MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL02

Total Repeats: 4089

< Previous123456789Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010333	CAGC	2	8	174103	174110	25 %	0 %	25 %	50 %	167621724
4002	NC_010333	GCC	2	6	174133	174138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621724
4003	NC_010333	GTC	2	6	174147	174152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621724
4004	NC_010333	GCA	2	6	174225	174230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_010333	GCC	2	6	174312	174317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621725
4006	NC_010333	GCC	2	6	174385	174390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621725
4007	NC_010333	GGC	2	6	174395	174400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621725
4008	NC_010333	CGA	2	6	174425	174430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621725
4009	NC_010333	CAGGA	2	10	174469	174478	40 %	0 %	40 %	20 %	167621725
4010	NC_010333	GCG	2	6	174546	174551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621725
4011	NC_010333	CCG	2	6	174628	174633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621725
4012	NC_010333	GCTC	2	8	174812	174819	0 %	25 %	25 %	50 %	167621725
4013	NC_010333	CCG	2	6	174853	174858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621725
4014	NC_010333	CGC	2	6	174881	174886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621725
4015	NC_010333	CCA	2	6	174978	174983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621725
4016	NC_010333	GCA	2	6	175014	175019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621725
4017	NC_010333	GCC	2	6	175032	175037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621725
4018	NC_010333	CAGG	2	8	175069	175076	25 %	0 %	50 %	25 %	167621725
4019	NC_010333	TCG	2	6	175109	175114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621725
4020	NC_010333	TCG	2	6	175174	175179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_010333	CGC	2	6	175233	175238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_010333	GCGCG	2	10	175281	175290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4023	NC_010333	GGCCCG	2	12	175313	175324	0 %	0 %	50 %	50 %	167621726
4024	NC_010333	CG	3	6	175323	175328	0 %	0 %	50 %	50 %	167621726
4025	NC_010333	ACC	2	6	175365	175370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621726
4026	NC_010333	GGC	2	6	175421	175426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621726
4027	NC_010333	CGG	3	9	175429	175437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621726
4028	NC_010333	CAG	2	6	175442	175447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621726
4029	NC_010333	TGAC	2	8	175539	175546	25 %	25 %	25 %	25 %	167621726
4030	NC_010333	GCC	2	6	175551	175556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621726
4031	NC_010333	GGC	2	6	175562	175567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621726
4032	NC_010333	GC	3	6	175589	175594	0 %	0 %	50 %	50 %	167621726
4033	NC_010333	GGC	2	6	175712	175717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621726
4034	NC_010333	ATC	2	6	175749	175754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621726
4035	NC_010333	GTT	2	6	175757	175762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621726
4036	NC_010333	CAG	2	6	175778	175783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621726
4037	NC_010333	GCTC	2	8	175818	175825	0 %	25 %	25 %	50 %	167621726
4038	NC_010333	CGCC	2	8	175835	175842	0 %	0 %	25 %	75 %	167621726
4039	NC_010333	TCG	2	6	175999	176004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621726
4040	NC_010333	CGA	2	6	176026	176031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621726
4041	NC_010333	GCA	2	6	176068	176073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621726
4042	NC_010333	CTGC	2	8	176095	176102	0 %	25 %	25 %	50 %	167621726
4043	NC_010333	GC	3	6	176147	176152	0 %	0 %	50 %	50 %	167621726
4044	NC_010333	GC	3	6	176235	176240	0 %	0 %	50 %	50 %	167621727
4045	NC_010333	ATCG	2	8	176245	176252	25 %	25 %	25 %	25 %	167621727
4046	NC_010333	CGG	2	6	176274	176279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4047	NC_010333	CGC	2	6	176353	176358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4048	NC_010333	CCA	2	6	176364	176369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621727
4049	NC_010333	TTCGC	2	10	176378	176387	0 %	40 %	20 %	40 %	167621727
4050	NC_010333	GCC	2	6	176402	176407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4051	NC_010333	TCG	2	6	176408	176413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621727
4052	NC_010333	GCCC	2	8	176420	176427	0 %	0 %	25 %	75 %	167621727
4053	NC_010333	CGG	2	6	176441	176446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4054	NC_010333	CGC	2	6	176449	176454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4055	NC_010333	GGGC	2	8	176476	176483	0 %	0 %	75 %	25 %	167621727
4056	NC_010333	GCG	2	6	176520	176525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4057	NC_010333	CGA	2	6	176529	176534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621727
4058	NC_010333	GCG	2	6	176575	176580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4059	NC_010333	AAC	2	6	176594	176599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621727
4060	NC_010333	GTA	2	6	176617	176622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621727
4061	NC_010333	GCG	2	6	176763	176768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4062	NC_010333	CGA	2	6	176811	176816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621727
4063	NC_010333	CCG	2	6	176818	176823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4064	NC_010333	TCG	2	6	176840	176845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621727
4065	NC_010333	CGC	3	9	176857	176865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4066	NC_010333	CGC	2	6	176880	176885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4067	NC_010333	GGC	2	6	176887	176892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4068	NC_010333	GCA	2	6	176916	176921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621727
4069	NC_010333	TCA	2	6	176934	176939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621727
4070	NC_010333	CCGAT	2	10	176940	176949	20 %	20 %	20 %	40 %	167621727
4071	NC_010333	GCC	2	6	176965	176970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4072	NC_010333	GC	3	6	176979	176984	0 %	0 %	50 %	50 %	167621727
4073	NC_010333	TGC	2	6	177018	177023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621727
4074	NC_010333	CAGG	2	8	177081	177088	25 %	0 %	50 %	25 %	167621727
4075	NC_010333	GGCC	2	8	177094	177101	0 %	0 %	50 %	50 %	167621727
4076	NC_010333	CCGA	2	8	177170	177177	25 %	0 %	25 %	50 %	167621727
4077	NC_010333	ACG	2	6	177179	177184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621727
4078	NC_010333	GGA	2	6	177188	177193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167621727
4079	NC_010333	ACC	2	6	177218	177223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621727
4080	NC_010333	GGCC	2	8	177257	177264	0 %	0 %	50 %	50 %	167621727
4081	NC_010333	GC	4	8	177270	177277	0 %	0 %	50 %	50 %	167621727
4082	NC_010333	GCG	2	6	177400	177405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4083	NC_010333	CGG	2	6	177440	177445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4084	NC_010333	GCC	2	6	177600	177605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621727
4085	NC_010333	GCG	2	6	177713	177718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621727
4086	NC_010333	GC	3	6	177778	177783	0 %	0 %	50 %	50 %	167621727
4087	NC_010333	CTC	2	6	177805	177810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621727
4088	NC_010333	TGGC	2	8	177824	177831	0 %	25 %	50 %	25 %	167621727
4089	NC_010333	GCT	2	6	177867	177872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous123456789Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.