MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 7412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010175	TG	3	6	296	301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010175	TC	3	6	435	440	0 %	50 %	0 %	50 %	163845604
3	NC_010175	GC	3	6	1548	1553	0 %	0 %	50 %	50 %	163845604
4	NC_010175	AG	3	6	3112	3117	50 %	0 %	50 %	0 %	163845605
5	NC_010175	CG	3	6	3465	3470	0 %	0 %	50 %	50 %	163845605
6	NC_010175	TC	3	6	3832	3837	0 %	50 %	0 %	50 %	163845605
7	NC_010175	GC	3	6	5792	5797	0 %	0 %	50 %	50 %	163845606
8	NC_010175	GC	3	6	5942	5947	0 %	0 %	50 %	50 %	163845606
9	NC_010175	GC	3	6	6950	6955	0 %	0 %	50 %	50 %	163845607
10	NC_010175	GT	3	6	8533	8538	0 %	50 %	50 %	0 %	163845608
11	NC_010175	CG	3	6	8590	8595	0 %	0 %	50 %	50 %	163845608
12	NC_010175	CT	3	6	10375	10380	0 %	50 %	0 %	50 %	163845609
13	NC_010175	CA	3	6	12687	12692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010175	CA	3	6	13535	13540	50 %	0 %	0 %	50 %	163845613
15	NC_010175	GC	3	6	14012	14017	0 %	0 %	50 %	50 %	163845614
16	NC_010175	GC	3	6	14205	14210	0 %	0 %	50 %	50 %	163845614
17	NC_010175	GT	3	6	14425	14430	0 %	50 %	50 %	0 %	163845614
18	NC_010175	GC	3	6	14676	14681	0 %	0 %	50 %	50 %	163845614
19	NC_010175	TC	3	6	15098	15103	0 %	50 %	0 %	50 %	163845614
20	NC_010175	GC	3	6	15513	15518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010175	AC	3	6	15638	15643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010175	AC	3	6	15745	15750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010175	GC	3	6	15914	15919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010175	AC	4	8	16260	16267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010175	AC	3	6	18068	18073	50 %	0 %	0 %	50 %	163845617
26	NC_010175	AG	3	6	18466	18471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010175	CA	4	8	19088	19095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010175	TC	4	8	21389	21396	0 %	50 %	0 %	50 %	163845619
29	NC_010175	TG	3	6	22573	22578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010175	CA	3	6	23323	23328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010175	CT	3	6	23354	23359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010175	CT	3	6	23614	23619	0 %	50 %	0 %	50 %	163845620
33	NC_010175	AG	3	6	24079	24084	50 %	0 %	50 %	0 %	163845620
34	NC_010175	CG	3	6	26499	26504	0 %	0 %	50 %	50 %	163845622
35	NC_010175	GC	3	6	27310	27315	0 %	0 %	50 %	50 %	163845623
36	NC_010175	GC	3	6	27543	27548	0 %	0 %	50 %	50 %	163845623
37	NC_010175	TG	3	6	28578	28583	0 %	50 %	50 %	0 %	163845624
38	NC_010175	GC	3	6	29219	29224	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
39	NC_010175	CG	3	6	29309	29314	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
40	NC_010175	GC	4	8	29409	29416	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
41	NC_010175	CG	3	6	30506	30511	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
42	NC_010175	AC	3	6	30543	30548	50 %	0 %	0 %	50 %	163845625
43	NC_010175	GC	3	6	30778	30783	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
44	NC_010175	AC	3	6	32139	32144	50 %	0 %	0 %	50 %	163845625
45	NC_010175	AC	3	6	32202	32207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010175	GT	3	6	32215	32220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010175	AC	3	6	32924	32929	50 %	0 %	0 %	50 %	163845626
48	NC_010175	AT	3	6	33832	33837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010175	AT	3	6	34785	34790	50 %	50 %	0 %	0 %	163845629
50	NC_010175	GC	3	6	36008	36013	0 %	0 %	50 %	50 %	163845629
51	NC_010175	CA	3	6	38272	38277	50 %	0 %	0 %	50 %	163845632
52	NC_010175	CA	3	6	39166	39171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010175	GA	3	6	39894	39899	50 %	0 %	50 %	0 %	163845633
54	NC_010175	GA	4	8	41688	41695	50 %	0 %	50 %	0 %	163845634
55	NC_010175	AC	3	6	42345	42350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010175	CT	3	6	42453	42458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010175	TG	3	6	44092	44097	0 %	50 %	50 %	0 %	163845638
58	NC_010175	GC	3	6	44353	44358	0 %	0 %	50 %	50 %	163845638
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60	NC_010175	AC	3	6	44987	44992	50 %	0 %	0 %	50 %	163845639
61	NC_010175	GC	3	6	45303	45308	0 %	0 %	50 %	50 %	163845639
62	NC_010175	CT	3	6	45495	45500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010175	GT	3	6	47010	47015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010175	GT	3	6	47161	47166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010175	AG	3	6	47369	47374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010175	AT	4	8	47827	47834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010175	GT	3	6	50601	50606	0 %	50 %	50 %	0 %	163845641
68	NC_010175	TC	3	6	50764	50769	0 %	50 %	0 %	50 %	163845641
69	NC_010175	GC	4	8	51089	51096	0 %	0 %	50 %	50 %	163845642
70	NC_010175	CA	3	6	52469	52474	50 %	0 %	0 %	50 %	163845643
71	NC_010175	CG	3	6	55886	55891	0 %	0 %	50 %	50 %	163845645
72	NC_010175	CG	3	6	55947	55952	0 %	0 %	50 %	50 %	163845645
73	NC_010175	TG	3	6	57004	57009	0 %	50 %	50 %	0 %	163845646
74	NC_010175	GC	3	6	57745	57750	0 %	0 %	50 %	50 %	163845647
75	NC_010175	CG	3	6	57783	57788	0 %	0 %	50 %	50 %	163845647
76	NC_010175	CT	3	6	58686	58691	0 %	50 %	0 %	50 %	163845649
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79	NC_010175	TA	3	6	59806	59811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010175	AT	3	6	59816	59821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010175	GC	3	6	61394	61399	0 %	0 %	50 %	50 %	163845652
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84	NC_010175	GA	3	6	64033	64038	50 %	0 %	50 %	0 %	163845653
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90	NC_010175	GC	3	6	69620	69625	0 %	0 %	50 %	50 %	163845658
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99	NC_010175	AC	3	6	76713	76718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010175	AC	3	6	76738	76743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010175	AC	3	6	76937	76942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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103	NC_010175	GC	3	6	77415	77420	0 %	0 %	50 %	50 %	163845664
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109	NC_010175	GC	3	6	81989	81994	0 %	0 %	50 %	50 %	163845669
110	NC_010175	CT	3	6	82316	82321	0 %	50 %	0 %	50 %	163845669
111	NC_010175	CG	3	6	82567	82572	0 %	0 %	50 %	50 %	163845669
112	NC_010175	GC	3	6	82804	82809	0 %	0 %	50 %	50 %	163845669
113	NC_010175	AC	3	6	82944	82949	50 %	0 %	0 %	50 %	163845669
114	NC_010175	CG	3	6	83067	83072	0 %	0 %	50 %	50 %	163845669
115	NC_010175	GC	3	6	83412	83417	0 %	0 %	50 %	50 %	163845669
116	NC_010175	GC	3	6	83587	83592	0 %	0 %	50 %	50 %	163845669
117	NC_010175	TC	3	6	83760	83765	0 %	50 %	0 %	50 %	163845669
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121	NC_010175	CA	3	6	85099	85104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010175	TG	3	6	86119	86124	0 %	50 %	50 %	0 %	163845671
123	NC_010175	AC	3	6	86657	86662	50 %	0 %	0 %	50 %	163845671
124	NC_010175	AC	3	6	86774	86779	50 %	0 %	0 %	50 %	163845672
125	NC_010175	GC	3	6	87590	87595	0 %	0 %	50 %	50 %	163845672
126	NC_010175	GC	3	6	88111	88116	0 %	0 %	50 %	50 %	163845672
127	NC_010175	AG	3	6	88372	88377	50 %	0 %	50 %	0 %	163845672
128	NC_010175	AG	3	6	88989	88994	50 %	0 %	50 %	0 %	163845672
129	NC_010175	GC	3	6	89304	89309	0 %	0 %	50 %	50 %	163845672
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131	NC_010175	GA	4	8	91054	91061	50 %	0 %	50 %	0 %	163845673
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