MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010287	CAG	2	6	186672	186677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154115
4003	NC_010287	TGC	2	6	186746	186751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154115
4004	NC_010287	ATT	2	6	186835	186840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154115
4005	NC_010287	CAGT	2	8	186875	186882	25 %	25 %	25 %	25 %	166154115
4006	NC_010287	TCT	2	6	187071	187076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154115
4007	NC_010287	AGT	2	6	187083	187088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154115
4008	NC_010287	ATC	2	6	187120	187125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154115
4009	NC_010287	ATT	2	6	187168	187173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154115
4010	NC_010287	TTG	2	6	187211	187216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154115
4011	NC_010287	CAAC	2	8	187220	187227	50 %	0 %	0 %	50 %	166154115
4012	NC_010287	AGG	2	6	187308	187313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154115
4013	NC_010287	AAG	2	6	187358	187363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154115
4014	NC_010287	TAG	2	6	187489	187494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154115
4015	NC_010287	TCTA	2	8	187613	187620	25 %	50 %	0 %	25 %	166154116
4016	NC_010287	AT	3	6	187660	187665	50 %	50 %	0 %	0 %	166154116
4017	NC_010287	CTT	2	6	187684	187689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154116
4018	NC_010287	AC	3	6	187699	187704	50 %	0 %	0 %	50 %	166154116
4019	NC_010287	GAA	2	6	187757	187762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154116
4020	NC_010287	TAT	2	6	187771	187776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154116
4021	NC_010287	AGG	2	6	187888	187893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154116
4022	NC_010287	GGAA	2	8	187942	187949	50 %	0 %	50 %	0 %	166154116
4023	NC_010287	AGA	2	6	188018	188023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154116
4024	NC_010287	GA	3	6	188040	188045	50 %	0 %	50 %	0 %	166154116
4025	NC_010287	GTT	2	6	188092	188097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154116
4026	NC_010287	TGA	2	6	188098	188103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154116
4027	NC_010287	GA	3	6	188164	188169	50 %	0 %	50 %	0 %	166154116
4028	NC_010287	GCT	2	6	188209	188214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154116
4029	NC_010287	TCT	2	6	188271	188276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154116
4030	NC_010287	ATA	2	6	188324	188329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154116
4031	NC_010287	GAG	2	6	188471	188476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154116
4032	NC_010287	TCAC	2	8	188518	188525	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_010287	AG	3	6	188568	188573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_010287	AGAGC	2	10	188588	188597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_010287	ATT	2	6	188637	188642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_010287	ATA	2	6	188675	188680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_010287	AAT	2	6	188756	188761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010287	TAA	2	6	188764	188769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_010287	GT	3	6	188816	188821	0 %	50 %	50 %	0 %	166154117
4040	NC_010287	TTTC	2	8	188918	188925	0 %	75 %	0 %	25 %	166154117
4041	NC_010287	ATT	2	6	189006	189011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154117
4042	NC_010287	AAT	2	6	189017	189022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154117
4043	NC_010287	CGT	2	6	189073	189078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154117
4044	NC_010287	GAT	2	6	189089	189094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154117
4045	NC_010287	TATG	2	8	189125	189132	25 %	50 %	25 %	0 %	166154117
4046	NC_010287	GCTT	2	8	189162	189169	0 %	50 %	25 %	25 %	166154117
4047	NC_010287	AGA	2	6	189205	189210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154117
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4052	NC_010287	ATA	2	6	189559	189564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154118
4053	NC_010287	A	6	6	189604	189609	100 %	0 %	0 %	0 %	166154118
4054	NC_010287	T	6	6	189623	189628	0 %	100 %	0 %	0 %	166154118
4055	NC_010287	T	6	6	189661	189666	0 %	100 %	0 %	0 %	166154118
4056	NC_010287	ATG	2	6	189768	189773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154118
4057	NC_010287	CAG	2	6	189781	189786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154118
4058	NC_010287	CTT	2	6	189813	189818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154118
4059	NC_010287	TGA	2	6	189835	189840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154118
4060	NC_010287	TGGT	2	8	189886	189893	0 %	50 %	50 %	0 %	166154118
4061	NC_010287	GAT	2	6	190061	190066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154118
4062	NC_010287	ACT	2	6	190172	190177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154118
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4065	NC_010287	TGT	2	6	190307	190312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154118
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4067	NC_010287	GAT	2	6	190352	190357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154118
4068	NC_010287	TGA	2	6	190358	190363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154118
4069	NC_010287	TAT	2	6	190409	190414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154118
4070	NC_010287	TGC	2	6	190418	190423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154118
4071	NC_010287	CTTC	2	8	190443	190450	0 %	50 %	0 %	50 %	166154118
4072	NC_010287	GTT	3	9	190461	190469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154118
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4077	NC_010287	GAC	2	6	190840	190845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154118
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4089	NC_010287	ATCT	2	8	191539	191546	25 %	50 %	0 %	25 %	166154119
4090	NC_010287	T	7	7	191548	191554	0 %	100 %	0 %	0 %	166154119
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4093	NC_010287	TCTGT	2	10	191656	191665	0 %	60 %	20 %	20 %	166154119
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4102	NC_010287	GCA	2	6	192057	192062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154119
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4106	NC_010287	TTGC	2	8	192234	192241	0 %	50 %	25 %	25 %	166154119
4107	NC_010287	AGA	2	6	192262	192267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154119
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4109	NC_010287	AG	3	6	192441	192446	50 %	0 %	50 %	0 %	166154120
4110	NC_010287	GT	4	8	192475	192482	0 %	50 %	50 %	0 %	166154120
4111	NC_010287	GGA	2	6	192555	192560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154120
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4114	NC_010287	AT	3	6	192756	192761	50 %	50 %	0 %	0 %	166154120
4115	NC_010287	TG	3	6	192831	192836	0 %	50 %	50 %	0 %	166154120
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4120	NC_010287	ATG	2	6	193141	193146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154120
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4122	NC_010287	GAA	2	6	193181	193186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154120
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4124	NC_010287	GA	3	6	193243	193248	50 %	0 %	50 %	0 %	166154120
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