MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 104645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010175	CACTG	2	10	51181	51190	20 %	20 %	20 %	40 %	163845642
1002	NC_010175	GCG	2	6	51258	51263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845642
1003	NC_010175	GGA	2	6	51353	51358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845642
1004	NC_010175	ATTG	2	8	51418	51425	25 %	50 %	25 %	0 %	163845642
1005	NC_010175	TAC	2	6	51475	51480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845642
1006	NC_010175	GTT	2	6	51485	51490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845642
1007	NC_010175	TGA	2	6	51508	51513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845642
1008	NC_010175	CAA	2	6	51565	51570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845642
1009	NC_010175	CAC	2	6	51633	51638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845642
1010	NC_010175	GCC	2	6	51655	51660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845642
1011	NC_010175	ACC	2	6	51680	51685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845642
1012	NC_010175	TGC	2	6	51775	51780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845642
1013	NC_010175	ACTG	2	8	51790	51797	25 %	25 %	25 %	25 %	163845642
1014	NC_010175	CAG	2	6	51857	51862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845642
1015	NC_010175	TGC	2	6	51865	51870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845642
1016	NC_010175	CGC	2	6	51889	51894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845642
1017	NC_010175	CGTG	2	8	51925	51932	0 %	25 %	50 %	25 %	163845642
1018	NC_010175	CAC	2	6	51976	51981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_010175	GTA	2	6	52009	52014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010175	GTG	2	6	52114	52119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010175	ACA	2	6	52148	52153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010175	AGG	2	6	52165	52170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010175	CCGA	2	8	52228	52235	25 %	0 %	25 %	50 %	163845643
1024	NC_010175	TTG	2	6	52304	52309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845643
1025	NC_010175	TAC	2	6	52417	52422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845643
1026	NC_010175	ATG	2	6	52453	52458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845643
1027	NC_010175	CA	3	6	52469	52474	50 %	0 %	0 %	50 %	163845643
1028	NC_010175	TGA	2	6	52533	52538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845643
1029	NC_010175	CCG	2	6	52593	52598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845643
1030	NC_010175	TTGA	2	8	52654	52661	25 %	50 %	25 %	0 %	163845643
1031	NC_010175	TTG	2	6	52691	52696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845643
1032	NC_010175	AGG	2	6	52730	52735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845643
1033	NC_010175	GACGGT	2	12	52888	52899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163845643
1034	NC_010175	TTC	2	6	52906	52911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845643
1035	NC_010175	TGA	2	6	52917	52922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845643
1036	NC_010175	ACG	2	6	53009	53014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845643
1037	NC_010175	GTGC	2	8	53044	53051	0 %	25 %	50 %	25 %	163845643
1038	NC_010175	GGT	2	6	53056	53061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845643
1039	NC_010175	GGTC	2	8	53079	53086	0 %	25 %	50 %	25 %	163845643
1040	NC_010175	TCA	2	6	53093	53098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845643
1041	NC_010175	TAC	2	6	53152	53157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845643
1042	NC_010175	CAT	2	6	53187	53192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845643
1043	NC_010175	TCGG	2	8	53252	53259	0 %	25 %	50 %	25 %	163845643
1044	NC_010175	GCC	2	6	53314	53319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845643
1045	NC_010175	CGAA	2	8	53361	53368	50 %	0 %	25 %	25 %	163845643
1046	NC_010175	TTCG	2	8	53510	53517	0 %	50 %	25 %	25 %	163845643
1047	NC_010175	CAGG	2	8	53602	53609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_010175	CCTG	2	8	53630	53637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_010175	CTCC	2	8	53677	53684	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1050	NC_010175	AGG	2	6	53765	53770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010175	A	6	6	53785	53790	100 %	0 %	0 %	0 %	163845644
1052	NC_010175	TCG	2	6	53802	53807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845644
1053	NC_010175	TCA	2	6	53880	53885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845644
1054	NC_010175	ACG	2	6	53922	53927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845644
1055	NC_010175	ATC	2	6	53930	53935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845644
1056	NC_010175	CTA	2	6	53959	53964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845644
1057	NC_010175	CAG	2	6	53982	53987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845644
1058	NC_010175	AAT	2	6	54011	54016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845644
1059	NC_010175	TGG	2	6	54023	54028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845644
1060	NC_010175	CGA	2	6	54034	54039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845644
1061	NC_010175	TTC	2	6	54044	54049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845644
1062	NC_010175	GCCTT	2	10	54098	54107	0 %	40 %	20 %	40 %	163845644
1063	NC_010175	TCG	2	6	54129	54134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845644
1064	NC_010175	GGC	2	6	54194	54199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845644
1065	NC_010175	GTG	2	6	54228	54233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845644
1066	NC_010175	GAG	2	6	54266	54271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845644
1067	NC_010175	GGCG	2	8	54276	54283	0 %	0 %	75 %	25 %	163845644
1068	NC_010175	ATG	2	6	54308	54313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845644
1069	NC_010175	CGC	2	6	54365	54370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845644
1070	NC_010175	TGA	2	6	54427	54432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845644
1071	NC_010175	GAG	2	6	54449	54454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845644
1072	NC_010175	GGT	2	6	54463	54468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845644
1073	NC_010175	ACT	2	6	54606	54611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845644
1074	NC_010175	GTG	2	6	54620	54625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845644
1075	NC_010175	CCT	2	6	54700	54705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845644
1076	NC_010175	CCA	2	6	54726	54731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845644
1077	NC_010175	AAC	2	6	54748	54753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845644
1078	NC_010175	CAA	2	6	54763	54768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845644
1079	NC_010175	CGG	2	6	54806	54811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845644
1080	NC_010175	GAA	2	6	54823	54828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845644
1081	NC_010175	CAT	2	6	54843	54848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845644
1082	NC_010175	GCGT	2	8	54856	54863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_010175	TGT	2	6	54869	54874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010175	ATC	2	6	54884	54889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_010175	TCC	2	6	55040	55045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845645
1086	NC_010175	CGT	2	6	55084	55089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845645
1087	NC_010175	GCA	2	6	55095	55100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845645
1088	NC_010175	TCG	2	6	55144	55149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845645
1089	NC_010175	CGTG	2	8	55164	55171	0 %	25 %	50 %	25 %	163845645
1090	NC_010175	GAA	2	6	55195	55200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845645
1091	NC_010175	CGG	2	6	55316	55321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845645
1092	NC_010175	CTG	2	6	55339	55344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845645
1093	NC_010175	GCG	2	6	55456	55461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845645
1094	NC_010175	TTG	2	6	55493	55498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845645
1095	NC_010175	TTG	2	6	55550	55555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845645
1096	NC_010175	C	6	6	55583	55588	0 %	0 %	0 %	100 %	163845645
1097	NC_010175	TGG	2	6	55635	55640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845645
1098	NC_010175	TGC	2	6	55740	55745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845645
1099	NC_010175	ATTC	2	8	55766	55773	25 %	50 %	0 %	25 %	163845645
1100	NC_010175	CTG	2	6	55783	55788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845645
1101	NC_010175	A	6	6	55792	55797	100 %	0 %	0 %	0 %	163845645
1102	NC_010175	CGA	2	6	55818	55823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845645
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1104	NC_010175	GGC	2	6	55866	55871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845645
1105	NC_010175	CG	3	6	55886	55891	0 %	0 %	50 %	50 %	163845645
1106	NC_010175	AAC	2	6	55905	55910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845645
1107	NC_010175	GATC	2	8	55929	55936	25 %	25 %	25 %	25 %	163845645
1108	NC_010175	CG	3	6	55947	55952	0 %	0 %	50 %	50 %	163845645
1109	NC_010175	GTT	3	9	55968	55976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845645
1110	NC_010175	TGG	2	6	55995	56000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845645
1111	NC_010175	CGA	2	6	56034	56039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845645
1112	NC_010175	GCC	2	6	56047	56052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845645
1113	NC_010175	GTG	2	6	56140	56145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845645
1114	NC_010175	GCC	2	6	56210	56215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845645
1115	NC_010175	CGG	3	9	56247	56255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845645
1116	NC_010175	TCA	2	6	56273	56278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845645
1117	NC_010175	ACGCA	2	10	56290	56299	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_010175	ACG	2	6	56320	56325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845646
1119	NC_010175	GTT	2	6	56399	56404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845646
1120	NC_010175	ACT	2	6	56443	56448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845646
1121	NC_010175	CGG	2	6	56458	56463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845646
1122	NC_010175	ATC	2	6	56544	56549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845646
1123	NC_010175	GAA	2	6	56559	56564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845646
1124	NC_010175	CAG	2	6	56593	56598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845646
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1126	NC_010175	TGC	2	6	56693	56698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845646
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1253	NC_010175	ATGG	2	8	62265	62272	25 %	25 %	50 %	0 %	163845652
1254	NC_010175	GAG	2	6	62327	62332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845652
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1262	NC_010175	CACTGC	2	12	62680	62691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163845652
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1292	NC_010175	TTG	2	6	64318	64323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1362	NC_010175	GGAA	2	8	67785	67792	50 %	0 %	50 %	0 %	163845656
1363	NC_010175	TGT	3	9	67809	67817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845656
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1368	NC_010175	AACC	2	8	68018	68025	50 %	0 %	0 %	50 %	163845656
1369	NC_010175	ATGGT	2	10	68030	68039	20 %	40 %	40 %	0 %	163845656
1370	NC_010175	ACC	2	6	68093	68098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845656
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1372	NC_010175	CGGCTG	2	12	68162	68173	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163845656
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1375	NC_010175	GCT	2	6	68270	68275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845657
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1378	NC_010175	CGCTC	2	10	68372	68381	0 %	20 %	20 %	60 %	163845657
1379	NC_010175	G	6	6	68428	68433	0 %	0 %	100 %	0 %	163845657
1380	NC_010175	GC	3	6	68546	68551	0 %	0 %	50 %	50 %	163845657
1381	NC_010175	GAT	2	6	68607	68612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845657
1382	NC_010175	TCCGC	2	10	68618	68627	0 %	20 %	20 %	60 %	163845657
1383	NC_010175	GGC	2	6	68652	68657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845657
1384	NC_010175	CGTT	3	12	68670	68681	0 %	50 %	25 %	25 %	163845657
1385	NC_010175	CG	3	6	68694	68699	0 %	0 %	50 %	50 %	163845657
1386	NC_010175	ACC	2	6	68740	68745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845657
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1388	NC_010175	GGT	2	6	68849	68854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845658
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1391	NC_010175	TGC	2	6	69148	69153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845658
1392	NC_010175	TC	3	6	69172	69177	0 %	50 %	0 %	50 %	163845658
1393	NC_010175	TGC	2	6	69285	69290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845658
1394	NC_010175	TGA	2	6	69454	69459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845658
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1396	NC_010175	TGG	2	6	69690	69695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845658
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1398	NC_010175	GCTGG	2	10	69721	69730	0 %	20 %	60 %	20 %	163845658
1399	NC_010175	ATC	2	6	69758	69763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845658
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1408	NC_010175	GCC	2	6	70139	70144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845659
1409	NC_010175	CAG	2	6	70167	70172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845659
1410	NC_010175	CAT	2	6	70208	70213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845659
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1412	NC_010175	TTGA	2	8	70272	70279	25 %	50 %	25 %	0 %	163845659
1413	NC_010175	CAA	2	6	70375	70380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845659
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1415	NC_010175	CAT	2	6	70550	70555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845659
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1425	NC_010175	GACC	2	8	71183	71190	25 %	0 %	25 %	50 %	163845659
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1429	NC_010175	TGA	2	6	71390	71395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845659
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1431	NC_010175	AAC	2	6	71500	71505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845659
1432	NC_010175	A	6	6	71510	71515	100 %	0 %	0 %	0 %	163845659
1433	NC_010175	CAA	2	6	71519	71524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845659
1434	NC_010175	TTCAT	2	10	71557	71566	20 %	60 %	0 %	20 %	163845659
1435	NC_010175	CTGA	2	8	71571	71578	25 %	25 %	25 %	25 %	163845659
1436	NC_010175	CTG	2	6	71706	71711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845659
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1439	NC_010175	CTC	2	6	71946	71951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1440	NC_010175	TAT	2	6	71954	71959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_010175	ACC	2	6	71983	71988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1448	NC_010175	T	7	7	72486	72492	0 %	100 %	0 %	0 %	163845660
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1453	NC_010175	GCTG	2	8	72834	72841	0 %	25 %	50 %	25 %	163845660
1454	NC_010175	GCCC	2	8	72904	72911	0 %	0 %	25 %	75 %	163845660
1455	NC_010175	ATC	2	6	72928	72933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845660
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1461	NC_010175	GTGG	2	8	73211	73218	0 %	25 %	75 %	0 %	163845661
1462	NC_010175	CGC	2	6	73256	73261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845661
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1464	NC_010175	CGT	2	6	73288	73293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
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1471	NC_010175	GC	3	6	73608	73613	0 %	0 %	50 %	50 %	163845661
1472	NC_010175	GCT	2	6	73618	73623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
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1480	NC_010175	TCA	3	9	73938	73946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845661
1481	NC_010175	TGG	2	6	73950	73955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845661
1482	NC_010175	GCTGG	2	10	73964	73973	0 %	20 %	60 %	20 %	163845661
1483	NC_010175	TGGT	2	8	74001	74008	0 %	50 %	50 %	0 %	163845661
1484	NC_010175	ATC	2	6	74105	74110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845661
1485	NC_010175	CTG	2	6	74117	74122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1486	NC_010175	CGC	2	6	74157	74162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845661
1487	NC_010175	CGT	2	6	74177	74182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1488	NC_010175	GAA	2	6	74192	74197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845661
1489	NC_010175	GGT	2	6	74231	74236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845661
1490	NC_010175	TCT	2	6	74242	74247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845661
1491	NC_010175	GCT	2	6	74248	74253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1492	NC_010175	AGC	2	6	74294	74299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845661
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1494	NC_010175	CAC	2	6	74355	74360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845661
1495	NC_010175	TGA	2	6	74367	74372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845661
1496	NC_010175	AGC	2	6	74407	74412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1497	NC_010175	GTC	2	6	74444	74449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661
1498	NC_010175	CGG	2	6	74466	74471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845661
1499	NC_010175	TAT	2	6	74521	74526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845661
1500	NC_010175	CTG	2	6	74649	74654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845661

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