MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010001	TCT	2	6	132154	132159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878260
3002	NC_010001	ATG	2	6	132174	132179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878260
3003	NC_010001	TGAT	2	8	132205	132212	25 %	50 %	25 %	0 %	160878260
3004	NC_010001	AGTT	2	8	132235	132242	25 %	50 %	25 %	0 %	160878260
3005	NC_010001	TAT	2	6	132278	132283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878260
3006	NC_010001	GAA	2	6	132357	132362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878260
3007	NC_010001	CTA	2	6	132379	132384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878260
3008	NC_010001	CAAA	2	8	132487	132494	75 %	0 %	0 %	25 %	160878260
3009	NC_010001	GTA	2	6	132517	132522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878260
3010	NC_010001	ATTA	2	8	132542	132549	50 %	50 %	0 %	0 %	160878260
3011	NC_010001	ATG	2	6	132568	132573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878260
3012	NC_010001	A	6	6	132640	132645	100 %	0 %	0 %	0 %	160878260
3013	NC_010001	TTTA	2	8	132671	132678	25 %	75 %	0 %	0 %	160878260
3014	NC_010001	AGA	2	6	132689	132694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878260
3015	NC_010001	GAA	2	6	132729	132734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878260
3016	NC_010001	ATCA	2	8	132735	132742	50 %	25 %	0 %	25 %	160878260
3017	NC_010001	A	6	6	132789	132794	100 %	0 %	0 %	0 %	160878260
3018	NC_010001	AT	3	6	132803	132808	50 %	50 %	0 %	0 %	160878260
3019	NC_010001	TGA	2	6	132899	132904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878260
3020	NC_010001	AAGA	2	8	132957	132964	75 %	0 %	25 %	0 %	160878260
3021	NC_010001	TATT	2	8	132982	132989	25 %	75 %	0 %	0 %	160878260
3022	NC_010001	ATA	2	6	133029	133034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878260
3023	NC_010001	AT	4	8	133096	133103	50 %	50 %	0 %	0 %	160878260
3024	NC_010001	AGG	2	6	133132	133137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878260
3025	NC_010001	A	6	6	133151	133156	100 %	0 %	0 %	0 %	160878260
3026	NC_010001	AT	3	6	133165	133170	50 %	50 %	0 %	0 %	160878261
3027	NC_010001	T	6	6	133187	133192	0 %	100 %	0 %	0 %	160878261
3028	NC_010001	CTT	2	6	133228	133233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878261
3029	NC_010001	TGG	2	6	133248	133253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878261
3030	NC_010001	TTA	2	6	133260	133265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878261
3031	NC_010001	GAT	2	6	133280	133285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878261
3032	NC_010001	AGC	2	6	133315	133320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878261
3033	NC_010001	TTATA	2	10	133333	133342	40 %	60 %	0 %	0 %	160878261
3034	NC_010001	T	6	6	133408	133413	0 %	100 %	0 %	0 %	160878261
3035	NC_010001	AAC	2	6	133414	133419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878261
3036	NC_010001	ATG	2	6	133452	133457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878261
3037	NC_010001	AAAG	2	8	133461	133468	75 %	0 %	25 %	0 %	160878261
3038	NC_010001	TATCA	2	10	133525	133534	40 %	40 %	0 %	20 %	160878261
3039	NC_010001	CAG	2	6	133565	133570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878261
3040	NC_010001	T	6	6	133594	133599	0 %	100 %	0 %	0 %	160878261
3041	NC_010001	TAT	2	6	133687	133692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878261
3042	NC_010001	TAT	2	6	133699	133704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878261
3043	NC_010001	TTC	2	6	133711	133716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878261
3044	NC_010001	CAG	2	6	133733	133738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878261
3045	NC_010001	AAGA	2	8	133770	133777	75 %	0 %	25 %	0 %	160878261
3046	NC_010001	TAA	2	6	133846	133851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878261
3047	NC_010001	TA	3	6	133925	133930	50 %	50 %	0 %	0 %	160878261
3048	NC_010001	TTG	2	6	133935	133940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878261
3049	NC_010001	TCC	2	6	134060	134065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878261
3050	NC_010001	GCA	2	6	134084	134089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878261
3051	NC_010001	AGA	2	6	134122	134127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878261
3052	NC_010001	ACA	2	6	134205	134210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878261
3053	NC_010001	GAC	2	6	134296	134301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878261
3054	NC_010001	ATG	2	6	134328	134333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878261
3055	NC_010001	AAT	2	6	134336	134341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878261
3056	NC_010001	ATA	2	6	134454	134459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878261
3057	NC_010001	AGA	2	6	134473	134478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878261
3058	NC_010001	TGC	2	6	134503	134508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878261
3059	NC_010001	GAA	2	6	134573	134578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878261
3060	NC_010001	TCT	2	6	134579	134584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878261
3061	NC_010001	TGA	2	6	134659	134664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878261
3062	NC_010001	CAA	2	6	134667	134672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878261
3063	NC_010001	GAA	2	6	134716	134721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878261
3064	NC_010001	TAT	2	6	134722	134727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878261
3065	NC_010001	ATG	2	6	134832	134837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878261
3066	NC_010001	GAA	2	6	134845	134850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878261
3067	NC_010001	A	6	6	134849	134854	100 %	0 %	0 %	0 %	160878261
3068	NC_010001	A	7	7	134901	134907	100 %	0 %	0 %	0 %	160878261
3069	NC_010001	TAGTAA	2	12	134914	134925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010001	TAA	2	6	134935	134940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010001	AGGT	2	8	135011	135018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010001	ATA	2	6	135030	135035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010001	CCT	2	6	135081	135086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_010001	AAC	2	6	135151	135156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_010001	AGA	2	6	135199	135204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878262
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3077	NC_010001	GTTT	2	8	135273	135280	0 %	75 %	25 %	0 %	160878262
3078	NC_010001	TTA	2	6	135281	135286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878262
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3080	NC_010001	GCA	2	6	135380	135385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878262
3081	NC_010001	CTT	2	6	135402	135407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878262
3082	NC_010001	CAA	2	6	135420	135425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878262
3083	NC_010001	CAT	2	6	135474	135479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878262
3084	NC_010001	GA	3	6	135513	135518	50 %	0 %	50 %	0 %	160878262
3085	NC_010001	T	6	6	135667	135672	0 %	100 %	0 %	0 %	160878262
3086	NC_010001	TGC	2	6	135679	135684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878262
3087	NC_010001	AGTTTA	2	12	135710	135721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	160878262
3088	NC_010001	AGCA	2	8	135742	135749	50 %	0 %	25 %	25 %	160878262
3089	NC_010001	CAT	2	6	135762	135767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878262
3090	NC_010001	TCA	2	6	135938	135943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878262
3091	NC_010001	GAAGA	2	10	135948	135957	60 %	0 %	40 %	0 %	160878262
3092	NC_010001	TAC	2	6	135999	136004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878262
3093	NC_010001	T	6	6	136024	136029	0 %	100 %	0 %	0 %	160878262
3094	NC_010001	TTC	2	6	136033	136038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878262
3095	NC_010001	T	6	6	136043	136048	0 %	100 %	0 %	0 %	160878262
3096	NC_010001	TGG	2	6	136074	136079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878262
3097	NC_010001	TTC	2	6	136085	136090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878262
3098	NC_010001	CGTT	2	8	136190	136197	0 %	50 %	25 %	25 %	160878262
3099	NC_010001	TAT	2	6	136203	136208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878262
3100	NC_010001	TCC	2	6	136214	136219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878262
3101	NC_010001	CAA	2	6	136221	136226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878262
3102	NC_010001	TAC	2	6	136261	136266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878262
3103	NC_010001	CT	3	6	136329	136334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_010001	ATAAA	2	10	136335	136344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010001	TA	3	6	136364	136369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010001	T	6	6	136381	136386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010001	A	6	6	136408	136413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010001	TAA	2	6	136424	136429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010001	AAAAT	2	10	136432	136441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010001	GA	3	6	136538	136543	50 %	0 %	50 %	0 %	160878263
3111	NC_010001	AAC	2	6	136572	136577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878263
3112	NC_010001	GAA	2	6	136585	136590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878263
3113	NC_010001	TTA	2	6	136603	136608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878263
3114	NC_010001	AAG	2	6	136658	136663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878263
3115	NC_010001	TA	3	6	136669	136674	50 %	50 %	0 %	0 %	160878263
3116	NC_010001	GTA	2	6	136699	136704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878263
3117	NC_010001	TA	3	6	136726	136731	50 %	50 %	0 %	0 %	160878263
3118	NC_010001	TATT	2	8	136806	136813	25 %	75 %	0 %	0 %	160878263
3119	NC_010001	ATG	2	6	136880	136885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878263
3120	NC_010001	TGG	2	6	136932	136937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878263
3121	NC_010001	AAT	2	6	136945	136950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878263
3122	NC_010001	AGA	2	6	136974	136979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878263
3123	NC_010001	AATT	2	8	137024	137031	50 %	50 %	0 %	0 %	160878263
3124	NC_010001	ATT	2	6	137099	137104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878263
3125	NC_010001	AAAG	2	8	137126	137133	75 %	0 %	25 %	0 %	160878263
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