MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010117	AAT	2	6	137994	137999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010117	CT	3	6	138056	138061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_010117	AG	3	6	138063	138068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010117	TC	3	6	138134	138139	0 %	50 %	0 %	50 %	161829835
3005	NC_010117	AGC	2	6	138179	138184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829835
3006	NC_010117	GAG	2	6	138219	138224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161829835
3007	NC_010117	TAC	2	6	138271	138276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829835
3008	NC_010117	AAG	2	6	138390	138395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829835
3009	NC_010117	CTT	2	6	138517	138522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829835
3010	NC_010117	ATT	2	6	138591	138596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829835
3011	NC_010117	GAA	2	6	138599	138604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829835
3012	NC_010117	AAAGAT	2	12	138686	138697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161829835
3013	NC_010117	A	6	6	138716	138721	100 %	0 %	0 %	0 %	161829835
3014	NC_010117	GAA	2	6	138750	138755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829835
3015	NC_010117	AGATGA	2	12	138767	138778	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	161829835
3016	NC_010117	GCC	2	6	138788	138793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829835
3017	NC_010117	AGG	2	6	138802	138807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161829835
3018	NC_010117	CT	4	8	138818	138825	0 %	50 %	0 %	50 %	161829835
3019	NC_010117	AGA	2	6	138830	138835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829835
3020	NC_010117	AT	3	6	138938	138943	50 %	50 %	0 %	0 %	161829835
3021	NC_010117	CAA	2	6	139020	139025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829835
3022	NC_010117	AGA	2	6	139037	139042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829835
3023	NC_010117	A	6	6	139048	139053	100 %	0 %	0 %	0 %	161829835
3024	NC_010117	CGC	2	6	139076	139081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829835
3025	NC_010117	CAA	2	6	139094	139099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829835
3026	NC_010117	CCG	2	6	139101	139106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829835
3027	NC_010117	GGA	2	6	139205	139210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161829835
3028	NC_010117	ACA	2	6	139232	139237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829835
3029	NC_010117	ATT	2	6	139249	139254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829835
3030	NC_010117	TCGCT	2	10	139329	139338	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3031	NC_010117	TAA	2	6	139415	139420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830412
3032	NC_010117	TGA	2	6	139446	139451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830412
3033	NC_010117	TTC	2	6	139472	139477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830412
3034	NC_010117	ATTA	2	8	139496	139503	50 %	50 %	0 %	0 %	161830412
3035	NC_010117	GTCC	2	8	139552	139559	0 %	25 %	25 %	50 %	161830412
3036	NC_010117	GTC	2	6	139571	139576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830412
3037	NC_010117	TAAA	2	8	139637	139644	75 %	25 %	0 %	0 %	161830412
3038	NC_010117	AC	3	6	139728	139733	50 %	0 %	0 %	50 %	161830412
3039	NC_010117	TCT	3	9	139899	139907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830412
3040	NC_010117	GTCG	2	8	139940	139947	0 %	25 %	50 %	25 %	161830412
3041	NC_010117	GCC	2	6	139964	139969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830412
3042	NC_010117	TGG	2	6	140002	140007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830412
3043	NC_010117	ATCGGT	2	12	140009	140020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161830412
3044	NC_010117	CGC	2	6	140101	140106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830412
3045	NC_010117	TCAC	2	8	140142	140149	25 %	25 %	0 %	50 %	161830412
3046	NC_010117	ATC	2	6	140190	140195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830412
3047	NC_010117	ATA	2	6	140208	140213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830412
3048	NC_010117	T	6	6	140247	140252	0 %	100 %	0 %	0 %	161830412
3049	NC_010117	T	6	6	140304	140309	0 %	100 %	0 %	0 %	161830412
3050	NC_010117	T	7	7	140419	140425	0 %	100 %	0 %	0 %	161830412
3051	NC_010117	GATC	2	8	140433	140440	25 %	25 %	25 %	25 %	161830412
3052	NC_010117	TAA	2	6	140506	140511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830412
3053	NC_010117	CT	3	6	140598	140603	0 %	50 %	0 %	50 %	161830412
3054	NC_010117	GTTGAA	2	12	140668	140679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830412
3055	NC_010117	GCG	2	6	140695	140700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830412
3056	NC_010117	CGAT	2	8	140718	140725	25 %	25 %	25 %	25 %	161830412
3057	NC_010117	TAA	2	6	140744	140749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830412
3058	NC_010117	GC	3	6	140772	140777	0 %	0 %	50 %	50 %	161830412
3059	NC_010117	T	6	6	140782	140787	0 %	100 %	0 %	0 %	161830412
3060	NC_010117	ATTA	2	8	140801	140808	50 %	50 %	0 %	0 %	161830412
3061	NC_010117	TCG	2	6	140913	140918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830412
3062	NC_010117	TGT	2	6	140922	140927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830412
3063	NC_010117	GAA	2	6	140935	140940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830412
3064	NC_010117	A	6	6	140961	140966	100 %	0 %	0 %	0 %	161830412
3065	NC_010117	CGCC	2	8	140992	140999	0 %	0 %	25 %	75 %	161830412
3066	NC_010117	AGGA	2	8	141040	141047	50 %	0 %	50 %	0 %	161830412
3067	NC_010117	GGAA	2	8	141074	141081	50 %	0 %	50 %	0 %	161830412
3068	NC_010117	TAA	3	9	141084	141092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830412
3069	NC_010117	ACG	2	6	141116	141121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830412
3070	NC_010117	GCC	2	6	141126	141131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830412
3071	NC_010117	GTCG	2	8	141133	141140	0 %	25 %	50 %	25 %	161830412
3072	NC_010117	CT	3	6	141164	141169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_010117	ATA	2	6	141186	141191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010117	CAT	2	6	141248	141253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_010117	GC	3	6	141332	141337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_010117	GC	3	6	141341	141346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_010117	GAA	2	6	141374	141379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010117	ATGAT	2	10	141399	141408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010117	TCC	2	6	141419	141424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_010117	CAT	4	12	141479	141490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831472
3081	NC_010117	GCC	2	6	141579	141584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831472
3082	NC_010117	GC	3	6	141727	141732	0 %	0 %	50 %	50 %	161831472
3083	NC_010117	CG	3	6	141741	141746	0 %	0 %	50 %	50 %	161831472
3084	NC_010117	TGCC	2	8	141760	141767	0 %	25 %	25 %	50 %	161831472
3085	NC_010117	CGT	2	6	141776	141781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831472
3086	NC_010117	ACA	2	6	141797	141802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831472
3087	NC_010117	GCT	2	6	141819	141824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831472
3088	NC_010117	A	7	7	141829	141835	100 %	0 %	0 %	0 %	161831472
3089	NC_010117	TGA	2	6	141863	141868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831472
3090	NC_010117	CGC	2	6	141950	141955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831472
3091	NC_010117	CGC	2	6	141978	141983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831472
3092	NC_010117	TTA	2	6	141984	141989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831472
3093	NC_010117	GAA	3	9	142002	142010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831472
3094	NC_010117	GAC	2	6	142191	142196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831472
3095	NC_010117	CG	3	6	142203	142208	0 %	0 %	50 %	50 %	161831472
3096	NC_010117	TGC	2	6	142358	142363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831472
3097	NC_010117	ATTTA	2	10	142370	142379	40 %	60 %	0 %	0 %	161831472
3098	NC_010117	TTA	2	6	142581	142586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831472
3099	NC_010117	A	6	6	142611	142616	100 %	0 %	0 %	0 %	161831472
3100	NC_010117	GAT	2	6	142683	142688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831472
3101	NC_010117	A	6	6	142705	142710	100 %	0 %	0 %	0 %	161830080
3102	NC_010117	TTG	2	6	142721	142726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830080
3103	NC_010117	TGG	2	6	142736	142741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830080
3104	NC_010117	ATT	3	9	142743	142751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830080
3105	NC_010117	AAAT	2	8	142775	142782	75 %	25 %	0 %	0 %	161830080
3106	NC_010117	A	7	7	142800	142806	100 %	0 %	0 %	0 %	161830080
3107	NC_010117	TTA	2	6	142810	142815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830080
3108	NC_010117	CG	3	6	142841	142846	0 %	0 %	50 %	50 %	161830080
3109	NC_010117	GTT	2	6	142875	142880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830080
3110	NC_010117	TTAAA	2	10	142934	142943	60 %	40 %	0 %	0 %	161830080
3111	NC_010117	CG	3	6	143041	143046	0 %	0 %	50 %	50 %	161830080
3112	NC_010117	TCG	2	6	143075	143080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830080
3113	NC_010117	ATTT	2	8	143082	143089	25 %	75 %	0 %	0 %	161830080
3114	NC_010117	TCG	2	6	143129	143134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830080
3115	NC_010117	CGTG	2	8	143171	143178	0 %	25 %	50 %	25 %	161830080
3116	NC_010117	G	6	6	143191	143196	0 %	0 %	100 %	0 %	161830080
3117	NC_010117	AGT	2	6	143259	143264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830080
3118	NC_010117	GGT	2	6	143268	143273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830080
3119	NC_010117	T	7	7	143312	143318	0 %	100 %	0 %	0 %	161830080
3120	NC_010117	GTT	2	6	143337	143342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830080
3121	NC_010117	GAA	2	6	143437	143442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830080
3122	NC_010117	AAT	2	6	143446	143451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830080
3123	NC_010117	GAA	2	6	143471	143476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830080
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3371	NC_010117	A	6	6	154438	154443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3376	NC_010117	GTG	2	6	154948	154953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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