MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010287	GGT	2	6	21150	21155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153987
502	NC_010287	TTTC	2	8	21212	21219	0 %	75 %	0 %	25 %	166153987
503	NC_010287	CTT	2	6	21276	21281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153987
504	NC_010287	T	6	6	21298	21303	0 %	100 %	0 %	0 %	166153987
505	NC_010287	AAG	2	6	21324	21329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153987
506	NC_010287	GCA	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153987
507	NC_010287	GTA	2	6	21404	21409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153987
508	NC_010287	CT	3	6	21453	21458	0 %	50 %	0 %	50 %	166153987
509	NC_010287	GGA	2	6	21460	21465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153987
510	NC_010287	G	6	6	21469	21474	0 %	0 %	100 %	0 %	166153987
511	NC_010287	TCT	2	6	21532	21537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153987
512	NC_010287	T	6	6	21556	21561	0 %	100 %	0 %	0 %	166153987
513	NC_010287	TGA	2	6	21577	21582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153987
514	NC_010287	AAG	2	6	21603	21608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153987
515	NC_010287	TTA	2	6	21653	21658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153987
516	NC_010287	CTT	2	6	21672	21677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153987
517	NC_010287	AAG	2	6	21690	21695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153987
518	NC_010287	TATC	2	8	21731	21738	25 %	50 %	0 %	25 %	166153987
519	NC_010287	ATC	2	6	21785	21790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153987
520	NC_010287	CT	3	6	21809	21814	0 %	50 %	0 %	50 %	166153987
521	NC_010287	AAG	2	6	21822	21827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153987
522	NC_010287	TC	3	6	21906	21911	0 %	50 %	0 %	50 %	166153987
523	NC_010287	A	7	7	21935	21941	100 %	0 %	0 %	0 %	166153987
524	NC_010287	GC	3	6	21975	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	166153987
525	NC_010287	AG	3	6	22046	22051	50 %	0 %	50 %	0 %	166153987
526	NC_010287	TCGG	2	8	22084	22091	0 %	25 %	50 %	25 %	166153987
527	NC_010287	CAG	2	6	22094	22099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153987
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529	NC_010287	AAG	2	6	22170	22175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153987
530	NC_010287	ATT	2	6	22230	22235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153987
531	NC_010287	AGA	2	6	22246	22251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153987
532	NC_010287	TTCC	2	8	22254	22261	0 %	50 %	0 %	50 %	166153987
533	NC_010287	GAG	2	6	22262	22267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153987
534	NC_010287	ATG	2	6	22317	22322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153987
535	NC_010287	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	166153987
536	NC_010287	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	166153987
537	NC_010287	GCT	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166153988
538	NC_010287	CAG	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153988
539	NC_010287	GA	3	6	22563	22568	50 %	0 %	50 %	0 %	166153988
540	NC_010287	TCT	2	6	22591	22596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153988
541	NC_010287	AGC	2	6	22626	22631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153988
542	NC_010287	GA	3	6	22670	22675	50 %	0 %	50 %	0 %	166153988
543	NC_010287	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153988
544	NC_010287	AGA	2	6	22776	22781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153988
545	NC_010287	GA	3	6	22814	22819	50 %	0 %	50 %	0 %	166153988
546	NC_010287	GTT	2	6	22827	22832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153988
547	NC_010287	TAT	2	6	22877	22882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153988
548	NC_010287	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	166153988
549	NC_010287	TCA	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153988
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551	NC_010287	TC	4	8	23183	23190	0 %	50 %	0 %	50 %	166153989
552	NC_010287	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	166153989
553	NC_010287	GCA	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153989
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555	NC_010287	AAT	2	6	23304	23309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153989
556	NC_010287	GTT	2	6	23417	23422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153989
557	NC_010287	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153989
558	NC_010287	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	166153989
559	NC_010287	GAA	2	6	23592	23597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153989
560	NC_010287	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	166153989
561	NC_010287	TTG	2	6	23679	23684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153989
562	NC_010287	AGA	3	9	23687	23695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153989
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571	NC_010287	CGA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153990
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577	NC_010287	CTA	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153990
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582	NC_010287	TCTGCA	2	12	24857	24868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_010287	AGC	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153991
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611	NC_010287	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532524909
612	NC_010287	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	532524909
613	NC_010287	TGT	2	6	26220	26225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532524909
614	NC_010287	T	6	6	26300	26305	0 %	100 %	0 %	0 %	532524909
615	NC_010287	CTT	2	6	26337	26342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010287	CGAG	2	8	26408	26415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_010287	T	7	7	26493	26499	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
618	NC_010287	GA	3	6	26504	26509	50 %	0 %	50 %	0 %	166153992
619	NC_010287	AG	3	6	26559	26564	50 %	0 %	50 %	0 %	166153992
620	NC_010287	TGT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153992
621	NC_010287	AAAG	2	8	26647	26654	75 %	0 %	25 %	0 %	166153992
622	NC_010287	T	6	6	26674	26679	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
623	NC_010287	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	166153992
624	NC_010287	GTT	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153992
625	NC_010287	T	6	6	26759	26764	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
626	NC_010287	T	6	6	26838	26843	0 %	100 %	0 %	0 %	166153992
627	NC_010287	GGT	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153992
628	NC_010287	AGA	2	6	26981	26986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153992
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