MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010117	TGC	2	6	67997	68002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830731
1502	NC_010117	TAA	2	6	68016	68021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830731
1503	NC_010117	TCG	2	6	68155	68160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830731
1504	NC_010117	CTT	2	6	68177	68182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830731
1505	NC_010117	GCG	2	6	68217	68222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830731
1506	NC_010117	TGC	2	6	68228	68233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830731
1507	NC_010117	ATA	2	6	68254	68259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830731
1508	NC_010117	TTC	2	6	68280	68285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830731
1509	NC_010117	GGA	2	6	68293	68298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830731
1510	NC_010117	GC	3	6	68321	68326	0 %	0 %	50 %	50 %	161830731
1511	NC_010117	ACTTCG	2	12	68329	68340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161830731
1512	NC_010117	T	6	6	68373	68378	0 %	100 %	0 %	0 %	161830731
1513	NC_010117	T	6	6	68406	68411	0 %	100 %	0 %	0 %	161830731
1514	NC_010117	CTT	2	6	68501	68506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830731
1515	NC_010117	AAT	2	6	68577	68582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830731
1516	NC_010117	AAGG	2	8	68640	68647	50 %	0 %	50 %	0 %	161830731
1517	NC_010117	TTC	2	6	68748	68753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830731
1518	NC_010117	CGC	2	6	68767	68772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830731
1519	NC_010117	CG	3	6	68799	68804	0 %	0 %	50 %	50 %	161830731
1520	NC_010117	CAT	2	6	68810	68815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830731
1521	NC_010117	GAT	2	6	68823	68828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830731
1522	NC_010117	GTCATT	2	12	68863	68874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161830731
1523	NC_010117	GCT	2	6	68878	68883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_010117	TTA	2	6	68942	68947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010117	TTC	2	6	68970	68975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831128
1526	NC_010117	TGCG	2	8	69044	69051	0 %	25 %	50 %	25 %	161831128
1527	NC_010117	TAA	2	6	69069	69074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831128
1528	NC_010117	GCA	2	6	69256	69261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831128
1529	NC_010117	GCTT	2	8	69290	69297	0 %	50 %	25 %	25 %	161831128
1530	NC_010117	AAC	2	6	69310	69315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831128
1531	NC_010117	ATG	2	6	69400	69405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831128
1532	NC_010117	TGC	2	6	69407	69412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831128
1533	NC_010117	CTTT	2	8	69570	69577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_010117	CGT	2	6	69646	69651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_010117	GAC	2	6	69723	69728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_010117	TTC	2	6	69760	69765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831301
1537	NC_010117	TGG	2	6	69885	69890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831301
1538	NC_010117	GAG	2	6	69912	69917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831301
1539	NC_010117	AGGT	2	8	69950	69957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010117	TTG	2	6	70071	70076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830028
1541	NC_010117	ATT	2	6	70095	70100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830028
1542	NC_010117	TAA	2	6	70104	70109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830028
1543	NC_010117	T	6	6	70164	70169	0 %	100 %	0 %	0 %	161830028
1544	NC_010117	TTAT	2	8	70171	70178	25 %	75 %	0 %	0 %	161830028
1545	NC_010117	TCG	2	6	70228	70233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830028
1546	NC_010117	T	6	6	70242	70247	0 %	100 %	0 %	0 %	161830028
1547	NC_010117	T	7	7	70272	70278	0 %	100 %	0 %	0 %	161830028
1548	NC_010117	GATT	2	8	70348	70355	25 %	50 %	25 %	0 %	161830028
1549	NC_010117	TAA	2	6	70449	70454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830028
1550	NC_010117	TGGC	2	8	70460	70467	0 %	25 %	50 %	25 %	161830028
1551	NC_010117	TGA	2	6	70477	70482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830028
1552	NC_010117	GCG	2	6	70546	70551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830028
1553	NC_010117	TGAG	2	8	70561	70568	25 %	25 %	50 %	0 %	161830028
1554	NC_010117	GCG	2	6	70586	70591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830028
1555	NC_010117	GTC	2	6	70645	70650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830028
1556	NC_010117	T	6	6	70690	70695	0 %	100 %	0 %	0 %	161830028
1557	NC_010117	GTT	2	6	70706	70711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830028
1558	NC_010117	ATA	2	6	70722	70727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830028
1559	NC_010117	ATTT	2	8	70733	70740	25 %	75 %	0 %	0 %	161830028
1560	NC_010117	TTCCC	2	10	70756	70765	0 %	40 %	0 %	60 %	161830028
1561	NC_010117	ATG	2	6	70779	70784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830028
1562	NC_010117	T	6	6	70826	70831	0 %	100 %	0 %	0 %	161830028
1563	NC_010117	GTT	2	6	70832	70837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830028
1564	NC_010117	TTG	2	6	70990	70995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830028
1565	NC_010117	GGA	2	6	71010	71015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830028
1566	NC_010117	GCAAT	2	10	71067	71076	40 %	20 %	20 %	20 %	161830028
1567	NC_010117	ATT	2	6	71088	71093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830028
1568	NC_010117	GTT	2	6	71155	71160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830028
1569	NC_010117	AAT	2	6	71178	71183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830028
1570	NC_010117	AACC	2	8	71209	71216	50 %	0 %	0 %	50 %	161830028
1571	NC_010117	TGA	2	6	71228	71233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830028
1572	NC_010117	GA	3	6	71260	71265	50 %	0 %	50 %	0 %	161830028
1573	NC_010117	AAG	2	6	71325	71330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830028
1574	NC_010117	AAC	2	6	71337	71342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830028
1575	NC_010117	AAT	2	6	71358	71363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830028
1576	NC_010117	TTC	2	6	71405	71410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830885
1577	NC_010117	AGC	2	6	71427	71432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830885
1578	NC_010117	TGC	2	6	71454	71459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830885
1579	NC_010117	TTAA	2	8	71466	71473	50 %	50 %	0 %	0 %	161830885
1580	NC_010117	A	6	6	71511	71516	100 %	0 %	0 %	0 %	161830885
1581	NC_010117	ATTG	2	8	71542	71549	25 %	50 %	25 %	0 %	161830885
1582	NC_010117	GTAG	2	8	71560	71567	25 %	25 %	50 %	0 %	161830885
1583	NC_010117	GTG	2	6	71581	71586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830885
1584	NC_010117	ATA	2	6	71665	71670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830885
1585	NC_010117	T	7	7	71706	71712	0 %	100 %	0 %	0 %	161830885
1586	NC_010117	ATA	2	6	71768	71773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830885
1587	NC_010117	CG	3	6	71859	71864	0 %	0 %	50 %	50 %	161830885
1588	NC_010117	CCG	2	6	71913	71918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830885
1589	NC_010117	A	6	6	72015	72020	100 %	0 %	0 %	0 %	161830885
1590	NC_010117	ATG	2	6	72044	72049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830885
1591	NC_010117	AT	3	6	72061	72066	50 %	50 %	0 %	0 %	161830885
1592	NC_010117	GAT	2	6	72068	72073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830885
1593	NC_010117	GCA	2	6	72120	72125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830885
1594	NC_010117	TAGG	2	8	72129	72136	25 %	25 %	50 %	0 %	161830885
1595	NC_010117	T	7	7	72210	72216	0 %	100 %	0 %	0 %	161830885
1596	NC_010117	TTC	2	6	72320	72325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830885
1597	NC_010117	GCC	2	6	72363	72368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830885
1598	NC_010117	TTC	2	6	72464	72469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830885
1599	NC_010117	GCC	2	6	72649	72654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830885
1600	NC_010117	CA	3	6	72716	72721	50 %	0 %	0 %	50 %	161830885
1601	NC_010117	GCT	2	6	72732	72737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830885
1602	NC_010117	GAA	2	6	72855	72860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830885
1603	NC_010117	CTTC	2	8	72876	72883	0 %	50 %	0 %	50 %	161830885
1604	NC_010117	A	6	6	72891	72896	100 %	0 %	0 %	0 %	161830885
1605	NC_010117	AGG	2	6	72944	72949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830885
1606	NC_010117	T	6	6	72964	72969	0 %	100 %	0 %	0 %	161830885
1607	NC_010117	GGT	2	6	73052	73057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830885
1608	NC_010117	TAA	2	6	73133	73138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830885
1609	NC_010117	CTG	2	6	73148	73153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830885
1610	NC_010117	AGC	2	6	73363	73368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831337
1611	NC_010117	A	6	6	73369	73374	100 %	0 %	0 %	0 %	161831337
1612	NC_010117	AAG	2	6	73430	73435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831337
1613	NC_010117	TCAT	2	8	73453	73460	25 %	50 %	0 %	25 %	161831337
1614	NC_010117	GAA	2	6	73518	73523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831337
1615	NC_010117	A	6	6	73633	73638	100 %	0 %	0 %	0 %	161831337
1616	NC_010117	ACT	2	6	73641	73646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831337
1617	NC_010117	AAT	2	6	73649	73654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831337
1618	NC_010117	TGA	2	6	73688	73693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831337
1619	NC_010117	AGA	2	6	73734	73739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831337
1620	NC_010117	GTTTT	2	10	73861	73870	0 %	80 %	20 %	0 %	161831337
1621	NC_010117	T	6	6	73867	73872	0 %	100 %	0 %	0 %	161831337
1622	NC_010117	CTT	2	6	73915	73920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831337
1623	NC_010117	GAA	2	6	73953	73958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831337
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1625	NC_010117	TTA	2	6	74005	74010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831337
1626	NC_010117	GAAAA	2	10	74047	74056	80 %	0 %	20 %	0 %	161831337
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