MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 104645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010175	ATC	2	6	349538	349543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845868
7002	NC_010175	TCA	2	6	349585	349590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845868
7003	NC_010175	TGAAG	2	10	349617	349626	40 %	20 %	40 %	0 %	163845868
7004	NC_010175	ATCAAG	2	12	349628	349639	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	163845868
7005	NC_010175	GCC	2	6	349650	349655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845868
7006	NC_010175	AAT	2	6	349658	349663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845868
7007	NC_010175	GCT	2	6	349726	349731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845868
7008	NC_010175	CAG	2	6	349754	349759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845868
7009	NC_010175	CTG	2	6	349907	349912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845868
7010	NC_010175	GATG	2	8	349937	349944	25 %	25 %	50 %	0 %	163845868
7011	NC_010175	ACCA	2	8	349964	349971	50 %	0 %	0 %	50 %	163845868
7012	NC_010175	GGT	2	6	349977	349982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845868
7013	NC_010175	CATA	2	8	349999	350006	50 %	25 %	0 %	25 %	163845868
7014	NC_010175	AAT	2	6	350055	350060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_010175	ACT	2	6	350070	350075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_010175	ATC	2	6	350144	350149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_010175	TCA	2	6	350204	350209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_010175	GTTT	2	8	350217	350224	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_010175	GTTG	2	8	350295	350302	0 %	50 %	50 %	0 %	163845869
7020	NC_010175	CCAG	2	8	350303	350310	25 %	0 %	25 %	50 %	163845869
7021	NC_010175	CTG	2	6	350318	350323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845869
7022	NC_010175	CCA	2	6	350357	350362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845869
7023	NC_010175	AGC	2	6	350404	350409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845869
7024	NC_010175	TTG	2	6	350439	350444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845869
7025	NC_010175	TGA	2	6	350469	350474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845869
7026	NC_010175	ATG	2	6	350500	350505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845869
7027	NC_010175	GCA	2	6	350552	350557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845869
7028	NC_010175	CGA	2	6	350579	350584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845869
7029	NC_010175	CAA	2	6	350585	350590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845869
7030	NC_010175	AAT	2	6	350646	350651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845869
7031	NC_010175	TGC	2	6	350697	350702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845869
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7033	NC_010175	ATC	2	6	350773	350778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845869
7034	NC_010175	CAA	2	6	350781	350786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845869
7035	NC_010175	GCC	2	6	350807	350812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845869
7036	NC_010175	GCC	3	9	350869	350877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845869
7037	NC_010175	CGG	2	6	350885	350890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845869
7038	NC_010175	G	6	6	350955	350960	0 %	0 %	100 %	0 %	163845869
7039	NC_010175	CCG	2	6	350991	350996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845869
7040	NC_010175	AAT	2	6	351018	351023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845869
7041	NC_010175	GCA	2	6	351044	351049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845869
7042	NC_010175	ATC	2	6	351052	351057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845869
7043	NC_010175	TC	3	6	351056	351061	0 %	50 %	0 %	50 %	163845869
7044	NC_010175	GAATT	2	10	351079	351088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_010175	CGT	2	6	351119	351124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_010175	AGCA	2	8	351183	351190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7047	NC_010175	ACAT	2	8	351218	351225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7048	NC_010175	CAG	2	6	351251	351256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_010175	GTAT	2	8	351257	351264	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_010175	ACC	2	6	351326	351331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_010175	GA	3	6	351386	351391	50 %	0 %	50 %	0 %	163845870
7052	NC_010175	GCA	2	6	351429	351434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845870
7053	NC_010175	CAGGA	2	10	351449	351458	40 %	0 %	40 %	20 %	163845870
7054	NC_010175	GGTC	2	8	351472	351479	0 %	25 %	50 %	25 %	163845870
7055	NC_010175	TCA	2	6	351501	351506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845870
7056	NC_010175	TGT	2	6	351537	351542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845870
7057	NC_010175	GTG	2	6	351556	351561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845870
7058	NC_010175	GCCGG	2	10	351564	351573	0 %	0 %	60 %	40 %	163845870
7059	NC_010175	ACC	2	6	351579	351584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845870
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7061	NC_010175	TCG	2	6	351678	351683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845870
7062	NC_010175	TCACG	2	10	351745	351754	20 %	20 %	20 %	40 %	163845870
7063	NC_010175	ACCG	2	8	351875	351882	25 %	0 %	25 %	50 %	163845870
7064	NC_010175	A	7	7	351974	351980	100 %	0 %	0 %	0 %	163845870
7065	NC_010175	TCAG	2	8	352026	352033	25 %	25 %	25 %	25 %	163845870
7066	NC_010175	ACC	2	6	352197	352202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845870
7067	NC_010175	CGG	2	6	352219	352224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845870
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7069	NC_010175	CATT	2	8	352267	352274	25 %	50 %	0 %	25 %	163845870
7070	NC_010175	CGGT	2	8	352293	352300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7071	NC_010175	TAC	2	6	352314	352319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_010175	ATTA	2	8	352348	352355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_010175	CAG	2	6	352391	352396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_010175	GTC	2	6	352490	352495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_010175	CCT	2	6	352498	352503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_010175	TG	3	6	352571	352576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_010175	CGATA	2	10	352619	352628	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7078	NC_010175	CAT	2	6	352638	352643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_010175	TGCT	2	8	352659	352666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7080	NC_010175	ACGC	2	8	352729	352736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_010175	ACTTG	2	10	352741	352750	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7082	NC_010175	TAC	2	6	352765	352770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_010175	CAG	2	6	352988	352993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845871
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7085	NC_010175	CTG	2	6	353207	353212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845871
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7088	NC_010175	GACA	2	8	353377	353384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7089	NC_010175	CA	3	6	353396	353401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7090	NC_010175	CAG	2	6	353415	353420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_010175	GA	3	6	353551	353556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_010175	CAA	2	6	353589	353594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_010175	GCT	2	6	353667	353672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_010175	CTT	2	6	353675	353680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_010175	GATA	2	8	353778	353785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_010175	TCA	2	6	354011	354016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7099	NC_010175	AACGCA	2	12	354283	354294	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	163845872
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7107	NC_010175	TAT	2	6	354563	354568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845872
7108	NC_010175	ATT	2	6	354571	354576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845872
7109	NC_010175	T	6	6	354629	354634	0 %	100 %	0 %	0 %	163845872
7110	NC_010175	TCC	2	6	354760	354765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845872
7111	NC_010175	ATT	2	6	354830	354835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163845872
7112	NC_010175	TTG	2	6	354845	354850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845872
7113	NC_010175	GAA	2	6	354866	354871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845872
7114	NC_010175	GCG	2	6	354897	354902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845872
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7119	NC_010175	TGG	2	6	355153	355158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845872
7120	NC_010175	CGC	2	6	355322	355327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845872
7121	NC_010175	GCG	2	6	355375	355380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845872
7122	NC_010175	AGG	2	6	355552	355557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_010175	GCG	2	6	355582	355587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845873
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7125	NC_010175	CAG	2	6	355642	355647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845873
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7239	NC_010175	TGG	3	9	361646	361654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7242	NC_010175	CGGT	2	8	361726	361733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7243	NC_010175	CCG	2	6	361748	361753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7244	NC_010175	GGC	2	6	361765	361770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7245	NC_010175	ACG	2	6	361808	361813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7246	NC_010175	ATC	2	6	361863	361868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7247	NC_010175	ATT	2	6	361897	361902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7248	NC_010175	GCGG	2	8	362121	362128	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7249	NC_010175	GGT	2	6	362203	362208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7250	NC_010175	GCGA	2	8	362317	362324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7251	NC_010175	GTT	2	6	362383	362388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7252	NC_010175	GTCT	2	8	362406	362413	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7254	NC_010175	GCT	2	6	362434	362439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7378	NC_010175	CGG	2	6	368725	368730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845881
7379	NC_010175	GCT	2	6	368798	368803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845881
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7451	NC_010175	CGG	3	9	371190	371198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7452	NC_010175	CAA	2	6	371248	371253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7476	NC_010175	GC	3	6	372164	372169	0 %	0 %	50 %	50 %	163845883
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7492	NC_010175	GC	3	6	372776	372781	0 %	0 %	50 %	50 %	163845884
7493	NC_010175	GCT	2	6	372794	372799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845884
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7497	NC_010175	GCA	2	6	372942	372947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845884
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7500	NC_010175	GGGC	2	8	373147	373154	0 %	0 %	75 %	25 %	163845884

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