MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 2852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010287	TCTT	2	8	110	117	0 %	75 %	0 %	25 %	166153974
2	NC_010287	TTGT	2	8	305	312	0 %	75 %	25 %	0 %	166153974
3	NC_010287	CATG	2	8	468	475	25 %	25 %	25 %	25 %	166153974
4	NC_010287	AAAG	2	8	883	890	75 %	0 %	25 %	0 %	166153974
5	NC_010287	GCTA	2	8	975	982	25 %	25 %	25 %	25 %	166153974
6	NC_010287	CATG	2	8	1294	1301	25 %	25 %	25 %	25 %	166153975
7	NC_010287	AGAT	2	8	1346	1353	50 %	25 %	25 %	0 %	166153975
8	NC_010287	AGGA	2	8	1424	1431	50 %	0 %	50 %	0 %	166153975
9	NC_010287	GTCT	2	8	1837	1844	0 %	50 %	25 %	25 %	166153975
10	NC_010287	TTTG	2	8	2044	2051	0 %	75 %	25 %	0 %	166153975
11	NC_010287	CCTT	2	8	2067	2074	0 %	50 %	0 %	50 %	166153975
12	NC_010287	AAGG	2	8	2314	2321	50 %	0 %	50 %	0 %	166153975
13	NC_010287	TTTG	2	8	4348	4355	0 %	75 %	25 %	0 %	166153977
14	NC_010287	TGCT	2	8	4430	4437	0 %	50 %	25 %	25 %	166153977
15	NC_010287	GTTT	2	8	4578	4585	0 %	75 %	25 %	0 %	166153977
16	NC_010287	CAGC	2	8	4657	4664	25 %	0 %	25 %	50 %	166153977
17	NC_010287	AAAC	2	8	4737	4744	75 %	0 %	0 %	25 %	166153977
18	NC_010287	AATC	2	8	4896	4903	50 %	25 %	0 %	25 %	166153977
19	NC_010287	CCTT	2	8	5366	5373	0 %	50 %	0 %	50 %	166153978
20	NC_010287	CTTT	2	8	5961	5968	0 %	75 %	0 %	25 %	166153978
21	NC_010287	CTTA	2	8	6240	6247	25 %	50 %	0 %	25 %	166153978
22	NC_010287	TTCG	2	8	6300	6307	0 %	50 %	25 %	25 %	166153978
23	NC_010287	TTCG	2	8	6642	6649	0 %	50 %	25 %	25 %	166153979
24	NC_010287	GAAA	2	8	6728	6735	75 %	0 %	25 %	0 %	166153979
25	NC_010287	TTCT	2	8	6760	6767	0 %	75 %	0 %	25 %	166153979
26	NC_010287	TTGT	2	8	7216	7223	0 %	75 %	25 %	0 %	166153979
27	NC_010287	TCTA	2	8	7683	7690	25 %	50 %	0 %	25 %	166153980
28	NC_010287	AAGA	2	8	7753	7760	75 %	0 %	25 %	0 %	166153980
29	NC_010287	TGTT	2	8	8211	8218	0 %	75 %	25 %	0 %	166153980
30	NC_010287	AATA	2	8	8412	8419	75 %	25 %	0 %	0 %	166153980
31	NC_010287	ACAT	2	8	8446	8453	50 %	25 %	0 %	25 %	166153980
32	NC_010287	GAAA	2	8	8589	8596	75 %	0 %	25 %	0 %	166153980
33	NC_010287	TTGC	2	8	9371	9378	0 %	50 %	25 %	25 %	166153980
34	NC_010287	GCTT	2	8	10419	10426	0 %	50 %	25 %	25 %	166153980
35	NC_010287	TCGA	2	8	10495	10502	25 %	25 %	25 %	25 %	166153980
36	NC_010287	GAAG	2	8	10835	10842	50 %	0 %	50 %	0 %	166153981
37	NC_010287	TAGG	2	8	11008	11015	25 %	25 %	50 %	0 %	166153981
38	NC_010287	TTAC	2	8	11294	11301	25 %	50 %	0 %	25 %	166153981
39	NC_010287	GAGT	2	8	11902	11909	25 %	25 %	50 %	0 %	166153981
40	NC_010287	GATG	2	8	12327	12334	25 %	25 %	50 %	0 %	166153981
41	NC_010287	AAAT	2	8	13207	13214	75 %	25 %	0 %	0 %	166153981
42	NC_010287	AGGG	2	8	13360	13367	25 %	0 %	75 %	0 %	166153981
43	NC_010287	TTCA	2	8	13642	13649	25 %	50 %	0 %	25 %	166153981
44	NC_010287	TAGT	2	8	13811	13818	25 %	50 %	25 %	0 %	166153982
45	NC_010287	TTTA	2	8	14223	14230	25 %	75 %	0 %	0 %	166153982
46	NC_010287	GGAT	2	8	14506	14513	25 %	25 %	50 %	0 %	166153982
47	NC_010287	TGCT	2	8	14587	14594	0 %	50 %	25 %	25 %	166153982
48	NC_010287	GATC	2	8	15153	15160	25 %	25 %	25 %	25 %	166153982
49	NC_010287	AGAA	2	8	15666	15673	75 %	0 %	25 %	0 %	166153983
50	NC_010287	AGAA	2	8	15841	15848	75 %	0 %	25 %	0 %	166153983
51	NC_010287	GCAG	2	8	16435	16442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010287	GAAA	2	8	16838	16845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010287	TTCA	2	8	17392	17399	25 %	50 %	0 %	25 %	166153984
54	NC_010287	CGTA	2	8	18031	18038	25 %	25 %	25 %	25 %	166153984
55	NC_010287	CTTT	2	8	20186	20193	0 %	75 %	0 %	25 %	166153985
56	NC_010287	TAAT	3	12	20972	20983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010287	TTTC	2	8	21212	21219	0 %	75 %	0 %	25 %	166153987
58	NC_010287	TATC	2	8	21731	21738	25 %	50 %	0 %	25 %	166153987
59	NC_010287	TCGG	2	8	22084	22091	0 %	25 %	50 %	25 %	166153987
60	NC_010287	TTCC	2	8	22254	22261	0 %	50 %	0 %	50 %	166153987
61	NC_010287	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	166153987
62	NC_010287	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	166153987
63	NC_010287	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	166153988
64	NC_010287	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	166153989
65	NC_010287	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	166153989
66	NC_010287	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	166153989
67	NC_010287	AAAG	2	8	24239	24246	75 %	0 %	25 %	0 %	166153989
68	NC_010287	GGAT	2	8	24519	24526	25 %	25 %	50 %	0 %	166153990
69	NC_010287	CTCC	2	8	24844	24851	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_010287	CCGA	2	8	25090	25097	25 %	0 %	25 %	50 %	166153991
71	NC_010287	CGAG	2	8	26408	26415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010287	AAAG	2	8	26647	26654	75 %	0 %	25 %	0 %	166153992
73	NC_010287	GCCT	2	8	27780	27787	0 %	25 %	25 %	50 %	166153992
74	NC_010287	CTAG	2	8	27954	27961	25 %	25 %	25 %	25 %	166153992
75	NC_010287	TGGC	2	8	28047	28054	0 %	25 %	50 %	25 %	166153992
76	NC_010287	AGCG	2	8	29191	29198	25 %	0 %	50 %	25 %	166153993
77	NC_010287	ATGA	2	8	29771	29778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010287	AGAA	2	8	29783	29790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010287	AGCT	2	8	29831	29838	25 %	25 %	25 %	25 %	166153994
80	NC_010287	GATA	2	8	30197	30204	50 %	25 %	25 %	0 %	166153995
81	NC_010287	GTTC	2	8	32705	32712	0 %	50 %	25 %	25 %	166153998
82	NC_010287	ACAA	2	8	32999	33006	75 %	0 %	0 %	25 %	166153999
83	NC_010287	TATT	2	8	33009	33016	25 %	75 %	0 %	0 %	166153999
84	NC_010287	GAAA	2	8	33900	33907	75 %	0 %	25 %	0 %	166154000
85	NC_010287	ACAA	2	8	34118	34125	75 %	0 %	0 %	25 %	166154000
86	NC_010287	GGTA	2	8	34831	34838	25 %	25 %	50 %	0 %	166154002
87	NC_010287	TTGC	2	8	35052	35059	0 %	50 %	25 %	25 %	166154002
88	NC_010287	TCTT	2	8	35142	35149	0 %	75 %	0 %	25 %	166154002
89	NC_010287	GAGG	2	8	35448	35455	25 %	0 %	75 %	0 %	166154002
90	NC_010287	CATC	2	8	35643	35650	25 %	25 %	0 %	50 %	166154002
91	NC_010287	CTTG	2	8	36977	36984	0 %	50 %	25 %	25 %	166154003
92	NC_010287	CAGC	2	8	37183	37190	25 %	0 %	25 %	50 %	166154003
93	NC_010287	GAAA	2	8	37539	37546	75 %	0 %	25 %	0 %	166154003
94	NC_010287	CAAT	2	8	37798	37805	50 %	25 %	0 %	25 %	166154003
95	NC_010287	ATTT	2	8	38747	38754	25 %	75 %	0 %	0 %	166154004
96	NC_010287	CTTT	2	8	38851	38858	0 %	75 %	0 %	25 %	166154004
97	NC_010287	AAGG	2	8	38890	38897	50 %	0 %	50 %	0 %	166154004
98	NC_010287	TTAT	2	8	39004	39011	25 %	75 %	0 %	0 %	166154004
99	NC_010287	ATTT	2	8	39630	39637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010287	ATAC	2	8	39803	39810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010287	TCGT	2	8	39948	39955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010287	AGGG	2	8	40113	40120	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010287	TTTG	2	8	40386	40393	0 %	75 %	25 %	0 %	166154005
104	NC_010287	CAGA	2	8	40903	40910	50 %	0 %	25 %	25 %	166154006
105	NC_010287	CTTC	2	8	40996	41003	0 %	50 %	0 %	50 %	166154006
106	NC_010287	AAAC	2	8	41212	41219	75 %	0 %	0 %	25 %	166154006
107	NC_010287	AACC	2	8	41240	41247	50 %	0 %	0 %	50 %	166154006
108	NC_010287	TTGA	2	8	41890	41897	25 %	50 %	25 %	0 %	166154006
109	NC_010287	GAAG	2	8	42234	42241	50 %	0 %	50 %	0 %	166154006
110	NC_010287	AATA	2	8	43054	43061	75 %	25 %	0 %	0 %	166154006
111	NC_010287	TTTA	2	8	43074	43081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010287	AAGC	2	8	43733	43740	50 %	0 %	25 %	25 %	166154009
113	NC_010287	TCAC	2	8	43909	43916	25 %	25 %	0 %	50 %	166154009
114	NC_010287	GATC	2	8	44332	44339	25 %	25 %	25 %	25 %	166154010
115	NC_010287	GAGT	2	8	45034	45041	25 %	25 %	50 %	0 %	166154011
116	NC_010287	TTCT	2	8	45814	45821	0 %	75 %	0 %	25 %	166154011
117	NC_010287	AGAA	2	8	46433	46440	75 %	0 %	25 %	0 %	166154012
118	NC_010287	TAAA	2	8	46664	46671	75 %	25 %	0 %	0 %	166154013
119	NC_010287	GAAG	2	8	46771	46778	50 %	0 %	50 %	0 %	166154013
120	NC_010287	GTTG	2	8	47328	47335	0 %	50 %	50 %	0 %	166154013
121	NC_010287	GAAG	2	8	47592	47599	50 %	0 %	50 %	0 %	166154014
122	NC_010287	TCTG	2	8	47703	47710	0 %	50 %	25 %	25 %	166154014
123	NC_010287	GGAG	2	8	48003	48010	25 %	0 %	75 %	0 %	166154014
124	NC_010287	TTGC	2	8	48686	48693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010287	AAGA	2	8	49542	49549	75 %	0 %	25 %	0 %	166154015
126	NC_010287	GCAG	2	8	50698	50705	25 %	0 %	50 %	25 %	166154016
127	NC_010287	AAAC	2	8	50992	50999	75 %	0 %	0 %	25 %	166154016
128	NC_010287	CCTC	2	8	52015	52022	0 %	25 %	0 %	75 %	166154016
129	NC_010287	AATC	2	8	52178	52185	50 %	25 %	0 %	25 %	166154016
130	NC_010287	GGAT	2	8	52669	52676	25 %	25 %	50 %	0 %	166154016
131	NC_010287	AGGA	2	8	52848	52855	50 %	0 %	50 %	0 %	166154016
132	NC_010287	TTTC	2	8	53624	53631	0 %	75 %	0 %	25 %	166154017
133	NC_010287	TGCC	2	8	54068	54075	0 %	25 %	25 %	50 %	166154017
134	NC_010287	GTTT	2	8	54248	54255	0 %	75 %	25 %	0 %	166154017
135	NC_010287	TACA	2	8	54795	54802	50 %	25 %	0 %	25 %	166154018
136	NC_010287	AGGA	2	8	54959	54966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010287	AGAA	2	8	54999	55006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010287	ATTT	2	8	55234	55241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010287	GATC	2	8	55944	55951	25 %	25 %	25 %	25 %	166154020
140	NC_010287	CAAT	2	8	56439	56446	50 %	25 %	0 %	25 %	166154020
141	NC_010287	TCTT	2	8	56455	56462	0 %	75 %	0 %	25 %	166154020
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