_010379	TTCATT	2	12	18218	18229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169834577
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609	NC_010379	TTA	2	6	18349	18354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834577
610	NC_010379	TTC	2	6	18410	18415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834577
611	NC_010379	T	6	6	18431	18436	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
612	NC_010379	TTC	2	6	18527	18532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834577
613	NC_010379	AAT	2	6	18537	18542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834577
614	NC_010379	T	7	7	18542	18548	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
615	NC_010379	TCT	2	6	18561	18566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834577
616	NC_010379	TAAAAG	2	12	18586	18597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169834577
617	NC_010379	TTC	2	6	18627	18632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834577
618	NC_010379	TTTA	2	8	18635	18642	25 %	75 %	0 %	0 %	169834577
619	NC_010379	AT	3	6	18733	18738	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
620	NC_010379	ATT	2	6	18741	18746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834577
621	NC_010379	AAT	2	6	18754	18759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834577
622	NC_010379	TA	4	8	18791	18798	50 %	50 %	0 %	0 %	169834577
623	NC_010379	T	6	6	18822	18827	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
624	NC_010379	ATA	2	6	18828	18833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834577
625	NC_010379	CTTT	2	8	18840	18847	0 %	75 %	0 %	25 %	169834577
626	NC_010379	ATT	2	6	18848	18853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834577
627	NC_010379	TAA	2	6	18865	18870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834577
628	NC_010379	TCT	2	6	18927	18932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834577
629	NC_010379	TTTG	2	8	18957	18964	0 %	75 %	25 %	0 %	169834577
630	NC_010379	CT	3	6	18978	18983	0 %	50 %	0 %	50 %	169834577
631	NC_010379	T	6	6	18989	18994	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
632	NC_010379	T	8	8	19039	19046	0 %	100 %	0 %	0 %	169834577
633	NC_010379	ATCTT	2	10	19047	19056	20 %	60 %	0 %	20 %	169834577
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