MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010117	TGA	2	6	161009	161014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830087
3502	NC_010117	TGT	2	6	161018	161023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830087
3503	NC_010117	A	6	6	161037	161042	100 %	0 %	0 %	0 %	161830087
3504	NC_010117	ATT	2	6	161064	161069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830087
3505	NC_010117	ATCG	2	8	161073	161080	25 %	25 %	25 %	25 %	161830087
3506	NC_010117	A	6	6	161085	161090	100 %	0 %	0 %	0 %	161830087
3507	NC_010117	GAAA	2	8	161096	161103	75 %	0 %	25 %	0 %	161830087
3508	NC_010117	TGA	2	6	161126	161131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830087
3509	NC_010117	ATT	2	6	161140	161145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830087
3510	NC_010117	TGC	2	6	161197	161202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830087
3511	NC_010117	AAC	3	9	161203	161211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830087
3512	NC_010117	ATTA	2	8	161264	161271	50 %	50 %	0 %	0 %	161830087
3513	NC_010117	ATC	2	6	161330	161335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830700
3514	NC_010117	TTG	2	6	161360	161365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830700
3515	NC_010117	TTA	2	6	161385	161390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830700
3516	NC_010117	CTG	2	6	161397	161402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830700
3517	NC_010117	TC	3	6	161429	161434	0 %	50 %	0 %	50 %	161830700
3518	NC_010117	TAG	2	6	161451	161456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830700
3519	NC_010117	TTCCT	2	10	161467	161476	0 %	60 %	0 %	40 %	161830700
3520	NC_010117	GCT	2	6	161498	161503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830700
3521	NC_010117	CGT	2	6	161536	161541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830700
3522	NC_010117	TAA	3	9	161643	161651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830700
3523	NC_010117	T	6	6	161671	161676	0 %	100 %	0 %	0 %	161830700
3524	NC_010117	TTAT	2	8	161686	161693	25 %	75 %	0 %	0 %	161830700
3525	NC_010117	ATT	2	6	161708	161713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830700
3526	NC_010117	TTA	2	6	161723	161728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830700
3527	NC_010117	A	6	6	161768	161773	100 %	0 %	0 %	0 %	161830700
3528	NC_010117	A	7	7	161822	161828	100 %	0 %	0 %	0 %	161830700
3529	NC_010117	TGG	2	6	161837	161842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830700
3530	NC_010117	TCA	2	6	161865	161870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830700
3531	NC_010117	A	6	6	162005	162010	100 %	0 %	0 %	0 %	161830700
3532	NC_010117	TC	3	6	162059	162064	0 %	50 %	0 %	50 %	161830700
3533	NC_010117	GCG	2	6	162121	162126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830700
3534	NC_010117	GAT	3	9	162139	162147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830700
3535	NC_010117	CGG	2	6	162193	162198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830700
3536	NC_010117	ATA	2	6	162221	162226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830700
3537	NC_010117	TTA	2	6	162230	162235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830700
3538	NC_010117	GTT	2	6	162251	162256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830700
3539	NC_010117	T	7	7	162395	162401	0 %	100 %	0 %	0 %	161831333
3540	NC_010117	ATGA	2	8	162441	162448	50 %	25 %	25 %	0 %	161831333
3541	NC_010117	GAT	2	6	162455	162460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831333
3542	NC_010117	ATC	2	6	162489	162494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831333
3543	NC_010117	AAT	2	6	162495	162500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831333
3544	NC_010117	TGCA	2	8	162510	162517	25 %	25 %	25 %	25 %	161831333
3545	NC_010117	TAA	2	6	162568	162573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831333
3546	NC_010117	CGA	2	6	162579	162584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831333
3547	NC_010117	GCA	2	6	162620	162625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831333
3548	NC_010117	CTT	2	6	162656	162661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831333
3549	NC_010117	TAA	2	6	162672	162677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831333
3550	NC_010117	A	6	6	162676	162681	100 %	0 %	0 %	0 %	161831333
3551	NC_010117	GGT	2	6	162719	162724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831333
3552	NC_010117	AAT	2	6	162782	162787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831333
3553	NC_010117	TAA	2	6	162881	162886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831333
3554	NC_010117	CCT	2	6	162940	162945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831333
3555	NC_010117	ATTT	2	8	163038	163045	25 %	75 %	0 %	0 %	161831333
3556	NC_010117	TTA	2	6	163067	163072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831333
3557	NC_010117	AAG	2	6	163161	163166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831333
3558	NC_010117	CCA	2	6	163208	163213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831333
3559	NC_010117	CGG	2	6	163238	163243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831333
3560	NC_010117	TAAG	2	8	163293	163300	50 %	25 %	25 %	0 %	161831333
3561	NC_010117	AGC	2	6	163342	163347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831333
3562	NC_010117	GAC	2	6	163406	163411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831333
3563	NC_010117	ATA	2	6	163417	163422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831333
3564	NC_010117	T	9	9	163425	163433	0 %	100 %	0 %	0 %	161831333
3565	NC_010117	GATTG	2	10	163519	163528	20 %	40 %	40 %	0 %	161830284
3566	NC_010117	ACA	2	6	163548	163553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830284
3567	NC_010117	AAT	2	6	163594	163599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830284
3568	NC_010117	TC	3	6	163669	163674	0 %	50 %	0 %	50 %	161830284
3569	NC_010117	ATA	2	6	163695	163700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830284
3570	NC_010117	TA	3	6	163724	163729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010117	TAG	3	9	163758	163766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010117	CGG	2	6	163813	163818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_010117	ATGA	2	8	163833	163840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_010117	TAT	2	6	163864	163869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010117	TAAT	2	8	163877	163884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_010117	GCA	2	6	163895	163900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_010117	TGGC	2	8	163995	164002	0 %	25 %	50 %	25 %	161829758
3578	NC_010117	GCT	2	6	164083	164088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829758
3579	NC_010117	CGC	2	6	164227	164232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829758
3580	NC_010117	A	6	6	164273	164278	100 %	0 %	0 %	0 %	161829758
3581	NC_010117	TAT	2	6	164338	164343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829758
3582	NC_010117	GTG	2	6	164399	164404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161829758
3583	NC_010117	TCC	2	6	164536	164541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161829758
3584	NC_010117	CGA	2	6	164618	164623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829758
3585	NC_010117	A	7	7	164625	164631	100 %	0 %	0 %	0 %	161829758
3586	NC_010117	CGT	2	6	164639	164644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161829758
3587	NC_010117	A	7	7	164646	164652	100 %	0 %	0 %	0 %	161829758
3588	NC_010117	A	7	7	164655	164661	100 %	0 %	0 %	0 %	161829758
3589	NC_010117	CCG	2	6	164687	164692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831373
3590	NC_010117	AATT	2	8	164741	164748	50 %	50 %	0 %	0 %	161831373
3591	NC_010117	ATT	2	6	164776	164781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831373
3592	NC_010117	CG	3	6	164783	164788	0 %	0 %	50 %	50 %	161831373
3593	NC_010117	ATT	2	6	164797	164802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831373
3594	NC_010117	TGA	2	6	164820	164825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831373
3595	NC_010117	TCC	2	6	164890	164895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161831373
3596	NC_010117	ACA	2	6	164992	164997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831373
3597	NC_010117	GCG	2	6	165101	165106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831373
3598	NC_010117	ATG	2	6	165134	165139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831373
3599	NC_010117	T	6	6	165141	165146	0 %	100 %	0 %	0 %	161831373
3600	NC_010117	A	6	6	165221	165226	100 %	0 %	0 %	0 %	161831373
3601	NC_010117	AAG	2	6	165263	165268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831373
3602	NC_010117	CGC	2	6	165273	165278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831373
3603	NC_010117	ATT	2	6	165289	165294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831373
3604	NC_010117	A	6	6	165325	165330	100 %	0 %	0 %	0 %	161831373
3605	NC_010117	TAA	2	6	165342	165347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831373
3606	NC_010117	TCGG	2	8	165430	165437	0 %	25 %	50 %	25 %	161831373
3607	NC_010117	TTA	2	6	165483	165488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831373
3608	NC_010117	CAA	2	6	165525	165530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830501
3609	NC_010117	AAAG	2	8	165531	165538	75 %	0 %	25 %	0 %	161830501
3610	NC_010117	ACAAT	2	10	165543	165552	60 %	20 %	0 %	20 %	161830501
3611	NC_010117	TAA	2	6	165587	165592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830501
3612	NC_010117	GAT	2	6	165594	165599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830501
3613	NC_010117	CTA	2	6	165643	165648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830501
3614	NC_010117	CCG	2	6	165703	165708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_010117	GCT	2	6	165764	165769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_010117	CATGC	2	10	165825	165834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3617	NC_010117	C	6	6	165860	165865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3618	NC_010117	AGG	2	6	165884	165889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_010117	AGCGA	2	10	165961	165970	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3620	NC_010117	TCCCT	2	10	166074	166083	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3621	NC_010117	CCAT	2	8	166137	166144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_010117	AGA	2	6	166240	166245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831186
3623	NC_010117	CGT	2	6	166288	166293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831186
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3625	NC_010117	TGA	2	6	166360	166365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831186
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4000	NC_010117	TCC	2	6	183563	183568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830981

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