MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 104645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010175	CGTT	2	8	171761	171768	0 %	50 %	25 %	25 %	163845733
3502	NC_010175	GGT	2	6	171782	171787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845733
3503	NC_010175	GCGT	2	8	171922	171929	0 %	25 %	50 %	25 %	163845733
3504	NC_010175	GCG	2	6	171932	171937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845733
3505	NC_010175	GGA	2	6	171950	171955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845733
3506	NC_010175	GAT	2	6	171956	171961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845733
3507	NC_010175	CGGCAA	2	12	171989	172000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845733
3508	NC_010175	ACGTG	2	10	172118	172127	20 %	20 %	40 %	20 %	163845733
3509	NC_010175	GGTA	2	8	172156	172163	25 %	25 %	50 %	0 %	163845734
3510	NC_010175	TCA	2	6	172179	172184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845734
3511	NC_010175	TCG	2	6	172479	172484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845734
3512	NC_010175	TCA	2	6	172491	172496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845734
3513	NC_010175	CAC	2	6	172511	172516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845734
3514	NC_010175	ACA	2	6	172662	172667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845734
3515	NC_010175	TCA	2	6	172777	172782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845734
3516	NC_010175	ATC	2	6	172855	172860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845734
3517	NC_010175	TTG	2	6	172866	172871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845734
3518	NC_010175	ATT	2	6	172934	172939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845735
3519	NC_010175	TCGC	2	8	172970	172977	0 %	25 %	25 %	50 %	163845735
3520	NC_010175	CAAC	2	8	173027	173034	50 %	0 %	0 %	50 %	163845735
3521	NC_010175	TGA	2	6	173088	173093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845735
3522	NC_010175	ACA	2	6	173152	173157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845735
3523	NC_010175	GAT	2	6	173227	173232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845735
3524	NC_010175	A	6	6	173250	173255	100 %	0 %	0 %	0 %	163845735
3525	NC_010175	CAT	2	6	173264	173269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845735
3526	NC_010175	TGG	2	6	173321	173326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845735
3527	NC_010175	TCT	2	6	173343	173348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845735
3528	NC_010175	CA	3	6	173414	173419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_010175	AACG	2	8	173473	173480	50 %	0 %	25 %	25 %	163845736
3530	NC_010175	GCG	2	6	173510	173515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845736
3531	NC_010175	CTT	2	6	173557	173562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845736
3532	NC_010175	GCC	2	6	173573	173578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845736
3533	NC_010175	GTT	2	6	173590	173595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845736
3534	NC_010175	CTG	2	6	173600	173605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845736
3535	NC_010175	CGTG	2	8	173854	173861	0 %	25 %	50 %	25 %	163845736
3536	NC_010175	CACC	2	8	173891	173898	25 %	0 %	0 %	75 %	163845736
3537	NC_010175	TTG	2	6	173966	173971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845736
3538	NC_010175	GC	3	6	173977	173982	0 %	0 %	50 %	50 %	163845736
3539	NC_010175	TGG	2	6	174016	174021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845736
3540	NC_010175	TGC	2	6	174037	174042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845736
3541	NC_010175	GGC	2	6	174124	174129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845736
3542	NC_010175	TGCCC	2	10	174274	174283	0 %	20 %	20 %	60 %	163845736
3543	NC_010175	GCG	2	6	174285	174290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845736
3544	NC_010175	ATTCTG	2	12	174296	174307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	163845736
3545	NC_010175	TTG	2	6	174425	174430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845736
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3547	NC_010175	CGAG	2	8	174689	174696	25 %	0 %	50 %	25 %	163845737
3548	NC_010175	TGG	2	6	174723	174728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845737
3549	NC_010175	ACT	2	6	174793	174798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845737
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3552	NC_010175	GCC	2	6	174989	174994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845737
3553	NC_010175	AAG	2	6	175005	175010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845737
3554	NC_010175	GCC	2	6	175025	175030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845737
3555	NC_010175	GGCTA	2	10	175039	175048	20 %	20 %	40 %	20 %	163845737
3556	NC_010175	GTG	2	6	175107	175112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845737
3557	NC_010175	TGA	2	6	175279	175284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845737
3558	NC_010175	TGG	2	6	175339	175344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845737
3559	NC_010175	AACC	2	8	175378	175385	50 %	0 %	0 %	50 %	163845737
3560	NC_010175	TCG	2	6	175426	175431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845737
3561	NC_010175	ATT	2	6	175443	175448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845737
3562	NC_010175	GGC	2	6	175464	175469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845737
3563	NC_010175	AGG	2	6	175491	175496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_010175	GAT	2	6	175500	175505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845738
3565	NC_010175	AG	3	6	175509	175514	50 %	0 %	50 %	0 %	163845738
3566	NC_010175	CTG	2	6	175639	175644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845738
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3568	NC_010175	CT	3	6	175804	175809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_010175	CAGAG	2	10	175811	175820	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3570	NC_010175	GAG	3	9	175818	175826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010175	GTA	2	6	175828	175833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845739
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3574	NC_010175	GTG	2	6	175894	175899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845739
3575	NC_010175	GGATT	2	10	175906	175915	20 %	40 %	40 %	0 %	163845739
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3584	NC_010175	TGA	2	6	176225	176230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845739
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3587	NC_010175	AG	3	6	176405	176410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_010175	CGG	2	6	176953	176958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845740
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3601	NC_010175	AGGC	2	8	177270	177277	25 %	0 %	50 %	25 %	163845740
3602	NC_010175	ACCG	2	8	177284	177291	25 %	0 %	25 %	50 %	163845740
3603	NC_010175	GCCAC	2	10	177333	177342	20 %	0 %	20 %	60 %	163845740
3604	NC_010175	GCA	2	6	177365	177370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845740
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3608	NC_010175	GA	3	6	177641	177646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_010175	TGA	2	6	177726	177731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845741
3610	NC_010175	TGA	2	6	177780	177785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845741
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3612	NC_010175	TGT	2	6	177997	178002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845741
3613	NC_010175	CGCAG	2	10	178087	178096	20 %	0 %	40 %	40 %	163845741
3614	NC_010175	CTA	2	6	178196	178201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_010175	CCG	2	6	178206	178211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_010175	CTC	2	6	178248	178253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_010175	ACCAGC	2	12	178317	178328	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	163845742
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3619	NC_010175	CTG	2	6	178377	178382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845742
3620	NC_010175	TGGT	2	8	178413	178420	0 %	50 %	50 %	0 %	163845742
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3622	NC_010175	CGC	2	6	178523	178528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845742
3623	NC_010175	GTT	2	6	178623	178628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_010175	TCG	2	6	178663	178668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845743
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3643	NC_010175	GTG	2	6	179892	179897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3664	NC_010175	CGTGA	2	10	181023	181032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3738	NC_010175	GTG	2	6	184468	184473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3739	NC_010175	ACCGG	2	10	184537	184546	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3740	NC_010175	CAG	2	6	184592	184597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3742	NC_010175	GCT	2	6	184721	184726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3743	NC_010175	TGC	2	6	184766	184771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3744	NC_010175	GAC	2	6	184804	184809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3745	NC_010175	CGA	2	6	184832	184837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3746	NC_010175	CCA	2	6	184842	184847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3747	NC_010175	TCT	2	6	184929	184934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3998	NC_010175	AGA	2	6	199099	199104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845760
3999	NC_010175	GAA	2	6	199385	199390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845760
4000	NC_010175	CAG	3	9	199493	199501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845760

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