MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010117	TAA	2	6	45515	45520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829887
1002	NC_010117	CAC	2	6	45565	45570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161829887
1003	NC_010117	AGAA	2	8	45573	45580	75 %	0 %	25 %	0 %	161829887
1004	NC_010117	AAT	2	6	45586	45591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829887
1005	NC_010117	GAA	2	6	45596	45601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829887
1006	NC_010117	GAT	2	6	45661	45666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829887
1007	NC_010117	ATG	2	6	45676	45681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829887
1008	NC_010117	CG	3	6	45733	45738	0 %	0 %	50 %	50 %	161830711
1009	NC_010117	TGCGC	2	10	45764	45773	0 %	20 %	40 %	40 %	161830711
1010	NC_010117	TG	3	6	45775	45780	0 %	50 %	50 %	0 %	161830711
1011	NC_010117	TAT	2	6	45857	45862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010117	AAT	2	6	45870	45875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010117	ATT	2	6	45901	45906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010117	CGC	2	6	45974	45979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830337
1015	NC_010117	GAA	2	6	45982	45987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830337
1016	NC_010117	GT	3	6	46050	46055	0 %	50 %	50 %	0 %	161830337
1017	NC_010117	CTT	2	6	46142	46147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1018	NC_010117	TCT	2	6	46189	46194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1019	NC_010117	TCT	2	6	46198	46203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1020	NC_010117	CTT	2	6	46244	46249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1021	NC_010117	TTC	2	6	46278	46283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1022	NC_010117	GGC	2	6	46288	46293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830337
1023	NC_010117	CTT	2	6	46310	46315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1024	NC_010117	GGT	2	6	46336	46341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830337
1025	NC_010117	CTT	2	6	46343	46348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1026	NC_010117	GGC	2	6	46369	46374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830337
1027	NC_010117	GGC	2	6	46384	46389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830337
1028	NC_010117	CTT	2	6	46424	46429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1029	NC_010117	GAG	2	6	46436	46441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830337
1030	NC_010117	GGC	2	6	46450	46455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830337
1031	NC_010117	TCT	2	6	46456	46461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830337
1032	NC_010117	CTT	2	6	46490	46495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830129
1033	NC_010117	CTC	2	6	46521	46526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830129
1034	NC_010117	CTT	2	6	46559	46564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830129
1035	NC_010117	AGG	2	6	46569	46574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830129
1036	NC_010117	CTT	2	6	46592	46597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830129
1037	NC_010117	AGG	2	6	46635	46640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830129
1038	NC_010117	AGG	2	6	46686	46691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830129
1039	NC_010117	AGATTC	2	12	46817	46828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161830620
1040	NC_010117	AAC	2	6	46856	46861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830620
1041	NC_010117	ACT	2	6	46892	46897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830620
1042	NC_010117	A	6	6	46938	46943	100 %	0 %	0 %	0 %	161830620
1043	NC_010117	TCT	2	6	46950	46955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830620
1044	NC_010117	TCC	2	6	46973	46978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161830620
1045	NC_010117	ACA	2	6	46989	46994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830620
1046	NC_010117	AAC	2	6	46997	47002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830620
1047	NC_010117	ATTT	2	8	47051	47058	25 %	75 %	0 %	0 %	161830620
1048	NC_010117	AG	3	6	47106	47111	50 %	0 %	50 %	0 %	161830620
1049	NC_010117	CCG	2	6	47112	47117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830620
1050	NC_010117	CAC	2	6	47144	47149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_010117	TGAG	2	8	47151	47158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010117	TCCC	2	8	47171	47178	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1053	NC_010117	TTA	2	6	47211	47216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010117	A	6	6	47242	47247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010117	GAA	2	6	47284	47289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010117	GATT	2	8	47314	47321	25 %	50 %	25 %	0 %	161831125
1057	NC_010117	TCG	2	6	47351	47356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831125
1058	NC_010117	CTT	2	6	47481	47486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_010117	GAG	2	6	47492	47497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010117	TCG	2	6	47528	47533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010117	A	6	6	47545	47550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010117	T	8	8	47592	47599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010117	GTT	2	6	47651	47656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010117	TTTTC	2	10	47680	47689	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_010117	T	7	7	47717	47723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010117	TCC	2	6	47730	47735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_010117	GTG	2	6	47771	47776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010117	GAC	2	6	47786	47791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_010117	TAA	2	6	47849	47854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010117	A	6	6	47853	47858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010117	ATT	2	6	47882	47887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010117	TAA	2	6	47915	47920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010117	T	6	6	47962	47967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010117	TAA	2	6	48022	48027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010117	A	6	6	48128	48133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010117	TCA	2	6	48138	48143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010117	CGTAA	2	10	48154	48163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_010117	A	7	7	48185	48191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010117	T	6	6	48211	48216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010117	GA	3	6	48241	48246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010117	TAAT	2	8	48247	48254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010117	GTAATT	2	12	48274	48285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010117	TTG	2	6	48290	48295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010117	ATAA	2	8	48306	48313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010117	GTT	2	6	48410	48415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830022
1086	NC_010117	CCAC	2	8	48422	48429	25 %	0 %	0 %	75 %	161830022
1087	NC_010117	CTT	2	6	48453	48458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830022
1088	NC_010117	ATA	2	6	48782	48787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830022
1089	NC_010117	ACG	2	6	48848	48853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830022
1090	NC_010117	GCT	2	6	48869	48874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830022
1091	NC_010117	ACC	2	6	48974	48979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830022
1092	NC_010117	CTT	2	6	49116	49121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830022
1093	NC_010117	TTC	2	6	49159	49164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830022
1094	NC_010117	CGC	2	6	49227	49232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830022
1095	NC_010117	CAT	2	6	49233	49238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830022
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1097	NC_010117	TC	3	6	49314	49319	0 %	50 %	0 %	50 %	161830022
1098	NC_010117	GCA	3	9	49358	49366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830022
1099	NC_010117	TAA	2	6	49420	49425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830022
1100	NC_010117	TGCG	2	8	49482	49489	0 %	25 %	50 %	25 %	161830022
1101	NC_010117	T	6	6	49516	49521	0 %	100 %	0 %	0 %	161830022
1102	NC_010117	TTG	2	6	49623	49628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830022
1103	NC_010117	TTC	2	6	49736	49741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831401
1104	NC_010117	GGTGGC	2	12	49760	49771	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	161831401
1105	NC_010117	TTC	2	6	49799	49804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831401
1106	NC_010117	TAAT	2	8	49840	49847	50 %	50 %	0 %	0 %	161831401
1107	NC_010117	GCC	2	6	49961	49966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831401
1108	NC_010117	GCA	2	6	49995	50000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831401
1109	NC_010117	GC	3	6	50060	50065	0 %	0 %	50 %	50 %	161831401
1110	NC_010117	CCG	2	6	50070	50075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831401
1111	NC_010117	CGA	2	6	50083	50088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831401
1112	NC_010117	GCC	2	6	50126	50131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161831401
1113	NC_010117	GT	3	6	50169	50174	0 %	50 %	50 %	0 %	161831401
1114	NC_010117	GGC	2	6	50190	50195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831401
1115	NC_010117	TCG	2	6	50214	50219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831401
1116	NC_010117	CGG	2	6	50287	50292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831401
1117	NC_010117	TTG	2	6	50384	50389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831401
1118	NC_010117	CGCC	2	8	50476	50483	0 %	0 %	25 %	75 %	161831401
1119	NC_010117	TCT	2	6	50496	50501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831401
1120	NC_010117	TGG	2	6	50653	50658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831401
1121	NC_010117	ACG	2	6	50694	50699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831401
1122	NC_010117	TAA	2	6	50889	50894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010117	A	6	6	50893	50898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010117	T	6	6	50918	50923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010117	AGG	2	6	50960	50965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010117	T	7	7	50999	51005	0 %	100 %	0 %	0 %	161830390
1127	NC_010117	CAA	2	6	51035	51040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830390
1128	NC_010117	GCA	2	6	51042	51047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830390
1129	NC_010117	TATT	2	8	51266	51273	25 %	75 %	0 %	0 %	161830390
1130	NC_010117	GCA	2	6	51357	51362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830390
1131	NC_010117	GCA	2	6	51447	51452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830390
1132	NC_010117	TGGA	2	8	51472	51479	25 %	25 %	50 %	0 %	161830390
1133	NC_010117	CAGCC	2	10	51543	51552	20 %	0 %	20 %	60 %	161830390
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1255	NC_010117	CA	3	6	56992	56997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1256	NC_010117	ACC	2	6	57072	57077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_010117	TCGC	2	8	57090	57097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1258	NC_010117	AGTTAT	2	12	57187	57198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_010117	TCA	2	6	57206	57211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_010117	TAA	2	6	57243	57248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_010117	TA	3	6	57252	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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