MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 chromosome

Total Repeats: 44365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010117	AAAT	2	8	229213	229220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_010117	CA	3	6	229233	229238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_010117	T	6	6	229244	229249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_010117	ATTTT	2	10	229401	229410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_010117	CTT	2	6	229424	229429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_010117	CAG	2	6	229438	229443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_010117	T	6	6	229513	229518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_010117	ATAA	2	8	229663	229670	75 %	25 %	0 %	0 %	161831626
5009	NC_010117	CGT	2	6	229679	229684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831626
5010	NC_010117	AGG	2	6	229693	229698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831626
5011	NC_010117	AT	3	6	229708	229713	50 %	50 %	0 %	0 %	161831626
5012	NC_010117	AAC	2	6	229776	229781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161831626
5013	NC_010117	A	6	6	229791	229796	100 %	0 %	0 %	0 %	161831626
5014	NC_010117	T	6	6	229799	229804	0 %	100 %	0 %	0 %	161831626
5015	NC_010117	TAA	2	6	229844	229849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831626
5016	NC_010117	TAC	2	6	229895	229900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831626
5017	NC_010117	TTTGT	2	10	229972	229981	0 %	80 %	20 %	0 %	161831626
5018	NC_010117	TCA	2	6	230061	230066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831626
5019	NC_010117	T	6	6	230085	230090	0 %	100 %	0 %	0 %	161831626
5020	NC_010117	AATT	2	8	230150	230157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_010117	TGT	2	6	230290	230295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831005
5022	NC_010117	TCG	2	6	230298	230303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831005
5023	NC_010117	T	7	7	230496	230502	0 %	100 %	0 %	0 %	161831005
5024	NC_010117	GGA	2	6	230619	230624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831005
5025	NC_010117	ATC	2	6	230657	230662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161831005
5026	NC_010117	GCT	2	6	230769	230774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_010117	GAA	2	6	230845	230850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830586
5028	NC_010117	GGA	2	6	230926	230931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161830586
5029	NC_010117	TAT	2	6	230944	230949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830586
5030	NC_010117	GCG	2	6	230954	230959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161830586
5031	NC_010117	ATC	2	6	230970	230975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830586
5032	NC_010117	A	7	7	231013	231019	100 %	0 %	0 %	0 %	161830586
5033	NC_010117	TA	3	6	231021	231026	50 %	50 %	0 %	0 %	161830586
5034	NC_010117	CAT	2	6	231070	231075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830586
5035	NC_010117	A	8	8	231083	231090	100 %	0 %	0 %	0 %	161830586
5036	NC_010117	TCG	2	6	231117	231122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830586
5037	NC_010117	TGT	2	6	231195	231200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161830586
5038	NC_010117	A	6	6	231284	231289	100 %	0 %	0 %	0 %	161830586
5039	NC_010117	TGAT	2	8	231312	231319	25 %	50 %	25 %	0 %	161830586
5040	NC_010117	CTA	2	6	231339	231344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830586
5041	NC_010117	CAA	2	6	231356	231361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830586
5042	NC_010117	TTA	2	6	231375	231380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830586
5043	NC_010117	T	6	6	231384	231389	0 %	100 %	0 %	0 %	161830586
5044	NC_010117	ATTA	3	12	231534	231545	50 %	50 %	0 %	0 %	161830586
5045	NC_010117	GGA	2	6	231585	231590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_010117	TTAT	2	8	231642	231649	25 %	75 %	0 %	0 %	161830376
5047	NC_010117	T	7	7	231886	231892	0 %	100 %	0 %	0 %	161830376
5048	NC_010117	TTA	2	6	231918	231923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
5049	NC_010117	CTT	2	6	231964	231969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830376
5050	NC_010117	GAA	2	6	231987	231992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830376
5051	NC_010117	ATT	2	6	232044	232049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
5052	NC_010117	TGC	2	6	232094	232099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161830376
5053	NC_010117	TATT	2	8	232100	232107	25 %	75 %	0 %	0 %	161830376
5054	NC_010117	ACGC	2	8	232212	232219	25 %	0 %	25 %	50 %	161830376
5055	NC_010117	A	7	7	232255	232261	100 %	0 %	0 %	0 %	161830376
5056	NC_010117	ATT	2	6	232281	232286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
5057	NC_010117	T	6	6	232313	232318	0 %	100 %	0 %	0 %	161830376
5058	NC_010117	ATA	2	6	232357	232362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830376
5059	NC_010117	T	6	6	232370	232375	0 %	100 %	0 %	0 %	161830376
5060	NC_010117	TTCC	2	8	232459	232466	0 %	50 %	0 %	50 %	161830376
5061	NC_010117	AAG	2	6	232480	232485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161830376
5062	NC_010117	TAT	2	6	232493	232498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161830376
5063	NC_010117	A	6	6	232526	232531	100 %	0 %	0 %	0 %	161830376
5064	NC_010117	TGA	2	6	232694	232699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830376
5065	NC_010117	ATC	2	6	232735	232740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161830376
5066	NC_010117	TCT	2	6	232764	232769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830376
5067	NC_010117	TC	3	6	232804	232809	0 %	50 %	0 %	50 %	161831505
5068	NC_010117	GAG	2	6	232816	232821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831505
5069	NC_010117	TTAA	2	8	232827	232834	50 %	50 %	0 %	0 %	161831505
5070	NC_010117	T	6	6	232918	232923	0 %	100 %	0 %	0 %	161831505
5071	NC_010117	A	6	6	232980	232985	100 %	0 %	0 %	0 %	161831505
5072	NC_010117	GTA	2	6	233009	233014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
5073	NC_010117	TAAAT	2	10	233127	233136	60 %	40 %	0 %	0 %	161831505
5074	NC_010117	GCA	2	6	233229	233234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831505
5075	NC_010117	TTA	2	6	233328	233333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831505
5076	NC_010117	AAATT	2	10	233353	233362	60 %	40 %	0 %	0 %	161831505
5077	NC_010117	TGC	2	6	233367	233372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831505
5078	NC_010117	GAG	2	6	233404	233409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831505
5079	NC_010117	ATG	2	6	233426	233431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
5080	NC_010117	TAAG	2	8	233441	233448	50 %	25 %	25 %	0 %	161831505
5081	NC_010117	TAA	2	6	233489	233494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
5082	NC_010117	ATG	2	6	233505	233510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
5083	NC_010117	TTTC	2	8	233531	233538	0 %	75 %	0 %	25 %	161831505
5084	NC_010117	AT	3	6	233592	233597	50 %	50 %	0 %	0 %	161831505
5085	NC_010117	T	8	8	233634	233641	0 %	100 %	0 %	0 %	161831505
5086	NC_010117	GAT	2	6	233660	233665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831505
5087	NC_010117	ATCA	2	8	233669	233676	50 %	25 %	0 %	25 %	161831505
5088	NC_010117	AATAAA	2	12	233702	233713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	161831505
5089	NC_010117	TTAAT	2	10	233716	233725	40 %	60 %	0 %	0 %	161831505
5090	NC_010117	T	7	7	233725	233731	0 %	100 %	0 %	0 %	161831505
5091	NC_010117	ACC	2	6	233888	233893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831505
5092	NC_010117	AAT	2	6	233963	233968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
5093	NC_010117	TGC	2	6	234032	234037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831505
5094	NC_010117	AGG	2	6	234050	234055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831505
5095	NC_010117	AAT	2	6	234086	234091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
5096	NC_010117	TAA	2	6	234095	234100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
5097	NC_010117	TGG	2	6	234124	234129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161831505
5098	NC_010117	ATA	2	6	234270	234275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
5099	NC_010117	AAAGAT	2	12	234301	234312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161831505
5100	NC_010117	TAA	2	6	234317	234322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831505
5101	NC_010117	AGG	2	6	234337	234342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161831505
5102	NC_010117	TTAT	2	8	234345	234352	25 %	75 %	0 %	0 %	161831505
5103	NC_010117	T	7	7	234383	234389	0 %	100 %	0 %	0 %	161831225
5104	NC_010117	TGC	2	6	234404	234409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161831225
5105	NC_010117	ATT	2	6	234451	234456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161831225
5106	NC_010117	T	6	6	234467	234472	0 %	100 %	0 %	0 %	161831225
5107	NC_010117	GTGA	2	8	234547	234554	25 %	25 %	50 %	0 %	161831225
5108	NC_010117	TAA	2	6	234655	234660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831225
5109	NC_010117	TGT	2	6	234704	234709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161831225
5110	NC_010117	CAG	2	6	234783	234788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831225
5111	NC_010117	GCA	2	6	234819	234824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161831225
5112	NC_010117	T	7	7	234845	234851	0 %	100 %	0 %	0 %	161831225
5113	NC_010117	AAT	2	6	234869	234874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161831225
5114	NC_010117	GAA	2	6	235022	235027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831225
5115	NC_010117	ATG	2	6	235133	235138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161831225
5116	NC_010117	TAT	2	6	235140	235145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010117	TAA	2	6	235182	235187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161829941
5118	NC_010117	T	6	6	235229	235234	0 %	100 %	0 %	0 %	161829941
5119	NC_010117	T	8	8	235265	235272	0 %	100 %	0 %	0 %	161829941
5120	NC_010117	GTTT	2	8	235278	235285	0 %	75 %	25 %	0 %	161829941
5121	NC_010117	CAAGC	2	10	235288	235297	40 %	0 %	20 %	40 %	161829941
5122	NC_010117	AAAC	2	8	235299	235306	75 %	0 %	0 %	25 %	161829941
5123	NC_010117	TCT	2	6	235338	235343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829941
5124	NC_010117	ATG	2	6	235394	235399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161829941
5125	NC_010117	CGC	3	9	235411	235419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161829941
5126	NC_010117	CTT	2	6	235473	235478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161829941
5127	NC_010117	T	8	8	235539	235546	0 %	100 %	0 %	0 %	161829941
5128	NC_010117	G	6	6	235586	235591	0 %	0 %	100 %	0 %	161829941
5129	NC_010117	CAA	2	6	235616	235621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829941
5130	NC_010117	CTA	2	6	235627	235632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829941
5131	NC_010117	ATC	2	6	235673	235678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161829941
5132	NC_010117	TTTA	2	8	235685	235692	25 %	75 %	0 %	0 %	161829941
5133	NC_010117	CAA	2	6	235715	235720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161829941
5134	NC_010117	CG	3	6	235768	235773	0 %	0 %	50 %	50 %	161829941
5135	NC_010117	GAA	2	6	235774	235779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161829941
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5137	NC_010117	GGC	2	6	235937	235942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161829941
5138	NC_010117	T	8	8	236166	236173	0 %	100 %	0 %	0 %	161829941
5139	NC_010117	TTTCAT	2	12	236315	236326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	161830632
5140	NC_010117	CGC	2	6	236333	236338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830632
5141	NC_010117	AAC	2	6	236373	236378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161830632
5142	NC_010117	CTT	2	6	236386	236391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161830632
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5145	NC_010117	ATG	2	6	236612	236617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161830632
5146	NC_010117	GCC	2	6	236648	236653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161830632
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5157	NC_010117	TAA	2	6	237388	237393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161830632
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5159	NC_010117	T	6	6	237429	237434	0 %	100 %	0 %	0 %	161830632
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5164	NC_010117	TTTGT	2	10	237585	237594	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_010117	AAG	2	6	237698	237703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161831069
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5198	NC_010117	TGT	2	6	239008	239013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5199	NC_010117	T	7	7	239046	239052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5200	NC_010117	CTG	2	6	239135	239140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5203	NC_010117	T	6	6	239199	239204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5208	NC_010117	AC	3	6	239485	239490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5210	NC_010117	T	6	6	239534	239539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5211	NC_010117	GGC	2	6	239652	239657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5212	NC_010117	TTG	2	6	239807	239812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5217	NC_010117	GAA	2	6	240005	240010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5221	NC_010117	GC	3	6	240133	240138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5222	NC_010117	CTT	2	6	240403	240408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5229	NC_010117	GAT	2	6	240745	240750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_010117	TCA	2	6	240757	240762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5232	NC_010117	AC	3	6	240952	240957	50 %	0 %	0 %	50 %	161831474
5233	NC_010117	CAC	2	6	241022	241027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161831474
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5238	NC_010117	CCA	2	6	241359	241364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5240	NC_010117	TTG	2	6	241438	241443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_010117	GCT	2	6	241461	241466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5242	NC_010117	GTAAA	2	10	241487	241496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_010117	TGG	2	6	241582	241587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_010117	GTA	2	6	241618	241623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5247	NC_010117	ATT	2	6	241838	241843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_010117	AAT	2	6	241909	241914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_010117	G	6	6	241963	241968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_010117	TCC	2	6	241973	241978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5251	NC_010117	TTC	2	6	242100	242105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5253	NC_010117	ATCT	2	8	242244	242251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5254	NC_010117	ACTG	2	8	242277	242284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5255	NC_010117	AAG	2	6	242481	242486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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