MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 2848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010280	TCTT	2	8	110	117	0 %	75 %	0 %	25 %	166154849
2	NC_010280	TTGT	2	8	305	312	0 %	75 %	25 %	0 %	166154849
3	NC_010280	CATG	2	8	468	475	25 %	25 %	25 %	25 %	166154849
4	NC_010280	AAAG	2	8	883	890	75 %	0 %	25 %	0 %	166154849
5	NC_010280	GCTA	2	8	975	982	25 %	25 %	25 %	25 %	166154849
6	NC_010280	CATG	2	8	1294	1301	25 %	25 %	25 %	25 %	166154850
7	NC_010280	AGAT	2	8	1346	1353	50 %	25 %	25 %	0 %	166154850
8	NC_010280	AGGA	2	8	1424	1431	50 %	0 %	50 %	0 %	166154850
9	NC_010280	GTCT	2	8	1837	1844	0 %	50 %	25 %	25 %	166154850
10	NC_010280	TTTG	2	8	2044	2051	0 %	75 %	25 %	0 %	166154850
11	NC_010280	CCTT	2	8	2067	2074	0 %	50 %	0 %	50 %	166154850
12	NC_010280	AAGG	2	8	2314	2321	50 %	0 %	50 %	0 %	166154850
13	NC_010280	TTTG	2	8	4348	4355	0 %	75 %	25 %	0 %	166154852
14	NC_010280	TGCT	2	8	4430	4437	0 %	50 %	25 %	25 %	166154852
15	NC_010280	GTTT	2	8	4578	4585	0 %	75 %	25 %	0 %	166154852
16	NC_010280	CAGC	2	8	4657	4664	25 %	0 %	25 %	50 %	166154852
17	NC_010280	AAAC	2	8	4737	4744	75 %	0 %	0 %	25 %	166154852
18	NC_010280	AATC	2	8	4896	4903	50 %	25 %	0 %	25 %	166154852
19	NC_010280	CCTT	2	8	5366	5373	0 %	50 %	0 %	50 %	166154853
20	NC_010280	CTTT	2	8	5961	5968	0 %	75 %	0 %	25 %	166154853
21	NC_010280	CTTA	2	8	6240	6247	25 %	50 %	0 %	25 %	166154853
22	NC_010280	TTCG	2	8	6300	6307	0 %	50 %	25 %	25 %	166154853
23	NC_010280	TTCG	2	8	6642	6649	0 %	50 %	25 %	25 %	166154854
24	NC_010280	GAAA	2	8	6728	6735	75 %	0 %	25 %	0 %	166154854
25	NC_010280	TTCT	2	8	6760	6767	0 %	75 %	0 %	25 %	166154854
26	NC_010280	TTGT	2	8	7216	7223	0 %	75 %	25 %	0 %	166154854
27	NC_010280	TCTA	2	8	7683	7690	25 %	50 %	0 %	25 %	166154855
28	NC_010280	AAGA	2	8	7753	7760	75 %	0 %	25 %	0 %	166154855
29	NC_010280	TGTT	2	8	8211	8218	0 %	75 %	25 %	0 %	166154855
30	NC_010280	AATA	2	8	8412	8419	75 %	25 %	0 %	0 %	166154855
31	NC_010280	ACAT	2	8	8446	8453	50 %	25 %	0 %	25 %	166154855
32	NC_010280	GAAA	2	8	8589	8596	75 %	0 %	25 %	0 %	166154855
33	NC_010280	TTGC	2	8	9371	9378	0 %	50 %	25 %	25 %	166154855
34	NC_010280	GCTT	2	8	10419	10426	0 %	50 %	25 %	25 %	166154855
35	NC_010280	TCGA	2	8	10495	10502	25 %	25 %	25 %	25 %	166154855
36	NC_010280	GAAG	2	8	10835	10842	50 %	0 %	50 %	0 %	166154856
37	NC_010280	TAGG	2	8	11008	11015	25 %	25 %	50 %	0 %	166154856
38	NC_010280	TTAC	2	8	11294	11301	25 %	50 %	0 %	25 %	166154856
39	NC_010280	GAGT	2	8	11902	11909	25 %	25 %	50 %	0 %	166154856
40	NC_010280	GATG	2	8	12327	12334	25 %	25 %	50 %	0 %	166154856
41	NC_010280	AAAT	2	8	13207	13214	75 %	25 %	0 %	0 %	166154856
42	NC_010280	AGGG	2	8	13360	13367	25 %	0 %	75 %	0 %	166154856
43	NC_010280	TTCA	2	8	13642	13649	25 %	50 %	0 %	25 %	166154856
44	NC_010280	TAGT	2	8	13811	13818	25 %	50 %	25 %	0 %	166154857
45	NC_010280	TTTA	2	8	14223	14230	25 %	75 %	0 %	0 %	166154857
46	NC_010280	GGAT	2	8	14506	14513	25 %	25 %	50 %	0 %	166154857
47	NC_010280	TGCT	2	8	14587	14594	0 %	50 %	25 %	25 %	166154857
48	NC_010280	GATC	2	8	15153	15160	25 %	25 %	25 %	25 %	166154857
49	NC_010280	AGAA	2	8	15666	15673	75 %	0 %	25 %	0 %	166154858
50	NC_010280	AGAA	2	8	15841	15848	75 %	0 %	25 %	0 %	166154858
51	NC_010280	GCAG	2	8	16435	16442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010280	GAAA	2	8	16838	16845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010280	TTCA	2	8	17390	17397	25 %	50 %	0 %	25 %	166154859
54	NC_010280	CGTA	2	8	18029	18036	25 %	25 %	25 %	25 %	166154859
55	NC_010280	CTTT	2	8	20184	20191	0 %	75 %	0 %	25 %	166154860
56	NC_010280	TAAT	3	12	20970	20981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010280	TTTC	2	8	21210	21217	0 %	75 %	0 %	25 %	166154862
58	NC_010280	TATC	2	8	21729	21736	25 %	50 %	0 %	25 %	166154862
59	NC_010280	TCGG	2	8	22082	22089	0 %	25 %	50 %	25 %	166154862
60	NC_010280	TTCC	2	8	22252	22259	0 %	50 %	0 %	50 %	166154862
61	NC_010280	TTCT	2	8	22372	22379	0 %	75 %	0 %	25 %	166154862
62	NC_010280	AGGG	2	8	22424	22431	25 %	0 %	75 %	0 %	166154862
63	NC_010280	TTTC	2	8	22830	22837	0 %	75 %	0 %	25 %	166154863
64	NC_010280	TCTT	2	8	22924	22931	0 %	75 %	0 %	25 %	166154863
65	NC_010280	TACA	2	8	23214	23221	50 %	25 %	0 %	25 %	166154864
66	NC_010280	GGAA	2	8	23534	23541	50 %	0 %	50 %	0 %	166154864
67	NC_010280	AAAC	2	8	23611	23618	75 %	0 %	0 %	25 %	166154864
68	NC_010280	AAAG	2	8	24237	24244	75 %	0 %	25 %	0 %	166154864
69	NC_010280	GGAT	2	8	24517	24524	25 %	25 %	50 %	0 %	166154865
70	NC_010280	CTCC	2	8	24842	24849	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_010280	CCGA	2	8	25088	25095	25 %	0 %	25 %	50 %	166154866
72	NC_010280	CGAG	2	8	26406	26413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010280	AAAG	2	8	26645	26652	75 %	0 %	25 %	0 %	166154867
74	NC_010280	GCCT	2	8	27778	27785	0 %	25 %	25 %	50 %	166154867
75	NC_010280	CTAG	2	8	27952	27959	25 %	25 %	25 %	25 %	166154867
76	NC_010280	TGGC	2	8	28045	28052	0 %	25 %	50 %	25 %	166154867
77	NC_010280	AGCG	2	8	29189	29196	25 %	0 %	50 %	25 %	166154868
78	NC_010280	ATGA	2	8	29769	29776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010280	AGAA	2	8	29781	29788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010280	AGCT	2	8	29829	29836	25 %	25 %	25 %	25 %	166154869
81	NC_010280	GATA	2	8	30195	30202	50 %	25 %	25 %	0 %	166154870
82	NC_010280	GTTC	2	8	32703	32710	0 %	50 %	25 %	25 %	166154873
83	NC_010280	ACAA	2	8	32997	33004	75 %	0 %	0 %	25 %	166154874
84	NC_010280	TATT	2	8	33007	33014	25 %	75 %	0 %	0 %	166154874
85	NC_010280	GAAA	2	8	33898	33905	75 %	0 %	25 %	0 %	166154875
86	NC_010280	ACAA	2	8	34116	34123	75 %	0 %	0 %	25 %	166154875
87	NC_010280	GGTA	2	8	34829	34836	25 %	25 %	50 %	0 %	166154877
88	NC_010280	TTGC	2	8	35050	35057	0 %	50 %	25 %	25 %	166154877
89	NC_010280	TCTT	2	8	35140	35147	0 %	75 %	0 %	25 %	166154877
90	NC_010280	GAGG	2	8	35446	35453	25 %	0 %	75 %	0 %	166154877
91	NC_010280	CATC	2	8	35641	35648	25 %	25 %	0 %	50 %	166154877
92	NC_010280	CTTG	2	8	36975	36982	0 %	50 %	25 %	25 %	166154878
93	NC_010280	CAGC	2	8	37181	37188	25 %	0 %	25 %	50 %	166154878
94	NC_010280	GAAA	2	8	37537	37544	75 %	0 %	25 %	0 %	166154878
95	NC_010280	CAAT	2	8	37796	37803	50 %	25 %	0 %	25 %	166154878
96	NC_010280	ATTT	2	8	38745	38752	25 %	75 %	0 %	0 %	166154879
97	NC_010280	CTTT	2	8	38849	38856	0 %	75 %	0 %	25 %	166154879
98	NC_010280	AAGG	2	8	38888	38895	50 %	0 %	50 %	0 %	166154879
99	NC_010280	TTAT	2	8	39002	39009	25 %	75 %	0 %	0 %	166154879
100	NC_010280	ATTT	2	8	39628	39635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010280	ATAC	2	8	39808	39815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010280	TCGT	2	8	39953	39960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010280	AGGG	2	8	40118	40125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010280	TTTG	2	8	40391	40398	0 %	75 %	25 %	0 %	166154880
105	NC_010280	CAGA	2	8	40908	40915	50 %	0 %	25 %	25 %	166154881
106	NC_010280	CTTC	2	8	41001	41008	0 %	50 %	0 %	50 %	166154881
107	NC_010280	AAAC	2	8	41217	41224	75 %	0 %	0 %	25 %	166154881
108	NC_010280	AACC	2	8	41245	41252	50 %	0 %	0 %	50 %	166154881
109	NC_010280	TTGA	2	8	41895	41902	25 %	50 %	25 %	0 %	166154881
110	NC_010280	GAAG	2	8	42239	42246	50 %	0 %	50 %	0 %	166154881
111	NC_010280	AATA	2	8	43059	43066	75 %	25 %	0 %	0 %	166154881
112	NC_010280	TTTA	2	8	43079	43086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010280	AAGC	2	8	43738	43745	50 %	0 %	25 %	25 %	166154884
114	NC_010280	TCAC	2	8	43914	43921	25 %	25 %	0 %	50 %	166154884
115	NC_010280	GATC	2	8	44337	44344	25 %	25 %	25 %	25 %	166154885
116	NC_010280	GAGT	2	8	45039	45046	25 %	25 %	50 %	0 %	166154886
117	NC_010280	TTCT	2	8	45819	45826	0 %	75 %	0 %	25 %	166154886
118	NC_010280	AGAA	2	8	46438	46445	75 %	0 %	25 %	0 %	166154887
119	NC_010280	TAAA	2	8	46669	46676	75 %	25 %	0 %	0 %	166154888
120	NC_010280	GAAG	2	8	46776	46783	50 %	0 %	50 %	0 %	166154888
121	NC_010280	GTTG	2	8	47333	47340	0 %	50 %	50 %	0 %	166154888
122	NC_010280	GAAG	2	8	47597	47604	50 %	0 %	50 %	0 %	166154889
123	NC_010280	TCTG	2	8	47708	47715	0 %	50 %	25 %	25 %	166154889
124	NC_010280	GGAG	2	8	48008	48015	25 %	0 %	75 %	0 %	166154889
125	NC_010280	TTGC	2	8	48691	48698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010280	AAGA	2	8	49547	49554	75 %	0 %	25 %	0 %	166154890
127	NC_010280	GCAG	2	8	50703	50710	25 %	0 %	50 %	25 %	166154891
128	NC_010280	AAAC	2	8	50997	51004	75 %	0 %	0 %	25 %	166154891
129	NC_010280	CCTC	2	8	52020	52027	0 %	25 %	0 %	75 %	166154891
130	NC_010280	AATC	2	8	52183	52190	50 %	25 %	0 %	25 %	166154891
131	NC_010280	GGAT	2	8	52674	52681	25 %	25 %	50 %	0 %	166154891
132	NC_010280	AGGA	2	8	52853	52860	50 %	0 %	50 %	0 %	166154891
133	NC_010280	TTTC	2	8	53629	53636	0 %	75 %	0 %	25 %	166154892
134	NC_010280	TGCC	2	8	54073	54080	0 %	25 %	25 %	50 %	166154892
135	NC_010280	GTTT	2	8	54253	54260	0 %	75 %	25 %	0 %	166154892
136	NC_010280	TACA	2	8	54800	54807	50 %	25 %	0 %	25 %	166154893
137	NC_010280	AGGA	2	8	54964	54971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010280	AGAA	2	8	55004	55011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010280	ATTT	2	8	55239	55246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010280	GATC	2	8	55949	55956	25 %	25 %	25 %	25 %	166154895
141	NC_010280	CAAT	2	8	56444	56451	50 %	25 %	0 %	25 %	166154895
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143	NC_010280	ATCA	2	8	56634	56641	50 %	25 %	0 %	25 %	166154896
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