MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL01

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010335	TGCGT	2	10	94	103	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010335	CGGCG	2	10	204	213	0 %	0 %	60 %	40 %	167621729
3	NC_010335	GGCCT	2	10	238	247	0 %	20 %	40 %	40 %	167621729
4	NC_010335	CCGCC	2	10	518	527	0 %	0 %	20 %	80 %	167621729
5	NC_010335	CAGCC	2	10	1327	1336	20 %	0 %	20 %	60 %	167621729
6	NC_010335	GCCGG	2	10	3101	3110	0 %	0 %	60 %	40 %	167621731
7	NC_010335	GCCGG	2	10	3699	3708	0 %	0 %	60 %	40 %	167621731
8	NC_010335	CAGCC	2	10	5858	5867	20 %	0 %	20 %	60 %	167621733
9	NC_010335	CGGCG	2	10	6131	6140	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010335	GTCCC	2	10	6207	6216	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010335	GCCCG	2	10	6850	6859	0 %	0 %	40 %	60 %	167621734
12	NC_010335	CTCGC	2	10	7825	7834	0 %	20 %	20 %	60 %	167621736
13	NC_010335	GTCCG	2	10	9873	9882	0 %	20 %	40 %	40 %	167621738
14	NC_010335	GCGCG	2	10	11095	11104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010335	GCCCC	2	10	11196	11205	0 %	0 %	20 %	80 %	167621741
16	NC_010335	CCCCA	2	10	11895	11904	20 %	0 %	0 %	80 %	167621741
17	NC_010335	TGATC	2	10	14478	14487	20 %	40 %	20 %	20 %	167621745
18	NC_010335	GCCCT	2	10	14893	14902	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_010335	GCCGA	2	10	19685	19694	20 %	0 %	40 %	40 %	167621752
20	NC_010335	GCCGC	2	10	20103	20112	0 %	0 %	40 %	60 %	167621752
21	NC_010335	ATCCG	2	10	20679	20688	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010335	GGCGA	2	10	20928	20937	20 %	0 %	60 %	20 %	167621753
23	NC_010335	TTCCC	2	10	22210	22219	0 %	40 %	0 %	60 %	167621754
24	NC_010335	GGCGC	2	10	22232	22241	0 %	0 %	60 %	40 %	167621754
25	NC_010335	GACCG	2	10	22705	22714	20 %	0 %	40 %	40 %	167621755
26	NC_010335	CGCGG	2	10	22843	22852	0 %	0 %	60 %	40 %	167621755
27	NC_010335	GCTTG	2	10	23655	23664	0 %	40 %	40 %	20 %	167621755
28	NC_010335	GGTCC	2	10	25098	25107	0 %	20 %	40 %	40 %	167621755
29	NC_010335	TGGCC	2	10	25221	25230	0 %	20 %	40 %	40 %	167621755
30	NC_010335	GCCAG	2	10	25336	25345	20 %	0 %	40 %	40 %	167621755
31	NC_010335	CGGCC	2	10	25627	25636	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_010335	TCGCC	2	10	26669	26678	0 %	20 %	20 %	60 %	167621757
33	NC_010335	CATTG	2	10	27863	27872	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010335	GCCGC	2	10	28206	28215	0 %	0 %	40 %	60 %	167621759
35	NC_010335	GGGCC	2	10	28510	28519	0 %	0 %	60 %	40 %	167621759
36	NC_010335	CGGCG	2	10	30290	30299	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010335	TCGGC	2	10	30761	30770	0 %	20 %	40 %	40 %	167621762
38	NC_010335	CGCTG	2	10	31740	31749	0 %	20 %	40 %	40 %	167621763
39	NC_010335	CTTGC	2	10	32264	32273	0 %	40 %	20 %	40 %	167621764
40	NC_010335	GACCG	2	10	32321	32330	20 %	0 %	40 %	40 %	167621764
41	NC_010335	TATTC	2	10	33173	33182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010335	CGGCG	2	10	34056	34065	0 %	0 %	60 %	40 %	167621766
43	NC_010335	CGCGG	2	10	34504	34513	0 %	0 %	60 %	40 %	167621766
44	NC_010335	TCGCC	2	10	34679	34688	0 %	20 %	20 %	60 %	167621766
45	NC_010335	CGGCG	2	10	35430	35439	0 %	0 %	60 %	40 %	167621767
46	NC_010335	TTGGC	2	10	35699	35708	0 %	40 %	40 %	20 %	167621767
47	NC_010335	CGCGG	2	10	35752	35761	0 %	0 %	60 %	40 %	167621767
48	NC_010335	GCCCC	2	10	43874	43883	0 %	0 %	20 %	80 %	167621772
49	NC_010335	CGGCG	2	10	44085	44094	0 %	0 %	60 %	40 %	167621772
50	NC_010335	GACCA	2	10	44269	44278	40 %	0 %	20 %	40 %	167621772
51	NC_010335	AGGCC	2	10	44500	44509	20 %	0 %	40 %	40 %	167621772
52	NC_010335	GCCGC	2	10	44536	44545	0 %	0 %	40 %	60 %	167621772
53	NC_010335	GCCAA	2	10	45001	45010	40 %	0 %	20 %	40 %	167621773
54	NC_010335	CCGCC	2	10	46270	46279	0 %	0 %	20 %	80 %	167621774
55	NC_010335	GCCGC	2	10	47008	47017	0 %	0 %	40 %	60 %	167621775
56	NC_010335	GCGAA	2	10	49950	49959	40 %	0 %	40 %	20 %	167621780
57	NC_010335	CGGCG	2	10	52258	52267	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_010335	CGATC	2	10	52324	52333	20 %	20 %	20 %	40 %	167621782
59	NC_010335	CTGGG	2	10	54076	54085	0 %	20 %	60 %	20 %	167621783
60	NC_010335	CGGCG	2	10	55190	55199	0 %	0 %	60 %	40 %	167621784
61	NC_010335	CGACG	2	10	57687	57696	20 %	0 %	40 %	40 %	167621786
62	NC_010335	GCCGC	2	10	58528	58537	0 %	0 %	40 %	60 %	167621787
63	NC_010335	GCCGC	2	10	58805	58814	0 %	0 %	40 %	60 %	167621788
64	NC_010335	GCGCC	2	10	59864	59873	0 %	0 %	40 %	60 %	167621789
65	NC_010335	CGGCC	2	10	60085	60094	0 %	0 %	40 %	60 %	167621789
66	NC_010335	GATCA	2	10	63442	63451	40 %	20 %	20 %	20 %	167621791
67	NC_010335	TGGCG	2	10	63498	63507	0 %	20 %	60 %	20 %	167621791
68	NC_010335	GATCT	2	10	63687	63696	20 %	40 %	20 %	20 %	167621792
69	NC_010335	GCGTC	2	10	63788	63797	0 %	20 %	40 %	40 %	167621792
70	NC_010335	CGATC	2	10	64018	64027	20 %	20 %	20 %	40 %	167621793
71	NC_010335	CGGCG	2	10	65427	65436	0 %	0 %	60 %	40 %	167621794
72	NC_010335	TCGCC	2	10	66020	66029	0 %	20 %	20 %	60 %	167621794
73	NC_010335	CCGCG	2	10	66521	66530	0 %	0 %	40 %	60 %	167621795
74	NC_010335	CCGGG	2	10	68233	68242	0 %	0 %	60 %	40 %	167621797
75	NC_010335	CGATC	2	10	68749	68758	20 %	20 %	20 %	40 %	167621798
76	NC_010335	AGCCG	2	10	68970	68979	20 %	0 %	40 %	40 %	167621799
77	NC_010335	CCTGC	2	10	69307	69316	0 %	20 %	20 %	60 %	167621799
78	NC_010335	ACGGC	2	10	73453	73462	20 %	0 %	40 %	40 %	167621804
79	NC_010335	GCCGC	2	10	73657	73666	0 %	0 %	40 %	60 %	167621804
80	NC_010335	GTCCC	2	10	74611	74620	0 %	20 %	20 %	60 %	167621807
81	NC_010335	TCCGG	2	10	75253	75262	0 %	20 %	40 %	40 %	167621808
82	NC_010335	CGGCG	2	10	75593	75602	0 %	0 %	60 %	40 %	167621808
83	NC_010335	AGATC	2	10	75939	75948	40 %	20 %	20 %	20 %	167621809
84	NC_010335	GTGAC	2	10	76400	76409	20 %	20 %	40 %	20 %	167621809
85	NC_010335	GATCG	2	10	77131	77140	20 %	20 %	40 %	20 %	167621809
86	NC_010335	CCCCT	2	10	77870	77879	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
87	NC_010335	CCGAC	2	10	79411	79420	20 %	0 %	20 %	60 %	167621811
88	NC_010335	GTCAC	2	10	80030	80039	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_010335	CGCCC	2	10	80147	80156	0 %	0 %	20 %	80 %	167621812
90	NC_010335	CGCGC	2	10	80244	80253	0 %	0 %	40 %	60 %	167621812
91	NC_010335	AGGAT	2	10	81159	81168	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010335	CCCCG	2	10	81369	81378	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
93	NC_010335	GGCCG	2	10	82013	82022	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_010335	TTATG	2	10	83512	83521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010335	CGGTG	2	10	83635	83644	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010335	GATCG	2	10	84679	84688	20 %	20 %	40 %	20 %	167621817
97	NC_010335	GCCCT	2	10	85161	85170	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_010335	CGCGG	2	10	85562	85571	0 %	0 %	60 %	40 %	167621818
99	NC_010335	CGCCA	2	10	86836	86845	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_010335	GGGAG	2	10	87146	87155	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010335	CCCGC	2	10	87776	87785	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102	NC_010335	CAAGG	2	10	87914	87923	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010335	CGGCC	2	10	88534	88543	0 %	0 %	40 %	60 %	167621821
104	NC_010335	AGCGC	2	10	89381	89390	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_010335	GCCCC	2	10	89571	89580	0 %	0 %	20 %	80 %	167621822
106	NC_010335	AGGGG	2	10	89798	89807	20 %	0 %	80 %	0 %	167621822
107	NC_010335	CGCGC	2	10	91045	91054	0 %	0 %	40 %	60 %	167621823
108	NC_010335	GTTCA	2	10	92596	92605	20 %	40 %	20 %	20 %	167621825
109	NC_010335	GGCGG	2	10	93034	93043	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010335	ATCAG	2	10	97579	97588	40 %	20 %	20 %	20 %	167621831
111	NC_010335	TCCGG	2	10	98524	98533	0 %	20 %	40 %	40 %	167621833
112	NC_010335	GGACA	2	10	99960	99969	40 %	0 %	40 %	20 %	167621833
113	NC_010335	CAGGC	2	10	100870	100879	20 %	0 %	40 %	40 %	167621833
114	NC_010335	AGGGC	2	10	102213	102222	20 %	0 %	60 %	20 %	167621834
115	NC_010335	CGCGC	2	10	102457	102466	0 %	0 %	40 %	60 %	167621834
116	NC_010335	CGCGC	2	10	102985	102994	0 %	0 %	40 %	60 %	167621834
117	NC_010335	CCACG	2	10	104045	104054	20 %	0 %	20 %	60 %	167621835
118	NC_010335	GCGCC	2	10	104949	104958	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_010335	CTTCG	2	10	106302	106311	0 %	40 %	20 %	40 %	167621837
120	NC_010335	GGCGC	2	10	107116	107125	0 %	0 %	60 %	40 %	167621838
121	NC_010335	CACGC	2	10	109425	109434	20 %	0 %	20 %	60 %	167621838
122	NC_010335	CGATC	2	10	109995	110004	20 %	20 %	20 %	40 %	167621839
123	NC_010335	CGGCC	2	10	111230	111239	0 %	0 %	40 %	60 %	167621839
124	NC_010335	CCCAG	2	10	111499	111508	20 %	0 %	20 %	60 %	167621839
125	NC_010335	ACGCC	2	10	111838	111847	20 %	0 %	20 %	60 %	167621840
126	NC_010335	CGAGA	2	10	112987	112996	40 %	0 %	40 %	20 %	167621840
127	NC_010335	GCGCG	2	10	115228	115237	0 %	0 %	60 %	40 %	167621844
128	NC_010335	GACCG	2	10	115441	115450	20 %	0 %	40 %	40 %	167621844
129	NC_010335	GGCCC	2	10	116645	116654	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_010335	GTTTG	2	10	116900	116909	0 %	60 %	40 %	0 %	167621848
131	NC_010335	TGCTG	2	10	117377	117386	0 %	40 %	40 %	20 %	167621849
132	NC_010335	CCGCG	2	10	119814	119823	0 %	0 %	40 %	60 %	167621850
133	NC_010335	CGCAG	2	10	120837	120846	20 %	0 %	40 %	40 %	167621850
134	NC_010335	CGCGC	2	10	120997	121006	0 %	0 %	40 %	60 %	167621850
135	NC_010335	GCGCA	2	10	121255	121264	20 %	0 %	40 %	40 %	167621851
136	NC_010335	TCGGC	2	10	121838	121847	0 %	20 %	40 %	40 %	167621851
137	NC_010335	GGCGC	2	10	121851	121860	0 %	0 %	60 %	40 %	167621851
138	NC_010335	CGCGC	2	10	123834	123843	0 %	0 %	40 %	60 %	167621853
139	NC_010335	GACCG	2	10	124897	124906	20 %	0 %	40 %	40 %	167621854
140	NC_010335	GAGGG	2	10	125095	125104	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_010335	GCGCC	2	10	167243	167252	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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198	NC_010335	GCTCG	2	10	190716	190725	0 %	20 %	40 %	40 %	167621905
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258	NC_010335	CAGGC	2	10	232654	232663	20 %	0 %	40 %	40 %	167621939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.