MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 104645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010175	C	6	6	123794	123799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2502	NC_010175	A	6	6	123814	123819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_010175	CTC	2	6	123827	123832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_010175	C	6	6	123832	123837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2505	NC_010175	CTC	2	6	123862	123867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_010175	C	6	6	123867	123872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2507	NC_010175	G	6	6	123876	123881	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_010175	G	6	6	123891	123896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2510	NC_010175	C	6	6	123953	123958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2511	NC_010175	G	6	6	123962	123967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_010175	G	6	6	123977	123982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_010175	CTC	2	6	124029	124034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_010175	CGG	2	6	124038	124043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_010175	GAG	2	6	124048	124053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2519	NC_010175	CTC	2	6	124128	124133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2520	NC_010175	C	6	6	124133	124138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2521	NC_010175	G	6	6	124142	124147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_010175	CAC	2	6	127175	127180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_010175	CAG	2	6	127190	127195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_010175	CTT	2	6	127209	127214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_010175	TCA	2	6	127215	127220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_010175	ACCA	2	8	127277	127284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2600	NC_010175	CGA	2	6	127330	127335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2605	NC_010175	TGC	2	6	127665	127670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_010175	CTG	2	6	127716	127721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_010175	CAT	2	6	127745	127750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2610	NC_010175	CAC	2	6	127887	127892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_010175	GCA	2	6	127948	127953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2616	NC_010175	CAC	2	6	128177	128182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2622	NC_010175	CAC	2	6	128476	128481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_010175	TGC	2	6	128544	128549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_010175	CTG	2	6	128595	128600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_010175	CAT	2	6	128624	128629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_010175	CGA	2	6	128637	128642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_010175	CAC	2	6	128721	128726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2628	NC_010175	TGC	2	6	128789	128794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_010175	CTG	2	6	128840	128845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_010175	CAT	2	6	128869	128874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_010175	CGA	2	6	128882	128887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_010175	CAC	2	6	129020	129025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2633	NC_010175	TGC	2	6	129088	129093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_010175	CAT	2	6	129168	129173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_010175	CGA	2	6	129181	129186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_010175	TGC	2	6	129333	129338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2658	NC_010175	CAT	2	6	130611	130616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2742	NC_010175	GTG	2	6	134465	134470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2743	NC_010175	GAA	3	9	134489	134497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2753	NC_010175	CTG	3	9	135128	135136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845699
2754	NC_010175	TCT	2	6	135201	135206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845699
2755	NC_010175	TGG	2	6	135232	135237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2756	NC_010175	TAT	2	6	135368	135373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2757	NC_010175	TTGA	2	8	135517	135524	25 %	50 %	25 %	0 %	163845700
2758	NC_010175	TGC	2	6	135606	135611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845700
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2766	NC_010175	CAT	2	6	135828	135833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845700
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2774	NC_010175	GCC	2	6	136248	136253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2775	NC_010175	TAC	2	6	136255	136260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2844	NC_010175	TGA	2	6	139085	139090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845702
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2857	NC_010175	C	7	7	139696	139702	0 %	0 %	0 %	100 %	163845702
2858	NC_010175	GCC	2	6	139800	139805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845702
2859	NC_010175	CCGGTG	2	12	139921	139932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163845702
2860	NC_010175	ACG	2	6	139945	139950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845702
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2862	NC_010175	GAA	2	6	140028	140033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845702
2863	NC_010175	GGT	2	6	140049	140054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845702
2864	NC_010175	CCGC	2	8	140113	140120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2865	NC_010175	AGG	2	6	140165	140170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2866	NC_010175	CCG	2	6	140207	140212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845703
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2869	NC_010175	CTCA	2	8	140357	140364	25 %	25 %	0 %	50 %	163845703
2870	NC_010175	ACG	2	6	140370	140375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845703
2871	NC_010175	CGC	2	6	140406	140411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845703
2872	NC_010175	ATC	2	6	140457	140462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845703
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2874	NC_010175	CGG	2	6	140572	140577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845703
2875	NC_010175	GCC	2	6	140667	140672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845703
2876	NC_010175	GC	4	8	140732	140739	0 %	0 %	50 %	50 %	163845703
2877	NC_010175	GCC	2	6	140772	140777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845703
2878	NC_010175	GCT	2	6	140804	140809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845703
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2880	NC_010175	CTG	2	6	140895	140900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845703
2881	NC_010175	CTG	2	6	140919	140924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845703
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2883	NC_010175	CTG	2	6	141003	141008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845703
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2912	NC_010175	TGG	2	6	142821	142826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2980	NC_010175	GCGGT	2	10	146698	146707	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2981	NC_010175	AG	3	6	146790	146795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2982	NC_010175	ATGT	2	8	146847	146854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2983	NC_010175	TGC	2	6	146882	146887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2985	NC_010175	ACG	2	6	146921	146926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2986	NC_010175	CTG	2	6	146933	146938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2988	NC_010175	GT	3	6	147001	147006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2989	NC_010175	ACA	2	6	147034	147039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2990	NC_010175	CGT	2	6	147051	147056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2991	NC_010175	CAACA	2	10	147065	147074	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2992	NC_010175	GTTGT	2	10	147104	147113	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2993	NC_010175	AGA	2	6	147143	147148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_010175	AAC	2	6	147157	147162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2995	NC_010175	CGT	2	6	147263	147268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845710
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2997	NC_010175	CAC	2	6	147353	147358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2998	NC_010175	TCAT	2	8	147435	147442	25 %	50 %	0 %	25 %	163845711
2999	NC_010175	GCG	2	6	147467	147472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845711
3000	NC_010175	CAG	2	6	147514	147519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845711

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