MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010287	TGCAG	2	10	232124	232133	20 %	20 %	40 %	20 %	166154155
5002	NC_010287	GAA	3	9	232135	232143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154155
5003	NC_010287	ATT	2	6	232149	232154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154155
5004	NC_010287	GTT	2	6	232157	232162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154155
5005	NC_010287	GGA	2	6	232165	232170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5006	NC_010287	GGAT	2	8	232184	232191	25 %	25 %	50 %	0 %	166154155
5007	NC_010287	TTG	2	6	232202	232207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154155
5008	NC_010287	TAA	2	6	232230	232235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154155
5009	NC_010287	AGG	2	6	232260	232265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5010	NC_010287	GAG	3	9	232340	232348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5011	NC_010287	GAGG	2	8	232415	232422	25 %	0 %	75 %	0 %	166154155
5012	NC_010287	ACA	2	6	232499	232504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154155
5013	NC_010287	GAA	2	6	232525	232530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154155
5014	NC_010287	AAT	2	6	232579	232584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154155
5015	NC_010287	CTTT	2	8	232588	232595	0 %	75 %	0 %	25 %	166154155
5016	NC_010287	TTA	2	6	232619	232624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154155
5017	NC_010287	TCT	2	6	232687	232692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154155
5018	NC_010287	GAA	2	6	232693	232698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154155
5019	NC_010287	AGA	2	6	232708	232713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154155
5020	NC_010287	GGA	2	6	232723	232728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5021	NC_010287	GGC	2	6	232807	232812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154155
5022	NC_010287	TGT	2	6	232896	232901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154155
5023	NC_010287	T	6	6	232901	232906	0 %	100 %	0 %	0 %	166154155
5024	NC_010287	TGA	2	6	232926	232931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154155
5025	NC_010287	AAC	2	6	233014	233019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154155
5026	NC_010287	GAG	2	6	233033	233038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5027	NC_010287	GGA	2	6	233083	233088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5028	NC_010287	TTC	2	6	233109	233114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154155
5029	NC_010287	CTAT	2	8	233138	233145	25 %	50 %	0 %	25 %	166154155
5030	NC_010287	ACG	2	6	233210	233215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154155
5031	NC_010287	AAAG	2	8	233236	233243	75 %	0 %	25 %	0 %	166154155
5032	NC_010287	CTG	2	6	233249	233254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154155
5033	NC_010287	AAAGT	2	10	233321	233330	60 %	20 %	20 %	0 %	166154155
5034	NC_010287	ACA	2	6	233349	233354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154155
5035	NC_010287	GCT	2	6	233434	233439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154155
5036	NC_010287	TCT	2	6	233521	233526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154155
5037	NC_010287	GAA	2	6	233559	233564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154155
5038	NC_010287	ACA	2	6	233572	233577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154155
5039	NC_010287	CCT	2	6	233618	233623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154155
5040	NC_010287	TCT	2	6	233626	233631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154155
5041	NC_010287	AGG	2	6	233639	233644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5042	NC_010287	CTC	2	6	233657	233662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154155
5043	NC_010287	GGA	2	6	233677	233682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5044	NC_010287	AGTT	2	8	233714	233721	25 %	50 %	25 %	0 %	166154155
5045	NC_010287	ACA	2	6	233725	233730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154155
5046	NC_010287	GAA	2	6	233760	233765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154155
5047	NC_010287	TGA	2	6	233805	233810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154155
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5049	NC_010287	GAA	2	6	234016	234021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154155
5050	NC_010287	TGTCT	2	10	234027	234036	0 %	60 %	20 %	20 %	166154155
5051	NC_010287	ATT	2	6	234092	234097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154155
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5053	NC_010287	TGG	2	6	234123	234128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154155
5054	NC_010287	TGG	2	6	234186	234191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166154155
5055	NC_010287	CTG	2	6	234197	234202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154155
5056	NC_010287	GCT	2	6	234250	234255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154155
5057	NC_010287	GTT	2	6	234310	234315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154155
5058	NC_010287	TA	3	6	234323	234328	50 %	50 %	0 %	0 %	166154155
5059	NC_010287	TTC	2	6	234352	234357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154155
5060	NC_010287	CTT	2	6	234431	234436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154155
5061	NC_010287	GAG	2	6	234446	234451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5062	NC_010287	AGG	2	6	234735	234740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5063	NC_010287	GGGA	2	8	234773	234780	25 %	0 %	75 %	0 %	166154155
5064	NC_010287	ATA	2	6	234827	234832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154155
5065	NC_010287	GGA	2	6	234883	234888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154155
5066	NC_010287	T	8	8	235011	235018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010287	GAG	2	6	235038	235043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_010287	TCTT	2	8	235053	235060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_010287	T	9	9	235059	235067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010287	T	7	7	235109	235115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_010287	ACT	2	6	235155	235160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154156
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5073	NC_010287	CTT	2	6	235314	235319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154156
5074	NC_010287	AGG	2	6	235331	235336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154156
5075	NC_010287	GGATTA	2	12	235353	235364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154156
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5078	NC_010287	TGC	2	6	235407	235412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154156
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5080	NC_010287	TGC	2	6	235580	235585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154156
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5082	NC_010287	TA	3	6	235657	235662	50 %	50 %	0 %	0 %	166154156
5083	NC_010287	A	7	7	235710	235716	100 %	0 %	0 %	0 %	166154156
5084	NC_010287	AAC	2	6	235754	235759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154156
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5089	NC_010287	TGA	2	6	235868	235873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154156
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5091	NC_010287	AGA	3	9	235945	235953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154156
5092	NC_010287	GTT	2	6	235968	235973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_010287	T	7	7	235972	235978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_010287	GCCTG	2	10	235986	235995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5095	NC_010287	TAA	2	6	235999	236004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010287	T	8	8	236015	236022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_010287	CGA	2	6	236037	236042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154157
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5099	NC_010287	CAG	2	6	236099	236104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154157
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5103	NC_010287	GGA	2	6	236227	236232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154157
5104	NC_010287	AGTA	2	8	236240	236247	50 %	25 %	25 %	0 %	166154157
5105	NC_010287	ATTT	2	8	236296	236303	25 %	75 %	0 %	0 %	166154157
5106	NC_010287	T	8	8	236301	236308	0 %	100 %	0 %	0 %	166154157
5107	NC_010287	T	7	7	236356	236362	0 %	100 %	0 %	0 %	166154158
5108	NC_010287	GGC	2	6	236418	236423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154158
5109	NC_010287	TGC	2	6	236424	236429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154158
5110	NC_010287	CTT	2	6	236497	236502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154158
5111	NC_010287	T	6	6	236524	236529	0 %	100 %	0 %	0 %	166154158
5112	NC_010287	CAAT	2	8	236532	236539	50 %	25 %	0 %	25 %	166154158
5113	NC_010287	AGA	2	6	236575	236580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154158
5114	NC_010287	AAAG	2	8	236660	236667	75 %	0 %	25 %	0 %	166154158
5115	NC_010287	A	7	7	236719	236725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010287	ATT	2	6	236747	236752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010287	CTT	2	6	236759	236764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_010287	TTTG	2	8	236793	236800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010287	AAG	2	6	236853	236858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010287	AGTT	2	8	236917	236924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_010287	TTA	2	6	237071	237076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154159
5122	NC_010287	GTT	2	6	237104	237109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154159
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5124	NC_010287	AT	3	6	237133	237138	50 %	50 %	0 %	0 %	166154159
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5244	NC_010287	TTG	2	6	243559	243564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154163
5245	NC_010287	TCGA	2	8	243601	243608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5246	NC_010287	A	8	8	243625	243632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_010287	T	6	6	243660	243665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_010287	GAA	2	6	243672	243677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_010287	AG	4	8	243811	243818	50 %	0 %	50 %	0 %	166154164
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5499	NC_010287	GCG	2	6	254963	254968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154171
5500	NC_010287	AGT	2	6	255022	255027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154171

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