MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010280	GCG	2	6	254970	254975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166155046
5502	NC_010280	AGT	2	6	255029	255034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155046
5503	NC_010280	TAT	2	6	255044	255049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155046
5504	NC_010280	GGC	2	6	255050	255055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166155046
5505	NC_010280	TGC	2	6	255095	255100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155046
5506	NC_010280	TA	3	6	255121	255126	50 %	50 %	0 %	0 %	166155046
5507	NC_010280	CTGAA	2	10	255229	255238	40 %	20 %	20 %	20 %	166155046
5508	NC_010280	ATCT	2	8	255277	255284	25 %	50 %	0 %	25 %	166155046
5509	NC_010280	CAC	2	6	255342	255347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	166155046
5510	NC_010280	T	6	6	255376	255381	0 %	100 %	0 %	0 %	166155046
5511	NC_010280	CAAGA	2	10	255417	255426	60 %	0 %	20 %	20 %	166155046
5512	NC_010280	CTT	2	6	255427	255432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155046
5513	NC_010280	GAT	2	6	255552	255557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155046
5514	NC_010280	GCTAT	2	10	255591	255600	20 %	40 %	20 %	20 %	166155046
5515	NC_010280	AGG	2	6	255611	255616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155046
5516	NC_010280	TTAA	2	8	255657	255664	50 %	50 %	0 %	0 %	166155046
5517	NC_010280	GAA	2	6	255676	255681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155046
5518	NC_010280	TTA	2	6	255700	255705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155046
5519	NC_010280	CAG	2	6	255721	255726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155046
5520	NC_010280	GGT	2	6	255741	255746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155046
5521	NC_010280	ATG	2	6	255850	255855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155046
5522	NC_010280	AGCT	2	8	255863	255870	25 %	25 %	25 %	25 %	166155046
5523	NC_010280	TTC	2	6	255885	255890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155046
5524	NC_010280	GAT	2	6	255933	255938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155046
5525	NC_010280	GAA	2	6	255966	255971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155046
5526	NC_010280	GAA	2	6	255987	255992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155046
5527	NC_010280	GA	3	6	256015	256020	50 %	0 %	50 %	0 %	166155046
5528	NC_010280	AAG	2	6	256032	256037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155046
5529	NC_010280	ATCC	2	8	256114	256121	25 %	25 %	0 %	50 %	166155046
5530	NC_010280	GTG	2	6	256152	256157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155046
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5532	NC_010280	CTG	2	6	256210	256215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155046
5533	NC_010280	CT	3	6	256281	256286	0 %	50 %	0 %	50 %	166155046
5534	NC_010280	TGAT	2	8	256324	256331	25 %	50 %	25 %	0 %	166155046
5535	NC_010280	CAA	2	6	256345	256350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166155046
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5537	NC_010280	CTT	2	6	256510	256515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155046
5538	NC_010280	GTT	2	6	256601	256606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155046
5539	NC_010280	GAG	2	6	256618	256623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166155046
5540	NC_010280	TCA	2	6	256647	256652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155046
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5543	NC_010280	GAA	2	6	256856	256861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155046
5544	NC_010280	CCAG	2	8	257060	257067	25 %	0 %	25 %	50 %	166155046
5545	NC_010280	A	6	6	257073	257078	100 %	0 %	0 %	0 %	166155046
5546	NC_010280	A	6	6	257106	257111	100 %	0 %	0 %	0 %	166155046
5547	NC_010280	TAT	2	6	257127	257132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155046
5548	NC_010280	TCA	2	6	257142	257147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166155046
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5552	NC_010280	GAA	2	6	257252	257257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155046
5553	NC_010280	CTGT	2	8	257263	257270	0 %	50 %	25 %	25 %	166155046
5554	NC_010280	GAA	2	6	257277	257282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155046
5555	NC_010280	TAAT	2	8	257301	257308	50 %	50 %	0 %	0 %	166155046
5556	NC_010280	CAAC	2	8	257424	257431	50 %	0 %	0 %	50 %	166155047
5557	NC_010280	ATT	2	6	257465	257470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166155047
5558	NC_010280	GCG	2	6	257562	257567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	166155047
5559	NC_010280	T	6	6	257589	257594	0 %	100 %	0 %	0 %	166155047
5560	NC_010280	AG	3	6	257604	257609	50 %	0 %	50 %	0 %	166155047
5561	NC_010280	TTGG	2	8	257611	257618	0 %	50 %	50 %	0 %	166155047
5562	NC_010280	AAT	2	6	257620	257625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155047
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5565	NC_010280	GAAA	2	8	257754	257761	75 %	0 %	25 %	0 %	166155047
5566	NC_010280	TGC	2	6	257784	257789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166155047
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5568	NC_010280	TAG	2	6	257894	257899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155047
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5570	NC_010280	TCT	2	6	257927	257932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155047
5571	NC_010280	TGA	2	6	257945	257950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155047
5572	NC_010280	TCCTT	2	10	257951	257960	0 %	60 %	0 %	40 %	166155047
5573	NC_010280	GAT	2	6	257976	257981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155047
5574	NC_010280	TTGAT	2	10	258044	258053	20 %	60 %	20 %	0 %	166155047
5575	NC_010280	AGA	2	6	258066	258071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155047
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5581	NC_010280	GCA	2	6	258361	258366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166155047
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5583	NC_010280	T	8	8	258501	258508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_010280	ATA	2	6	258518	258523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_010280	TTA	2	6	258537	258542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5588	NC_010280	GAA	2	6	258677	258682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166155048
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5593	NC_010280	T	7	7	258968	258974	0 %	100 %	0 %	0 %	166155048
5594	NC_010280	A	6	6	259002	259007	100 %	0 %	0 %	0 %	166155048
5595	NC_010280	ATG	2	6	259088	259093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155048
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5601	NC_010280	ATG	2	6	259402	259407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010280	T	6	6	259415	259420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_010280	ATG	2	6	259431	259436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166155049
5604	NC_010280	GATA	2	8	259445	259452	50 %	25 %	25 %	0 %	166155049
5605	NC_010280	GGT	2	6	259499	259504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166155049
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5620	NC_010280	T	6	6	260074	260079	0 %	100 %	0 %	0 %	166155050
5621	NC_010280	TAA	2	6	260131	260136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166155050
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5623	NC_010280	GTT	2	6	260272	260277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166155050
5624	NC_010280	TTC	2	6	260288	260293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166155050
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5627	NC_010280	T	8	8	260369	260376	0 %	100 %	0 %	0 %	166155050
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5657	NC_010280	TA	3	6	261627	261632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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