MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010280	CT	3	6	637671	637676	0 %	50 %	0 %	50 %	166155372
14002	NC_010280	TTC	2	6	637699	637704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155372
14003	NC_010280	A	6	6	637804	637809	100 %	0 %	0 %	0 %	166155372
14004	NC_010280	GCT	2	6	637857	637862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155372
14005	NC_010280	TGA	2	6	637871	637876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155372
14006	NC_010280	AGA	2	6	637879	637884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155372
14007	NC_010280	ACA	2	6	637913	637918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155372
14008	NC_010280	GAA	2	6	637935	637940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155372
14009	NC_010280	TGA	2	6	637955	637960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155372
14010	NC_010280	AGT	2	6	637976	637981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155372
14011	NC_010280	AAAG	2	8	638063	638070	75 %	0 %	25 %	0 %	166155372
14012	NC_010280	CGT	2	6	638115	638120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155372
14013	NC_010280	TCCT	2	8	638160	638167	0 %	50 %	0 %	50 %	166155372
14014	NC_010280	GCA	2	6	638207	638212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155372
14015	NC_010280	GGA	2	6	638232	638237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155372
14016	NC_010280	GAT	2	6	638297	638302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155372
14017	NC_010280	TCC	2	6	638309	638314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155372
14018	NC_010280	CGC	2	6	638364	638369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	166155372
14019	NC_010280	TGTGT	2	10	638376	638385	0 %	60 %	40 %	0 %	166155372
14020	NC_010280	TGA	2	6	638390	638395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155372
14021	NC_010280	CAT	3	9	638498	638506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155372
14022	NC_010280	GTG	2	6	638545	638550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155372
14023	NC_010280	TGC	2	6	638609	638614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155372
14024	NC_010280	AAG	2	6	638619	638624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155372
14025	NC_010280	AAG	2	6	638686	638691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155372
14026	NC_010280	TAA	2	6	638720	638725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155372
14027	NC_010280	GGA	2	6	638858	638863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155372
14028	NC_010280	AAG	2	6	638902	638907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155372
14029	NC_010280	CG	4	8	638919	638926	0 %	0 %	50 %	50 %	166155372
14030	NC_010280	AGA	2	6	638933	638938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155372
14031	NC_010280	GTT	2	6	638943	638948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155372
14032	NC_010280	AGA	3	9	638957	638965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155372
14033	NC_010280	TGA	2	6	639017	639022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155372
14034	NC_010280	CTC	3	9	639042	639050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155373
14035	NC_010280	TAAAG	2	10	639263	639272	60 %	20 %	20 %	0 %	166155373
14036	NC_010280	GAT	2	6	639273	639278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155373
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14039	NC_010280	TGT	2	6	639419	639424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155373
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14042	NC_010280	CTT	2	6	639549	639554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155373
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14050	NC_010280	CTT	2	6	640015	640020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155373
14051	NC_010280	CAA	2	6	640032	640037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155373
14052	NC_010280	CTC	2	6	640050	640055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155373
14053	NC_010280	CAA	2	6	640065	640070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155373
14054	NC_010280	CAT	2	6	640139	640144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_010280	A	7	7	640151	640157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_010280	A	7	7	640165	640171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_010280	GCC	2	6	640184	640189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_010280	AATT	2	8	640218	640225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_010280	A	6	6	640235	640240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_010280	TTG	2	6	640256	640261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_010280	A	6	6	640263	640268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_010280	ATA	2	6	640285	640290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_010280	TCA	2	6	640334	640339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155374
14064	NC_010280	GAG	2	6	640495	640500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155374
14065	NC_010280	TGG	2	6	640523	640528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155374
14066	NC_010280	TGC	2	6	640532	640537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155374
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14069	NC_010280	AAAACA	2	12	640601	640612	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	166155374
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14071	NC_010280	AAG	2	6	640771	640776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155374
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14073	NC_010280	GAG	2	6	640879	640884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155374
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14077	NC_010280	TA	3	6	641035	641040	50 %	50 %	0 %	0 %	166155374
14078	NC_010280	GTC	2	6	641094	641099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155374
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14087	NC_010280	CTTA	2	8	641491	641498	25 %	50 %	0 %	25 %	166155374
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14091	NC_010280	ACG	2	6	641621	641626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155374
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14093	NC_010280	ATG	2	6	641734	641739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155374
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14100	NC_010280	CT	3	6	641964	641969	0 %	50 %	0 %	50 %	166155374
14101	NC_010280	ACA	2	6	641975	641980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155374
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14103	NC_010280	AAAAAG	2	12	642030	642041	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_010280	CCT	4	12	642114	642125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	166155375
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14106	NC_010280	ACC	2	6	642204	642209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155375
14107	NC_010280	TACA	2	8	642214	642221	50 %	25 %	0 %	25 %	166155375
14108	NC_010280	AAG	2	6	642256	642261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155375
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14112	NC_010280	TTGG	2	8	642387	642394	0 %	50 %	50 %	0 %	166155375
14113	NC_010280	TCA	2	6	642423	642428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155375
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14493	NC_010280	AT	3	6	659882	659887	50 %	50 %	0 %	0 %	166155390
14494	NC_010280	AGA	2	6	659917	659922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155390
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14498	NC_010280	CTA	2	6	660050	660055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155390
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