MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010117	GCTGTC	2	12	296887	296898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830353
6502	NC_010117	CAA	2	6	296985	296990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830353
6503	NC_010117	CG	3	6	296998	297003	0 %	0 %	50 %	50 %	161830353
6504	NC_010117	GGT	2	6	297021	297026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830353
6505	NC_010117	GAA	2	6	297088	297093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830353
6506	NC_010117	TTGAT	2	10	297110	297119	20 %	60 %	20 %	0 %	161830353
6507	NC_010117	TATT	2	8	297132	297139	25 %	75 %	0 %	0 %	161830353
6508	NC_010117	A	6	6	297221	297226	100 %	0 %	0 %	0 %	161830353
6509	NC_010117	GAA	2	6	297253	297258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830353
6510	NC_010117	TG	3	6	297356	297361	0 %	50 %	50 %	0 %	161830353
6511	NC_010117	ATT	2	6	297393	297398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830353
6512	NC_010117	TGAT	2	8	297407	297414	25 %	50 %	25 %	0 %	161830353
6513	NC_010117	CACC	2	8	297425	297432	25 %	0 %	0 %	75 %	161830353
6514	NC_010117	TGCC	2	8	297437	297444	0 %	25 %	25 %	50 %	161830353
6515	NC_010117	GTG	2	6	297449	297454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830353
6516	NC_010117	AAG	2	6	297455	297460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830353
6517	NC_010117	CGA	2	6	297492	297497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830353
6518	NC_010117	GAA	2	6	297670	297675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830353
6519	NC_010117	GTGC	2	8	297685	297692	0 %	25 %	50 %	25 %	161830353
6520	NC_010117	GCC	2	6	297703	297708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830353
6521	NC_010117	CAAC	2	8	297750	297757	50 %	0 %	0 %	50 %	161830353
6522	NC_010117	ATT	2	6	297763	297768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830353
6523	NC_010117	A	6	6	297842	297847	100 %	0 %	0 %	0 %	161830353
6524	NC_010117	AAG	2	6	297875	297880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830353
6525	NC_010117	GCG	2	6	297975	297980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830353
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6527	NC_010117	G	6	6	298081	298086	0 %	0 %	100 %	0 %	161830353
6528	NC_010117	TCG	2	6	298163	298168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830353
6529	NC_010117	CAG	2	6	298196	298201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830353
6530	NC_010117	AAGTGG	2	12	298397	298408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	161830353
6531	NC_010117	AGA	2	6	298416	298421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830353
6532	NC_010117	CTG	2	6	298490	298495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830353
6533	NC_010117	TTG	2	6	298502	298507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830353
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6535	NC_010117	ACA	2	6	298644	298649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830353
6536	NC_010117	AAG	2	6	298655	298660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830353
6537	NC_010117	AG	3	6	298693	298698	50 %	0 %	50 %	0 %	161829893
6538	NC_010117	GAC	2	6	298746	298751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829893
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6540	NC_010117	CGG	2	6	298791	298796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161829893
6541	NC_010117	AGAAA	2	10	298797	298806	80 %	0 %	20 %	0 %	161829893
6542	NC_010117	GC	4	8	298839	298846	0 %	0 %	50 %	50 %	161829893
6543	NC_010117	GAA	2	6	298938	298943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829893
6544	NC_010117	GCG	2	6	298957	298962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161829893
6545	NC_010117	TGG	2	6	298982	298987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161829893
6546	NC_010117	TGG	2	6	299090	299095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161829893
6547	NC_010117	ATA	2	6	299179	299184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829893
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6549	NC_010117	GGT	2	6	299355	299360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161829893
6550	NC_010117	ATC	2	6	299383	299388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829893
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6552	NC_010117	ACG	2	6	299428	299433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829893
6553	NC_010117	GAC	2	6	299436	299441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829893
6554	NC_010117	ATT	2	6	299469	299474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829893
6555	NC_010117	GAA	2	6	299530	299535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829893
6556	NC_010117	GATC	2	8	299567	299574	25 %	25 %	25 %	25 %	161829893
6557	NC_010117	CA	3	6	299579	299584	50 %	0 %	0 %	50 %	161829893
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6560	NC_010117	CA	3	6	299635	299640	50 %	0 %	0 %	50 %	161829893
6561	NC_010117	ACG	2	6	299680	299685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829893
6562	NC_010117	ATTG	2	8	299766	299773	25 %	50 %	25 %	0 %	161829893
6563	NC_010117	GATG	2	8	299784	299791	25 %	25 %	50 %	0 %	161829893
6564	NC_010117	ATT	2	6	299854	299859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161829893
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6567	NC_010117	TCT	2	6	299976	299981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_010117	TCT	2	6	299983	299988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_010117	T	6	6	300015	300020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_010117	ATTA	2	8	300039	300046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_010117	ATCG	2	8	300109	300116	25 %	25 %	25 %	25 %	161830951
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6574	NC_010117	CTATT	2	10	300173	300182	20 %	60 %	0 %	20 %	161830951
6575	NC_010117	CGA	2	6	300185	300190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830951
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6592	NC_010117	AAG	2	6	301144	301149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830071
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6594	NC_010117	GC	3	6	301190	301195	0 %	0 %	50 %	50 %	161830071
6595	NC_010117	A	6	6	301210	301215	100 %	0 %	0 %	0 %	161830071
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6608	NC_010117	AG	3	6	301664	301669	50 %	0 %	50 %	0 %	161830071
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6993	NC_010117	CCT	2	6	320404	320409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6994	NC_010117	ATA	2	6	320450	320455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6995	NC_010117	AAT	2	6	320524	320529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6996	NC_010117	TTTCG	2	10	320542	320551	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6997	NC_010117	ACCC	2	8	320568	320575	25 %	0 %	0 %	75 %	161831163
6998	NC_010117	TTG	2	6	320576	320581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831163
6999	NC_010117	CAA	2	6	320583	320588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831163
7000	NC_010117	TGA	2	6	320596	320601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831163

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