MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010001	TGC	2	6	1	6	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010001	AT	3	6	45	50	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010001	CTT	2	6	165	170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878163
4	NC_010001	ATG	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
5	NC_010001	GAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
6	NC_010001	AATA	2	8	261	268	75 %	25 %	0 %	0 %	160878163
7	NC_010001	CTT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878163
8	NC_010001	AATAA	2	10	381	390	80 %	20 %	0 %	0 %	160878163
9	NC_010001	A	6	6	389	394	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
10	NC_010001	CTTA	2	8	406	413	25 %	50 %	0 %	25 %	160878163
11	NC_010001	GCA	2	6	471	476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878163
12	NC_010001	TATT	2	8	520	527	25 %	75 %	0 %	0 %	160878163
13	NC_010001	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878163
14	NC_010001	TA	3	6	579	584	50 %	50 %	0 %	0 %	160878163
15	NC_010001	TAC	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878163
16	NC_010001	TTA	2	6	717	722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
17	NC_010001	GAT	2	6	726	731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
18	NC_010001	TAT	2	6	740	745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
19	NC_010001	AGAA	2	8	752	759	75 %	0 %	25 %	0 %	160878163
20	NC_010001	A	7	7	803	809	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
21	NC_010001	ATT	2	6	816	821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
22	NC_010001	GAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
23	NC_010001	A	6	6	945	950	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
24	NC_010001	GAA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
25	NC_010001	TGA	3	9	974	982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
26	NC_010001	AGA	2	6	1072	1077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
27	NC_010001	AAG	2	6	1078	1083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
28	NC_010001	AGA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
29	NC_010001	ATA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
30	NC_010001	TTA	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878163
31	NC_010001	GTT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878163
32	NC_010001	TAC	2	6	1187	1192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878163
33	NC_010001	GAT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878163
34	NC_010001	TAA	2	6	1349	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
35	NC_010001	AAG	2	6	1371	1376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878163
36	NC_010001	TCCT	2	8	1379	1386	0 %	50 %	0 %	50 %	160878163
37	NC_010001	ATTA	2	8	1406	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	160878163
38	NC_010001	A	7	7	1413	1419	100 %	0 %	0 %	0 %	160878163
39	NC_010001	ATA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878163
40	NC_010001	TCTT	2	8	1439	1446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010001	ATT	2	6	1508	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010001	T	6	6	1554	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010001	ATG	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010001	TAA	2	6	1655	1660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010001	TAA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010001	TTCT	2	8	1718	1725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010001	CTA	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010001	TAA	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010001	ATTA	2	8	1802	1809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010001	TA	3	6	1812	1817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010001	GAAT	2	8	1869	1876	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
52	NC_010001	TTC	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878164
53	NC_010001	ATTAA	2	10	1972	1981	60 %	40 %	0 %	0 %	160878164
54	NC_010001	T	6	6	2066	2071	0 %	100 %	0 %	0 %	160878164
55	NC_010001	ATA	2	6	2077	2082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
56	NC_010001	AGA	2	6	2184	2189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
57	NC_010001	GAAG	2	8	2217	2224	50 %	0 %	50 %	0 %	160878164
58	NC_010001	AAG	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
59	NC_010001	T	6	6	2273	2278	0 %	100 %	0 %	0 %	160878164
60	NC_010001	TAA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
61	NC_010001	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878164
62	NC_010001	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
63	NC_010001	AAG	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878164
64	NC_010001	TATTTG	2	12	2519	2530	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	160878164
65	NC_010001	TAA	2	6	2622	2627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878164
66	NC_010001	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	160878164
67	NC_010001	TAGA	2	8	2648	2655	50 %	25 %	25 %	0 %	160878164
68	NC_010001	TTAA	2	8	2665	2672	50 %	50 %	0 %	0 %	160878164
69	NC_010001	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878164
70	NC_010001	A	6	6	2713	2718	100 %	0 %	0 %	0 %	160878164
71	NC_010001	GATATT	2	12	2761	2772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	160878164
72	NC_010001	TGA	3	9	2841	2849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878164
73	NC_010001	TTC	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878164
74	NC_010001	GCA	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878164
75	NC_010001	A	6	6	2969	2974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010001	TAA	2	6	2982	2987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010001	ATG	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010001	AT	3	6	3095	3100	50 %	50 %	0 %	0 %	160878165
79	NC_010001	A	6	6	3103	3108	100 %	0 %	0 %	0 %	160878165
80	NC_010001	AGA	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878165
81	NC_010001	TTG	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878165
82	NC_010001	TTA	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878165
83	NC_010001	A	8	8	3245	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	160878165
84	NC_010001	TGG	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878165
85	NC_010001	TCG	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878165
86	NC_010001	ATC	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010001	TATG	2	8	3367	3374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010001	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010001	A	7	7	3464	3470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010001	GA	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010001	T	6	6	3542	3547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010001	AAAT	2	8	3548	3555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010001	AAT	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010001	ATTT	2	8	3632	3639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010001	TGTT	2	8	3656	3663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010001	T	6	6	3666	3671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010001	A	8	8	3743	3750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010001	A	8	8	3758	3765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010001	T	6	6	3811	3816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010001	GAT	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
101	NC_010001	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
102	NC_010001	AGA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
103	NC_010001	GAT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
104	NC_010001	ATC	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878166
105	NC_010001	A	9	9	4130	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	160878166
106	NC_010001	TCT	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878166
107	NC_010001	ATT	2	6	4190	4195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
108	NC_010001	TGT	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878166
109	NC_010001	T	7	7	4215	4221	0 %	100 %	0 %	0 %	160878166
110	NC_010001	GGA	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878166
111	NC_010001	TAAG	2	8	4297	4304	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
112	NC_010001	ACA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878166
113	NC_010001	TTA	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
114	NC_010001	TG	3	6	4406	4411	0 %	50 %	50 %	0 %	160878166
115	NC_010001	AATT	2	8	4420	4427	50 %	50 %	0 %	0 %	160878166
116	NC_010001	AG	4	8	4451	4458	50 %	0 %	50 %	0 %	160878166
117	NC_010001	ATGA	2	8	4476	4483	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
118	NC_010001	TTA	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
119	NC_010001	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	160878166
120	NC_010001	AGA	2	6	4523	4528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
121	NC_010001	GCA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878166
122	NC_010001	CTG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878166
123	NC_010001	GAT	2	6	4785	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878166
124	NC_010001	TAGA	2	8	4804	4811	50 %	25 %	25 %	0 %	160878166
125	NC_010001	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878166
126	NC_010001	TTG	2	6	4840	4845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878166
127	NC_010001	GAA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878166
128	NC_010001	AGG	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010001	TAG	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878167
130	NC_010001	AAAC	2	8	5224	5231	75 %	0 %	0 %	25 %	160878167
131	NC_010001	A	6	6	5235	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	160878167
132	NC_010001	CGG	2	6	5282	5287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160878167
133	NC_010001	GGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878167
134	NC_010001	GGA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878167
135	NC_010001	GTT	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878167
136	NC_010001	AAC	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
137	NC_010001	GAA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878167
138	NC_010001	TATGAT	2	12	5523	5534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	160878167
139	NC_010001	AAC	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878167
140	NC_010001	ATT	2	6	5586	5591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878167
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259	NC_010001	ATGC	2	8	10452	10459	25 %	25 %	25 %	25 %	160878169
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267	NC_010001	GTT	2	6	10767	10772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_010001	AT	3	6	12245	12250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_010001	TAAAA	2	10	17566	17575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_010001	A	7	7	17572	17578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_010001	AAC	2	6	17585	17590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_010001	ATA	2	6	17591	17596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_010001	A	6	6	17598	17603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_010001	ATA	2	6	17606	17611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_010001	TAA	2	6	17641	17646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_010001	AAAC	2	8	17828	17835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
415	NC_010001	AGT	2	6	17842	17847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NC_010001	CAC	2	6	17848	17853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
417	NC_010001	TGA	2	6	17860	17865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NC_010001	TAA	2	6	17918	17923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_010001	TGG	2	6	17931	17936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_010001	TTG	2	6	18335	18340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_010001	TAC	2	6	18372	18377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_010001	GGGAG	2	10	18428	18437	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_010001	GGT	2	6	18679	18684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_010001	GT	4	8	18969	18976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
442	NC_010001	AGC	2	6	19028	19033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_010001	GA	3	6	19069	19074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
444	NC_010001	AC	3	6	19103	19108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
445	NC_010001	GAA	2	6	19165	19170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_010001	AAG	2	6	19199	19204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NC_010001	AG	3	6	19203	19208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
448	NC_010001	TCT	2	6	19243	19248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_010001	ACA	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_010001	GAG	2	6	19579	19584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010001	CGG	2	6	19828	19833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_010001	AG	3	6	20262	20267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_010001	CGT	2	6	20517	20522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_010001	TCAA	2	8	20893	20900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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