MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 110326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010001	AAG	2	6	42388	42393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878187
1002	NC_010001	TTA	2	6	42454	42459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878187
1003	NC_010001	TA	3	6	42557	42562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010001	T	6	6	42583	42588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010001	TG	3	6	42622	42627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010001	TAG	2	6	42747	42752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878188
1007	NC_010001	GATA	2	8	42785	42792	50 %	25 %	25 %	0 %	160878188
1008	NC_010001	CTAT	2	8	42796	42803	25 %	50 %	0 %	25 %	160878188
1009	NC_010001	AAT	2	6	42916	42921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878188
1010	NC_010001	CAC	2	6	42933	42938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_010001	TAA	2	6	42981	42986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010001	TTATA	2	10	42991	43000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010001	T	6	6	43036	43041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010001	TATT	2	8	43043	43050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010001	AATTT	2	10	43123	43132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010001	GAA	2	6	43156	43161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010001	AG	4	8	43252	43259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010001	AT	3	6	43280	43285	50 %	50 %	0 %	0 %	160878189
1019	NC_010001	TCGT	2	8	43369	43376	0 %	50 %	25 %	25 %	160878189
1020	NC_010001	TTG	2	6	43390	43395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878189
1021	NC_010001	TTA	2	6	43405	43410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878189
1022	NC_010001	TTA	2	6	43506	43511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878189
1023	NC_010001	T	7	7	43525	43531	0 %	100 %	0 %	0 %	160878189
1024	NC_010001	GT	3	6	43548	43553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010001	ATT	2	6	43556	43561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010001	ATA	2	6	43575	43580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010001	AGAT	2	8	43664	43671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010001	AT	3	6	43670	43675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010001	T	8	8	43707	43714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010001	ATT	2	6	43726	43731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010001	AGG	2	6	43737	43742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010001	ATCT	2	8	43799	43806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_010001	ATT	2	6	43817	43822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010001	TCG	2	6	43863	43868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010001	T	6	6	43871	43876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010001	T	7	7	43878	43884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010001	AT	3	6	43905	43910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010001	TCG	2	6	43911	43916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010001	A	6	6	43958	43963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010001	AGC	2	6	44001	44006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010001	GAA	2	6	44133	44138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010001	GTTG	2	8	44176	44183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010001	GAA	2	6	44305	44310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878190
1044	NC_010001	GTC	2	6	44315	44320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878190
1045	NC_010001	A	6	6	44341	44346	100 %	0 %	0 %	0 %	160878190
1046	NC_010001	TCG	2	6	44467	44472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878190
1047	NC_010001	TGTTC	2	10	44492	44501	0 %	60 %	20 %	20 %	160878190
1048	NC_010001	GAA	2	6	44509	44514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878190
1049	NC_010001	ATT	2	6	44534	44539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878190
1050	NC_010001	CCTA	2	8	44612	44619	25 %	25 %	0 %	50 %	160878190
1051	NC_010001	A	7	7	44619	44625	100 %	0 %	0 %	0 %	160878190
1052	NC_010001	TATT	2	8	44633	44640	25 %	75 %	0 %	0 %	160878190
1053	NC_010001	CTTT	2	8	44692	44699	0 %	75 %	0 %	25 %	160878190
1054	NC_010001	A	6	6	44701	44706	100 %	0 %	0 %	0 %	160878190
1055	NC_010001	TGA	2	6	44715	44720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878190
1056	NC_010001	TAT	2	6	44814	44819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878190
1057	NC_010001	GAA	2	6	44833	44838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878190
1058	NC_010001	TGA	3	9	44841	44849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878190
1059	NC_010001	ATT	2	6	44851	44856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878190
1060	NC_010001	A	6	6	44862	44867	100 %	0 %	0 %	0 %	160878190
1061	NC_010001	A	7	7	44939	44945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010001	T	6	6	44961	44966	0 %	100 %	0 %	0 %	160878191
1063	NC_010001	TAA	2	6	44984	44989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878191
1064	NC_010001	AGA	2	6	45090	45095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878191
1065	NC_010001	TA	3	6	45098	45103	50 %	50 %	0 %	0 %	160878191
1066	NC_010001	CGT	2	6	45104	45109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878191
1067	NC_010001	AAT	2	6	45142	45147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878191
1068	NC_010001	TTA	2	6	45207	45212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878191
1069	NC_010001	TGAGTA	2	12	45213	45224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878191
1070	NC_010001	TAA	2	6	45287	45292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878191
1071	NC_010001	ATT	2	6	45293	45298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878191
1072	NC_010001	AAT	2	6	45307	45312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878191
1073	NC_010001	TAA	2	6	45317	45322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878191
1074	NC_010001	A	7	7	45321	45327	100 %	0 %	0 %	0 %	160878191
1075	NC_010001	A	6	6	45340	45345	100 %	0 %	0 %	0 %	160878191
1076	NC_010001	TAT	2	6	45383	45388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878191
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1078	NC_010001	TACC	2	8	45402	45409	25 %	25 %	0 %	50 %	160878191
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1080	NC_010001	TAT	2	6	45592	45597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878191
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1085	NC_010001	TAAAA	2	10	45777	45786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010001	TGC	2	6	45787	45792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_010001	TA	3	6	45796	45801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010001	T	6	6	45888	45893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010001	ATCT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_010001	A	7	7	46003	46009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010001	GGA	2	6	46031	46036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010001	ATCT	2	8	46106	46113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1095	NC_010001	AGG	2	6	46266	46271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878192
1096	NC_010001	AGA	2	6	46324	46329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878192
1097	NC_010001	TG	3	6	46377	46382	0 %	50 %	50 %	0 %	160878192
1098	NC_010001	AT	3	6	46459	46464	50 %	50 %	0 %	0 %	160878192
1099	NC_010001	A	6	6	46495	46500	100 %	0 %	0 %	0 %	160878192
1100	NC_010001	TC	3	6	46530	46535	0 %	50 %	0 %	50 %	160878192
1101	NC_010001	CAG	2	6	46663	46668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878192
1102	NC_010001	TACT	2	8	46685	46692	25 %	50 %	0 %	25 %	160878192
1103	NC_010001	TTA	2	6	46774	46779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878192
1104	NC_010001	TGA	2	6	46807	46812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878192
1105	NC_010001	CCT	2	6	46887	46892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878192
1106	NC_010001	TTA	2	6	46904	46909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878192
1107	NC_010001	AGCAAA	2	12	47052	47063	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	160878192
1108	NC_010001	A	6	6	47061	47066	100 %	0 %	0 %	0 %	160878192
1109	NC_010001	AAG	2	6	47088	47093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878192
1110	NC_010001	TAC	2	6	47170	47175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_010001	TAC	2	6	47187	47192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010001	TA	3	6	47229	47234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010001	ATA	2	6	47283	47288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010001	AAAAC	2	10	47386	47395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_010001	TGA	2	6	47407	47412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010001	AGA	3	9	47487	47495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878193
1117	NC_010001	ATT	2	6	47496	47501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878193
1118	NC_010001	TGA	2	6	47511	47516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878193
1119	NC_010001	AGA	2	6	47538	47543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878193
1120	NC_010001	AAC	2	6	47564	47569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878193
1121	NC_010001	TTG	2	6	47624	47629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878193
1122	NC_010001	GAAA	2	8	47667	47674	75 %	0 %	25 %	0 %	160878193
1123	NC_010001	TGA	2	6	47699	47704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878193
1124	NC_010001	TAT	2	6	47778	47783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878193
1125	NC_010001	GGA	2	6	47863	47868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878193
1126	NC_010001	ACAATG	2	12	47902	47913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	160878193
1127	NC_010001	GAA	2	6	47944	47949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878193
1128	NC_010001	GCT	2	6	47950	47955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878193
1129	NC_010001	CTT	2	6	48030	48035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878193
1130	NC_010001	GAA	2	6	48064	48069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878193
1131	NC_010001	GAA	2	6	48162	48167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878193
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