MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_010280	TTC	2	6	113957	113962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154939
2503	NC_010280	AGC	2	6	113972	113977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154939
2504	NC_010280	CTT	2	6	113980	113985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154939
2505	NC_010280	T	6	6	113991	113996	0 %	100 %	0 %	0 %	166154939
2506	NC_010280	ATC	2	6	114051	114056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154939
2507	NC_010280	TCA	2	6	114163	114168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154939
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2509	NC_010280	TTG	2	6	114254	114259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154939
2510	NC_010280	T	7	7	114294	114300	0 %	100 %	0 %	0 %	166154939
2511	NC_010280	AAG	2	6	114335	114340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154939
2512	NC_010280	AG	3	6	114347	114352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_010280	GAT	2	6	114364	114369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_010280	T	6	6	114416	114421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_010280	AGGG	2	8	114430	114437	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_010280	G	6	6	114435	114440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_010280	AG	3	6	114464	114469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_010280	CTT	2	6	114475	114480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_010280	CT	3	6	114486	114491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_010280	ATG	2	6	114506	114511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_010280	TTTTTA	2	12	114519	114530	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_010280	AG	3	6	114543	114548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_010280	GTT	2	6	114557	114562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_010280	GA	3	6	114566	114571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_010280	TTA	2	6	114591	114596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_010280	TGGCA	2	10	114637	114646	20 %	20 %	40 %	20 %	166154940
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2531	NC_010280	TGA	2	6	114772	114777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154940
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2537	NC_010280	TGAT	2	8	115110	115117	25 %	50 %	25 %	0 %	166154940
2538	NC_010280	CCG	2	6	115153	115158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166154940
2539	NC_010280	ATT	2	6	115172	115177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154940
2540	NC_010280	TGAA	2	8	115179	115186	50 %	25 %	25 %	0 %	166154940
2541	NC_010280	A	6	6	115190	115195	100 %	0 %	0 %	0 %	166154940
2542	NC_010280	TCG	2	6	115356	115361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154940
2543	NC_010280	TTAGA	2	10	115363	115372	40 %	40 %	20 %	0 %	166154940
2544	NC_010280	T	8	8	115420	115427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_010280	T	6	6	115489	115494	0 %	100 %	0 %	0 %	166154941
2546	NC_010280	AGG	2	6	115517	115522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154941
2547	NC_010280	A	8	8	115604	115611	100 %	0 %	0 %	0 %	166154941
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2551	NC_010280	GAA	2	6	115845	115850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154941
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2553	NC_010280	TAT	2	6	116048	116053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154942
2554	NC_010280	CTTT	2	8	116099	116106	0 %	75 %	0 %	25 %	166154942
2555	NC_010280	CGG	2	6	116151	116156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154942
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2557	NC_010280	AAG	2	6	116310	116315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154942
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2559	NC_010280	A	6	6	116354	116359	100 %	0 %	0 %	0 %	166154942
2560	NC_010280	TG	3	6	116373	116378	0 %	50 %	50 %	0 %	166154942
2561	NC_010280	GT	3	6	116404	116409	0 %	50 %	50 %	0 %	166154942
2562	NC_010280	ATT	2	6	116411	116416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154942
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2567	NC_010280	TAGT	2	8	116594	116601	25 %	50 %	25 %	0 %	166154943
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2573	NC_010280	ATC	2	6	116798	116803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154943
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2582	NC_010280	GGA	2	6	117174	117179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154943
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2593	NC_010280	GAAG	2	8	117770	117777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_010280	AAAT	2	8	117938	117945	75 %	25 %	0 %	0 %	166154944
2596	NC_010280	AAT	2	6	117948	117953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154944
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2599	NC_010280	CAC	2	6	118050	118055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154944
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2603	NC_010280	CGTGG	2	10	118343	118352	0 %	20 %	60 %	20 %	166154944
2604	NC_010280	AAGC	2	8	118390	118397	50 %	0 %	25 %	25 %	166154944
2605	NC_010280	CGC	2	6	118412	118417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166154944
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2608	NC_010280	GAC	2	6	118633	118638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154944
2609	NC_010280	GTA	2	6	118720	118725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154944
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2611	NC_010280	AG	3	6	118945	118950	50 %	0 %	50 %	0 %	166154944
2612	NC_010280	CCT	2	6	118951	118956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154944
2613	NC_010280	TGA	2	6	119001	119006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154944
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2617	NC_010280	GGA	2	6	119102	119107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154944
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2621	NC_010280	A	6	6	119575	119580	100 %	0 %	0 %	0 %	166154944
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2623	NC_010280	AAG	2	6	119631	119636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154944
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