MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010117	AAT	2	6	252973	252978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830542
5502	NC_010117	A	7	7	253047	253053	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
5503	NC_010117	TAT	2	6	253071	253076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830542
5504	NC_010117	AAT	2	6	253095	253100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830542
5505	NC_010117	TTTA	2	8	253110	253117	25 %	75 %	0 %	0 %	161830542
5506	NC_010117	A	6	6	253125	253130	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
5507	NC_010117	GGT	2	6	253132	253137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830542
5508	NC_010117	CTA	2	6	253151	253156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830542
5509	NC_010117	TTA	2	6	253225	253230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830542
5510	NC_010117	A	7	7	253230	253236	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
5511	NC_010117	ATG	2	6	253259	253264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830542
5512	NC_010117	TATT	2	8	253313	253320	25 %	75 %	0 %	0 %	161830542
5513	NC_010117	A	6	6	253321	253326	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
5514	NC_010117	ATT	2	6	253358	253363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830542
5515	NC_010117	CAA	2	6	253366	253371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830542
5516	NC_010117	CAAT	2	8	253410	253417	50 %	25 %	0 %	25 %	161830542
5517	NC_010117	ATT	2	6	253423	253428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830542
5518	NC_010117	GGA	2	6	253459	253464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830542
5519	NC_010117	ACC	2	6	253492	253497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161830542
5520	NC_010117	ATT	2	6	253528	253533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830542
5521	NC_010117	A	7	7	253555	253561	100 %	0 %	0 %	0 %	161830542
5522	NC_010117	TAT	2	6	253648	253653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830542
5523	NC_010117	T	6	6	253713	253718	0 %	100 %	0 %	0 %	161830542
5524	NC_010117	ATTTA	2	10	253739	253748	40 %	60 %	0 %	0 %	161830542
5525	NC_010117	T	6	6	253758	253763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_010117	CAGC	2	8	253911	253918	25 %	0 %	25 %	50 %	161830831
5527	NC_010117	CTG	2	6	254040	254045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830831
5528	NC_010117	AGC	2	6	254077	254082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161830831
5529	NC_010117	CGG	3	9	254091	254099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830831
5530	NC_010117	T	8	8	254162	254169	0 %	100 %	0 %	0 %	161830831
5531	NC_010117	TAA	2	6	254197	254202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830831
5532	NC_010117	TCGC	2	8	254222	254229	0 %	25 %	25 %	50 %	161830831
5533	NC_010117	TAA	2	6	254249	254254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830831
5534	NC_010117	CGG	2	6	254262	254267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830831
5535	NC_010117	AAT	2	6	254269	254274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830831
5536	NC_010117	ACA	2	6	254303	254308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830831
5537	NC_010117	CCG	2	6	254312	254317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830831
5538	NC_010117	TTC	2	6	254326	254331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830831
5539	NC_010117	GCG	2	6	254431	254436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830831
5540	NC_010117	T	6	6	254538	254543	0 %	100 %	0 %	0 %	161830831
5541	NC_010117	T	6	6	254556	254561	0 %	100 %	0 %	0 %	161830831
5542	NC_010117	GCG	2	6	254624	254629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830831
5543	NC_010117	CAT	2	6	254649	254654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830831
5544	NC_010117	TCA	2	6	254684	254689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830831
5545	NC_010117	GCC	2	6	254701	254706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830831
5546	NC_010117	GGC	2	6	254740	254745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830831
5547	NC_010117	AAT	2	6	254812	254817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830831
5548	NC_010117	TAA	2	6	254854	254859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830831
5549	NC_010117	AAC	2	6	254950	254955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830831
5550	NC_010117	ATTC	2	8	255060	255067	25 %	50 %	0 %	25 %	161830831
5551	NC_010117	GTG	2	6	255216	255221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010117	TCT	2	6	255346	255351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831358
5553	NC_010117	TCG	2	6	255369	255374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831358
5554	NC_010117	TTC	2	6	255402	255407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161831358
5555	NC_010117	CGGC	2	8	255458	255465	0 %	0 %	50 %	50 %	161831358
5556	NC_010117	TG	3	6	255525	255530	0 %	50 %	50 %	0 %	161831358
5557	NC_010117	GCG	2	6	255570	255575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831358
5558	NC_010117	ATC	2	6	255650	255655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831358
5559	NC_010117	ATT	2	6	255663	255668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831358
5560	NC_010117	GTG	2	6	255682	255687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831358
5561	NC_010117	GAC	2	6	255777	255782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831358
5562	NC_010117	GGT	2	6	255787	255792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831358
5563	NC_010117	TGG	2	6	255806	255811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831358
5564	NC_010117	G	6	6	255810	255815	0 %	0 %	100 %	0 %	161831358
5565	NC_010117	GGC	2	6	255834	255839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831358
5566	NC_010117	ACTT	2	8	255859	255866	25 %	50 %	0 %	25 %	161831358
5567	NC_010117	TTA	2	6	255877	255882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831358
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5570	NC_010117	GCT	2	6	255958	255963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831358
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5572	NC_010117	TGC	2	6	256016	256021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831358
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5579	NC_010117	CGG	2	6	256167	256172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161831358
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5581	NC_010117	ATCG	2	8	256199	256206	25 %	25 %	25 %	25 %	161831358
5582	NC_010117	CTTT	2	8	256243	256250	0 %	75 %	0 %	25 %	161831358
5583	NC_010117	T	6	6	256301	256306	0 %	100 %	0 %	0 %	161831358
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5588	NC_010117	TTTA	2	8	256484	256491	25 %	75 %	0 %	0 %	161831358
5589	NC_010117	T	7	7	256497	256503	0 %	100 %	0 %	0 %	161831358
5590	NC_010117	GATT	2	8	256548	256555	25 %	50 %	25 %	0 %	161831358
5591	NC_010117	A	6	6	256716	256721	100 %	0 %	0 %	0 %	161829704
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5593	NC_010117	T	6	6	256751	256756	0 %	100 %	0 %	0 %	161829704
5594	NC_010117	AGC	2	6	256868	256873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161829704
5595	NC_010117	GC	3	6	256915	256920	0 %	0 %	50 %	50 %	161829704
5596	NC_010117	CATA	2	8	256935	256942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5597	NC_010117	A	7	7	256951	256957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_010117	T	7	7	256972	256978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_010117	AATT	2	8	256993	257000	50 %	50 %	0 %	0 %	161830692
5600	NC_010117	CGC	2	6	257027	257032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830692
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5605	NC_010117	GT	3	6	257351	257356	0 %	50 %	50 %	0 %	161830692
5606	NC_010117	A	6	6	257383	257388	100 %	0 %	0 %	0 %	161830692
5607	NC_010117	TGAG	2	8	257404	257411	25 %	25 %	50 %	0 %	161830692
5608	NC_010117	AGA	2	6	257421	257426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830692
5609	NC_010117	ACCGTA	2	12	257476	257487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161830692
5610	NC_010117	GCC	2	6	257490	257495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830692
5611	NC_010117	TAA	2	6	257688	257693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830692
5612	NC_010117	GTTT	2	8	257791	257798	0 %	75 %	25 %	0 %	161830692
5613	NC_010117	TCA	2	6	257800	257805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830692
5614	NC_010117	ACA	2	6	257818	257823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830692
5615	NC_010117	AGT	2	6	257853	257858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830692
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5618	NC_010117	TGG	2	6	258092	258097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161830692
5619	NC_010117	TGC	2	6	258161	258166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830692
5620	NC_010117	AAT	2	6	258271	258276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830692
5621	NC_010117	GCAA	2	8	258383	258390	50 %	0 %	25 %	25 %	161830692
5622	NC_010117	GAA	2	6	258433	258438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830692
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5624	NC_010117	ATT	2	6	258483	258488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830692
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