MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 4506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	AATAA	2	10	381	390	80 %	20 %	0 %	0 %	160878163
2	NC_010001	ATTAA	2	10	1972	1981	60 %	40 %	0 %	0 %	160878164
3	NC_010001	TGCAA	2	10	5765	5774	40 %	20 %	20 %	20 %	160878167
4	NC_010001	GTTAA	2	10	9305	9314	40 %	40 %	20 %	0 %	160878168
5	NC_010001	GAAAG	2	10	11413	11422	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010001	AAAAT	2	10	12879	12888	80 %	20 %	0 %	0 %	160878172
7	NC_010001	GAACA	2	10	13578	13587	60 %	0 %	20 %	20 %	160878172
8	NC_010001	CTATA	2	10	15085	15094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010001	AAATT	2	10	15129	15138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010001	TCGTG	2	10	16804	16813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010001	TAAAA	2	10	17566	17575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010001	AATAC	2	10	17743	17752	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010001	GGGAG	2	10	18428	18437	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010001	CCGTA	2	10	19552	19561	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010001	CGGGA	2	10	20655	20664	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010001	AAGAT	2	10	20701	20710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010001	TCCAA	2	10	21489	21498	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010001	TAAAA	2	10	21998	22007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010001	GAAAT	2	10	22190	22199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010001	AATTT	2	10	22215	22224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010001	AGCTA	2	10	22606	22615	40 %	20 %	20 %	20 %	160878174
22	NC_010001	GATAA	2	10	24145	24154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010001	AAATG	2	10	24314	24323	60 %	20 %	20 %	0 %	160878176
24	NC_010001	ATGGT	2	10	25441	25450	20 %	40 %	40 %	0 %	160878176
25	NC_010001	AGCAA	2	10	25948	25957	60 %	0 %	20 %	20 %	160878176
26	NC_010001	TAAGT	2	10	26321	26330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010001	TTAAA	2	10	26938	26947	60 %	40 %	0 %	0 %	160878177
28	NC_010001	TAAAT	2	10	28890	28899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010001	CAAAC	2	10	30266	30275	60 %	0 %	0 %	40 %	160878179
30	NC_010001	GGAAT	2	10	33809	33818	40 %	20 %	40 %	0 %	160878182
31	NC_010001	TGATT	2	10	34076	34085	20 %	60 %	20 %	0 %	160878182
32	NC_010001	AATCA	2	10	36490	36499	60 %	20 %	0 %	20 %	160878184
33	NC_010001	ATTAT	2	10	36867	36876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010001	ATTAT	2	10	36890	36899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010001	TATGA	2	10	37526	37535	40 %	40 %	20 %	0 %	160878185
36	NC_010001	AGAAT	2	10	37744	37753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010001	TACAG	2	10	39617	39626	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010001	TTATT	2	10	39689	39698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010001	AATTT	2	10	39795	39804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010001	ATGAA	2	10	39856	39865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010001	TTATA	2	10	42991	43000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010001	AATTT	2	10	43123	43132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010001	TGTTC	2	10	44492	44501	0 %	60 %	20 %	20 %	160878190
44	NC_010001	TAAAA	2	10	45777	45786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010001	AAAAC	2	10	47386	47395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010001	TGTAT	2	10	49063	49072	20 %	60 %	20 %	0 %	160878194
47	NC_010001	TAACG	2	10	50122	50131	40 %	20 %	20 %	20 %	160878195
48	NC_010001	TCTTA	2	10	50714	50723	20 %	60 %	0 %	20 %	160878195
49	NC_010001	TTATG	2	10	54100	54109	20 %	60 %	20 %	0 %	160878198
50	NC_010001	TGGAC	2	10	55671	55680	20 %	20 %	40 %	20 %	160878200
51	NC_010001	AGAGG	3	15	56393	56407	40 %	0 %	60 %	0 %	160878201
52	NC_010001	AAAAG	2	10	57220	57229	80 %	0 %	20 %	0 %	160878201
53	NC_010001	GAAAT	2	10	59724	59733	60 %	20 %	20 %	0 %	160878202
54	NC_010001	CGGAG	2	10	63456	63465	20 %	0 %	60 %	20 %	160878206
55	NC_010001	ATCAA	2	10	63884	63893	60 %	20 %	0 %	20 %	160878207
56	NC_010001	AACGA	2	10	64344	64353	60 %	0 %	20 %	20 %	160878207
57	NC_010001	ATCAA	2	10	64809	64818	60 %	20 %	0 %	20 %	160878207
58	NC_010001	TTTTG	2	10	65846	65855	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010001	TTTTA	2	10	66139	66148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010001	ATTAA	2	10	66574	66583	60 %	40 %	0 %	0 %	160878209
61	NC_010001	TTATT	2	10	67391	67400	20 %	80 %	0 %	0 %	160878210
62	NC_010001	TGAAT	2	10	67689	67698	40 %	40 %	20 %	0 %	160878210
63	NC_010001	ATCTT	2	10	67896	67905	20 %	60 %	0 %	20 %	160878210
64	NC_010001	ATATT	2	10	69598	69607	40 %	60 %	0 %	0 %	160878212
65	NC_010001	TTGGC	2	10	70380	70389	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010001	TATGA	2	10	71032	71041	40 %	40 %	20 %	0 %	160878213
67	NC_010001	AATCA	2	10	71551	71560	60 %	20 %	0 %	20 %	160878213
68	NC_010001	AGTAC	2	10	72187	72196	40 %	20 %	20 %	20 %	160878214
69	NC_010001	GTACT	2	10	72837	72846	20 %	40 %	20 %	20 %	160878215
70	NC_010001	TTATA	2	10	73944	73953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010001	GTTTT	2	10	74223	74232	0 %	80 %	20 %	0 %	160878216
72	NC_010001	TATTG	2	10	74909	74918	20 %	60 %	20 %	0 %	160878216
73	NC_010001	GTATA	2	10	74992	75001	40 %	40 %	20 %	0 %	160878216
74	NC_010001	GGTTC	2	10	75561	75570	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010001	TCGTG	2	10	77070	77079	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010001	GGGAG	2	10	78831	78840	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010001	CCGTA	2	10	79955	79964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010001	CGGGA	2	10	81058	81067	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010001	AAGAT	2	10	81104	81113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010001	TAAAT	2	10	82603	82612	60 %	40 %	0 %	0 %	160878218
81	NC_010001	ATAGT	2	10	83457	83466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010001	AAGAG	2	10	84355	84364	60 %	0 %	40 %	0 %	160878219
83	NC_010001	TAGAA	2	10	84538	84547	60 %	20 %	20 %	0 %	160878219
84	NC_010001	CTGTA	2	10	86823	86832	20 %	40 %	20 %	20 %	160878221
85	NC_010001	TACTT	2	10	90550	90559	20 %	60 %	0 %	20 %	160878225
86	NC_010001	CAAAC	2	10	91383	91392	60 %	0 %	0 %	40 %	160878226
87	NC_010001	TAAAG	2	10	93376	93385	60 %	20 %	20 %	0 %	160878227
88	NC_010001	GTAAA	2	10	95084	95093	60 %	20 %	20 %	0 %	160878228
89	NC_010001	GGAAT	2	10	97300	97309	40 %	20 %	40 %	0 %	160878229
90	NC_010001	ACAAA	2	10	97345	97354	80 %	0 %	0 %	20 %	160878229
91	NC_010001	AGCAA	2	10	98030	98039	60 %	0 %	20 %	20 %	160878229
92	NC_010001	ATTAT	2	10	98149	98158	40 %	60 %	0 %	0 %	160878229
93	NC_010001	AATAA	2	10	98208	98217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010001	TAGAG	2	10	98562	98571	40 %	20 %	40 %	0 %	160878230
95	NC_010001	ACGGT	2	10	98709	98718	20 %	20 %	40 %	20 %	160878230
96	NC_010001	GATAA	2	10	99085	99094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010001	GTAAG	2	10	99313	99322	40 %	20 %	40 %	0 %	160878231
98	NC_010001	GCGCA	2	10	99430	99439	20 %	0 %	40 %	40 %	160878231
99	NC_010001	ACAGG	2	10	100479	100488	40 %	0 %	40 %	20 %	160878231
100	NC_010001	ATTAC	2	10	102389	102398	40 %	40 %	0 %	20 %	160878233
101	NC_010001	AAGAT	2	10	102482	102491	60 %	20 %	20 %	0 %	160878233
102	NC_010001	GCAAA	2	10	103249	103258	60 %	0 %	20 %	20 %	160878233
103	NC_010001	GGATT	2	10	108169	108178	20 %	40 %	40 %	0 %	160878239
104	NC_010001	TGTAT	2	10	108432	108441	20 %	60 %	20 %	0 %	160878239
105	NC_010001	GATAA	2	10	108623	108632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010001	TTAAA	2	10	112538	112547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010001	ATAAA	2	10	113983	113992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010001	TCGTT	2	10	116029	116038	0 %	60 %	20 %	20 %	160878248
109	NC_010001	ATTTA	2	10	119723	119732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010001	ATTAT	2	10	119890	119899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010001	GTATC	2	10	122787	122796	20 %	40 %	20 %	20 %	160878253
112	NC_010001	GTTTT	2	10	123378	123387	0 %	80 %	20 %	0 %	160878253
113	NC_010001	AATTA	2	10	124117	124126	60 %	40 %	0 %	0 %	160878253
114	NC_010001	ACTTT	2	10	124624	124633	20 %	60 %	0 %	20 %	160878254
115	NC_010001	TTTTA	2	10	125754	125763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010001	AAAAG	2	10	126663	126672	80 %	0 %	20 %	0 %	160878256
117	NC_010001	ATTCC	2	10	127691	127700	20 %	40 %	0 %	40 %	160878256
118	NC_010001	GTTTT	2	10	128423	128432	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010001	TACTC	2	10	128613	128622	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010001	CAGGG	2	10	129507	129516	20 %	0 %	60 %	20 %	160878258
121	NC_010001	TATTT	2	10	129807	129816	20 %	80 %	0 %	0 %	160878258
122	NC_010001	GTTAT	2	10	131416	131425	20 %	60 %	20 %	0 %	160878260
123	NC_010001	CATGG	2	10	131528	131537	20 %	20 %	40 %	20 %	160878260
124	NC_010001	TTATA	2	10	133333	133342	40 %	60 %	0 %	0 %	160878261
125	NC_010001	TATCA	2	10	133525	133534	40 %	40 %	0 %	20 %	160878261
126	NC_010001	GAAGA	2	10	135948	135957	60 %	0 %	40 %	0 %	160878262
127	NC_010001	ATAAA	2	10	136335	136344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010001	AAAAT	2	10	136432	136441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010001	AAAGG	2	10	137538	137547	60 %	0 %	40 %	0 %	160878263
130	NC_010001	AGAAA	2	10	138089	138098	80 %	0 %	20 %	0 %	160878264
131	NC_010001	GCATT	2	10	138649	138658	20 %	40 %	20 %	20 %	160878264
132	NC_010001	AATGA	2	10	139050	139059	60 %	20 %	20 %	0 %	160878264
133	NC_010001	CGTTT	2	10	142036	142045	0 %	60 %	20 %	20 %	160878266
134	NC_010001	CACTT	2	10	143003	143012	20 %	40 %	0 %	40 %	160878267
135	NC_010001	TTCTC	2	10	144064	144073	0 %	60 %	0 %	40 %	160878268
136	NC_010001	AGGAT	2	10	144198	144207	40 %	20 %	40 %	0 %	160878268
137	NC_010001	ATTGT	2	10	146269	146278	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010001	GGGAA	2	10	148966	148975	40 %	0 %	60 %	0 %	160878271
139	NC_010001	AAATG	2	10	152563	152572	60 %	20 %	20 %	0 %	160878272
140	NC_010001	AAGTT	2	10	154123	154132	40 %	40 %	20 %	0 %	160878273
141	NC_010001	TAACA	2	10	158016	158025	60 %	20 %	0 %	20 %	160878278
142	NC_010001	ATATT	2	10	158465	158474	40 %	60 %	0 %	0 %	160878278
143	NC_010001	AGATA	2	10	158610	158619	60 %	20 %	20 %	0 %	160878278
144	NC_010001	AGAAA	2	10	160100	160109	80 %	0 %	20 %	0 %	160878279
145	NC_010001	TCAAA	2	10	160147	160156	60 %	20 %	0 %	20 %	160878279
146	NC_010001	CTATG	2	10	160511	160520	20 %	40 %	20 %	20 %	160878279
147	NC_010001	GAGAT	2	10	162774	162783	40 %	20 %	40 %	0 %	160878281
148	NC_010001	TGATT	2	10	165498	165507	20 %	60 %	20 %	0 %	160878284
149	NC_010001	TAAAA	2	10	166285	166294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010001	TTTGA	3	15	167088	167102	20 %	60 %	20 %	0 %	160878285
151	NC_010001	TAATG	2	10	168222	168231	40 %	40 %	20 %	0 %	160878285
152	NC_010001	TATCC	2	10	168670	168679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_010001	TTTAG	2	10	169045	169054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010001	AAAAT	2	10	170716	170725	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010001	ACTTT	2	10	171279	171288	20 %	60 %	0 %	20 %	160878288
156	NC_010001	TGCAT	2	10	172600	172609	20 %	40 %	20 %	20 %	160878289
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158	NC_010001	TAGCA	2	10	174934	174943	40 %	20 %	20 %	20 %	160878291
159	NC_010001	TAAGT	2	10	174991	175000	40 %	40 %	20 %	0 %	160878291
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161	NC_010001	ATGGA	2	10	175659	175668	40 %	20 %	40 %	0 %	160878291
162	NC_010001	CTGAA	2	10	178518	178527	40 %	20 %	20 %	20 %	160878295
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164	NC_010001	TAAAA	2	10	178962	178971	80 %	20 %	0 %	0 %	160878296
165	NC_010001	AAGAA	2	10	179219	179228	80 %	0 %	20 %	0 %	160878296
166	NC_010001	AAAAC	2	10	179616	179625	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_010001	TTTTC	2	10	181377	181386	0 %	80 %	0 %	20 %	160878298
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179	NC_010001	AAGTT	2	10	188363	188372	40 %	40 %	20 %	0 %	160878303
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182	NC_010001	ATTTC	2	10	192052	192061	20 %	60 %	0 %	20 %	160878307
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187	NC_010001	TGATT	2	10	197372	197381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_010001	AATTG	2	10	210365	210374	40 %	40 %	20 %	0 %	160878324
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201	NC_010001	TAAGG	2	10	211933	211942	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
202	NC_010001	CTTAT	2	10	212913	212922	20 %	60 %	0 %	20 %	160878326
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258	NC_010001	AAAAG	2	10	280833	280842	80 %	0 %	20 %	0 %	160878384
259	NC_010001	TAGTG	2	10	280992	281001	20 %	40 %	40 %	0 %	160878384
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261	NC_010001	AAAAG	2	10	283652	283661	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010001	AAGAT	2	10	284677	284686	60 %	20 %	20 %	0 %	160878387
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267	NC_010001	AAGCG	2	10	288672	288681	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_010001	TTAGT	2	10	289502	289511	20 %	60 %	20 %	0 %	160878392
269	NC_010001	TATCA	2	10	290369	290378	40 %	40 %	0 %	20 %	160878392
270	NC_010001	ATATC	2	10	291722	291731	40 %	40 %	0 %	20 %	160878393
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272	NC_010001	TATAC	2	10	292938	292947	40 %	40 %	0 %	20 %	160878395
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402	NC_010001	CTTGT	2	10	422229	422238	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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