MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 104645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010175	GAA	2	6	26872	26877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845623
502	NC_010175	GCC	2	6	26884	26889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845623
503	NC_010175	ATC	2	6	26945	26950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845623
504	NC_010175	CTG	2	6	26971	26976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845623
505	NC_010175	TGAT	2	8	27020	27027	25 %	50 %	25 %	0 %	163845623
506	NC_010175	ACCG	2	8	27104	27111	25 %	0 %	25 %	50 %	163845623
507	NC_010175	CGA	2	6	27117	27122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845623
508	NC_010175	CGC	2	6	27151	27156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845623
509	NC_010175	CGT	2	6	27243	27248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845623
510	NC_010175	GC	3	6	27310	27315	0 %	0 %	50 %	50 %	163845623
511	NC_010175	TACACC	2	12	27331	27342	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	163845623
512	NC_010175	ACC	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845623
513	NC_010175	CAC	2	6	27405	27410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845623
514	NC_010175	CACG	2	8	27430	27437	25 %	0 %	25 %	50 %	163845623
515	NC_010175	TGCA	2	8	27487	27494	25 %	25 %	25 %	25 %	163845623
516	NC_010175	GC	3	6	27543	27548	0 %	0 %	50 %	50 %	163845623
517	NC_010175	CTT	2	6	27552	27557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845623
518	NC_010175	AGA	2	6	27627	27632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845623
519	NC_010175	CTA	2	6	27654	27659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845623
520	NC_010175	GAG	2	6	27668	27673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845623
521	NC_010175	CTC	2	6	27693	27698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845624
522	NC_010175	TCG	2	6	27724	27729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845624
523	NC_010175	ATGC	2	8	27768	27775	25 %	25 %	25 %	25 %	163845624
524	NC_010175	TTC	2	6	27825	27830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845624
525	NC_010175	TGG	2	6	27931	27936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845624
526	NC_010175	TCGGT	2	10	28018	28027	0 %	40 %	40 %	20 %	163845624
527	NC_010175	GTG	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845624
528	NC_010175	ACCTC	2	10	28252	28261	20 %	20 %	0 %	60 %	163845624
529	NC_010175	CGC	2	6	28317	28322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845624
530	NC_010175	CTA	2	6	28379	28384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845624
531	NC_010175	GCA	2	6	28434	28439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845624
532	NC_010175	ACTCGG	2	12	28493	28504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163845624
533	NC_010175	TGC	2	6	28556	28561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845624
534	NC_010175	TG	3	6	28578	28583	0 %	50 %	50 %	0 %	163845624
535	NC_010175	CAT	2	6	28613	28618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845624
536	NC_010175	CGG	2	6	28723	28728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845624
537	NC_010175	TCG	2	6	28732	28737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845624
538	NC_010175	TGC	2	6	28739	28744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845624
539	NC_010175	GGC	2	6	28963	28968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
540	NC_010175	CTC	2	6	28975	28980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845625
541	NC_010175	GGCC	2	8	28995	29002	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
542	NC_010175	TCG	2	6	29039	29044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845625
543	NC_010175	TGCAA	2	10	29075	29084	40 %	20 %	20 %	20 %	163845625
544	NC_010175	GC	3	6	29219	29224	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
545	NC_010175	CG	3	6	29309	29314	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
546	NC_010175	GGC	2	6	29317	29322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
547	NC_010175	GC	4	8	29409	29416	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
548	NC_010175	GCC	2	6	29479	29484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
549	NC_010175	TCG	2	6	29507	29512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845625
550	NC_010175	GATC	2	8	29553	29560	25 %	25 %	25 %	25 %	163845625
551	NC_010175	CAAT	2	8	29589	29596	50 %	25 %	0 %	25 %	163845625
552	NC_010175	GAA	2	6	29619	29624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845625
553	NC_010175	TTCGG	2	10	29665	29674	0 %	40 %	40 %	20 %	163845625
554	NC_010175	CAC	2	6	29691	29696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845625
555	NC_010175	GAGC	2	8	29736	29743	25 %	0 %	50 %	25 %	163845625
556	NC_010175	GGC	2	6	29773	29778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
557	NC_010175	ACCA	2	8	29836	29843	50 %	0 %	0 %	50 %	163845625
558	NC_010175	CAC	2	6	29876	29881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845625
559	NC_010175	CGC	2	6	29994	29999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
560	NC_010175	GCAATG	2	12	30004	30015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163845625
561	NC_010175	ATC	2	6	30025	30030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845625
562	NC_010175	CAG	2	6	30034	30039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845625
563	NC_010175	ACA	2	6	30044	30049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845625
564	NC_010175	CGC	2	6	30060	30065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
565	NC_010175	CAA	2	6	30069	30074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845625
566	NC_010175	GCC	2	6	30076	30081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
567	NC_010175	GCC	2	6	30085	30090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
568	NC_010175	CTGG	2	8	30120	30127	0 %	25 %	50 %	25 %	163845625
569	NC_010175	TCC	2	6	30158	30163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845625
570	NC_010175	GATTG	2	10	30174	30183	20 %	40 %	40 %	0 %	163845625
571	NC_010175	GAA	2	6	30216	30221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845625
572	NC_010175	GCC	2	6	30325	30330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
573	NC_010175	ACTGA	2	10	30358	30367	40 %	20 %	20 %	20 %	163845625
574	NC_010175	CAGC	2	8	30410	30417	25 %	0 %	25 %	50 %	163845625
575	NC_010175	GCG	2	6	30439	30444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
576	NC_010175	CAT	2	6	30468	30473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845625
577	NC_010175	CG	3	6	30506	30511	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
578	NC_010175	AC	3	6	30543	30548	50 %	0 %	0 %	50 %	163845625
579	NC_010175	ACC	2	6	30608	30613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845625
580	NC_010175	GCG	2	6	30614	30619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
581	NC_010175	CGAC	2	8	30642	30649	25 %	0 %	25 %	50 %	163845625
582	NC_010175	CTG	2	6	30724	30729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845625
583	NC_010175	GC	3	6	30778	30783	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
584	NC_010175	CGG	2	6	30905	30910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
585	NC_010175	GAC	2	6	30915	30920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845625
586	NC_010175	GAA	2	6	30942	30947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845625
587	NC_010175	ATC	2	6	30958	30963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845625
588	NC_010175	TGGT	2	8	30977	30984	0 %	50 %	50 %	0 %	163845625
589	NC_010175	GGC	2	6	31272	31277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
590	NC_010175	GAAG	2	8	31296	31303	50 %	0 %	50 %	0 %	163845625
591	NC_010175	CCG	2	6	31353	31358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
592	NC_010175	CGC	2	6	31363	31368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
593	NC_010175	GCC	2	6	31374	31379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
594	NC_010175	TGA	2	6	31389	31394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845625
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596	NC_010175	GTG	2	6	31463	31468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845625
597	NC_010175	AGA	2	6	31550	31555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845625
598	NC_010175	ACC	2	6	31561	31566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845625
599	NC_010175	ATC	2	6	31586	31591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845625
600	NC_010175	TGA	2	6	31650	31655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845625
601	NC_010175	ATG	2	6	31693	31698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845625
602	NC_010175	ACT	2	6	31721	31726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845625
603	NC_010175	CTC	2	6	31729	31734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845625
604	NC_010175	GAT	2	6	31875	31880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845625
605	NC_010175	GCG	2	6	31955	31960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
606	NC_010175	CCG	2	6	31994	31999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845625
607	NC_010175	TGC	2	6	32031	32036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845625
608	NC_010175	CGG	2	6	32085	32090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845625
609	NC_010175	TCT	2	6	32099	32104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845625
610	NC_010175	AC	3	6	32139	32144	50 %	0 %	0 %	50 %	163845625
611	NC_010175	AC	3	6	32202	32207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_010175	GT	3	6	32215	32220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010175	CTA	2	6	32261	32266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010175	CAC	2	6	32274	32279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_010175	GCT	2	6	32359	32364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010175	GTT	2	6	32371	32376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010175	CAA	2	6	32492	32497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010175	GCTC	2	8	32515	32522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
619	NC_010175	ACA	2	6	32529	32534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010175	CGTAC	2	10	32719	32728	20 %	20 %	20 %	40 %	163845626
621	NC_010175	AAC	2	6	32767	32772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845626
622	NC_010175	GCA	3	9	32778	32786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845626
623	NC_010175	GGCC	2	8	32792	32799	0 %	0 %	50 %	50 %	163845626
624	NC_010175	GCA	2	6	32895	32900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845626
625	NC_010175	AC	3	6	32924	32929	50 %	0 %	0 %	50 %	163845626
626	NC_010175	CAA	2	6	32962	32967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845626
627	NC_010175	TGA	2	6	32968	32973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845626
628	NC_010175	CAC	2	6	33016	33021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845626
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630	NC_010175	TGA	2	6	33051	33056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845627
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752	NC_010175	A	7	7	38861	38867	100 %	0 %	0 %	0 %	163845632
753	NC_010175	TAT	2	6	38914	38919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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756	NC_010175	TCA	2	6	39004	39009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_010175	CAA	2	6	39044	39049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
758	NC_010175	GAC	2	6	39115	39120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
759	NC_010175	CA	3	6	39166	39171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
760	NC_010175	GCA	2	6	39238	39243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
761	NC_010175	ACG	2	6	39261	39266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
762	NC_010175	GGCAA	2	10	39287	39296	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
763	NC_010175	GAC	2	6	39351	39356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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765	NC_010175	GAA	2	6	39388	39393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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788	NC_010175	CAT	2	6	40686	40691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_010175	TGGCCG	2	12	40711	40722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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