MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010280	AGGGA	2	10	67799	67808	40 %	0 %	60 %	0 %	166154903
1502	NC_010280	AGAA	2	8	67937	67944	75 %	0 %	25 %	0 %	166154903
1503	NC_010280	TCA	2	6	67955	67960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154903
1504	NC_010280	CGAA	2	8	67970	67977	50 %	0 %	25 %	25 %	166154903
1505	NC_010280	GCT	2	6	68058	68063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154903
1506	NC_010280	CAT	2	6	68124	68129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154903
1507	NC_010280	GA	3	6	68137	68142	50 %	0 %	50 %	0 %	166154903
1508	NC_010280	GAGG	2	8	68196	68203	25 %	0 %	75 %	0 %	166154903
1509	NC_010280	TTA	2	6	68262	68267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154903
1510	NC_010280	A	6	6	68506	68511	100 %	0 %	0 %	0 %	166154904
1511	NC_010280	GT	3	6	68586	68591	0 %	50 %	50 %	0 %	166154904
1512	NC_010280	TTC	2	6	68619	68624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154904
1513	NC_010280	A	7	7	68895	68901	100 %	0 %	0 %	0 %	166154904
1514	NC_010280	GAT	2	6	68911	68916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154904
1515	NC_010280	TTC	2	6	69011	69016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154904
1516	NC_010280	A	6	6	69187	69192	100 %	0 %	0 %	0 %	166154904
1517	NC_010280	TCC	2	6	69210	69215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154904
1518	NC_010280	AGG	3	9	69222	69230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154904
1519	NC_010280	ATTAGG	2	12	69321	69332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154904
1520	NC_010280	GCG	2	6	69334	69339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154904
1521	NC_010280	ATT	2	6	69344	69349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154904
1522	NC_010280	AGC	2	6	69410	69415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154904
1523	NC_010280	GTA	2	6	69479	69484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154904
1524	NC_010280	T	6	6	69519	69524	0 %	100 %	0 %	0 %	166154904
1525	NC_010280	CAGC	2	8	69571	69578	25 %	0 %	25 %	50 %	166154904
1526	NC_010280	TTC	2	6	69647	69652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154904
1527	NC_010280	TCGT	2	8	69690	69697	0 %	50 %	25 %	25 %	166154904
1528	NC_010280	AG	3	6	69716	69721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010280	CTGT	2	8	69789	69796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_010280	TTCT	2	8	69947	69954	0 %	75 %	0 %	25 %	166154905
1531	NC_010280	TCC	2	6	69978	69983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154905
1532	NC_010280	TAT	2	6	70021	70026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154905
1533	NC_010280	CGT	2	6	70045	70050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154905
1534	NC_010280	GC	3	6	70053	70058	0 %	0 %	50 %	50 %	166154905
1535	NC_010280	TGT	2	6	70089	70094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154905
1536	NC_010280	TGA	2	6	70113	70118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154905
1537	NC_010280	GCA	2	6	70123	70128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154905
1538	NC_010280	TTG	2	6	70205	70210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154905
1539	NC_010280	A	6	6	70240	70245	100 %	0 %	0 %	0 %	166154905
1540	NC_010280	GAA	2	6	70251	70256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154905
1541	NC_010280	TC	3	6	70289	70294	0 %	50 %	0 %	50 %	166154905
1542	NC_010280	A	6	6	70313	70318	100 %	0 %	0 %	0 %	166154905
1543	NC_010280	GA	3	6	70328	70333	50 %	0 %	50 %	0 %	166154905
1544	NC_010280	CTT	2	6	70475	70480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154905
1545	NC_010280	AGA	2	6	70485	70490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154905
1546	NC_010280	TTC	2	6	70494	70499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154905
1547	NC_010280	CTT	2	6	70505	70510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154905
1548	NC_010280	CAA	2	6	70541	70546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154905
1549	NC_010280	T	6	6	70600	70605	0 %	100 %	0 %	0 %	166154905
1550	NC_010280	AAC	2	6	70647	70652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166154905
1551	NC_010280	TCT	3	9	70654	70662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154905
1552	NC_010280	CTTAA	2	10	70671	70680	40 %	40 %	0 %	20 %	166154905
1553	NC_010280	CGG	2	6	70697	70702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166154906
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1556	NC_010280	TGC	2	6	70754	70759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154906
1557	NC_010280	GAC	2	6	70843	70848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166154906
1558	NC_010280	AAAT	2	8	70863	70870	75 %	25 %	0 %	0 %	166154906
1559	NC_010280	TTG	2	6	70888	70893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154906
1560	NC_010280	ATAG	2	8	70931	70938	50 %	25 %	25 %	0 %	166154906
1561	NC_010280	TCA	2	6	70958	70963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154906
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1563	NC_010280	CCA	2	6	71073	71078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166154906
1564	NC_010280	TTC	2	6	71110	71115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154906
1565	NC_010280	GAT	2	6	71130	71135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154906
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1567	NC_010280	T	6	6	71242	71247	0 %	100 %	0 %	0 %	166154906
1568	NC_010280	AGT	2	6	71329	71334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154906
1569	NC_010280	GTA	2	6	71411	71416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154906
1570	NC_010280	T	6	6	71422	71427	0 %	100 %	0 %	0 %	166154906
1571	NC_010280	TAA	2	6	71453	71458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154906
1572	NC_010280	GCTT	2	8	71473	71480	0 %	50 %	25 %	25 %	166154906
1573	NC_010280	GGA	2	6	71481	71486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154906
1574	NC_010280	ATT	2	6	71494	71499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154906
1575	NC_010280	GAT	3	9	71521	71529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166154907
1576	NC_010280	GAG	2	6	71590	71595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154907
1577	NC_010280	GAG	2	6	71629	71634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154907
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1582	NC_010280	T	9	9	71845	71853	0 %	100 %	0 %	0 %	166154907
1583	NC_010280	TAA	2	6	71927	71932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154907
1584	NC_010280	TCC	2	6	71981	71986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166154907
1585	NC_010280	GT	3	6	72095	72100	0 %	50 %	50 %	0 %	166154907
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1591	NC_010280	CA	3	6	72454	72459	50 %	0 %	0 %	50 %	166154907
1592	NC_010280	CTA	2	6	72474	72479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_010280	A	7	7	72513	72519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010280	A	6	6	72521	72526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010280	AT	5	10	72557	72566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010280	AGG	2	6	72569	72574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010280	A	6	6	72608	72613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1600	NC_010280	TTC	2	6	72776	72781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154908
1601	NC_010280	AAG	2	6	72818	72823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154908
1602	NC_010280	TTC	2	6	72844	72849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154908
1603	NC_010280	CG	3	6	72856	72861	0 %	0 %	50 %	50 %	166154908
1604	NC_010280	TTG	2	6	72927	72932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154908
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1607	NC_010280	GA	3	6	73033	73038	50 %	0 %	50 %	0 %	166154908
1608	NC_010280	TCT	2	6	73056	73061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154908
1609	NC_010280	AGTG	2	8	73097	73104	25 %	25 %	50 %	0 %	166154908
1610	NC_010280	TTC	2	6	73161	73166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166154908
1611	NC_010280	ATT	2	6	73215	73220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154908
1612	NC_010280	TAA	2	6	73241	73246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166154908
1613	NC_010280	GAGT	2	8	73267	73274	25 %	25 %	50 %	0 %	166154908
1614	NC_010280	AGA	2	6	73283	73288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166154908
1615	NC_010280	TGC	2	6	73305	73310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166154909
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1618	NC_010280	TGT	2	6	73524	73529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166154909
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1621	NC_010280	ATC	2	6	73661	73666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166154909
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1623	NC_010280	GGA	2	6	73742	73747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166154909
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1625	NC_010280	TA	3	6	73791	73796	50 %	50 %	0 %	0 %	166154909
1626	NC_010280	ATT	2	6	73850	73855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166154909
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