MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 104645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010175	GATC	2	8	74707	74714	25 %	25 %	25 %	25 %	163845661
1502	NC_010175	CAA	2	6	74727	74732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845661
1503	NC_010175	TTG	2	6	74736	74741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845661
1504	NC_010175	ACCG	2	8	74756	74763	25 %	0 %	25 %	50 %	163845661
1505	NC_010175	GTG	2	6	74793	74798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845661
1506	NC_010175	CTA	2	6	74938	74943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845661
1507	NC_010175	GAC	2	6	75005	75010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1508	NC_010175	CTC	2	6	75019	75024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845661
1509	NC_010175	CCA	2	6	75198	75203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845661
1510	NC_010175	ACGC	2	8	75253	75260	25 %	0 %	25 %	50 %	163845661
1511	NC_010175	GT	3	6	75270	75275	0 %	50 %	50 %	0 %	163845661
1512	NC_010175	GC	3	6	75277	75282	0 %	0 %	50 %	50 %	163845661
1513	NC_010175	AGT	2	6	75313	75318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845661
1514	NC_010175	CTG	2	6	75356	75361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1515	NC_010175	ACTGGC	2	12	75376	75387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1516	NC_010175	GTG	2	6	75389	75394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845661
1517	NC_010175	CAA	2	6	75409	75414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845661
1518	NC_010175	CTG	2	6	75497	75502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1519	NC_010175	CGG	2	6	75543	75548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845661
1520	NC_010175	GTATG	2	10	75602	75611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010175	CA	3	6	75628	75633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_010175	GAG	2	6	75636	75641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010175	AGC	2	6	75664	75669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845662
1524	NC_010175	GC	3	6	75676	75681	0 %	0 %	50 %	50 %	163845662
1525	NC_010175	CCG	2	6	75706	75711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845662
1526	NC_010175	GCC	2	6	75783	75788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845662
1527	NC_010175	CGTG	2	8	75922	75929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_010175	CAGTGG	2	12	76021	76032	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1529	NC_010175	GCCC	2	8	76051	76058	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1530	NC_010175	CCG	2	6	76059	76064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_010175	CAACTA	2	12	76099	76110	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_010175	AGC	2	6	76177	76182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_010175	TAA	2	6	76258	76263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010175	TCA	2	6	76276	76281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_010175	ATTG	2	8	76386	76393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010175	GCG	2	6	76431	76436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845663
1537	NC_010175	CCA	2	6	76444	76449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845663
1538	NC_010175	ACC	2	6	76500	76505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845663
1539	NC_010175	CAG	2	6	76535	76540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845663
1540	NC_010175	CGA	2	6	76688	76693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845663
1541	NC_010175	AC	3	6	76713	76718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_010175	AC	3	6	76738	76743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_010175	TAC	2	6	76783	76788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_010175	CCTGAG	2	12	76871	76882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_010175	GCA	2	6	76903	76908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_010175	ACG	2	6	76910	76915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_010175	TTGA	2	8	76916	76923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_010175	AC	3	6	76937	76942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_010175	CAACG	2	10	77053	77062	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1550	NC_010175	TAC	2	6	77126	77131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010175	GGC	2	6	77199	77204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845664
1552	NC_010175	GCC	2	6	77299	77304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845664
1553	NC_010175	GC	3	6	77343	77348	0 %	0 %	50 %	50 %	163845664
1554	NC_010175	CTT	2	6	77398	77403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845664
1555	NC_010175	GC	3	6	77415	77420	0 %	0 %	50 %	50 %	163845664
1556	NC_010175	CTG	2	6	77477	77482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845664
1557	NC_010175	CAG	2	6	77488	77493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845664
1558	NC_010175	TGCG	2	8	77532	77539	0 %	25 %	50 %	25 %	163845664
1559	NC_010175	CAT	2	6	77647	77652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845664
1560	NC_010175	GTT	2	6	77681	77686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845664
1561	NC_010175	CCA	2	6	77693	77698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845664
1562	NC_010175	GGC	2	6	77713	77718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845664
1563	NC_010175	AGA	2	6	77837	77842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845665
1564	NC_010175	ACG	2	6	77865	77870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845665
1565	NC_010175	TCT	2	6	77926	77931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845665
1566	NC_010175	CT	3	6	78076	78081	0 %	50 %	0 %	50 %	163845665
1567	NC_010175	AGGT	2	8	78087	78094	25 %	25 %	50 %	0 %	163845665
1568	NC_010175	AGC	2	6	78102	78107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845665
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1570	NC_010175	GAC	2	6	78287	78292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845665
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1572	NC_010175	CCG	2	6	78438	78443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845665
1573	NC_010175	CCG	2	6	78528	78533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845666
1574	NC_010175	CCT	2	6	78552	78557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845666
1575	NC_010175	GAGT	2	8	78592	78599	25 %	25 %	50 %	0 %	163845666
1576	NC_010175	CGAA	2	8	78600	78607	50 %	0 %	25 %	25 %	163845666
1577	NC_010175	TCA	2	6	78729	78734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845666
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1580	NC_010175	CGA	2	6	78931	78936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845666
1581	NC_010175	C	6	6	79000	79005	0 %	0 %	0 %	100 %	163845666
1582	NC_010175	CGCT	2	8	79010	79017	0 %	25 %	25 %	50 %	163845666
1583	NC_010175	ACC	2	6	79070	79075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845666
1584	NC_010175	CGG	2	6	79119	79124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845666
1585	NC_010175	GC	3	6	79131	79136	0 %	0 %	50 %	50 %	163845666
1586	NC_010175	GA	3	6	79283	79288	50 %	0 %	50 %	0 %	163845666
1587	NC_010175	CTGC	2	8	79296	79303	0 %	25 %	25 %	50 %	163845666
1588	NC_010175	CAC	2	6	79428	79433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845666
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1592	NC_010175	ATC	3	9	79555	79563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845667
1593	NC_010175	ACT	2	6	79570	79575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845667
1594	NC_010175	TCA	2	6	79622	79627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845667
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1596	NC_010175	ATC	2	6	79673	79678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845667
1597	NC_010175	CATC	2	8	79695	79702	25 %	25 %	0 %	50 %	163845667
1598	NC_010175	CG	3	6	79752	79757	0 %	0 %	50 %	50 %	163845667
1599	NC_010175	TAA	2	6	79842	79847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845667
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1601	NC_010175	ATA	2	6	80045	80050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845667
1602	NC_010175	GAT	2	6	80058	80063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845667
1603	NC_010175	CAG	2	6	80131	80136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845667
1604	NC_010175	GAAA	2	8	80156	80163	75 %	0 %	25 %	0 %	163845667
1605	NC_010175	ACGA	2	8	80218	80225	50 %	0 %	25 %	25 %	163845667
1606	NC_010175	GCC	2	6	80327	80332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845667
1607	NC_010175	TGA	2	6	80393	80398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845667
1608	NC_010175	AGG	2	6	80417	80422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845667
1609	NC_010175	CGCAG	2	10	80471	80480	20 %	0 %	40 %	40 %	163845667
1610	NC_010175	GAT	2	6	80550	80555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845667
1611	NC_010175	CCAGT	2	10	80560	80569	20 %	20 %	20 %	40 %	163845667
1612	NC_010175	CAACC	2	10	80641	80650	40 %	0 %	0 %	60 %	163845667
1613	NC_010175	GCT	2	6	80766	80771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845667
1614	NC_010175	TGC	2	6	80789	80794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845667
1615	NC_010175	GCA	2	6	80915	80920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845667
1616	NC_010175	CGG	2	6	80989	80994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845667
1617	NC_010175	GCT	2	6	81006	81011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845667
1618	NC_010175	ACC	2	6	81013	81018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845667
1619	NC_010175	CACC	2	8	81084	81091	25 %	0 %	0 %	75 %	163845667
1620	NC_010175	GGCAAG	2	12	81106	81117	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1621	NC_010175	TGT	2	6	81140	81145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010175	AAAAG	2	10	81167	81176	80 %	0 %	20 %	0 %	163845668
1623	NC_010175	A	7	7	81184	81190	100 %	0 %	0 %	0 %	163845668
1624	NC_010175	T	6	6	81198	81203	0 %	100 %	0 %	0 %	163845668
1625	NC_010175	GGGT	2	8	81221	81228	0 %	25 %	75 %	0 %	163845668
1626	NC_010175	TACT	2	8	81366	81373	25 %	50 %	0 %	25 %	163845668
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1628	NC_010175	TGA	3	9	81542	81550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845669
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1630	NC_010175	TGCC	2	8	81630	81637	0 %	25 %	25 %	50 %	163845669
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1633	NC_010175	CTCG	2	8	81822	81829	0 %	25 %	25 %	50 %	163845669
1634	NC_010175	TGGG	2	8	81839	81846	0 %	25 %	75 %	0 %	163845669
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1749	NC_010175	AC	3	6	86774	86779	50 %	0 %	0 %	50 %	163845672
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1754	NC_010175	GCA	2	6	87143	87148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845672
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1758	NC_010175	GAC	2	6	87330	87335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845672
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1762	NC_010175	GCG	2	6	87682	87687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845672
1763	NC_010175	CTG	2	6	87785	87790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845672
1764	NC_010175	CAGGC	2	10	87794	87803	20 %	0 %	40 %	40 %	163845672
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1877	NC_010175	CAC	2	6	93486	93491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845676
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