MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010115	T	8	8	429	436	0 %	100 %	0 %	0 %	161789069
2	NC_010115	T	6	6	1098	1103	0 %	100 %	0 %	0 %	161789069
3	NC_010115	A	7	7	1159	1165	100 %	0 %	0 %	0 %	161789069
4	NC_010115	T	6	6	1363	1368	0 %	100 %	0 %	0 %	161789069
5	NC_010115	T	6	6	1787	1792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010115	A	6	6	1995	2000	100 %	0 %	0 %	0 %	161789101
7	NC_010115	A	6	6	2203	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010115	T	6	6	3098	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010115	A	6	6	3118	3123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010115	T	6	6	3357	3362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010115	T	7	7	3460	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	161789100
12	NC_010115	A	6	6	3686	3691	100 %	0 %	0 %	0 %	161789067
13	NC_010115	A	6	6	3844	3849	100 %	0 %	0 %	0 %	161789067
14	NC_010115	T	6	6	4218	4223	0 %	100 %	0 %	0 %	161789080
15	NC_010115	A	6	6	4226	4231	100 %	0 %	0 %	0 %	161789080
16	NC_010115	A	6	6	4343	4348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010115	T	8	8	4462	4469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010115	T	6	6	4493	4498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010115	A	6	6	4652	4657	100 %	0 %	0 %	0 %	161789096
20	NC_010115	A	6	6	4893	4898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010115	A	8	8	4976	4983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010115	T	7	7	5185	5191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010115	T	6	6	5607	5612	0 %	100 %	0 %	0 %	161789084
24	NC_010115	A	6	6	5866	5871	100 %	0 %	0 %	0 %	161789093
25	NC_010115	A	6	6	5966	5971	100 %	0 %	0 %	0 %	161789093
26	NC_010115	T	6	6	6641	6646	0 %	100 %	0 %	0 %	161789093
27	NC_010115	A	8	8	6695	6702	100 %	0 %	0 %	0 %	161789093
28	NC_010115	A	6	6	6795	6800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010115	A	7	7	6851	6857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010115	A	7	7	6874	6880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010115	A	8	8	6962	6969	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
32	NC_010115	A	6	6	7043	7048	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
33	NC_010115	A	7	7	7076	7082	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
34	NC_010115	A	6	6	7181	7186	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
35	NC_010115	A	7	7	7395	7401	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
36	NC_010115	A	7	7	7691	7697	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
37	NC_010115	A	6	6	7996	8001	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
38	NC_010115	A	8	8	8085	8092	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
39	NC_010115	A	6	6	8145	8150	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
40	NC_010115	A	8	8	8171	8178	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
41	NC_010115	A	7	7	8307	8313	100 %	0 %	0 %	0 %	161789104
42	NC_010115	A	6	6	8689	8694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010115	T	9	9	8738	8746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010115	T	7	7	8857	8863	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
45	NC_010115	A	6	6	8893	8898	100 %	0 %	0 %	0 %	161789088
46	NC_010115	T	6	6	8932	8937	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
47	NC_010115	T	6	6	8995	9000	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
48	NC_010115	T	7	7	9133	9139	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
49	NC_010115	G	6	6	9535	9540	0 %	0 %	100 %	0 %	161789088
50	NC_010115	T	8	8	9593	9600	0 %	100 %	0 %	0 %	161789088
51	NC_010115	A	6	6	9730	9735	100 %	0 %	0 %	0 %	161789065
52	NC_010115	C	6	6	9791	9796	0 %	0 %	0 %	100 %	161789065
53	NC_010115	A	6	6	10372	10377	100 %	0 %	0 %	0 %	161789065
54	NC_010115	T	7	7	10748	10754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010115	T	6	6	11047	11052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_010115	T	6	6	13462	13467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010115	T	6	6	13470	13475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010115	T	7	7	13498	13504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010115	A	7	7	13752	13758	100 %	0 %	0 %	0 %	161789102
66	NC_010115	A	8	8	13881	13888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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72	NC_010115	T	6	6	14976	14981	0 %	100 %	0 %	0 %	161789095
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81	NC_010115	T	6	6	17681	17686	0 %	100 %	0 %	0 %	161789090
82	NC_010115	A	6	6	17867	17872	100 %	0 %	0 %	0 %	161789090
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85	NC_010115	A	8	8	18322	18329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_010115	A	7	7	19071	19077	100 %	0 %	0 %	0 %	161789107
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92	NC_010115	A	6	6	19579	19584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010115	T	8	8	19612	19619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010115	T	7	7	19630	19636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_010115	A	6	6	21738	21743	100 %	0 %	0 %	0 %	161789078
100	NC_010115	A	6	6	21757	21762	100 %	0 %	0 %	0 %	161789078
101	NC_010115	A	7	7	21942	21948	100 %	0 %	0 %	0 %	161789071
102	NC_010115	A	6	6	22080	22085	100 %	0 %	0 %	0 %	161789071
103	NC_010115	A	7	7	22228	22234	100 %	0 %	0 %	0 %	161789071
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108	NC_010115	A	7	7	24660	24666	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
109	NC_010115	A	6	6	24777	24782	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
110	NC_010115	A	6	6	24799	24804	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
111	NC_010115	A	6	6	25311	25316	100 %	0 %	0 %	0 %	161789091
112	NC_010115	G	6	6	25424	25429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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114	NC_010115	A	6	6	25776	25781	100 %	0 %	0 %	0 %	161789076
115	NC_010115	T	6	6	25905	25910	0 %	100 %	0 %	0 %	161789076
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117	NC_010115	A	8	8	26807	26814	100 %	0 %	0 %	0 %	161789074
118	NC_010115	A	6	6	27074	27079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010115	A	6	6	27214	27219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010115	A	6	6	27348	27353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010115	A	7	7	27403	27409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_010115	A	6	6	27990	27995	100 %	0 %	0 %	0 %	161789073
126	NC_010115	A	6	6	28050	28055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010115	T	6	6	28068	28073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010115	A	6	6	28478	28483	100 %	0 %	0 %	0 %	161789064
129	NC_010115	T	6	6	28515	28520	0 %	100 %	0 %	0 %	161789064
130	NC_010115	T	6	6	28834	28839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_010115	A	7	7	29976	29982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010115	T	7	7	29999	30005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010115	A	7	7	30060	30066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_010115	T	6	6	30542	30547	0 %	100 %	0 %	0 %	161789106
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146	NC_010115	A	6	6	32184	32189	100 %	0 %	0 %	0 %	161789103
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148	NC_010115	A	6	6	33007	33012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010115	T	6	6	33100	33105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.